MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome

Total Repeats: 60996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007614	TTA	2	6	153792	153797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82701280
3002	NC_007614	TCC	2	6	153858	153863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701280
3003	NC_007614	TGC	2	6	153955	153960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701280
3004	NC_007614	GAT	2	6	153962	153967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701280
3005	NC_007614	CTTC	2	8	153969	153976	0 %	50 %	0 %	50 %	82701280
3006	NC_007614	AGG	2	6	154023	154028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701280
3007	NC_007614	TGC	2	6	154074	154079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701280
3008	NC_007614	ATC	2	6	154110	154115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701280
3009	NC_007614	GCC	2	6	154119	154124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701280
3010	NC_007614	GGC	2	6	154138	154143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701280
3011	NC_007614	TGG	2	6	154189	154194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_007614	CGA	2	6	154196	154201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_007614	CAG	2	6	154203	154208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_007614	GC	3	6	154213	154218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_007614	GCG	2	6	154384	154389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701281
3016	NC_007614	ACC	2	6	154427	154432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701281
3017	NC_007614	GCTGGT	2	12	154477	154488	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	82701281
3018	NC_007614	TTG	2	6	154580	154585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701281
3019	NC_007614	AAT	2	6	154691	154696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701281
3020	NC_007614	GCG	2	6	154774	154779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701281
3021	NC_007614	AGC	2	6	154824	154829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701281
3022	NC_007614	GCC	2	6	154945	154950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701281
3023	NC_007614	GGA	2	6	155047	155052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701281
3024	NC_007614	CTTA	2	8	155087	155094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_007614	AGC	2	6	155100	155105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_007614	GAG	2	6	155123	155128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_007614	TTTC	2	8	155205	155212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_007614	ATT	2	6	155314	155319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_007614	AGC	2	6	155358	155363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_007614	CCA	2	6	155406	155411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_007614	AAC	2	6	155415	155420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_007614	ATA	2	6	155563	155568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701282
3033	NC_007614	AAT	2	6	155586	155591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701282
3034	NC_007614	TTG	2	6	155650	155655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701282
3035	NC_007614	CGG	2	6	155665	155670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701282
3036	NC_007614	TGC	2	6	155671	155676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701282
3037	NC_007614	ATA	2	6	155722	155727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701282
3038	NC_007614	GGC	2	6	155729	155734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701282
3039	NC_007614	CAAATC	2	12	155796	155807	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	82701282
3040	NC_007614	CG	3	6	155838	155843	0 %	0 %	50 %	50 %	82701282
3041	NC_007614	GTA	2	6	155851	155856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701282
3042	NC_007614	TAA	2	6	155900	155905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701282
3043	NC_007614	CTC	2	6	155910	155915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701282
3044	NC_007614	TCC	2	6	155947	155952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701282
3045	NC_007614	TCC	2	6	156004	156009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701282
3046	NC_007614	CCT	2	6	156047	156052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701282
3047	NC_007614	CCG	2	6	156059	156064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701282
3048	NC_007614	CCA	2	6	156065	156070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701282
3049	NC_007614	TCC	2	6	156088	156093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701282
3050	NC_007614	CG	3	6	156105	156110	0 %	0 %	50 %	50 %	82701282
3051	NC_007614	TCT	2	6	156171	156176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701282
3052	NC_007614	CTTGA	2	10	156214	156223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3053	NC_007614	TCA	2	6	156300	156305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701283
3054	NC_007614	ACC	2	6	156321	156326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701283
3055	NC_007614	GTG	2	6	156378	156383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701283
3056	NC_007614	CTTG	2	8	156388	156395	0 %	50 %	25 %	25 %	82701283
3057	NC_007614	GCGAG	2	10	156400	156409	20 %	0 %	60 %	20 %	82701283
3058	NC_007614	TGC	2	6	156421	156426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701283
3059	NC_007614	CAC	2	6	156578	156583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701283
3060	NC_007614	AGA	2	6	156584	156589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701283
3061	NC_007614	A	6	6	156602	156607	100 %	0 %	0 %	0 %	82701283
3062	NC_007614	AG	3	6	156694	156699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_007614	CAG	2	6	156870	156875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_007614	A	6	6	156901	156906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_007614	CTCA	2	8	156945	156952	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_007614	AATG	2	8	157043	157050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_007614	G	6	6	157134	157139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_007614	AGC	2	6	157180	157185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_007614	TCT	2	6	157214	157219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701284
3070	NC_007614	GGT	2	6	157238	157243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701284
3071	NC_007614	CAA	2	6	157256	157261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701284
3072	NC_007614	CGC	2	6	157346	157351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701284
3073	NC_007614	CAA	2	6	157452	157457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701284
3074	NC_007614	CAG	2	6	157536	157541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701284
3075	NC_007614	CTG	2	6	157554	157559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701284
3076	NC_007614	AAATC	2	10	157585	157594	60 %	20 %	0 %	20 %	82701284
3077	NC_007614	CCA	2	6	157595	157600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701284
3078	NC_007614	CT	3	6	157706	157711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_007614	GCAAC	2	10	157729	157738	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3080	NC_007614	AGC	2	6	157814	157819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_007614	AGG	2	6	157837	157842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_007614	CCTTT	2	10	157853	157862	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3083	NC_007614	AAC	2	6	158009	158014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_007614	CTCC	2	8	158069	158076	0 %	25 %	0 %	75 %	82701285
3085	NC_007614	ACG	2	6	158185	158190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701285
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3087	NC_007614	CGGAT	2	10	158331	158340	20 %	20 %	40 %	20 %	82701285
3088	NC_007614	CATGAA	2	12	158574	158585	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82701285
3089	NC_007614	AAC	2	6	158676	158681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701285
3090	NC_007614	AATG	2	8	158688	158695	50 %	25 %	25 %	0 %	82701285
3091	NC_007614	CAG	2	6	158715	158720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701285
3092	NC_007614	TCCAG	2	10	158729	158738	20 %	20 %	20 %	40 %	82701285
3093	NC_007614	GAA	2	6	158796	158801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701285
3094	NC_007614	A	9	9	158806	158814	100 %	0 %	0 %	0 %	82701285
3095	NC_007614	TCG	2	6	158821	158826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701285
3096	NC_007614	CGAT	2	8	158854	158861	25 %	25 %	25 %	25 %	82701285
3097	NC_007614	GAA	2	6	158904	158909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701285
3098	NC_007614	AGC	2	6	159049	159054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701285
3099	NC_007614	GC	3	6	159087	159092	0 %	0 %	50 %	50 %	82701285
3100	NC_007614	CGC	2	6	159107	159112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701285
3101	NC_007614	AAT	2	6	159142	159147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701285
3102	NC_007614	GTG	2	6	159161	159166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701285
3103	NC_007614	CAGC	2	8	159174	159181	25 %	0 %	25 %	50 %	82701285
3104	NC_007614	CCCG	2	8	159198	159205	0 %	0 %	25 %	75 %	82701285
3105	NC_007614	AC	3	6	159272	159277	50 %	0 %	0 %	50 %	82701285
3106	NC_007614	CGG	2	6	159281	159286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701285
3107	NC_007614	CAG	2	6	159303	159308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701285
3108	NC_007614	CG	3	6	159356	159361	0 %	0 %	50 %	50 %	82701285
3109	NC_007614	CGA	2	6	159431	159436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701285
3110	NC_007614	GCCC	2	8	159513	159520	0 %	0 %	25 %	75 %	82701285
3111	NC_007614	GCA	2	6	159563	159568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701285
3112	NC_007614	GGTAA	2	10	159572	159581	40 %	20 %	40 %	0 %	82701285
3113	NC_007614	GATAG	2	10	159602	159611	40 %	20 %	40 %	0 %	82701285
3114	NC_007614	TCCA	2	8	159657	159664	25 %	25 %	0 %	50 %	82701285
3115	NC_007614	CGG	2	6	159684	159689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701285
3116	NC_007614	TTC	2	6	159690	159695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701285
3117	NC_007614	CG	3	6	159737	159742	0 %	0 %	50 %	50 %	82701285
3118	NC_007614	GC	3	6	159797	159802	0 %	0 %	50 %	50 %	82701285
3119	NC_007614	G	7	7	159864	159870	0 %	0 %	100 %	0 %	82701285
3120	NC_007614	AGCC	2	8	159891	159898	25 %	0 %	25 %	50 %	82701285
3121	NC_007614	GCG	2	6	159955	159960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701285
3122	NC_007614	GCG	2	6	159976	159981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701285
3123	NC_007614	TG	3	6	159998	160003	0 %	50 %	50 %	0 %	82701285
3124	NC_007614	GTG	3	9	160001	160009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701285
3125	NC_007614	AC	3	6	160030	160035	50 %	0 %	0 %	50 %	82701285
3126	NC_007614	ATA	2	6	160057	160062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701285
3127	NC_007614	CTG	2	6	160086	160091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701285
3128	NC_007614	AGA	2	6	160133	160138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701285
3129	NC_007614	GCA	2	6	160142	160147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701285
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3131	NC_007614	GATA	2	8	160283	160290	50 %	25 %	25 %	0 %	82701285
3132	NC_007614	T	6	6	160310	160315	0 %	100 %	0 %	0 %	82701285
3133	NC_007614	CGC	2	6	160362	160367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701285
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3235	NC_007614	ATC	2	6	164893	164898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3236	NC_007614	TCA	3	9	164914	164922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701291
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3239	NC_007614	TCCA	2	8	164971	164978	25 %	25 %	0 %	50 %	82701291
3240	NC_007614	CGA	2	6	165027	165032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701291
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3243	NC_007614	TTG	2	6	165098	165103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82701291
3244	NC_007614	ATT	2	6	165129	165134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_007614	GCA	2	6	165239	165244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_007614	CACC	2	8	165251	165258	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3247	NC_007614	GAT	2	6	165319	165324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_007614	TA	4	8	165331	165338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_007614	GC	3	6	165367	165372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_007614	GAT	2	6	165397	165402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_007614	ATA	2	6	165414	165419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_007614	GC	3	6	165431	165436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3500	NC_007614	GGT	2	6	178056	178061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701304

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