MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL1

Total Repeats: 3848

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009426	GCC	2	6	51056	51061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_009426	AAT	2	6	51142	51147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009426	CAT	2	6	51250	51255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_009426	GC	4	8	51285	51292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_009426	GCT	2	6	51296	51301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_009426	CAAC	2	8	51466	51473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_009426	CGA	2	6	51640	51645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_009426	GCC	2	6	51656	51661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_009426	TCG	2	6	51699	51704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009426	GGC	2	6	51754	51759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_009426	CCG	2	6	51924	51929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_009426	GCC	2	6	51953	51958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_009426	GAT	2	6	51976	51981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009426	CGC	2	6	52014	52019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_009426	GCC	2	6	52061	52066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_009426	GCG	2	6	52073	52078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_009426	ATCC	2	8	52137	52144	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_009426	CAGG	2	8	52188	52195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_009426	CAA	2	6	52219	52224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146275491
1020	NC_009426	GAC	2	6	52308	52313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275491
1021	NC_009426	GGTCCA	2	12	52330	52341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146275491
1022	NC_009426	CAC	2	6	52446	52451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275491
1023	NC_009426	CCGCA	2	10	52466	52475	20 %	0 %	20 %	60 %	146275491
1024	NC_009426	TGC	2	6	52508	52513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275491
1025	NC_009426	TGC	2	6	52518	52523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275491
1026	NC_009426	CCAA	2	8	52570	52577	50 %	0 %	0 %	50 %	146275491
1027	NC_009426	GCAAG	2	10	52621	52630	40 %	0 %	40 %	20 %	146275491
1028	NC_009426	CGC	3	9	52685	52693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275491
1029	NC_009426	TGC	2	6	52695	52700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275491
1030	NC_009426	CTGAA	2	10	52706	52715	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1031	NC_009426	GGC	2	6	52731	52736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_009426	CAT	2	6	52855	52860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275492
1033	NC_009426	CAC	2	6	52972	52977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275492
1034	NC_009426	GGC	2	6	52986	52991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275492
1035	NC_009426	CAG	2	6	53026	53031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275492
1036	NC_009426	GGC	2	6	53036	53041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275492
1037	NC_009426	TTC	2	6	53063	53068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146275492
1038	NC_009426	ATCGA	2	10	53069	53078	40 %	20 %	20 %	20 %	146275492
1039	NC_009426	CGA	2	6	53136	53141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275492
1040	NC_009426	TCC	2	6	53144	53149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146275492
1041	NC_009426	CAC	2	6	53290	53295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146275492
1042	NC_009426	CTC	2	6	53314	53319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146275492
1043	NC_009426	TCA	2	6	53322	53327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275492
1044	NC_009426	GC	3	6	53340	53345	0 %	0 %	50 %	50 %	146275492
1045	NC_009426	CTT	2	6	53374	53379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146275492
1046	NC_009426	ACTG	2	8	53468	53475	25 %	25 %	25 %	25 %	146275492
1047	NC_009426	GAA	2	6	53506	53511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275492
1048	NC_009426	AGC	2	6	53582	53587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275492
1049	NC_009426	CGCC	2	8	53610	53617	0 %	0 %	25 %	75 %	146275492
1050	NC_009426	TTC	2	6	53656	53661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146275492
1051	NC_009426	CAG	2	6	53676	53681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275492
1052	NC_009426	GC	3	6	53921	53926	0 %	0 %	50 %	50 %	146275493
1053	NC_009426	CG	4	8	54033	54040	0 %	0 %	50 %	50 %	146275493
1054	NC_009426	CG	3	6	54127	54132	0 %	0 %	50 %	50 %	146275493
1055	NC_009426	TCA	2	6	54135	54140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275493
1056	NC_009426	AGGTCG	2	12	54147	54158	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146275493
1057	NC_009426	GCC	2	6	54180	54185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275493
1058	NC_009426	GAC	2	6	54199	54204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275493
1059	NC_009426	ATC	2	6	54254	54259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275493
1060	NC_009426	AC	3	6	54261	54266	50 %	0 %	0 %	50 %	146275493
1061	NC_009426	CG	3	6	54298	54303	0 %	0 %	50 %	50 %	146275493
1062	NC_009426	GCC	2	6	54332	54337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275493
1063	NC_009426	ATC	2	6	54347	54352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275493
1064	NC_009426	CGG	2	6	54355	54360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275493
1065	NC_009426	CTGG	2	8	54484	54491	0 %	25 %	50 %	25 %	146275493
1066	NC_009426	CGG	2	6	54494	54499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275493
1067	NC_009426	CGG	2	6	54544	54549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275493
1068	NC_009426	GCG	2	6	54572	54577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275493
1069	NC_009426	GGC	2	6	54676	54681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275494
1070	NC_009426	GGTCC	2	10	54692	54701	0 %	20 %	40 %	40 %	146275494
1071	NC_009426	CTGG	2	8	54712	54719	0 %	25 %	50 %	25 %	146275494
1072	NC_009426	TCG	2	6	54816	54821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275494
1073	NC_009426	TGCG	2	8	54828	54835	0 %	25 %	50 %	25 %	146275494
1074	NC_009426	CCG	2	6	54951	54956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275494
1075	NC_009426	CGG	2	6	55015	55020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275494
1076	NC_009426	CAT	2	6	55084	55089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275494
1077	NC_009426	ACA	2	6	55119	55124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146275494
1078	NC_009426	AGC	2	6	55211	55216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275494
1079	NC_009426	CCGG	2	8	55277	55284	0 %	0 %	50 %	50 %	146275494
1080	NC_009426	CG	3	6	55293	55298	0 %	0 %	50 %	50 %	146275494
1081	NC_009426	CAG	2	6	55313	55318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275494
1082	NC_009426	GGC	2	6	55328	55333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275494
1083	NC_009426	CGC	2	6	55397	55402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275494
1084	NC_009426	CGC	2	6	55417	55422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275494
1085	NC_009426	CGA	2	6	55605	55610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275495
1086	NC_009426	GCC	2	6	55626	55631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275495
1087	NC_009426	AGA	2	6	55644	55649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275495
1088	NC_009426	AGGCC	2	10	55731	55740	20 %	0 %	40 %	40 %	146275495
1089	NC_009426	ATC	2	6	55741	55746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275495
1090	NC_009426	CGG	2	6	55794	55799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275495
1091	NC_009426	CG	3	6	55903	55908	0 %	0 %	50 %	50 %	146275495
1092	NC_009426	ATG	2	6	55942	55947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275495
1093	NC_009426	CGC	2	6	56040	56045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275495
1094	NC_009426	CCG	2	6	56052	56057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275495
1095	NC_009426	GCG	2	6	56072	56077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275495
1096	NC_009426	GCT	2	6	56094	56099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275495
1097	NC_009426	CGGC	2	8	56240	56247	0 %	0 %	50 %	50 %	146275495
1098	NC_009426	ACG	2	6	56249	56254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275495
1099	NC_009426	TC	3	6	56331	56336	0 %	50 %	0 %	50 %	146275495
1100	NC_009426	CGA	2	6	56451	56456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275495
1101	NC_009426	GTC	2	6	56476	56481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275495
1102	NC_009426	CGC	2	6	56493	56498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275495
1103	NC_009426	GGC	2	6	56607	56612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275495
1104	NC_009426	CAGT	2	8	56614	56621	25 %	25 %	25 %	25 %	146275496
1105	NC_009426	GAA	2	6	56707	56712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275496
1106	NC_009426	GAA	2	6	56791	56796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275496
1107	NC_009426	TGA	2	6	56862	56867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275496
1108	NC_009426	AGCA	2	8	56879	56886	50 %	0 %	25 %	25 %	146275496
1109	NC_009426	GGC	2	6	56986	56991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275496
1110	NC_009426	CAT	2	6	57052	57057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275496
1111	NC_009426	CCG	2	6	57095	57100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275496
1112	NC_009426	TGC	2	6	57125	57130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275496
1113	NC_009426	CGG	2	6	57197	57202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275496
1114	NC_009426	GCC	2	6	57255	57260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275496
1115	NC_009426	TTC	2	6	57277	57282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146275496
1116	NC_009426	GTA	2	6	57359	57364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275496
1117	NC_009426	AGGA	2	8	57481	57488	50 %	0 %	50 %	0 %	146275496
1118	NC_009426	AGC	2	6	57515	57520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275496
1119	NC_009426	GC	3	6	57519	57524	0 %	0 %	50 %	50 %	146275496
1120	NC_009426	GCC	2	6	57527	57532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275496
1121	NC_009426	CAG	2	6	57601	57606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275496
1122	NC_009426	TCC	2	6	57615	57620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146275496
1123	NC_009426	ATC	2	6	57788	57793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275496
1124	NC_009426	CAT	2	6	57796	57801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275496
1125	NC_009426	CCA	2	6	57904	57909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1127	NC_009426	GA	3	6	58047	58052	50 %	0 %	50 %	0 %	146275497
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1253	NC_009426	AGGT	2	8	63913	63920	25 %	25 %	50 %	0 %	146275503
1254	NC_009426	GCC	2	6	63976	63981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275503
1255	NC_009426	GGCA	2	8	63999	64006	25 %	0 %	50 %	25 %	146275503
1256	NC_009426	GCC	2	6	64154	64159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275504
1257	NC_009426	CCG	2	6	64192	64197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275504
1258	NC_009426	CAG	2	6	64378	64383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275504
1259	NC_009426	GAC	2	6	64390	64395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275504
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1261	NC_009426	ACG	2	6	64482	64487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275504
1262	NC_009426	ATGGAC	2	12	64519	64530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146275504
1263	NC_009426	GCTC	2	8	64596	64603	0 %	25 %	25 %	50 %	146275504
1264	NC_009426	GCC	2	6	64702	64707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275504
1265	NC_009426	CCTT	2	8	64745	64752	0 %	50 %	0 %	50 %	146275504
1266	NC_009426	GC	3	6	64776	64781	0 %	0 %	50 %	50 %	146275504
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1270	NC_009426	GC	3	6	64984	64989	0 %	0 %	50 %	50 %	146275504
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1272	NC_009426	GC	3	6	65014	65019	0 %	0 %	50 %	50 %	146275504
1273	NC_009426	CCG	2	6	65027	65032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275504
1274	NC_009426	CCG	2	6	65048	65053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275504
1275	NC_009426	CTTT	2	8	65155	65162	0 %	75 %	0 %	25 %	146275505
1276	NC_009426	CGG	2	6	65183	65188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275505
1277	NC_009426	GCTGA	2	10	65315	65324	20 %	20 %	40 %	20 %	146275505
1278	NC_009426	TCC	2	6	65343	65348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146275505
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1280	NC_009426	GCC	2	6	65441	65446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275505
1281	NC_009426	TCG	2	6	65457	65462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275505
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1283	NC_009426	GGC	2	6	65587	65592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275505
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1285	NC_009426	TCG	3	9	65694	65702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275505
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1299	NC_009426	GCC	2	6	66692	66697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275506
1300	NC_009426	CG	3	6	66706	66711	0 %	0 %	50 %	50 %	146275506
1301	NC_009426	GGTT	2	8	66777	66784	0 %	50 %	50 %	0 %	146275506
1302	NC_009426	GCG	2	6	66888	66893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275506
1303	NC_009426	GAG	2	6	66898	66903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146275506
1304	NC_009426	CGG	2	6	66944	66949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275506
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1310	NC_009426	TCG	2	6	67218	67223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275506
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1312	NC_009426	GCC	2	6	67294	67299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275506
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1316	NC_009426	GCC	2	6	67402	67407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275506
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1323	NC_009426	CGAG	2	8	67629	67636	25 %	0 %	50 %	25 %	146275506
1324	NC_009426	AGC	2	6	67652	67657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275506
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1327	NC_009426	AGG	2	6	67748	67753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146275506
1328	NC_009426	CAG	2	6	67813	67818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275506
1329	NC_009426	ACA	2	6	67940	67945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146275506
1330	NC_009426	GCCA	2	8	67964	67971	25 %	0 %	25 %	50 %	146275506
1331	NC_009426	GTA	2	6	67978	67983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146275506
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1340	NC_009426	CAT	2	6	68473	68478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146275506
1341	NC_009426	CG	3	6	68495	68500	0 %	0 %	50 %	50 %	146275506
1342	NC_009426	CAG	2	6	68518	68523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275506
1343	NC_009426	AGC	2	6	68578	68583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275506
1344	NC_009426	CGG	2	6	68649	68654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275506
1345	NC_009426	AC	3	6	68784	68789	50 %	0 %	0 %	50 %	146275506
1346	NC_009426	GGC	2	6	68830	68835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1347	NC_009426	GCC	2	6	68852	68857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1348	NC_009426	CGC	2	6	69045	69050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275507
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1351	NC_009426	TGT	2	6	69138	69143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146275507
1352	NC_009426	CCG	2	6	69156	69161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275507
1353	NC_009426	GCA	2	6	69165	69170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275507
1354	NC_009426	GGT	2	6	69184	69189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146275507
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1356	NC_009426	CGA	2	6	69225	69230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275507
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1358	NC_009426	GGC	2	6	69352	69357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275507
1359	NC_009426	CCGA	2	8	69374	69381	25 %	0 %	25 %	50 %	146275507
1360	NC_009426	GAG	2	6	69404	69409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146275507
1361	NC_009426	TGC	2	6	69438	69443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275507
1362	NC_009426	CGT	2	6	69495	69500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275507
1363	NC_009426	GTT	2	6	69517	69522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146275507
1364	NC_009426	GAA	2	6	69562	69567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275507
1365	NC_009426	GGC	3	9	69618	69626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275507
1366	NC_009426	GTG	2	6	69740	69745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146275507
1367	NC_009426	CCG	2	6	69795	69800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275507
1368	NC_009426	GCG	2	6	69804	69809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275507
1369	NC_009426	CG	3	6	69888	69893	0 %	0 %	50 %	50 %	146275507
1370	NC_009426	CGC	2	6	69927	69932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146275507
1371	NC_009426	TTGA	2	8	69995	70002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1372	NC_009426	ACG	2	6	70040	70045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146275508
1373	NC_009426	CG	4	8	70044	70051	0 %	0 %	50 %	50 %	146275508
1374	NC_009426	CTG	2	6	70067	70072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275508
1375	NC_009426	AGA	2	6	70176	70181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146275508
1376	NC_009426	TCCA	2	8	70256	70263	25 %	25 %	0 %	50 %	146275508
1377	NC_009426	GCT	2	6	70293	70298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146275508
1378	NC_009426	GCG	2	6	70354	70359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275508
1379	NC_009426	CGG	2	6	70467	70472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275508
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1383	NC_009426	GGC	2	6	70655	70660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146275509
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