MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nocardioides sp. JS614 chromosome

Total Repeats: 4843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008699	GAGCG	2	10	552	561	20 %	0 %	60 %	20 %	119714273
2	NC_008699	TGGAG	2	10	2651	2660	20 %	20 %	60 %	0 %	119714274
3	NC_008699	GCCGC	2	10	3234	3243	0 %	0 %	40 %	60 %	119714274
4	NC_008699	GGGCC	2	10	5685	5694	0 %	0 %	60 %	40 %	119714277
5	NC_008699	CGACG	2	10	5733	5742	20 %	0 %	40 %	40 %	119714277
6	NC_008699	CCGCG	2	10	7452	7461	0 %	0 %	40 %	60 %	119714278
7	NC_008699	GCGCG	2	10	10233	10242	0 %	0 %	60 %	40 %	119714279
8	NC_008699	AGCCC	2	10	12218	12227	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_008699	CCGAA	2	10	12508	12517	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008699	CGGCA	2	10	13299	13308	20 %	0 %	40 %	40 %	119714281
11	NC_008699	GGTCG	2	10	15861	15870	0 %	20 %	60 %	20 %	119714284
12	NC_008699	CCGGT	2	10	17067	17076	0 %	20 %	40 %	40 %	119714286
13	NC_008699	GCCGG	2	10	17686	17695	0 %	0 %	60 %	40 %	119714287
14	NC_008699	CCCGG	2	10	18091	18100	0 %	0 %	40 %	60 %	119714287
15	NC_008699	TGGGC	2	10	18733	18742	0 %	20 %	60 %	20 %	119714288
16	NC_008699	CGGCG	2	10	18743	18752	0 %	0 %	60 %	40 %	119714288
17	NC_008699	CCGGC	2	10	19132	19141	0 %	0 %	40 %	60 %	119714288
18	NC_008699	CCGTG	2	10	19377	19386	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008699	CTGGC	2	10	20244	20253	0 %	20 %	40 %	40 %	119714290
20	NC_008699	GTCGC	2	10	21025	21034	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008699	ACCGG	2	10	21934	21943	20 %	0 %	40 %	40 %	119714291
22	NC_008699	GTCCG	2	10	22918	22927	0 %	20 %	40 %	40 %	119714293
23	NC_008699	TGCGC	2	10	22930	22939	0 %	20 %	40 %	40 %	119714293
24	NC_008699	CACCG	2	10	23632	23641	20 %	0 %	20 %	60 %	119714293
25	NC_008699	GTCGC	2	10	25303	25312	0 %	20 %	40 %	40 %	119714294
26	NC_008699	CCGGG	2	10	25948	25957	0 %	0 %	60 %	40 %	119714295
27	NC_008699	GGGTC	2	10	27756	27765	0 %	20 %	60 %	20 %	119714296
28	NC_008699	CCGAG	2	10	27795	27804	20 %	0 %	40 %	40 %	119714296
29	NC_008699	GCTGG	2	10	27871	27880	0 %	20 %	60 %	20 %	119714296
30	NC_008699	CGCGC	2	10	28207	28216	0 %	0 %	40 %	60 %	119714296
31	NC_008699	GCGCG	2	10	30116	30125	0 %	0 %	60 %	40 %	119714298
32	NC_008699	TGCGG	2	10	30586	30595	0 %	20 %	60 %	20 %	119714298
33	NC_008699	GCCGC	2	10	30942	30951	0 %	0 %	40 %	60 %	119714298
34	NC_008699	CCGGG	2	10	31990	31999	0 %	0 %	60 %	40 %	119714300
35	NC_008699	CGGGC	2	10	32960	32969	0 %	0 %	60 %	40 %	119714301
36	NC_008699	GCTGG	2	10	34994	35003	0 %	20 %	60 %	20 %	119714303
37	NC_008699	TCCGG	2	10	35026	35035	0 %	20 %	40 %	40 %	119714303
38	NC_008699	CGGTG	2	10	35719	35728	0 %	20 %	60 %	20 %	119714304
39	NC_008699	CGAGG	2	10	36011	36020	20 %	0 %	60 %	20 %	119714304
40	NC_008699	ATCGG	2	10	38144	38153	20 %	20 %	40 %	20 %	119714306
41	NC_008699	CGTTC	2	10	38428	38437	0 %	40 %	20 %	40 %	119714306
42	NC_008699	CGGGA	2	10	38825	38834	20 %	0 %	60 %	20 %	119714306
43	NC_008699	CCGGG	2	10	40400	40409	0 %	0 %	60 %	40 %	119714308
44	NC_008699	CAGCG	2	10	40640	40649	20 %	0 %	40 %	40 %	119714308
45	NC_008699	CCGGG	2	10	40999	41008	0 %	0 %	60 %	40 %	119714308
46	NC_008699	CCACC	2	10	41649	41658	20 %	0 %	0 %	80 %	119714309
47	NC_008699	CGAGG	2	10	42336	42345	20 %	0 %	60 %	20 %	119714309
48	NC_008699	CCGGC	2	10	44223	44232	0 %	0 %	40 %	60 %	119714311
49	NC_008699	CCGCG	2	10	44766	44775	0 %	0 %	40 %	60 %	119714311
50	NC_008699	CGCGG	2	10	46722	46731	0 %	0 %	60 %	40 %	119714313
51	NC_008699	GGTCC	2	10	49184	49193	0 %	20 %	40 %	40 %	119714315
52	NC_008699	CGGCC	2	10	50540	50549	0 %	0 %	40 %	60 %	119714316
53	NC_008699	CCGCG	2	10	51628	51637	0 %	0 %	40 %	60 %	119714317
54	NC_008699	GGGTG	2	10	53060	53069	0 %	20 %	80 %	0 %	119714319
55	NC_008699	GCGCG	2	10	53240	53249	0 %	0 %	60 %	40 %	119714319
56	NC_008699	AGCCC	2	10	53759	53768	20 %	0 %	20 %	60 %	119714319
57	NC_008699	GCCGG	2	10	53784	53793	0 %	0 %	60 %	40 %	119714319
58	NC_008699	TCGCG	2	10	56837	56846	0 %	20 %	40 %	40 %	119714321
59	NC_008699	CGGCG	2	10	56957	56966	0 %	0 %	60 %	40 %	119714321
60	NC_008699	CAAAG	2	10	57338	57347	60 %	0 %	20 %	20 %	119714321
61	NC_008699	GGCCG	2	10	57947	57956	0 %	0 %	60 %	40 %	119714321
62	NC_008699	CTCCG	2	10	57969	57978	0 %	20 %	20 %	60 %	119714321
63	NC_008699	GTGAA	2	10	58128	58137	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008699	GGTGT	2	10	58234	58243	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008699	CGGGT	2	10	58388	58397	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_008699	CGGCG	2	10	59142	59151	0 %	0 %	60 %	40 %	119714322
67	NC_008699	CGTGG	2	10	63846	63855	0 %	20 %	60 %	20 %	119714327
68	NC_008699	CCTCG	2	10	64075	64084	0 %	20 %	20 %	60 %	119714328
69	NC_008699	CGGTT	2	10	67327	67336	0 %	40 %	40 %	20 %	119714330
70	NC_008699	CCAGC	2	10	69225	69234	20 %	0 %	20 %	60 %	119714332
71	NC_008699	GACCG	2	10	70253	70262	20 %	0 %	40 %	40 %	119714333
72	NC_008699	CACCG	2	10	72047	72056	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_008699	GCTCA	2	10	74608	74617	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_008699	CGGCT	2	10	75053	75062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_008699	GTGCC	2	10	75150	75159	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_008699	CGCTC	2	10	77957	77966	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_008699	CACGC	2	10	79040	79049	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_008699	GTCTC	2	10	81242	81251	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_008699	GACGG	2	10	81847	81856	20 %	0 %	60 %	20 %	119714340
80	NC_008699	TCGGG	2	10	82069	82078	0 %	20 %	60 %	20 %	119714340
81	NC_008699	CGTGG	2	10	82676	82685	0 %	20 %	60 %	20 %	119714341
82	NC_008699	GCCGC	2	10	84328	84337	0 %	0 %	40 %	60 %	119714343
83	NC_008699	GCTGC	2	10	84396	84405	0 %	20 %	40 %	40 %	119714343
84	NC_008699	GCAGC	2	10	86245	86254	20 %	0 %	40 %	40 %	119714345
85	NC_008699	TCTGC	2	10	86918	86927	0 %	40 %	20 %	40 %	119714345
86	NC_008699	CGCGC	2	10	87606	87615	0 %	0 %	40 %	60 %	119714346
87	NC_008699	CGGCG	2	10	87880	87889	0 %	0 %	60 %	40 %	119714346
88	NC_008699	CCGGC	2	10	88931	88940	0 %	0 %	40 %	60 %	119714347
89	NC_008699	CGCGG	2	10	93575	93584	0 %	0 %	60 %	40 %	119714350
90	NC_008699	CGGCG	2	10	94944	94953	0 %	0 %	60 %	40 %	119714352
91	NC_008699	CGGCA	2	10	95080	95089	20 %	0 %	40 %	40 %	119714352
92	NC_008699	ACCGG	2	10	95096	95105	20 %	0 %	40 %	40 %	119714352
93	NC_008699	GGTGG	2	10	95368	95377	0 %	20 %	80 %	0 %	119714352
94	NC_008699	GGCCG	2	10	100913	100922	0 %	0 %	60 %	40 %	119714357
95	NC_008699	CGCGC	2	10	103155	103164	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_008699	CCTGG	2	10	105071	105080	0 %	20 %	40 %	40 %	119714360
97	NC_008699	CGACC	2	10	106035	106044	20 %	0 %	20 %	60 %	119714361
98	NC_008699	CGCGG	2	10	107799	107808	0 %	0 %	60 %	40 %	119714363
99	NC_008699	CCAGG	2	10	109125	109134	20 %	0 %	40 %	40 %	119714364
100	NC_008699	GCCGC	2	10	109202	109211	0 %	0 %	40 %	60 %	119714364
101	NC_008699	CGCGC	2	10	114444	114453	0 %	0 %	40 %	60 %	119714367
102	NC_008699	CGCGG	2	10	116439	116448	0 %	0 %	60 %	40 %	119714369
103	NC_008699	CGGGC	2	10	118069	118078	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_008699	AGGCG	2	10	118140	118149	20 %	0 %	60 %	20 %	119714372
105	NC_008699	CGGCC	2	10	119633	119642	0 %	0 %	40 %	60 %	119714373
106	NC_008699	CCTGG	2	10	120592	120601	0 %	20 %	40 %	40 %	119714374
107	NC_008699	CGGGC	2	10	121904	121913	0 %	0 %	60 %	40 %	119714376
108	NC_008699	CCGGC	2	10	121949	121958	0 %	0 %	40 %	60 %	119714376
109	NC_008699	ACGGC	2	10	122293	122302	20 %	0 %	40 %	40 %	119714376
110	NC_008699	GACCC	2	10	124220	124229	20 %	0 %	20 %	60 %	119714376
111	NC_008699	CGGAC	2	10	124815	124824	20 %	0 %	40 %	40 %	119714377
112	NC_008699	GGGTC	2	10	128205	128214	0 %	20 %	60 %	20 %	119714381
113	NC_008699	GGCCG	2	10	128992	129001	0 %	0 %	60 %	40 %	119714381
114	NC_008699	CCGGC	2	10	129530	129539	0 %	0 %	40 %	60 %	119714382
115	NC_008699	GCGCC	2	10	130022	130031	0 %	0 %	40 %	60 %	119714383
116	NC_008699	GCCGA	2	10	130324	130333	20 %	0 %	40 %	40 %	119714383
117	NC_008699	GGCCG	2	10	131012	131021	0 %	0 %	60 %	40 %	119714384
118	NC_008699	AGCGC	2	10	131070	131079	20 %	0 %	40 %	40 %	119714384
119	NC_008699	TCCGC	2	10	132364	132373	0 %	20 %	20 %	60 %	119714386
120	NC_008699	GGCCG	2	10	132546	132555	0 %	0 %	60 %	40 %	119714386
121	NC_008699	GCTGC	2	10	132842	132851	0 %	20 %	40 %	40 %	119714386
122	NC_008699	CCGCC	2	10	135368	135377	0 %	0 %	20 %	80 %	119714389
123	NC_008699	ACCCG	2	10	136346	136355	20 %	0 %	20 %	60 %	119714389
124	NC_008699	CTCGG	2	10	137818	137827	0 %	20 %	40 %	40 %	119714391
125	NC_008699	GACAG	2	10	140695	140704	40 %	0 %	40 %	20 %	119714394
126	NC_008699	GCCGC	2	10	141533	141542	0 %	0 %	40 %	60 %	119714395
127	NC_008699	TCGCC	2	10	142295	142304	0 %	20 %	20 %	60 %	119714396
128	NC_008699	CGCTG	2	10	143129	143138	0 %	20 %	40 %	40 %	119714397
129	NC_008699	CCCGG	2	10	143270	143279	0 %	0 %	40 %	60 %	119714397
130	NC_008699	CGGCG	2	10	145634	145643	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008699	GGCCC	2	10	148037	148046	0 %	0 %	40 %	60 %	119714400
132	NC_008699	GCCGG	2	10	148640	148649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_008699	CGGAT	2	10	148709	148718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008699	GGCCG	2	10	149426	149435	0 %	0 %	60 %	40 %	119714402
135	NC_008699	CCGGC	2	10	152233	152242	0 %	0 %	40 %	60 %	119714405
136	NC_008699	CGGAC	2	10	152525	152534	20 %	0 %	40 %	40 %	119714405
137	NC_008699	CCCAG	2	10	152590	152599	20 %	0 %	20 %	60 %	119714405
138	NC_008699	CCCAG	2	10	152602	152611	20 %	0 %	20 %	60 %	119714405
139	NC_008699	GCCGA	2	10	152625	152634	20 %	0 %	40 %	40 %	119714405
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246	NC_008699	CGGGA	2	10	274071	274080	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
247	NC_008699	GTCGA	2	10	279540	279549	20 %	20 %	40 %	20 %	119714527
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249	NC_008699	CGGCC	2	10	282790	282799	0 %	0 %	40 %	60 %	119714530
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253	NC_008699	GCACC	2	10	285959	285968	20 %	0 %	20 %	60 %	119714534
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265	NC_008699	CGGCT	2	10	294359	294368	0 %	20 %	40 %	40 %	119714538
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