MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis FAM18 chromosome

Total Repeats: 1554

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008767	CTTGC	2	10	3237	3246	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008767	ATTTC	2	10	3520	3529	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008767	AGGCG	2	10	5742	5751	20 %	0 %	60 %	20 %	121633906
4	NC_008767	AGGGC	2	10	7864	7873	20 %	0 %	60 %	20 %	121633907
5	NC_008767	AAACC	2	10	8567	8576	60 %	0 %	0 %	40 %	121633908
6	NC_008767	CAAAC	2	10	10687	10696	60 %	0 %	0 %	40 %	121633909
7	NC_008767	TCCGC	2	10	12018	12027	0 %	20 %	20 %	60 %	121633910
8	NC_008767	GCGGT	2	10	13723	13732	0 %	20 %	60 %	20 %	121633912
9	NC_008767	GCCTT	2	10	14851	14860	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008767	CATTC	2	10	16602	16611	20 %	40 %	0 %	40 %	121633914
11	NC_008767	AGGTG	2	10	17050	17059	20 %	20 %	60 %	0 %	121633915
12	NC_008767	GTCGG	2	10	17739	17748	0 %	20 %	60 %	20 %	121633915
13	NC_008767	GGGCT	2	10	19713	19722	0 %	20 %	60 %	20 %	121633917
14	NC_008767	GGCGG	2	10	23212	23221	0 %	0 %	80 %	20 %	121633920
15	NC_008767	GCGGT	2	10	23687	23696	0 %	20 %	60 %	20 %	121633921
16	NC_008767	GCGCG	2	10	24084	24093	0 %	0 %	60 %	40 %	121633921
17	NC_008767	ACGGC	2	10	24629	24638	20 %	0 %	40 %	40 %	121633921
18	NC_008767	TAATG	2	10	26503	26512	40 %	40 %	20 %	0 %	121633922
19	NC_008767	GGCGG	2	10	28451	28460	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008767	AACAT	2	10	30201	30210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008767	TAATT	2	10	30222	30231	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008767	GAATT	2	10	30252	30261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008767	CCCGT	2	10	34367	34376	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_008767	CGGCG	2	10	34706	34715	0 %	0 %	60 %	40 %	121633931
25	NC_008767	GAAAA	2	10	35588	35597	80 %	0 %	20 %	0 %	121633931
26	NC_008767	GAACG	2	10	36237	36246	40 %	0 %	40 %	20 %	121633931
27	NC_008767	TTTGA	2	10	36678	36687	20 %	60 %	20 %	0 %	121633931
28	NC_008767	GAAAA	2	10	37338	37347	80 %	0 %	20 %	0 %	121633931
29	NC_008767	CAATT	2	10	37682	37691	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008767	GTTGG	2	10	39576	39585	0 %	40 %	60 %	0 %	121633932
31	NC_008767	AAACC	2	10	41966	41975	60 %	0 %	0 %	40 %	121633933
32	NC_008767	CCCGC	2	10	42463	42472	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_008767	AGGCG	2	10	44074	44083	20 %	0 %	60 %	20 %	121633935
34	NC_008767	GTGCG	2	10	44317	44326	0 %	20 %	60 %	20 %	121633935
35	NC_008767	TCGTG	2	10	47708	47717	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008767	AGAAA	2	10	48669	48678	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008767	GGGAG	2	10	49333	49342	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008767	AGGTT	2	10	50275	50284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008767	ATTTT	2	10	52689	52698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008767	TGCCG	2	10	54741	54750	0 %	20 %	40 %	40 %	121633942
41	NC_008767	TGGCT	2	10	55070	55079	0 %	40 %	40 %	20 %	121633942
42	NC_008767	TGCCC	2	10	55677	55686	0 %	20 %	20 %	60 %	121633942
43	NC_008767	GCGTA	2	10	57796	57805	20 %	20 %	40 %	20 %	121633945
44	NC_008767	TCGGC	2	10	59553	59562	0 %	20 %	40 %	40 %	121633946
45	NC_008767	TGCTA	2	10	60962	60971	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008767	ACATA	2	10	63730	63739	60 %	20 %	0 %	20 %	121633948
47	NC_008767	AAGCA	2	10	64704	64713	60 %	0 %	20 %	20 %	121633949
48	NC_008767	TTTAA	2	10	64954	64963	40 %	60 %	0 %	0 %	121633949
49	NC_008767	GATTT	2	10	66867	66876	20 %	60 %	20 %	0 %	121633951
50	NC_008767	TGTAT	2	10	68269	68278	20 %	60 %	20 %	0 %	121633952
51	NC_008767	AAAAG	2	10	68453	68462	80 %	0 %	20 %	0 %	121633953
52	NC_008767	TTTGA	2	10	69076	69085	20 %	60 %	20 %	0 %	121633953
53	NC_008767	TGGCT	2	10	70009	70018	0 %	40 %	40 %	20 %	121633954
54	NC_008767	GCAAG	2	10	71290	71299	40 %	0 %	40 %	20 %	121633956
55	NC_008767	GCGCG	2	10	72349	72358	0 %	0 %	60 %	40 %	121633956
56	NC_008767	CAACG	2	10	73271	73280	40 %	0 %	20 %	40 %	121633956
57	NC_008767	TTGAT	2	10	73584	73593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008767	TTTCC	2	10	73905	73914	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_008767	ATTTT	2	10	74254	74263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008767	TACGC	2	10	76416	76425	20 %	20 %	20 %	40 %	121633957
61	NC_008767	CCCGT	2	10	79501	79510	0 %	20 %	20 %	60 %	121633960
62	NC_008767	CCGTA	2	10	79738	79747	20 %	20 %	20 %	40 %	121633960
63	NC_008767	ACATC	2	10	80639	80648	40 %	20 %	0 %	40 %	121633961
64	NC_008767	GGCAA	2	10	81896	81905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008767	CGCAA	2	10	82350	82359	40 %	0 %	20 %	40 %	121633962
66	NC_008767	ACCGC	2	10	88639	88648	20 %	0 %	20 %	60 %	121633967
67	NC_008767	AAACC	2	10	89081	89090	60 %	0 %	0 %	40 %	121633967
68	NC_008767	ACCAA	2	10	90405	90414	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_008767	ATTTA	2	10	91227	91236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008767	AAATA	2	10	91237	91246	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008767	ATTAA	2	10	91262	91271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008767	CAGGT	2	10	92843	92852	20 %	20 %	40 %	20 %	121633974
73	NC_008767	TTTGA	2	10	93553	93562	20 %	60 %	20 %	0 %	121633974
74	NC_008767	AATGA	2	10	94260	94269	60 %	20 %	20 %	0 %	121633975
75	NC_008767	GAACA	2	10	96145	96154	60 %	0 %	20 %	20 %	121633975
76	NC_008767	CAAAC	2	10	97226	97235	60 %	0 %	0 %	40 %	121633976
77	NC_008767	CGTGC	2	10	98685	98694	0 %	20 %	40 %	40 %	121633978
78	NC_008767	GCCGC	2	10	99856	99865	0 %	0 %	40 %	60 %	121633979
79	NC_008767	AATTG	2	10	100641	100650	40 %	40 %	20 %	0 %	121633981
80	NC_008767	AAAAT	2	10	100902	100911	80 %	20 %	0 %	0 %	121633981
81	NC_008767	CGGCG	2	10	102746	102755	0 %	0 %	60 %	40 %	121633984
82	NC_008767	CAGGT	2	10	104212	104221	20 %	20 %	40 %	20 %	121633986
83	NC_008767	CGCCT	2	10	104898	104907	0 %	20 %	20 %	60 %	121633987
84	NC_008767	GGTAT	2	10	105138	105147	20 %	40 %	40 %	0 %	121633987
85	NC_008767	GGCGC	2	10	105389	105398	0 %	0 %	60 %	40 %	121633987
86	NC_008767	TGCCG	2	10	106512	106521	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_008767	CCGCC	2	10	106722	106731	0 %	0 %	20 %	80 %	121633989
88	NC_008767	TGGCG	2	10	106934	106943	0 %	20 %	60 %	20 %	121633989
89	NC_008767	CAAAG	2	10	107144	107153	60 %	0 %	20 %	20 %	121633989
90	NC_008767	GCGCC	2	10	108351	108360	0 %	0 %	40 %	60 %	121633990
91	NC_008767	GGCGC	2	10	108580	108589	0 %	0 %	60 %	40 %	121633990
92	NC_008767	TGAGT	2	10	110194	110203	20 %	40 %	40 %	0 %	121633992
93	NC_008767	CGGCG	2	10	110698	110707	0 %	0 %	60 %	40 %	121633992
94	NC_008767	GGCAA	2	10	110771	110780	40 %	0 %	40 %	20 %	121633992
95	NC_008767	CGGCG	2	10	112538	112547	0 %	0 %	60 %	40 %	121633993
96	NC_008767	GTTTT	2	10	113211	113220	0 %	80 %	20 %	0 %	121633994
97	NC_008767	CGTGT	2	10	114981	114990	0 %	40 %	40 %	20 %	121633996
98	NC_008767	GAAAA	2	10	115395	115404	80 %	0 %	20 %	0 %	121633996
99	NC_008767	AGGGC	2	10	115532	115541	20 %	0 %	60 %	20 %	121633996
100	NC_008767	TAATA	2	10	118250	118259	60 %	40 %	0 %	0 %	121633998
101	NC_008767	GAAGG	2	10	121888	121897	40 %	0 %	60 %	0 %	121634003
102	NC_008767	GTACC	2	10	123459	123468	20 %	20 %	20 %	40 %	121634006
103	NC_008767	TTGGG	2	10	128490	128499	0 %	40 %	60 %	0 %	121634009
104	NC_008767	CATAC	2	10	130966	130975	40 %	20 %	0 %	40 %	121634010
105	NC_008767	GTGAT	2	10	131845	131854	20 %	40 %	40 %	0 %	121634010
106	NC_008767	TTTCC	2	10	133612	133621	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_008767	CCTGC	2	10	136580	136589	0 %	20 %	20 %	60 %	121634013
108	NC_008767	CAAAC	2	10	138824	138833	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_008767	CTTTA	2	10	139451	139460	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008767	TGATT	2	10	142245	142254	20 %	60 %	20 %	0 %	121634021
111	NC_008767	AATGC	2	10	142939	142948	40 %	20 %	20 %	20 %	121634022
112	NC_008767	GTAAA	2	10	143890	143899	60 %	20 %	20 %	0 %	121634025
113	NC_008767	AATTT	2	10	144114	144123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008767	TCAAA	2	10	144962	144971	60 %	20 %	0 %	20 %	121634027
115	NC_008767	TTTGG	2	10	145773	145782	0 %	60 %	40 %	0 %	121634029
116	NC_008767	GAAAT	2	10	149619	149628	60 %	20 %	20 %	0 %	121634036
117	NC_008767	AAAAT	2	10	149881	149890	80 %	20 %	0 %	0 %	121634038
118	NC_008767	GGGTT	2	10	151368	151377	0 %	40 %	60 %	0 %	121634041
119	NC_008767	GTCAT	2	10	151890	151899	20 %	40 %	20 %	20 %	121634042
120	NC_008767	GCAAA	2	10	154262	154271	60 %	0 %	20 %	20 %	121634045
121	NC_008767	CGGTT	2	10	154292	154301	0 %	40 %	40 %	20 %	121634045
122	NC_008767	TGGCG	2	10	157805	157814	0 %	20 %	60 %	20 %	121634048
123	NC_008767	TGGTT	2	10	158779	158788	0 %	60 %	40 %	0 %	121634048
124	NC_008767	CGGCG	2	10	159332	159341	0 %	0 %	60 %	40 %	121634049
125	NC_008767	CCAAA	2	10	159721	159730	60 %	0 %	0 %	40 %	121634049
126	NC_008767	TTTAT	2	10	159928	159937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008767	TGGTT	2	10	160624	160633	0 %	60 %	40 %	0 %	121634050
128	NC_008767	TGCCG	2	10	161330	161339	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_008767	GCCGC	2	10	161724	161733	0 %	0 %	40 %	60 %	121634051
130	NC_008767	TCTGC	2	10	163276	163285	0 %	40 %	20 %	40 %	121634052
131	NC_008767	GCTCG	2	10	169232	169241	0 %	20 %	40 %	40 %	121634057
132	NC_008767	GCCGT	2	10	171735	171744	0 %	20 %	40 %	40 %	121634059
133	NC_008767	ACCAA	2	10	172577	172586	60 %	0 %	0 %	40 %	121634060
134	NC_008767	TGCCG	2	10	175153	175162	0 %	20 %	40 %	40 %	121634063
135	NC_008767	GTTGC	2	10	175468	175477	0 %	40 %	40 %	20 %	121634063
136	NC_008767	TGGCG	2	10	175892	175901	0 %	20 %	60 %	20 %	121634064
137	NC_008767	GTTTG	2	10	175916	175925	0 %	60 %	40 %	0 %	121634064
138	NC_008767	TAAAA	2	10	177883	177892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_008767	CTGCC	2	10	215407	215416	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
161	NC_008767	CGTGC	2	10	219844	219853	0 %	20 %	40 %	40 %	121634093
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257	NC_008767	ATAAA	2	10	371122	371131	80 %	20 %	0 %	0 %	121634230
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259	NC_008767	AATTG	2	10	376704	376713	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
260	NC_008767	TTTTC	2	10	377047	377056	0 %	80 %	0 %	20 %	121634237
261	NC_008767	TCAAA	2	10	377707	377716	60 %	20 %	0 %	20 %	121634237
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263	NC_008767	GGGAA	2	10	382021	382030	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
264	NC_008767	TGGAT	2	10	382442	382451	20 %	40 %	40 %	0 %	121634239
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266	NC_008767	GGATA	2	10	385422	385431	40 %	20 %	40 %	0 %	121634243
267	NC_008767	CGTTG	2	10	387392	387401	0 %	40 %	40 %	20 %	121634244
268	NC_008767	AAAAT	2	10	388804	388813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_008767	TGCCT	2	10	390149	390158	0 %	40 %	20 %	40 %	121634246
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