MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 chromosome

Total Repeats: 7899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008344	TTTA	2	8	515	522	25 %	75 %	0 %	0 %	114330037
2	NC_008344	ATGC	2	8	554	561	25 %	25 %	25 %	25 %	114330037
3	NC_008344	AACT	2	8	1257	1264	50 %	25 %	0 %	25 %	114330037
4	NC_008344	GTAA	2	8	1550	1557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008344	AGTG	2	8	1669	1676	25 %	25 %	50 %	0 %	114330038
6	NC_008344	TGGA	2	8	2184	2191	25 %	25 %	50 %	0 %	114330038
7	NC_008344	ATTT	2	8	2466	2473	25 %	75 %	0 %	0 %	114330038
8	NC_008344	ATTA	2	8	2680	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	114330038
9	NC_008344	GCGG	2	8	3143	3150	0 %	0 %	75 %	25 %	114330039
10	NC_008344	TGAC	2	8	4329	4336	25 %	25 %	25 %	25 %	114330039
11	NC_008344	TGGA	2	8	4344	4351	25 %	25 %	50 %	0 %	114330039
12	NC_008344	ATTG	2	8	4402	4409	25 %	50 %	25 %	0 %	114330039
13	NC_008344	GGAT	2	8	4548	4555	25 %	25 %	50 %	0 %	114330039
14	NC_008344	TTGA	2	8	4640	4647	25 %	50 %	25 %	0 %	114330039
15	NC_008344	CATT	2	8	5181	5188	25 %	50 %	0 %	25 %	114330039
16	NC_008344	GTTT	2	8	5735	5742	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008344	TGGA	2	8	5841	5848	25 %	25 %	50 %	0 %	114330041
18	NC_008344	GGTT	2	8	5959	5966	0 %	50 %	50 %	0 %	114330041
19	NC_008344	GTTG	2	8	6367	6374	0 %	50 %	50 %	0 %	114330041
20	NC_008344	AGTT	2	8	6494	6501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008344	TCAA	2	8	6502	6509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008344	CCAC	2	8	6781	6788	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_008344	ACAA	2	8	7050	7057	75 %	0 %	0 %	25 %	114330042
24	NC_008344	AAGG	2	8	7259	7266	50 %	0 %	50 %	0 %	114330042
25	NC_008344	GCGT	2	8	7644	7651	0 %	25 %	50 %	25 %	114330042
26	NC_008344	GCTG	2	8	8458	8465	0 %	25 %	50 %	25 %	114330042
27	NC_008344	TGGC	2	8	8986	8993	0 %	25 %	50 %	25 %	114330043
28	NC_008344	AGGA	2	8	9005	9012	50 %	0 %	50 %	0 %	114330043
29	NC_008344	CAGA	2	8	10078	10085	50 %	0 %	25 %	25 %	114330044
30	NC_008344	GGCC	2	8	10774	10781	0 %	0 %	50 %	50 %	114330045
31	NC_008344	GCAT	2	8	11213	11220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008344	TGAC	2	8	11567	11574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008344	CGCC	2	8	12116	12123	0 %	0 %	25 %	75 %	114330046
34	NC_008344	CACC	2	8	12502	12509	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_008344	CTCA	2	8	13013	13020	25 %	25 %	0 %	50 %	114330047
36	NC_008344	AGCA	2	8	13789	13796	50 %	0 %	25 %	25 %	114330048
37	NC_008344	GGCT	2	8	14541	14548	0 %	25 %	50 %	25 %	114330049
38	NC_008344	AGGC	2	8	14743	14750	25 %	0 %	50 %	25 %	114330049
39	NC_008344	AAAC	2	8	15082	15089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008344	AGAC	2	8	15273	15280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008344	CCGT	2	8	16417	16424	0 %	25 %	25 %	50 %	114330050
42	NC_008344	TCAC	2	8	16766	16773	25 %	25 %	0 %	50 %	114330050
43	NC_008344	TTAA	2	8	17276	17283	50 %	50 %	0 %	0 %	114330050
44	NC_008344	CTCC	2	8	17423	17430	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_008344	AGCC	2	8	17538	17545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008344	TAAC	2	8	18456	18463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008344	TCCA	2	8	18660	18667	25 %	25 %	0 %	50 %	114330052
48	NC_008344	AACC	2	8	19695	19702	50 %	0 %	0 %	50 %	114330052
49	NC_008344	CCAT	2	8	19937	19944	25 %	25 %	0 %	50 %	114330052
50	NC_008344	TTTG	2	8	20255	20262	0 %	75 %	25 %	0 %	114330053
51	NC_008344	CGCC	2	8	20291	20298	0 %	0 %	25 %	75 %	114330053
52	NC_008344	CGTA	2	8	20667	20674	25 %	25 %	25 %	25 %	114330053
53	NC_008344	TGGA	2	8	21719	21726	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008344	CACC	2	8	22121	22128	25 %	0 %	0 %	75 %	114330055
55	NC_008344	TAAT	2	8	22309	22316	50 %	50 %	0 %	0 %	114330055
56	NC_008344	ATAA	2	8	22930	22937	75 %	25 %	0 %	0 %	114330055
57	NC_008344	TCCG	2	8	23452	23459	0 %	25 %	25 %	50 %	114330056
58	NC_008344	GAAG	2	8	23644	23651	50 %	0 %	50 %	0 %	114330056
59	NC_008344	TCCA	2	8	23657	23664	25 %	25 %	0 %	50 %	114330056
60	NC_008344	ATGG	2	8	23693	23700	25 %	25 %	50 %	0 %	114330056
61	NC_008344	TACC	2	8	23746	23753	25 %	25 %	0 %	50 %	114330056
62	NC_008344	CGGC	2	8	24129	24136	0 %	0 %	50 %	50 %	114330056
63	NC_008344	GTGG	2	8	24791	24798	0 %	25 %	75 %	0 %	114330056
64	NC_008344	CAGC	2	8	25052	25059	25 %	0 %	25 %	50 %	114330056
65	NC_008344	GACG	2	8	26163	26170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008344	CTAT	2	8	26410	26417	25 %	50 %	0 %	25 %	114330057
67	NC_008344	TGCC	2	8	26850	26857	0 %	25 %	25 %	50 %	114330057
68	NC_008344	ACCA	2	8	27041	27048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008344	CGAG	2	8	27078	27085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008344	AGTG	2	8	27755	27762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008344	TATG	2	8	27849	27856	25 %	50 %	25 %	0 %	114330059
72	NC_008344	TATT	2	8	27881	27888	25 %	75 %	0 %	0 %	114330059
73	NC_008344	TTGA	2	8	28069	28076	25 %	50 %	25 %	0 %	114330059
74	NC_008344	GGCT	2	8	28681	28688	0 %	25 %	50 %	25 %	114330060
75	NC_008344	TTCA	2	8	28795	28802	25 %	50 %	0 %	25 %	114330060
76	NC_008344	AGCA	2	8	28840	28847	50 %	0 %	25 %	25 %	114330060
77	NC_008344	GGCA	2	8	29346	29353	25 %	0 %	50 %	25 %	114330060
78	NC_008344	GCCA	2	8	30096	30103	25 %	0 %	25 %	50 %	114330060
79	NC_008344	GCTC	2	8	30399	30406	0 %	25 %	25 %	50 %	114330060
80	NC_008344	TTCT	2	8	31330	31337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008344	TGTA	2	8	31700	31707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008344	GTGG	2	8	32401	32408	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008344	ACAA	2	8	32534	32541	75 %	0 %	0 %	25 %	114330061
84	NC_008344	CGGC	2	8	33352	33359	0 %	0 %	50 %	50 %	114330063
85	NC_008344	GCCG	2	8	33416	33423	0 %	0 %	50 %	50 %	114330063
86	NC_008344	CGTC	2	8	33578	33585	0 %	25 %	25 %	50 %	114330063
87	NC_008344	GGCT	2	8	33667	33674	0 %	25 %	50 %	25 %	114330063
88	NC_008344	GCAG	2	8	34727	34734	25 %	0 %	50 %	25 %	114330064
89	NC_008344	GAGC	2	8	36270	36277	25 %	0 %	50 %	25 %	114330068
90	NC_008344	GCCA	2	8	36313	36320	25 %	0 %	25 %	50 %	114330068
91	NC_008344	GCTT	2	8	36627	36634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008344	GCAG	2	8	36882	36889	25 %	0 %	50 %	25 %	114330069
93	NC_008344	AACG	2	8	37083	37090	50 %	0 %	25 %	25 %	114330069
94	NC_008344	GTTT	2	8	37360	37367	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008344	CAAT	2	8	37495	37502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008344	TCAG	2	8	37785	37792	25 %	25 %	25 %	25 %	114330070
97	NC_008344	CTAC	2	8	38344	38351	25 %	25 %	0 %	50 %	114330070
98	NC_008344	CCTT	2	8	39076	39083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008344	TTTC	2	8	39599	39606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008344	GCAT	2	8	39770	39777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008344	ATTC	2	8	39946	39953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008344	ACCG	2	8	40498	40505	25 %	0 %	25 %	50 %	114330072
103	NC_008344	AGCG	2	8	41011	41018	25 %	0 %	50 %	25 %	114330072
104	NC_008344	ATCG	2	8	41259	41266	25 %	25 %	25 %	25 %	114330072
105	NC_008344	AACC	2	8	41283	41290	50 %	0 %	0 %	50 %	114330072
106	NC_008344	AAAT	2	8	41333	41340	75 %	25 %	0 %	0 %	114330072
107	NC_008344	GTAT	2	8	41725	41732	25 %	50 %	25 %	0 %	114330072
108	NC_008344	CCAT	2	8	42297	42304	25 %	25 %	0 %	50 %	114330073
109	NC_008344	GTAA	2	8	42424	42431	50 %	25 %	25 %	0 %	114330073
110	NC_008344	ATAG	2	8	43252	43259	50 %	25 %	25 %	0 %	114330074
111	NC_008344	GGTC	2	8	43966	43973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008344	GAAT	2	8	44872	44879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008344	TATG	2	8	44911	44918	25 %	50 %	25 %	0 %	114330076
114	NC_008344	GCGA	2	8	45010	45017	25 %	0 %	50 %	25 %	114330076
115	NC_008344	GACT	2	8	45495	45502	25 %	25 %	25 %	25 %	114330076
116	NC_008344	GCCT	2	8	46309	46316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008344	GAAG	2	8	46730	46737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008344	CAGC	2	8	46768	46775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008344	CGAG	2	8	47034	47041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008344	AAGA	2	8	47213	47220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008344	TACT	2	8	47233	47240	25 %	50 %	0 %	25 %	114330079
122	NC_008344	ACTG	2	8	47447	47454	25 %	25 %	25 %	25 %	114330079
123	NC_008344	AACT	2	8	47582	47589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008344	GTTG	2	8	47607	47614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008344	GGCC	2	8	48208	48215	0 %	0 %	50 %	50 %	114330080
126	NC_008344	TGCT	2	8	48281	48288	0 %	50 %	25 %	25 %	114330080
127	NC_008344	TCCT	2	8	48296	48303	0 %	50 %	0 %	50 %	114330080
128	NC_008344	TGCC	2	8	48658	48665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008344	CGAA	2	8	48951	48958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008344	TGCG	2	8	49652	49659	0 %	25 %	50 %	25 %	114330081
131	NC_008344	AGCC	2	8	50083	50090	25 %	0 %	25 %	50 %	114330081
132	NC_008344	GCCA	2	8	50832	50839	25 %	0 %	25 %	50 %	114330081
133	NC_008344	AATG	2	8	52335	52342	50 %	25 %	25 %	0 %	114330083
134	NC_008344	GGTA	2	8	52471	52478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008344	TGCC	2	8	52837	52844	0 %	25 %	25 %	50 %	114330084
136	NC_008344	GCGA	2	8	53704	53711	25 %	0 %	50 %	25 %	114330084
137	NC_008344	ACCA	2	8	53949	53956	50 %	0 %	0 %	50 %	114330084
138	NC_008344	CCTG	2	8	54147	54154	0 %	25 %	25 %	50 %	114330084
139	NC_008344	ACCA	2	8	54441	54448	50 %	0 %	0 %	50 %	114330084
140	NC_008344	TTAT	2	8	54800	54807	25 %	75 %	0 %	0 %	114330085
141	NC_008344	GCAT	2	8	55083	55090	25 %	25 %	25 %	25 %	114330085
142	NC_008344	TCAT	2	8	55104	55111	25 %	50 %	0 %	25 %	114330085
143	NC_008344	TTAT	2	8	55409	55416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008344	AAAC	2	8	55925	55932	75 %	0 %	0 %	25 %	114330086
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