MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 chromosome

Total Repeats: 52264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008344	TTGA	2	8	28069	28076	25 %	50 %	25 %	0 %	114330059
502	NC_008344	GCA	2	6	28242	28247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330059
503	NC_008344	CAC	2	6	28315	28320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330060
504	NC_008344	AGCTCA	2	12	28329	28340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114330060
505	NC_008344	GCA	2	6	28349	28354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330060
506	NC_008344	ACA	2	6	28389	28394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330060
507	NC_008344	CGC	2	6	28399	28404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330060
508	NC_008344	CAT	2	6	28605	28610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330060
509	NC_008344	GGCT	2	8	28681	28688	0 %	25 %	50 %	25 %	114330060
510	NC_008344	ATG	2	6	28766	28771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330060
511	NC_008344	TTCA	2	8	28795	28802	25 %	50 %	0 %	25 %	114330060
512	NC_008344	CTT	2	6	28806	28811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330060
513	NC_008344	AGCA	2	8	28840	28847	50 %	0 %	25 %	25 %	114330060
514	NC_008344	CTT	2	6	28944	28949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330060
515	NC_008344	CG	3	6	29066	29071	0 %	0 %	50 %	50 %	114330060
516	NC_008344	GCA	2	6	29133	29138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330060
517	NC_008344	TCG	2	6	29141	29146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330060
518	NC_008344	GCC	2	6	29187	29192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330060
519	NC_008344	CGA	2	6	29217	29222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330060
520	NC_008344	CAC	2	6	29289	29294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330060
521	NC_008344	ATA	2	6	29309	29314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114330060
522	NC_008344	GGCA	2	8	29346	29353	25 %	0 %	50 %	25 %	114330060
523	NC_008344	ACC	2	6	29450	29455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330060
524	NC_008344	ACA	2	6	29547	29552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330060
525	NC_008344	TCT	2	6	29780	29785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330060
526	NC_008344	CGC	2	6	29807	29812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330060
527	NC_008344	GCC	2	6	29849	29854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330060
528	NC_008344	GAT	2	6	29908	29913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330060
529	NC_008344	CCG	2	6	29919	29924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330060
530	NC_008344	ACG	2	6	29996	30001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330060
531	NC_008344	GCC	2	6	30014	30019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330060
532	NC_008344	CGC	2	6	30078	30083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330060
533	NC_008344	GCCA	2	8	30096	30103	25 %	0 %	25 %	50 %	114330060
534	NC_008344	TGG	2	6	30176	30181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330060
535	NC_008344	CGT	2	6	30196	30201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330060
536	NC_008344	CCA	2	6	30226	30231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330060
537	NC_008344	CGG	2	6	30236	30241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330060
538	NC_008344	GCTC	2	8	30399	30406	0 %	25 %	25 %	50 %	114330060
539	NC_008344	AG	3	6	30418	30423	50 %	0 %	50 %	0 %	114330060
540	NC_008344	GGCCG	2	10	30430	30439	0 %	0 %	60 %	40 %	114330060
541	NC_008344	TTGGC	2	10	30449	30458	0 %	40 %	40 %	20 %	114330060
542	NC_008344	TGC	2	6	30465	30470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330060
543	NC_008344	CCG	2	6	30608	30613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330060
544	NC_008344	GT	3	6	30641	30646	0 %	50 %	50 %	0 %	114330060
545	NC_008344	CAC	2	6	30713	30718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_008344	AAT	2	6	30834	30839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_008344	GAC	2	6	30840	30845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_008344	TAG	2	6	30871	30876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_008344	CTG	2	6	30998	31003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_008344	TAT	2	6	31177	31182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008344	TGG	2	6	31204	31209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008344	TAG	2	6	31267	31272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008344	TTCT	2	8	31330	31337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
554	NC_008344	AGC	2	6	31359	31364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_008344	ATT	2	6	31403	31408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008344	TAT	2	6	31534	31539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008344	TGCGT	2	10	31601	31610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
558	NC_008344	GGT	2	6	31639	31644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_008344	TGC	2	6	31694	31699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_008344	TGTA	2	8	31700	31707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_008344	GC	3	6	31733	31738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_008344	TCA	2	6	31748	31753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008344	CGG	2	6	31826	31831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_008344	TTG	2	6	31874	31879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008344	G	6	6	31890	31895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
566	NC_008344	GGC	2	6	31945	31950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_008344	TTA	2	6	31991	31996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008344	ATG	2	6	32008	32013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008344	CCA	2	6	32027	32032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_008344	GCT	2	6	32037	32042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_008344	CTG	2	6	32083	32088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_008344	AAACA	2	10	32204	32213	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
573	NC_008344	A	6	6	32217	32222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008344	CAT	2	6	32272	32277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_008344	CACGCA	2	12	32295	32306	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
576	NC_008344	GTGG	2	8	32401	32408	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008344	GCA	2	6	32511	32516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330061
578	NC_008344	ACAA	2	8	32534	32541	75 %	0 %	0 %	25 %	114330061
579	NC_008344	CGT	2	6	32596	32601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330061
580	NC_008344	GCT	2	6	32764	32769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330062
581	NC_008344	CGA	2	6	32810	32815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330062
582	NC_008344	GCA	2	6	32822	32827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330062
583	NC_008344	GCC	2	6	32853	32858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330062
584	NC_008344	GTG	2	6	32860	32865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330062
585	NC_008344	GCA	2	6	32879	32884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330062
586	NC_008344	GCA	2	6	32891	32896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330062
587	NC_008344	CCT	2	6	32973	32978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_008344	GCA	2	6	32993	32998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330063
589	NC_008344	AAC	2	6	33072	33077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330063
590	NC_008344	GCC	2	6	33123	33128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330063
591	NC_008344	CCA	2	6	33199	33204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330063
592	NC_008344	TGA	2	6	33208	33213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330063
593	NC_008344	CGT	2	6	33289	33294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330063
594	NC_008344	CGGC	2	8	33352	33359	0 %	0 %	50 %	50 %	114330063
595	NC_008344	CGC	2	6	33385	33390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330063
596	NC_008344	GCCG	2	8	33416	33423	0 %	0 %	50 %	50 %	114330063
597	NC_008344	GCC	2	6	33426	33431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330063
598	NC_008344	CGA	3	9	33508	33516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330063
599	NC_008344	CGC	2	6	33545	33550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330063
600	NC_008344	CGTC	2	8	33578	33585	0 %	25 %	25 %	50 %	114330063
601	NC_008344	CAG	2	6	33596	33601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330063
602	NC_008344	GGCT	2	8	33667	33674	0 %	25 %	50 %	25 %	114330063
603	NC_008344	GT	3	6	33678	33683	0 %	50 %	50 %	0 %	114330063
604	NC_008344	GGC	2	6	33713	33718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330063
605	NC_008344	GAA	2	6	33752	33757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330063
606	NC_008344	CCA	2	6	33826	33831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330063
607	NC_008344	CGG	2	6	33926	33931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330063
608	NC_008344	CCA	2	6	33990	33995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330063
609	NC_008344	GAC	2	6	34007	34012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330063
610	NC_008344	GTC	2	6	34022	34027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330063
611	NC_008344	TGGCG	2	10	34093	34102	0 %	20 %	60 %	20 %	114330063
612	NC_008344	CTG	3	9	34121	34129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330063
613	NC_008344	AGT	2	6	34134	34139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330063
614	NC_008344	CGCAG	2	10	34195	34204	20 %	0 %	40 %	40 %	114330063
615	NC_008344	CA	3	6	34244	34249	50 %	0 %	0 %	50 %	114330063
616	NC_008344	GCC	2	6	34268	34273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330063
617	NC_008344	GC	3	6	34303	34308	0 %	0 %	50 %	50 %	114330063
618	NC_008344	TGC	2	6	34328	34333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330063
619	NC_008344	CACGGC	2	12	34487	34498	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114330063
620	NC_008344	CG	4	8	34515	34522	0 %	0 %	50 %	50 %	114330063
621	NC_008344	T	6	6	34564	34569	0 %	100 %	0 %	0 %	114330063
622	NC_008344	T	7	7	34636	34642	0 %	100 %	0 %	0 %	114330063
623	NC_008344	GCAG	2	8	34727	34734	25 %	0 %	50 %	25 %	114330064
624	NC_008344	ACA	2	6	34810	34815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330064
625	NC_008344	CAG	2	6	34852	34857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330064
626	NC_008344	CAT	2	6	34949	34954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330065
627	NC_008344	CTT	2	6	35028	35033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330065
628	NC_008344	AG	3	6	35073	35078	50 %	0 %	50 %	0 %	114330065
629	NC_008344	CA	3	6	35101	35106	50 %	0 %	0 %	50 %	114330065
630	NC_008344	CAA	2	6	35111	35116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330065
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784	NC_008344	GCG	2	6	43841	43846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1000	NC_008344	A	7	7	56761	56767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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