MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome

Total Repeats: 60996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_007614	GCG	2	6	103500	103505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701232
2003	NC_007614	AG	3	6	103549	103554	50 %	0 %	50 %	0 %	82701232
2004	NC_007614	TGG	2	6	103566	103571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701232
2005	NC_007614	TGC	2	6	103587	103592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701232
2006	NC_007614	GAG	2	6	103599	103604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701232
2007	NC_007614	GC	3	6	103624	103629	0 %	0 %	50 %	50 %	82701232
2008	NC_007614	GGA	2	6	103717	103722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701232
2009	NC_007614	GCG	2	6	103744	103749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701232
2010	NC_007614	CGA	2	6	103753	103758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701232
2011	NC_007614	TGA	2	6	103764	103769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701232
2012	NC_007614	GC	3	6	103847	103852	0 %	0 %	50 %	50 %	82701232
2013	NC_007614	CATG	2	8	103909	103916	25 %	25 %	25 %	25 %	82701232
2014	NC_007614	ACTC	2	8	103987	103994	25 %	25 %	0 %	50 %	82701232
2015	NC_007614	CTG	2	6	104054	104059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701232
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2017	NC_007614	AGT	2	6	104209	104214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_007614	CAT	2	6	104244	104249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_007614	TCA	2	6	104281	104286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701233
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2021	NC_007614	CGA	2	6	104381	104386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701233
2022	NC_007614	CTG	2	6	104440	104445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701233
2023	NC_007614	CGCA	2	8	104504	104511	25 %	0 %	25 %	50 %	82701233
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2027	NC_007614	GAGCAT	2	12	104657	104668	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	82701233
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2037	NC_007614	ACGG	2	8	105537	105544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2039	NC_007614	CGGG	2	8	105573	105580	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2040	NC_007614	CCA	2	6	105669	105674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701234
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2043	NC_007614	TCCT	2	8	105776	105783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2044	NC_007614	T	6	6	105787	105792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_007614	GCT	2	6	105840	105845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_007614	GAT	2	6	105884	105889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_007614	CAGGA	2	10	105943	105952	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2048	NC_007614	CTG	2	6	105977	105982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2049	NC_007614	TA	3	6	105990	105995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2052	NC_007614	GTA	2	6	106280	106285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_007614	GT	3	6	106306	106311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_007614	GACTT	2	10	106336	106345	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2055	NC_007614	GGA	2	6	106434	106439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_007614	CTGC	2	8	106506	106513	0 %	25 %	25 %	50 %	82701235
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2061	NC_007614	TTCCT	2	10	106947	106956	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2062	NC_007614	AT	3	6	107000	107005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2097	NC_007614	ATG	2	6	108983	108988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2115	NC_007614	A	7	7	109615	109621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2127	NC_007614	GGCA	2	8	110505	110512	25 %	0 %	50 %	25 %	82701239
2128	NC_007614	GGC	2	6	110530	110535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701239
2129	NC_007614	GGA	2	6	110602	110607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701239
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2131	NC_007614	GGC	2	6	110638	110643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701239
2132	NC_007614	GGC	2	6	110746	110751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701239
2133	NC_007614	ACGGG	2	10	110801	110810	20 %	0 %	60 %	20 %	82701239
2134	NC_007614	GGC	2	6	110854	110859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701239
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2138	NC_007614	GAAC	2	8	111250	111257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2139	NC_007614	AAT	2	6	111276	111281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_007614	C	6	6	111346	111351	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2141	NC_007614	AGG	2	6	111365	111370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2142	NC_007614	CGC	2	6	111444	111449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2143	NC_007614	GCT	2	6	111454	111459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2144	NC_007614	CCT	2	6	111482	111487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2145	NC_007614	CCG	2	6	111504	111509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2146	NC_007614	GCCA	2	8	111659	111666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2147	NC_007614	GCT	2	6	111734	111739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2153	NC_007614	GATG	2	8	111985	111992	25 %	25 %	50 %	0 %	82701240
2154	NC_007614	GTG	2	6	112010	112015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701240
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2157	NC_007614	TGC	2	6	112084	112089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701240
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2159	NC_007614	GCT	2	6	112162	112167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701240
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2161	NC_007614	TGG	2	6	112359	112364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701240
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2163	NC_007614	CTG	2	6	112596	112601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2166	NC_007614	G	6	6	112785	112790	0 %	0 %	100 %	0 %	82701241
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2179	NC_007614	TAT	2	6	113543	113548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2180	NC_007614	TGA	2	6	113554	113559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2189	NC_007614	AGA	2	6	114430	114435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701242
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2195	NC_007614	A	9	9	114862	114870	100 %	0 %	0 %	0 %	82701242
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2203	NC_007614	TGA	2	6	115083	115088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701242
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2228	NC_007614	GTA	2	6	116428	116433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2230	NC_007614	AGA	2	6	116531	116536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2231	NC_007614	AACC	2	8	116628	116635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2232	NC_007614	TAA	2	6	116648	116653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2233	NC_007614	CAG	2	6	116717	116722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701245
2234	NC_007614	AG	3	6	116757	116762	50 %	0 %	50 %	0 %	82701245
2235	NC_007614	CTCAA	2	10	116766	116775	40 %	20 %	0 %	40 %	82701245
2236	NC_007614	T	7	7	116793	116799	0 %	100 %	0 %	0 %	82701245
2237	NC_007614	TAA	2	6	116874	116879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701245
2238	NC_007614	ACAG	2	8	116945	116952	50 %	0 %	25 %	25 %	82701245
2239	NC_007614	AAAGA	2	10	116960	116969	80 %	0 %	20 %	0 %	82701245
2240	NC_007614	T	6	6	116977	116982	0 %	100 %	0 %	0 %	82701245
2241	NC_007614	AGCAC	2	10	117134	117143	40 %	0 %	20 %	40 %	82701245
2242	NC_007614	TCAAT	2	10	117199	117208	40 %	40 %	0 %	20 %	82701245
2243	NC_007614	T	6	6	117222	117227	0 %	100 %	0 %	0 %	82701245
2244	NC_007614	GCG	2	6	117289	117294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701245
2245	NC_007614	ATA	2	6	117297	117302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701245
2246	NC_007614	AAGAT	2	10	117456	117465	60 %	20 %	20 %	0 %	82701245
2247	NC_007614	TCC	2	6	117503	117508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701245
2248	NC_007614	GCA	2	6	117529	117534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701245
2249	NC_007614	T	6	6	117585	117590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2250	NC_007614	ATA	2	6	117705	117710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701246
2251	NC_007614	TTC	2	6	117791	117796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701246
2252	NC_007614	AAG	2	6	117816	117821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701246
2253	NC_007614	AAC	2	6	117917	117922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701246
2254	NC_007614	TTA	2	6	117942	117947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82701246
2255	NC_007614	ATA	2	6	118044	118049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701246
2256	NC_007614	GATC	2	8	118114	118121	25 %	25 %	25 %	25 %	82701246
2257	NC_007614	TGCTG	2	10	118212	118221	0 %	40 %	40 %	20 %	82701246
2258	NC_007614	GGC	2	6	118266	118271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701246
2259	NC_007614	T	6	6	118332	118337	0 %	100 %	0 %	0 %	82701246
2260	NC_007614	TGC	2	6	118379	118384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701246
2261	NC_007614	T	8	8	118395	118402	0 %	100 %	0 %	0 %	82701246
2262	NC_007614	ATC	2	6	118424	118429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701246
2263	NC_007614	A	6	6	118591	118596	100 %	0 %	0 %	0 %	82701247
2264	NC_007614	TTC	2	6	118636	118641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701247
2265	NC_007614	TGG	2	6	118680	118685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701247
2266	NC_007614	AGA	2	6	118745	118750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701247
2267	NC_007614	ACT	2	6	118842	118847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2268	NC_007614	GGA	2	6	118848	118853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2269	NC_007614	GTA	2	6	118903	118908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2270	NC_007614	A	6	6	118947	118952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2271	NC_007614	AATTA	2	10	118983	118992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2272	NC_007614	GGT	2	6	119032	119037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2273	NC_007614	T	7	7	119045	119051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2274	NC_007614	GTG	2	6	119076	119081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2275	NC_007614	GCT	2	6	119197	119202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2276	NC_007614	TAT	2	6	119231	119236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2277	NC_007614	ATCT	2	8	119262	119269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2278	NC_007614	GGAT	2	8	119270	119277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2279	NC_007614	AGTA	2	8	119315	119322	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2280	NC_007614	CTGT	2	8	119340	119347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2281	NC_007614	AGT	2	6	119361	119366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2282	NC_007614	AAAAG	2	10	119399	119408	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2283	NC_007614	AGA	2	6	119418	119423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2284	NC_007614	AAT	2	6	119435	119440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2285	NC_007614	AAGA	2	8	119459	119466	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2286	NC_007614	TAA	2	6	119484	119489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2287	NC_007614	AAT	2	6	119526	119531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701248
2288	NC_007614	AGA	2	6	119538	119543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701248
2289	NC_007614	AGGT	2	8	119564	119571	25 %	25 %	50 %	0 %	82701248
2290	NC_007614	AGCA	2	8	119633	119640	50 %	0 %	25 %	25 %	82701248
2291	NC_007614	CA	3	6	119639	119644	50 %	0 %	0 %	50 %	82701248
2292	NC_007614	TAGT	2	8	119654	119661	25 %	50 %	25 %	0 %	82701248
2293	NC_007614	AAG	2	6	119779	119784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701248
2294	NC_007614	GATA	2	8	119793	119800	50 %	25 %	25 %	0 %	82701248
2295	NC_007614	TAA	2	6	119847	119852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701248
2296	NC_007614	A	6	6	119851	119856	100 %	0 %	0 %	0 %	82701248
2297	NC_007614	AAAG	2	8	119898	119905	75 %	0 %	25 %	0 %	82701248
2298	NC_007614	TTA	2	6	120001	120006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82701248
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2300	NC_007614	GCT	2	6	120129	120134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2302	NC_007614	GTA	2	6	120258	120263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2303	NC_007614	TTAGC	2	10	120348	120357	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2304	NC_007614	CTTC	2	8	120542	120549	0 %	50 %	0 %	50 %	82701249
2305	NC_007614	TGG	2	6	120585	120590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701249
2306	NC_007614	TATG	2	8	120633	120640	25 %	50 %	25 %	0 %	82701249
2307	NC_007614	TTC	2	6	120724	120729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701249
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2311	NC_007614	TAC	2	6	121037	121042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701249
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2313	NC_007614	AT	4	8	121257	121264	50 %	50 %	0 %	0 %	82701249
2314	NC_007614	CT	3	6	121278	121283	0 %	50 %	0 %	50 %	82701249
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2320	NC_007614	AGA	2	6	121706	121711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2321	NC_007614	T	6	6	121817	121822	0 %	100 %	0 %	0 %	82701250
2322	NC_007614	TCC	2	6	121827	121832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701250
2323	NC_007614	GCC	2	6	121858	121863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701250
2324	NC_007614	TGC	2	6	121877	121882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701250
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2326	NC_007614	TGC	2	6	122040	122045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701250
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2333	NC_007614	TCC	2	6	122310	122315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701250
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2338	NC_007614	TCTTTC	4	24	122472	122495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701250
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2350	NC_007614	CAT	2	6	122855	122860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701250
2351	NC_007614	AGT	2	6	122913	122918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2352	NC_007614	GCC	2	6	122998	123003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701251
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2357	NC_007614	AGC	2	6	123304	123309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2358	NC_007614	GA	4	8	123366	123373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2359	NC_007614	CAATT	2	10	123404	123413	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2360	NC_007614	GAGCG	2	10	123426	123435	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2361	NC_007614	TA	3	6	123468	123473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2362	NC_007614	AGA	2	6	123747	123752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701252
2363	NC_007614	AACG	2	8	123841	123848	50 %	0 %	25 %	25 %	82701253
2364	NC_007614	GAA	2	6	123886	123891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701253
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2366	NC_007614	ATC	2	6	123938	123943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701253
2367	NC_007614	TCAG	2	8	123959	123966	25 %	25 %	25 %	25 %	82701253
2368	NC_007614	GCT	2	6	123973	123978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701253
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2370	NC_007614	TCTGA	2	10	124009	124018	20 %	40 %	20 %	20 %	82701253
2371	NC_007614	GCT	2	6	124066	124071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701253
2372	NC_007614	CTGCG	2	10	124259	124268	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2373	NC_007614	ATT	2	6	124333	124338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2374	NC_007614	TGCC	2	8	124362	124369	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2375	NC_007614	TCAA	2	8	124374	124381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2376	NC_007614	GTC	2	6	124400	124405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2377	NC_007614	GCA	2	6	124453	124458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2378	NC_007614	GAT	2	6	124477	124482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2379	NC_007614	AGTG	2	8	124492	124499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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