MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL2

Total Repeats: 11576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009427	CTT	2	6	20255	20260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146275645
502	NC_009427	GCGG	2	8	20284	20291	0 %	0 %	75 %	25 %	146275645
503	NC_009427	CG	3	6	20322	20327	0 %	0 %	50 %	50 %	146275645
504	NC_009427	CCG	2	6	20344	20349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275645
505	NC_009427	GCA	2	6	20428	20433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275645
506	NC_009427	TCG	2	6	20439	20444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275645
507	NC_009427	CGT	2	6	20455	20460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275645
508	NC_009427	GC	3	6	20487	20492	0 %	0 %	50 %	50 %	146275645
509	NC_009427	GCC	2	6	20564	20569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275645
510	NC_009427	TGC	2	6	20638	20643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275645
511	NC_009427	GC	3	6	20672	20677	0 %	0 %	50 %	50 %	146275645
512	NC_009427	GGT	2	6	20678	20683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146275645
513	NC_009427	CCG	2	6	20691	20696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275645
514	NC_009427	AGC	2	6	20731	20736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275645
515	NC_009427	CGC	2	6	20746	20751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275645
516	NC_009427	GCT	2	6	20779	20784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275645
517	NC_009427	TCA	2	6	20836	20841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275645
518	NC_009427	CGA	2	6	20881	20886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275645
519	NC_009427	GC	4	8	21045	21052	0 %	0 %	50 %	50 %	146275645
520	NC_009427	ATC	2	6	21063	21068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275645
521	NC_009427	TCG	3	9	21072	21080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275645
522	NC_009427	CGG	2	6	21155	21160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009427	ACCG	2	8	21172	21179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
524	NC_009427	TCA	2	6	21186	21191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_009427	TCC	2	6	21258	21263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146275646
526	NC_009427	CCA	3	9	21266	21274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275646
527	NC_009427	GCC	2	6	21294	21299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275646
528	NC_009427	CCG	2	6	21320	21325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275646
529	NC_009427	GCG	2	6	21354	21359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275646
530	NC_009427	GCG	2	6	21378	21383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275646
531	NC_009427	CAGC	2	8	21401	21408	25 %	0 %	25 %	50 %	146275646
532	NC_009427	GC	3	6	21495	21500	0 %	0 %	50 %	50 %	146275646
533	NC_009427	GCCT	2	8	21513	21520	0 %	25 %	25 %	50 %	146275646
534	NC_009427	CCA	2	6	21575	21580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275646
535	NC_009427	GCC	2	6	21591	21596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275646
536	NC_009427	CCCG	2	8	21597	21604	0 %	0 %	25 %	75 %	146275646
537	NC_009427	GCC	2	6	21749	21754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275646
538	NC_009427	AAGC	2	8	21761	21768	50 %	0 %	25 %	25 %	146275646
539	NC_009427	GGC	2	6	21783	21788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275646
540	NC_009427	CCG	2	6	21839	21844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275646
541	NC_009427	CG	4	8	21848	21855	0 %	0 %	50 %	50 %	146275646
542	NC_009427	CG	3	6	21889	21894	0 %	0 %	50 %	50 %	146275646
543	NC_009427	CG	3	6	21921	21926	0 %	0 %	50 %	50 %	146275646
544	NC_009427	CG	3	6	21935	21940	0 %	0 %	50 %	50 %	146275646
545	NC_009427	GGT	2	6	22085	22090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146275647
546	NC_009427	GAT	2	6	22124	22129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275647
547	NC_009427	GGTGC	2	10	22217	22226	0 %	20 %	60 %	20 %	146275647
548	NC_009427	GCA	2	6	22246	22251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275647
549	NC_009427	TCG	2	6	22320	22325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275647
550	NC_009427	TTG	2	6	22326	22331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146275647
551	NC_009427	CGT	2	6	22349	22354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275647
552	NC_009427	ATC	2	6	22389	22394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275647
553	NC_009427	ACG	2	6	22455	22460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275647
554	NC_009427	G	6	6	22470	22475	0 %	0 %	100 %	0 %	146275647
555	NC_009427	ACG	2	6	22653	22658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275648
556	NC_009427	CGATC	2	10	22696	22705	20 %	20 %	20 %	40 %	146275648
557	NC_009427	CGA	2	6	22716	22721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275648
558	NC_009427	CG	3	6	22725	22730	0 %	0 %	50 %	50 %	146275648
559	NC_009427	GCGG	2	8	22732	22739	0 %	0 %	75 %	25 %	146275648
560	NC_009427	CGA	2	6	22746	22751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275648
561	NC_009427	GGC	2	6	22786	22791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275648
562	NC_009427	GCCG	2	8	22800	22807	0 %	0 %	50 %	50 %	146275648
563	NC_009427	CCGGC	2	10	22941	22950	0 %	0 %	40 %	60 %	146275648
564	NC_009427	GAC	2	6	22981	22986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275648
565	NC_009427	CCG	2	6	23010	23015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275648
566	NC_009427	CGA	2	6	23040	23045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275648
567	NC_009427	TCG	2	6	23084	23089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275648
568	NC_009427	CGT	2	6	23100	23105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275648
569	NC_009427	GC	3	6	23240	23245	0 %	0 %	50 %	50 %	146275648
570	NC_009427	CGC	2	6	23290	23295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275648
571	NC_009427	GC	3	6	23300	23305	0 %	0 %	50 %	50 %	146275648
572	NC_009427	CTG	2	6	23341	23346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275648
573	NC_009427	CGT	2	6	23350	23355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275648
574	NC_009427	GAC	3	9	23392	23400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275648
575	NC_009427	CCGT	2	8	23404	23411	0 %	25 %	25 %	50 %	146275648
576	NC_009427	CT	3	6	23450	23455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_009427	TCGA	2	8	23516	23523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_009427	CAA	2	6	23590	23595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_009427	GCGCG	2	10	23629	23638	0 %	0 %	60 %	40 %	146275649
580	NC_009427	GCG	2	6	23690	23695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275649
581	NC_009427	AGC	2	6	23709	23714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275649
582	NC_009427	CGA	2	6	23719	23724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275649
583	NC_009427	CGA	2	6	23767	23772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275649
584	NC_009427	GCG	2	6	23801	23806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275649
585	NC_009427	CGCAGG	2	12	23850	23861	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146275649
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588	NC_009427	GCT	2	6	23967	23972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275649
589	NC_009427	GGC	2	6	23981	23986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275649
590	NC_009427	GCT	2	6	23995	24000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275649
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592	NC_009427	CG	3	6	24048	24053	0 %	0 %	50 %	50 %	146275649
593	NC_009427	GC	3	6	24063	24068	0 %	0 %	50 %	50 %	146275649
594	NC_009427	CG	4	8	24088	24095	0 %	0 %	50 %	50 %	146275649
595	NC_009427	TCG	2	6	24099	24104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275649
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598	NC_009427	TCA	2	6	24303	24308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275649
599	NC_009427	CGA	2	6	24313	24318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275649
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601	NC_009427	CGGAC	2	10	24373	24382	20 %	0 %	40 %	40 %	146275649
602	NC_009427	CTG	2	6	24395	24400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275649
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607	NC_009427	AAC	2	6	24608	24613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146275649
608	NC_009427	GC	3	6	24627	24632	0 %	0 %	50 %	50 %	146275649
609	NC_009427	CGA	2	6	24699	24704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275649
610	NC_009427	GGC	2	6	24709	24714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275649
611	NC_009427	CGA	2	6	24781	24786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275649
612	NC_009427	TGG	2	6	24798	24803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146275649
613	NC_009427	GCC	2	6	24816	24821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275649
614	NC_009427	GGCG	2	8	24884	24891	0 %	0 %	75 %	25 %	146275649
615	NC_009427	CGAG	2	8	24921	24928	25 %	0 %	50 %	25 %	146275649
616	NC_009427	GACG	2	8	24976	24983	25 %	0 %	50 %	25 %	146275650
617	NC_009427	GC	3	6	24984	24989	0 %	0 %	50 %	50 %	146275650
618	NC_009427	GCG	2	6	25054	25059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275650
619	NC_009427	GCTC	2	8	25072	25079	0 %	25 %	25 %	50 %	146275650
620	NC_009427	GCG	4	12	25099	25110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275650
621	NC_009427	TTC	2	6	25171	25176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146275650
622	NC_009427	GC	3	6	25180	25185	0 %	0 %	50 %	50 %	146275650
623	NC_009427	CAA	2	6	25206	25211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146275650
624	NC_009427	AACC	2	8	25218	25225	50 %	0 %	0 %	50 %	146275650
625	NC_009427	ACCTCA	2	12	25277	25288	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146275650
626	NC_009427	TTC	2	6	25297	25302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146275650
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628	NC_009427	GAT	2	6	25326	25331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275650
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771	NC_009427	CG	3	6	31825	31830	0 %	0 %	50 %	50 %	146275657
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