MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 chromosome

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008344	GGTG	2	8	109744	109751	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_008344	CGT	2	6	109779	109784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_008344	CCCCT	2	10	109817	109826	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2004	NC_008344	CAC	2	6	109832	109837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2005	NC_008344	ACGCA	2	10	109866	109875	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2006	NC_008344	GGC	2	6	109942	109947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330145
2007	NC_008344	GC	3	6	109984	109989	0 %	0 %	50 %	50 %	114330145
2008	NC_008344	GGTC	2	8	110008	110015	0 %	25 %	50 %	25 %	114330145
2009	NC_008344	AGC	2	6	110050	110055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330145
2010	NC_008344	TGA	2	6	110066	110071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330145
2011	NC_008344	ACA	2	6	110072	110077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330145
2012	NC_008344	CGA	2	6	110150	110155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330145
2013	NC_008344	TGA	2	6	110174	110179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330145
2014	NC_008344	CGT	2	6	110189	110194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330145
2015	NC_008344	GCCTT	2	10	110272	110281	0 %	40 %	20 %	40 %	114330145
2016	NC_008344	CGT	2	6	110315	110320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330145
2017	NC_008344	ATG	2	6	110437	110442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330145
2018	NC_008344	ATG	2	6	110461	110466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_008344	GCT	2	6	110623	110628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_008344	TGT	2	6	110729	110734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330146
2021	NC_008344	AGCCA	2	10	110750	110759	40 %	0 %	20 %	40 %	114330146
2022	NC_008344	CA	3	6	110758	110763	50 %	0 %	0 %	50 %	114330146
2023	NC_008344	GTC	2	6	110845	110850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330146
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2034	NC_008344	TGCT	2	8	111468	111475	0 %	50 %	25 %	25 %	114330146
2035	NC_008344	CAG	2	6	111477	111482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330146
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2045	NC_008344	T	7	7	111827	111833	0 %	100 %	0 %	0 %	114330146
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2048	NC_008344	GGA	2	6	112292	112297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_008344	CAC	2	6	112301	112306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2050	NC_008344	GTC	2	6	112330	112335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_008344	CCGT	2	8	112343	112350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2052	NC_008344	CGG	2	6	112440	112445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_008344	GCACCG	2	12	112446	112457	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_008344	ACG	3	9	112495	112503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_008344	CGG	2	6	112504	112509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_008344	GAC	2	6	112534	112539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_008344	TCCT	2	8	112591	112598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2058	NC_008344	GCC	2	6	112605	112610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2059	NC_008344	AGA	2	6	112644	112649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2061	NC_008344	GCG	2	6	112759	112764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330147
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2063	NC_008344	GAT	2	6	112951	112956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330147
2064	NC_008344	CGCC	2	8	113007	113014	0 %	0 %	25 %	75 %	114330147
2065	NC_008344	CTG	2	6	113043	113048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330147
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2091	NC_008344	CAT	2	6	114354	114359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330147
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2099	NC_008344	GTT	2	6	114773	114778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2101	NC_008344	CAAA	2	8	114823	114830	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2102	NC_008344	GCGT	2	8	114867	114874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2103	NC_008344	CGGA	2	8	114881	114888	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2104	NC_008344	ACG	2	6	114983	114988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2107	NC_008344	CA	3	6	115026	115031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2114	NC_008344	A	7	7	115423	115429	100 %	0 %	0 %	0 %	114330148
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2124	NC_008344	TCG	2	6	116038	116043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330150
2125	NC_008344	CGG	2	6	116151	116156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330150
2126	NC_008344	GGC	2	6	116220	116225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330150
2127	NC_008344	CG	3	6	116227	116232	0 %	0 %	50 %	50 %	114330150
2128	NC_008344	GCGAA	2	10	116243	116252	40 %	0 %	40 %	20 %	114330150
2129	NC_008344	TGC	2	6	116284	116289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330150
2130	NC_008344	GTGC	2	8	116312	116319	0 %	25 %	50 %	25 %	114330150
2131	NC_008344	GC	3	6	116318	116323	0 %	0 %	50 %	50 %	114330150
2132	NC_008344	CAGC	2	8	116331	116338	25 %	0 %	25 %	50 %	114330150
2133	NC_008344	TGC	2	6	116348	116353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330150
2134	NC_008344	GTG	2	6	116370	116375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330150
2135	NC_008344	CAG	2	6	116415	116420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330150
2136	NC_008344	GCG	2	6	116428	116433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330150
2137	NC_008344	TC	3	6	116489	116494	0 %	50 %	0 %	50 %	114330150
2138	NC_008344	CCA	2	6	116601	116606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330150
2139	NC_008344	CGA	2	6	116678	116683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330150
2140	NC_008344	CGG	2	6	116699	116704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330150
2141	NC_008344	GC	3	6	116707	116712	0 %	0 %	50 %	50 %	114330150
2142	NC_008344	TG	4	8	116737	116744	0 %	50 %	50 %	0 %	114330150
2143	NC_008344	GGA	2	6	116799	116804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330150
2144	NC_008344	CGTT	2	8	116809	116816	0 %	50 %	25 %	25 %	114330150
2145	NC_008344	CAT	2	6	116854	116859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2146	NC_008344	CAGT	2	8	116877	116884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2147	NC_008344	GCT	2	6	117025	117030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2148	NC_008344	CAC	2	6	117112	117117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330151
2149	NC_008344	CG	3	6	117120	117125	0 %	0 %	50 %	50 %	114330151
2150	NC_008344	GTTG	2	8	117148	117155	0 %	50 %	50 %	0 %	114330151
2151	NC_008344	GAT	2	6	117214	117219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330151
2152	NC_008344	CAG	2	6	117234	117239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330151
2153	NC_008344	CAC	2	6	117247	117252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330151
2154	NC_008344	CGC	2	6	117268	117273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330151
2155	NC_008344	TCG	2	6	117278	117283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330151
2156	NC_008344	CTG	2	6	117340	117345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330151
2157	NC_008344	CGTA	2	8	117412	117419	25 %	25 %	25 %	25 %	114330151
2158	NC_008344	CTT	2	6	117420	117425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330151
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2160	NC_008344	CCT	2	6	117576	117581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330151
2161	NC_008344	CTG	2	6	117607	117612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330151
2162	NC_008344	CAA	2	6	117661	117666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330151
2163	NC_008344	CGA	2	6	117702	117707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330151
2164	NC_008344	GACT	2	8	117737	117744	25 %	25 %	25 %	25 %	114330151
2165	NC_008344	TCG	2	6	117800	117805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330151
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2169	NC_008344	GC	4	8	117902	117909	0 %	0 %	50 %	50 %	114330151
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2173	NC_008344	GACCA	2	10	118268	118277	40 %	0 %	20 %	40 %	114330152
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2179	NC_008344	CAA	2	6	118542	118547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330152
2180	NC_008344	GCA	2	6	118581	118586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330152
2181	NC_008344	CAC	2	6	118622	118627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330152
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2183	NC_008344	TGTGG	2	10	118778	118787	0 %	40 %	60 %	0 %	114330152
2184	NC_008344	TCC	2	6	118797	118802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2185	NC_008344	TC	3	6	118803	118808	0 %	50 %	0 %	50 %	114330153
2186	NC_008344	CAA	2	6	118864	118869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330153
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2188	NC_008344	CAA	2	6	119008	119013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330153
2189	NC_008344	GCG	2	6	119030	119035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330153
2190	NC_008344	GAG	2	6	119084	119089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330153
2191	NC_008344	CA	3	6	119095	119100	50 %	0 %	0 %	50 %	114330153
2192	NC_008344	TCG	2	6	119117	119122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330153
2193	NC_008344	CG	3	6	119132	119137	0 %	0 %	50 %	50 %	114330153
2194	NC_008344	GCA	2	6	119244	119249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330153
2195	NC_008344	ATCGC	2	10	119273	119282	20 %	20 %	20 %	40 %	114330153
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2198	NC_008344	GAT	2	6	119344	119349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330153
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2200	NC_008344	CGT	2	6	119394	119399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330153
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2213	NC_008344	CCA	2	6	120185	120190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330153
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2215	NC_008344	TGC	2	6	120206	120211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330153
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2217	NC_008344	GATCGT	2	12	120309	120320	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114330153
2218	NC_008344	GAC	2	6	120343	120348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330153
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2220	NC_008344	CAG	2	6	120411	120416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330153
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2222	NC_008344	GC	3	6	120510	120515	0 %	0 %	50 %	50 %	114330154
2223	NC_008344	GGCT	2	8	120538	120545	0 %	25 %	50 %	25 %	114330154
2224	NC_008344	CGT	2	6	120560	120565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330154
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2226	NC_008344	GC	3	6	120666	120671	0 %	0 %	50 %	50 %	114330154
2227	NC_008344	GCG	2	6	120814	120819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330155
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2229	NC_008344	CTG	2	6	120966	120971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330155
2230	NC_008344	TGA	2	6	121010	121015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330155
2231	NC_008344	GGC	3	9	121027	121035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330155
2232	NC_008344	GC	4	8	121179	121186	0 %	0 %	50 %	50 %	114330155
2233	NC_008344	GTG	2	6	121217	121222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330155
2234	NC_008344	GCA	3	9	121271	121279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330155
2235	NC_008344	GT	3	6	121280	121285	0 %	50 %	50 %	0 %	114330155
2236	NC_008344	ATC	2	6	121299	121304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330155
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2238	NC_008344	GCT	2	6	121364	121369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330155
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2240	NC_008344	GGC	2	6	121401	121406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330155
2241	NC_008344	TAG	2	6	121423	121428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330155
2242	NC_008344	GAC	2	6	121429	121434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330155
2243	NC_008344	AGC	3	9	121459	121467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330155
2244	NC_008344	GGC	2	6	121506	121511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330155
2245	NC_008344	GGT	2	6	121512	121517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330155
2246	NC_008344	ATG	2	6	121546	121551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330155
2247	NC_008344	CG	3	6	121669	121674	0 %	0 %	50 %	50 %	114330156
2248	NC_008344	TCA	2	6	121713	121718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330156
2249	NC_008344	CGC	2	6	121769	121774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330156
2250	NC_008344	GCG	2	6	121780	121785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330156
2251	NC_008344	TTG	2	6	121847	121852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_008344	GTTC	2	8	121991	121998	0 %	50 %	25 %	25 %	114330157
2253	NC_008344	CCG	2	6	122117	122122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330157
2254	NC_008344	TAAG	2	8	122131	122138	50 %	25 %	25 %	0 %	114330157
2255	NC_008344	AG	3	6	122155	122160	50 %	0 %	50 %	0 %	114330157
2256	NC_008344	ATT	2	6	122170	122175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330157
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2260	NC_008344	CTG	2	6	122215	122220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330157
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2262	NC_008344	TGGCC	2	10	122292	122301	0 %	20 %	40 %	40 %	114330157
2263	NC_008344	TGA	2	6	122313	122318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330157
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2266	NC_008344	CGT	2	6	122499	122504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330157
2267	NC_008344	CATA	2	8	122515	122522	50 %	25 %	0 %	25 %	114330157
2268	NC_008344	GTTC	2	8	122529	122536	0 %	50 %	25 %	25 %	114330157
2269	NC_008344	CGG	2	6	122572	122577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330157
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2271	NC_008344	AGTCC	2	10	122615	122624	20 %	20 %	20 %	40 %	114330157
2272	NC_008344	G	6	6	122668	122673	0 %	0 %	100 %	0 %	114330157
2273	NC_008344	CATG	2	8	122679	122686	25 %	25 %	25 %	25 %	114330157
2274	NC_008344	CTC	2	6	122721	122726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2275	NC_008344	TGT	2	6	122727	122732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2276	NC_008344	CCG	2	6	122773	122778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2277	NC_008344	GAC	2	6	122949	122954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2278	NC_008344	GCC	2	6	122972	122977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2279	NC_008344	GTCG	2	8	123002	123009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2280	NC_008344	ACT	2	6	123049	123054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2281	NC_008344	TGA	2	6	123271	123276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2282	NC_008344	CGT	2	6	123405	123410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2283	NC_008344	CATA	2	8	123513	123520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2284	NC_008344	GTG	2	6	123546	123551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2285	NC_008344	TACT	2	8	123642	123649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2286	NC_008344	GTA	2	6	123687	123692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2287	NC_008344	AAT	2	6	123733	123738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2288	NC_008344	TG	3	6	123759	123764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2289	NC_008344	CAT	2	6	123837	123842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330158
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2295	NC_008344	ATG	2	6	124236	124241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330159
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2302	NC_008344	T	6	6	124457	124462	0 %	100 %	0 %	0 %	114330159
2303	NC_008344	GCA	2	6	124512	124517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330159
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2307	NC_008344	TGCC	2	8	124606	124613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2308	NC_008344	TCA	2	6	124635	124640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330160
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2322	NC_008344	GCT	2	6	125469	125474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330160
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2326	NC_008344	TCT	2	6	125701	125706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330160
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2340	NC_008344	CAG	2	6	126355	126360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330160
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2351	NC_008344	CAG	2	6	126672	126677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330160
2352	NC_008344	CG	5	10	126696	126705	0 %	0 %	50 %	50 %	114330160
2353	NC_008344	GCC	2	6	126791	126796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330160
2354	NC_008344	AGC	2	6	126832	126837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330160
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2356	NC_008344	CAG	2	6	126919	126924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330160
2357	NC_008344	GCA	2	6	126989	126994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330160
2358	NC_008344	CGA	2	6	126995	127000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330160
2359	NC_008344	GGAAGA	2	12	127016	127027	50 %	0 %	50 %	0 %	114330160
2360	NC_008344	G	6	6	127132	127137	0 %	0 %	100 %	0 %	114330160
2361	NC_008344	TGG	2	6	127209	127214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330160
2362	NC_008344	AAT	2	6	127257	127262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114330160
2363	NC_008344	AAT	2	6	127265	127270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114330160
2364	NC_008344	A	8	8	127285	127292	100 %	0 %	0 %	0 %	114330160
2365	NC_008344	CAGC	2	8	127348	127355	25 %	0 %	25 %	50 %	114330160
2366	NC_008344	TCG	2	6	127418	127423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330160
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2369	NC_008344	T	6	6	127680	127685	0 %	100 %	0 %	0 %	114330160
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2381	NC_008344	TGC	2	6	128503	128508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330161
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2490	NC_008344	TGA	2	6	133992	133997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330166
2491	NC_008344	ATG	2	6	134010	134015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330166
2492	NC_008344	AGC	2	6	134035	134040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330166
2493	NC_008344	TGA	2	6	134041	134046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330166
2494	NC_008344	CTT	2	6	134129	134134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330166
2495	NC_008344	CAT	2	6	134246	134251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330166
2496	NC_008344	CATG	2	8	134273	134280	25 %	25 %	25 %	25 %	114330166
2497	NC_008344	TGA	2	6	134329	134334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330166
2498	NC_008344	AC	3	6	134340	134345	50 %	0 %	0 %	50 %	114330166
2499	NC_008344	CTG	2	6	134454	134459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330166
2500	NC_008344	AAC	2	6	134490	134495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330166

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