MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 chromosome

Total Repeats: 102677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007964	CG	3	6	20340	20345	0 %	0 %	50 %	50 %	92115652
502	NC_007964	GCG	2	6	20350	20355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115652
503	NC_007964	GGCGAA	2	12	20386	20397	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	92115652
504	NC_007964	GCGGCT	2	12	20436	20447	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	92115652
505	NC_007964	CG	3	6	20549	20554	0 %	0 %	50 %	50 %	92115652
506	NC_007964	TGT	2	6	20558	20563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92115652
507	NC_007964	GCG	2	6	20591	20596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115652
508	NC_007964	AAT	2	6	20626	20631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	92115652
509	NC_007964	CCGGC	2	10	20635	20644	0 %	0 %	40 %	60 %	92115652
510	NC_007964	CGC	2	6	20680	20685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115652
511	NC_007964	TAT	2	6	20692	20697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	92115652
512	NC_007964	CGG	2	6	20706	20711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115652
513	NC_007964	CG	3	6	20842	20847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_007964	CCA	2	6	20945	20950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92115653
515	NC_007964	GCC	2	6	20968	20973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115653
516	NC_007964	CG	3	6	21009	21014	0 %	0 %	50 %	50 %	92115653
517	NC_007964	ATC	2	6	21035	21040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115653
518	NC_007964	CGC	2	6	21061	21066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115653
519	NC_007964	GATCTC	2	12	21087	21098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	92115653
520	NC_007964	CAT	2	6	21138	21143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115653
521	NC_007964	CG	4	8	21169	21176	0 %	0 %	50 %	50 %	92115653
522	NC_007964	CAC	2	6	21199	21204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92115653
523	NC_007964	ATC	2	6	21206	21211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115653
524	NC_007964	TCGC	2	8	21281	21288	0 %	25 %	25 %	50 %	92115653
525	NC_007964	GAC	3	9	21343	21351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115653
526	NC_007964	AGGC	2	8	21415	21422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
527	NC_007964	CGC	3	9	21547	21555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115654
528	NC_007964	ACG	2	6	21598	21603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115654
529	NC_007964	TGG	2	6	21613	21618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115654
530	NC_007964	GGC	2	6	21626	21631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115654
531	NC_007964	TCG	2	6	21640	21645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115654
532	NC_007964	GAG	2	6	21660	21665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92115654
533	NC_007964	GC	3	6	21743	21748	0 %	0 %	50 %	50 %	92115654
534	NC_007964	GGC	2	6	21761	21766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115654
535	NC_007964	GTC	2	6	21792	21797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115654
536	NC_007964	CGA	2	6	21824	21829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115654
537	NC_007964	CGC	2	6	21837	21842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115654
538	NC_007964	GC	3	6	21841	21846	0 %	0 %	50 %	50 %	92115654
539	NC_007964	GGT	2	6	21848	21853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115654
540	NC_007964	TGG	2	6	21859	21864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115654
541	NC_007964	ATC	3	9	21880	21888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92115654
542	NC_007964	GC	4	8	21903	21910	0 %	0 %	50 %	50 %	92115654
543	NC_007964	CG	3	6	21924	21929	0 %	0 %	50 %	50 %	92115654
544	NC_007964	CGT	2	6	22061	22066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115654
545	NC_007964	CG	3	6	22075	22080	0 %	0 %	50 %	50 %	92115654
546	NC_007964	TCG	2	6	22111	22116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115654
547	NC_007964	CGGA	2	8	22201	22208	25 %	0 %	50 %	25 %	92115654
548	NC_007964	GCT	2	6	22229	22234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115654
549	NC_007964	TCGCC	2	10	22238	22247	0 %	20 %	20 %	60 %	92115654
550	NC_007964	GC	3	6	22336	22341	0 %	0 %	50 %	50 %	92115654
551	NC_007964	TGA	2	6	22418	22423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115654
552	NC_007964	CCG	2	6	22427	22432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115654
553	NC_007964	TCG	2	6	22489	22494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115654
554	NC_007964	CGC	2	6	22585	22590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115654
555	NC_007964	GCG	2	6	22605	22610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115654
556	NC_007964	CAGC	2	8	22679	22686	25 %	0 %	25 %	50 %	92115654
557	NC_007964	ACG	2	6	22716	22721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115654
558	NC_007964	CGCGC	2	10	22740	22749	0 %	0 %	40 %	60 %	92115654
559	NC_007964	TCG	2	6	22765	22770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115654
560	NC_007964	CCTG	2	8	22832	22839	0 %	25 %	25 %	50 %	92115654
561	NC_007964	GCTCG	2	10	22871	22880	0 %	20 %	40 %	40 %	92115654
562	NC_007964	CGA	2	6	22913	22918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115654
563	NC_007964	CCG	2	6	22923	22928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115654
564	NC_007964	CGT	2	6	22936	22941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115654
565	NC_007964	CCCG	2	8	23031	23038	0 %	0 %	25 %	75 %	92115655
566	NC_007964	GTC	2	6	23047	23052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115655
567	NC_007964	CGA	2	6	23061	23066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115655
568	NC_007964	CG	3	6	23071	23076	0 %	0 %	50 %	50 %	92115655
569	NC_007964	CGG	2	6	23125	23130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115655
570	NC_007964	GTC	2	6	23140	23145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115655
571	NC_007964	CG	3	6	23150	23155	0 %	0 %	50 %	50 %	92115655
572	NC_007964	GGC	2	6	23232	23237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115655
573	NC_007964	TC	3	6	23250	23255	0 %	50 %	0 %	50 %	92115655
574	NC_007964	ACG	2	6	23315	23320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115655
575	NC_007964	GC	5	10	23373	23382	0 %	0 %	50 %	50 %	92115655
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580	NC_007964	ATG	2	6	23618	23623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92115655
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582	NC_007964	CG	3	6	23659	23664	0 %	0 %	50 %	50 %	92115655
583	NC_007964	GCG	2	6	23672	23677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115655
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586	NC_007964	CGA	2	6	23742	23747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115655
587	NC_007964	ACC	2	6	23758	23763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92115655
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589	NC_007964	TGG	2	6	23954	23959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115655
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592	NC_007964	CGGC	2	8	23995	24002	0 %	0 %	50 %	50 %	92115655
593	NC_007964	GCC	2	6	24040	24045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115656
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597	NC_007964	TCAT	2	8	24162	24169	25 %	50 %	0 %	25 %	92115656
598	NC_007964	CCG	3	9	24183	24191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115656
599	NC_007964	CGA	2	6	24241	24246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115656
600	NC_007964	CCAA	2	8	24293	24300	50 %	0 %	0 %	50 %	92115656
601	NC_007964	CGA	2	6	24346	24351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115656
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605	NC_007964	GCC	2	6	24625	24630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115657
606	NC_007964	TGCCGG	2	12	24648	24659	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	92115657
607	NC_007964	GCTG	2	8	24696	24703	0 %	25 %	50 %	25 %	92115657
608	NC_007964	CGCT	2	8	24716	24723	0 %	25 %	25 %	50 %	92115657
609	NC_007964	GGT	2	6	24763	24768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92115657
610	NC_007964	CCG	2	6	24804	24809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115657
611	NC_007964	GC	3	6	24814	24819	0 %	0 %	50 %	50 %	92115657
612	NC_007964	TGC	2	6	24822	24827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115657
613	NC_007964	ACGA	2	8	24846	24853	50 %	0 %	25 %	25 %	92115657
614	NC_007964	TCG	2	6	24888	24893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115657
615	NC_007964	GCG	2	6	24944	24949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115657
616	NC_007964	TCG	2	6	24960	24965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115657
617	NC_007964	CGA	2	6	24982	24987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115657
618	NC_007964	GC	3	6	25040	25045	0 %	0 %	50 %	50 %	92115657
619	NC_007964	AAGCG	2	10	25062	25071	40 %	0 %	40 %	20 %	92115657
620	NC_007964	GCC	2	6	25081	25086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115657
621	NC_007964	GGCC	2	8	25087	25094	0 %	0 %	50 %	50 %	92115657
622	NC_007964	GC	3	6	25102	25107	0 %	0 %	50 %	50 %	92115657
623	NC_007964	GATC	2	8	25108	25115	25 %	25 %	25 %	25 %	92115657
624	NC_007964	GCT	2	6	25153	25158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115657
625	NC_007964	GCC	2	6	25165	25170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115657
626	NC_007964	CTG	2	6	25190	25195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115657
627	NC_007964	CATC	2	8	25216	25223	25 %	25 %	0 %	50 %	92115657
628	NC_007964	GGC	2	6	25247	25252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115657
629	NC_007964	TCG	2	6	25281	25286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115657
630	NC_007964	TCG	2	6	25293	25298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92115657
631	NC_007964	CGA	3	9	25306	25314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115657
632	NC_007964	ACG	2	6	25317	25322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115657
633	NC_007964	CGA	2	6	25324	25329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115657
634	NC_007964	GCC	2	6	25330	25335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92115657
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752	NC_007964	CG	3	6	30597	30602	0 %	0 %	50 %	50 %	92115662
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756	NC_007964	CGG	2	6	30769	30774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115662
757	NC_007964	CGA	2	6	30794	30799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115662
758	NC_007964	CAA	2	6	30836	30841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92115662
759	NC_007964	GCCTC	2	10	30883	30892	0 %	20 %	20 %	60 %	92115662
760	NC_007964	GACATC	2	12	30909	30920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	92115662
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763	NC_007964	CGA	2	6	31001	31006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115662
764	NC_007964	CGA	3	9	31100	31108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115662
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768	NC_007964	CG	3	6	31378	31383	0 %	0 %	50 %	50 %	92115662
769	NC_007964	GC	3	6	31410	31415	0 %	0 %	50 %	50 %	92115662
770	NC_007964	CGG	2	6	31456	31461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115662
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874	NC_007964	GCG	2	6	35309	35314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92115665
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880	NC_007964	GAC	2	6	35468	35473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92115666
881	NC_007964	ATTCG	2	10	35486	35495	20 %	40 %	20 %	20 %	92115666
882	NC_007964	A	7	7	35521	35527	100 %	0 %	0 %	0 %	92115666
883	NC_007964	AAT	2	6	35544	35549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	92115666
884	NC_007964	AC	3	6	35557	35562	50 %	0 %	0 %	50 %	92115666
885	NC_007964	GCAG	2	8	35597	35604	25 %	0 %	50 %	25 %	92115666
886	NC_007964	ACCA	2	8	35658	35665	50 %	0 %	0 %	50 %	92115666
887	NC_007964	GCGA	2	8	35682	35689	25 %	0 %	50 %	25 %	92115666
888	NC_007964	C	6	6	35699	35704	0 %	0 %	0 %	100 %	92115666
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