MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid2

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008342	AAACG	2	10	673	682	60 %	0 %	20 %	20 %	114326612
2	NC_008342	GCCTT	2	10	4145	4154	0 %	40 %	20 %	40 %	114326614
3	NC_008342	CCGCG	2	10	6006	6015	0 %	0 %	40 %	60 %	114326617
4	NC_008342	CAAGC	2	10	6130	6139	40 %	0 %	20 %	40 %	114326617
5	NC_008342	AGGCA	2	10	6345	6354	40 %	0 %	40 %	20 %	114326617
6	NC_008342	GCCGC	2	10	6686	6695	0 %	0 %	40 %	60 %	114326617
7	NC_008342	AAACA	2	10	7078	7087	80 %	0 %	0 %	20 %	114326618
8	NC_008342	CAATA	2	10	7189	7198	60 %	20 %	0 %	20 %	114326618
9	NC_008342	CAAAA	2	10	7466	7475	80 %	0 %	0 %	20 %	114326618
10	NC_008342	ACAAA	2	10	7696	7705	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008342	AGCCA	2	10	7917	7926	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_008342	CTGTC	2	10	8020	8029	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008342	TTTTG	2	10	8365	8374	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008342	CTGCG	2	10	11457	11466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008342	ATCTT	2	10	11537	11546	20 %	60 %	0 %	20 %	114326624
16	NC_008342	ACGTC	2	10	13356	13365	20 %	20 %	20 %	40 %	114326625
17	NC_008342	CCCCG	2	10	13656	13665	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_008342	CCAAA	2	10	14020	14029	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008342	TGCGA	2	10	17638	17647	20 %	20 %	40 %	20 %	114326627
20	NC_008342	CGTGT	2	10	19452	19461	0 %	40 %	40 %	20 %	114326628
21	NC_008342	GCACG	2	10	20994	21003	20 %	0 %	40 %	40 %	114326628
22	NC_008342	GCGCG	2	10	24560	24569	0 %	0 %	60 %	40 %	114326630
23	NC_008342	CGGTC	2	10	25152	25161	0 %	20 %	40 %	40 %	114326631
24	NC_008342	GATCT	2	10	27961	27970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008342	TTGTC	2	10	29261	29270	0 %	60 %	20 %	20 %	114326636
26	NC_008342	GCCCG	2	10	32896	32905	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_008342	GGGTG	2	10	39881	39890	0 %	20 %	80 %	0 %	114326647
28	NC_008342	ATGCA	2	10	40909	40918	40 %	20 %	20 %	20 %	114326648
29	NC_008342	TTAAT	2	10	41402	41411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008342	ATCCA	2	10	46671	46680	40 %	20 %	0 %	40 %	114326653
31	NC_008342	GCGCT	2	10	50673	50682	0 %	20 %	40 %	40 %	114326658
32	NC_008342	ATCTG	2	10	50811	50820	20 %	40 %	20 %	20 %	114326658
33	NC_008342	TCATT	2	10	52430	52439	20 %	60 %	0 %	20 %	114326658
34	NC_008342	CCCAG	2	10	53489	53498	20 %	0 %	20 %	60 %	114326661
35	NC_008342	GCAAG	2	10	53966	53975	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008342	TTGTT	2	10	54484	54493	0 %	80 %	20 %	0 %	114326663
37	NC_008342	CATTT	2	10	55267	55276	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.