MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 chromosome

Total Repeats: 71783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007964	ACG	2	6	35	40	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007964	CTG	2	6	301	306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115634
3	NC_007964	ACG	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115634
4	NC_007964	CGC	2	6	498	503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115634
5	NC_007964	CGG	2	6	564	569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115634
6	NC_007964	CAT	2	6	604	609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115634
7	NC_007964	CTG	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115634
8	NC_007964	CCG	2	6	720	725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115634
9	NC_007964	TCG	2	6	744	749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115634
10	NC_007964	CGA	2	6	817	822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115634
11	NC_007964	GGT	3	9	901	909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115634
12	NC_007964	CGA	2	6	946	951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115634
13	NC_007964	CGG	2	6	973	978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115634
14	NC_007964	GGT	2	6	1273	1278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115634
15	NC_007964	GTG	2	6	1337	1342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115634
16	NC_007964	GCC	2	6	1407	1412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115634
17	NC_007964	ACC	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92115634
18	NC_007964	TGC	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115634
19	NC_007964	CCG	2	6	1634	1639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007964	ATC	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007964	CTG	2	6	1765	1770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115635
22	NC_007964	CGG	2	6	1804	1809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
23	NC_007964	GGC	2	6	1908	1913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
24	NC_007964	CGG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
25	NC_007964	GCC	2	6	2134	2139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115635
26	NC_007964	GAG	2	6	2185	2190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115635
27	NC_007964	TAT	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	92115635
28	NC_007964	GCG	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
29	NC_007964	TCA	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115635
30	NC_007964	CGT	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115635
31	NC_007964	AAC	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115635
32	NC_007964	TCG	2	6	2525	2530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115635
33	NC_007964	GGC	2	6	2547	2552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
34	NC_007964	CGA	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115635
35	NC_007964	CGG	2	6	2612	2617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115635
36	NC_007964	GAG	2	6	2665	2670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115635
37	NC_007964	CTG	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115635
38	NC_007964	CGC	2	6	2736	2741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115635
39	NC_007964	ATC	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007964	TGA	2	6	2991	2996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007964	GCT	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115636
42	NC_007964	GCG	2	6	3185	3190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115636
43	NC_007964	AGG	2	6	3202	3207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115636
44	NC_007964	ATC	2	6	3214	3219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115636
45	NC_007964	CAG	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115636
46	NC_007964	CGG	2	6	3364	3369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115636
47	NC_007964	CGG	2	6	3444	3449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115636
48	NC_007964	CTT	2	6	3452	3457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92115636
49	NC_007964	CGA	2	6	3560	3565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115636
50	NC_007964	GCT	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115636
51	NC_007964	CGG	2	6	3751	3756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115636
52	NC_007964	GGA	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115636
53	NC_007964	GCC	3	9	3804	3812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115636
54	NC_007964	TCG	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115636
55	NC_007964	GCT	4	12	3974	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115636
56	NC_007964	CGA	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115636
57	NC_007964	CCG	2	6	4016	4021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115636
58	NC_007964	CCG	2	6	4469	4474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115637
59	NC_007964	GCA	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
60	NC_007964	GTC	2	6	4630	4635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
61	NC_007964	CGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
62	NC_007964	CGA	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
63	NC_007964	TCA	2	6	4781	4786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115637
64	NC_007964	CGG	2	6	4803	4808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
65	NC_007964	CGG	2	6	4839	4844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
66	NC_007964	GGT	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115637
67	NC_007964	GTC	2	6	4969	4974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
68	NC_007964	CGT	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
69	NC_007964	GAT	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115637
70	NC_007964	ACG	2	6	5162	5167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
71	NC_007964	GCG	2	6	5168	5173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
72	NC_007964	TCG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
73	NC_007964	CAA	2	6	5202	5207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115637
74	NC_007964	GGC	2	6	5268	5273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
75	NC_007964	TGG	2	6	5278	5283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115637
76	NC_007964	CAA	2	6	5319	5324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115637
77	NC_007964	CGG	2	6	5340	5345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
78	NC_007964	CGA	2	6	5439	5444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
79	NC_007964	TCG	2	6	5500	5505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
80	NC_007964	GGT	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115637
81	NC_007964	TCA	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115637
82	NC_007964	GGT	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115637
83	NC_007964	GGC	4	12	5634	5645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
84	NC_007964	GTT	2	6	5760	5765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92115637
85	NC_007964	TCG	2	6	5768	5773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
86	NC_007964	GTC	2	6	5889	5894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
87	NC_007964	ATC	2	6	5980	5985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115637
88	NC_007964	TGA	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115637
89	NC_007964	GCT	3	9	6027	6035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
90	NC_007964	TTC	3	9	6040	6048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92115637
91	NC_007964	GCC	2	6	6096	6101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115637
92	NC_007964	CGA	2	6	6186	6191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
93	NC_007964	TGG	2	6	6248	6253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115637
94	NC_007964	TGC	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
95	NC_007964	ACA	2	6	6284	6289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115637
96	NC_007964	GGC	2	6	6324	6329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
97	NC_007964	CGG	2	6	6359	6364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
98	NC_007964	CGC	2	6	6381	6386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115637
99	NC_007964	CGA	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
100	NC_007964	GCG	2	6	6494	6499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115637
101	NC_007964	CGA	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
102	NC_007964	GCT	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
103	NC_007964	CGA	2	6	6558	6563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
104	NC_007964	GCT	2	6	6771	6776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115637
105	NC_007964	AGG	2	6	6791	6796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115637
106	NC_007964	CGA	2	6	6798	6803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
107	NC_007964	CGA	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115637
108	NC_007964	GGC	2	6	6901	6906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007964	TGT	2	6	6917	6922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007964	GTT	2	6	6980	6985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007964	GTC	3	9	7062	7070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007964	GAT	2	6	7132	7137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115638
113	NC_007964	CGC	2	6	7278	7283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115638
114	NC_007964	GCG	2	6	7445	7450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115638
115	NC_007964	ATC	2	6	7468	7473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115638
116	NC_007964	ACG	2	6	7474	7479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115638
117	NC_007964	CAA	2	6	7506	7511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115638
118	NC_007964	AGG	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115638
119	NC_007964	GCA	2	6	7739	7744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115638
120	NC_007964	GCG	2	6	7817	7822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115638
121	NC_007964	TCG	2	6	7835	7840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115638
122	NC_007964	GCA	4	12	7841	7852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115638
123	NC_007964	GAT	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115638
124	NC_007964	GCG	2	6	7913	7918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115638
125	NC_007964	CCG	2	6	7987	7992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115638
126	NC_007964	CCG	2	6	8002	8007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115638
127	NC_007964	GAT	2	6	8070	8075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115638
128	NC_007964	CGA	3	9	8123	8131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115638
129	NC_007964	GCG	2	6	8134	8139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115638
130	NC_007964	GGC	2	6	8142	8147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115638
131	NC_007964	CGG	2	6	8431	8436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007964	CTG	2	6	8515	8520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007964	CGG	2	6	8771	8776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115639
134	NC_007964	CCG	2	6	8882	8887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115639
135	NC_007964	GCG	2	6	9174	9179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115640
136	NC_007964	TGC	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115640
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139	NC_007964	GAC	2	6	9447	9452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115640
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142	NC_007964	CGA	2	6	9653	9658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115640
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151	NC_007964	CGC	3	9	9927	9935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_007964	GAT	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115641
153	NC_007964	ACC	2	6	10072	10077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92115641
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155	NC_007964	ATG	2	6	10304	10309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007964	ATG	2	6	10314	10319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_007964	AGC	2	6	10326	10331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_007964	CGA	2	6	10384	10389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_007964	GCG	2	6	10410	10415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_007964	TGT	2	6	10428	10433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_007964	GAC	2	6	14198	14203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115645
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239	NC_007964	CGA	2	6	14864	14869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115645
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248	NC_007964	CAG	2	6	15264	15269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_007964	TTC	2	6	15391	15396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_007964	GAA	2	6	15444	15449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_007964	CGA	2	6	15522	15527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115646
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255	NC_007964	GAC	2	6	15805	15810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115646
256	NC_007964	GAA	2	6	15838	15843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92115646
257	NC_007964	CGC	2	6	15871	15876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_007964	GCA	2	6	15901	15906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115647
259	NC_007964	CGG	2	6	16000	16005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115647
260	NC_007964	AAG	2	6	16115	16120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92115647
261	NC_007964	GGC	3	9	16121	16129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115647
262	NC_007964	CGG	2	6	16221	16226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115647
263	NC_007964	TCG	2	6	16323	16328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115647
264	NC_007964	CGC	2	6	16353	16358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115647
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267	NC_007964	GCC	2	6	16610	16615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115647
268	NC_007964	TGG	2	6	16665	16670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
269	NC_007964	CGC	2	6	16671	16676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_007964	CTT	2	6	16722	16727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_007964	CAG	2	6	16849	16854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_007964	CTC	2	6	17378	17383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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295	NC_007964	GGC	2	6	18127	18132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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