MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 plasmid 2

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007616	TCCC	2	8	122	129	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_007616	GCGA	2	8	1213	1220	25 %	0 %	50 %	25 %	82703912
3	NC_007616	AGAA	2	8	1389	1396	75 %	0 %	25 %	0 %	82703912
4	NC_007616	TACG	2	8	1915	1922	25 %	25 %	25 %	25 %	82703913
5	NC_007616	ATTT	2	8	2144	2151	25 %	75 %	0 %	0 %	82703913
6	NC_007616	AATA	2	8	2857	2864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007616	AGGT	2	8	3044	3051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007616	ACTA	2	8	3197	3204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007616	GCCT	2	8	3506	3513	0 %	25 %	25 %	50 %	82703915
10	NC_007616	AGGC	2	8	3781	3788	25 %	0 %	50 %	25 %	82703915
11	NC_007616	AGGG	2	8	4850	4857	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007616	GCAG	2	8	4991	4998	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007616	GTCT	2	8	5838	5845	0 %	50 %	25 %	25 %	82703917
14	NC_007616	AGAC	2	8	6267	6274	50 %	0 %	25 %	25 %	82703918
15	NC_007616	TGGA	2	8	6369	6376	25 %	25 %	50 %	0 %	82703918
16	NC_007616	TGAA	2	8	6716	6723	50 %	25 %	25 %	0 %	82703918
17	NC_007616	TGCG	2	8	7147	7154	0 %	25 %	50 %	25 %	82703918
18	NC_007616	AAGG	2	8	7351	7358	50 %	0 %	50 %	0 %	82703918
19	NC_007616	CAGG	2	8	7601	7608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007616	CTAG	2	8	7678	7685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007616	ATTG	2	8	7796	7803	25 %	50 %	25 %	0 %	82703919
22	NC_007616	TGTC	2	8	9224	9231	0 %	50 %	25 %	25 %	82703921
23	NC_007616	TGAG	2	8	9746	9753	25 %	25 %	50 %	0 %	82703921
24	NC_007616	CGGG	2	8	10051	10058	0 %	0 %	75 %	25 %	82703921
25	NC_007616	GCAA	2	8	10601	10608	50 %	0 %	25 %	25 %	82703922
26	NC_007616	GCTT	2	8	10616	10623	0 %	50 %	25 %	25 %	82703922
27	NC_007616	CGTT	2	8	11195	11202	0 %	50 %	25 %	25 %	82703922
28	NC_007616	TGGG	2	8	11699	11706	0 %	25 %	75 %	0 %	82703922
29	NC_007616	TGCC	2	8	11778	11785	0 %	25 %	25 %	50 %	82703922
30	NC_007616	TCCG	2	8	11905	11912	0 %	25 %	25 %	50 %	82703922
31	NC_007616	CGCC	2	8	12095	12102	0 %	0 %	25 %	75 %	82703923
32	NC_007616	CAGC	2	8	12110	12117	25 %	0 %	25 %	50 %	82703923
33	NC_007616	CGCT	2	8	12265	12272	0 %	25 %	25 %	50 %	82703923
34	NC_007616	GGGA	2	8	12452	12459	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007616	GGAG	2	8	13052	13059	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007616	AGCG	2	8	13301	13308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007616	AGCC	2	8	13708	13715	25 %	0 %	25 %	50 %	82703925
38	NC_007616	ACGG	2	8	13820	13827	25 %	0 %	50 %	25 %	82703925
39	NC_007616	TTCA	2	8	14194	14201	25 %	50 %	0 %	25 %	82703925
40	NC_007616	GAAA	2	8	14376	14383	75 %	0 %	25 %	0 %	82703925
41	NC_007616	TCTA	2	8	14600	14607	25 %	50 %	0 %	25 %	82703925
42	NC_007616	ATTG	2	8	14943	14950	25 %	50 %	25 %	0 %	82703925
43	NC_007616	GATA	2	8	14961	14968	50 %	25 %	25 %	0 %	82703925
44	NC_007616	AAAT	2	8	16062	16069	75 %	25 %	0 %	0 %	82703926
45	NC_007616	GCAC	2	8	16088	16095	25 %	0 %	25 %	50 %	82703926
46	NC_007616	TGAT	2	8	16841	16848	25 %	50 %	25 %	0 %	82703927

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.