MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome

Total Repeats: 60996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007614	TGCA	2	8	25411	25418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_007614	CGAA	2	8	25445	25452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_007614	TCC	2	6	25461	25466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_007614	GCT	2	6	25527	25532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_007614	A	7	7	25577	25583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_007614	T	6	6	25642	25647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007614	CAT	2	6	25694	25699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_007614	ATTA	2	8	25729	25736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007614	AGC	2	6	25747	25752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_007614	CTT	2	6	25785	25790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_007614	TTC	2	6	25821	25826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_007614	GCC	2	6	25878	25883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_007614	TAG	2	6	25946	25951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_007614	ACA	2	6	25982	25987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_007614	TGA	2	6	26045	26050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007614	GCT	2	6	26155	26160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701161
517	NC_007614	TCC	2	6	26172	26177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701161
518	NC_007614	CAG	2	6	26229	26234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701161
519	NC_007614	CCA	2	6	26258	26263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701161
520	NC_007614	TGA	2	6	26318	26323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701161
521	NC_007614	GC	3	6	26326	26331	0 %	0 %	50 %	50 %	82701161
522	NC_007614	A	6	6	26366	26371	100 %	0 %	0 %	0 %	82701161
523	NC_007614	C	8	8	26490	26497	0 %	0 %	0 %	100 %	82701161
524	NC_007614	GCC	2	6	26530	26535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701161
525	NC_007614	CAG	3	9	26538	26546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701161
526	NC_007614	CAG	3	9	26580	26588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701161
527	NC_007614	CG	3	6	26604	26609	0 %	0 %	50 %	50 %	82701161
528	NC_007614	AGA	2	6	26635	26640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701161
529	NC_007614	GGGA	2	8	26653	26660	25 %	0 %	75 %	0 %	82701161
530	NC_007614	GGA	2	6	26692	26697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82701161
531	NC_007614	GCA	2	6	26713	26718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701161
532	NC_007614	TCC	2	6	26719	26724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701161
533	NC_007614	TCC	2	6	26728	26733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701161
534	NC_007614	ACTCCG	2	12	26737	26748	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	82701161
535	NC_007614	AGC	3	9	26749	26757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701161
536	NC_007614	GCC	3	9	26830	26838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701161
537	NC_007614	CTGC	2	8	26845	26852	0 %	25 %	25 %	50 %	82701161
538	NC_007614	GCC	2	6	26859	26864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701161
539	NC_007614	GAT	2	6	26879	26884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82701161
540	NC_007614	CGG	2	6	26910	26915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701161
541	NC_007614	GC	3	6	26945	26950	0 %	0 %	50 %	50 %	82701161
542	NC_007614	TGCC	2	8	26963	26970	0 %	25 %	25 %	50 %	82701161
543	NC_007614	TGC	2	6	26978	26983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701161
544	NC_007614	CAG	2	6	27195	27200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701161
545	NC_007614	ACG	2	6	27217	27222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701161
546	NC_007614	GAA	2	6	27243	27248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701161
547	NC_007614	G	6	6	27276	27281	0 %	0 %	100 %	0 %	82701161
548	NC_007614	T	6	6	27285	27290	0 %	100 %	0 %	0 %	82701161
549	NC_007614	CCT	2	6	27401	27406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_007614	AGG	2	6	27455	27460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_007614	GC	4	8	27499	27506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_007614	TCT	2	6	27542	27547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_007614	AGT	2	6	27589	27594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_007614	CTG	2	6	27620	27625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_007614	TAA	2	6	27627	27632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_007614	CAA	2	6	27635	27640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_007614	CAT	2	6	27755	27760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_007614	TCT	2	6	27764	27769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_007614	T	6	6	27769	27774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007614	CATTC	2	10	27818	27827	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
561	NC_007614	GCTTC	2	10	27860	27869	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
562	NC_007614	GGA	2	6	27885	27890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007614	GAT	2	6	27909	27914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007614	TCA	2	6	27920	27925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_007614	A	6	6	27935	27940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007614	ACTAAA	2	12	27963	27974	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
567	NC_007614	CGA	2	6	28116	28121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701162
568	NC_007614	AAG	2	6	28124	28129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701162
569	NC_007614	TGAA	2	8	28226	28233	50 %	25 %	25 %	0 %	82701162
570	NC_007614	CG	4	8	28269	28276	0 %	0 %	50 %	50 %	82701162
571	NC_007614	AG	3	6	28299	28304	50 %	0 %	50 %	0 %	82701162
572	NC_007614	G	6	6	28332	28337	0 %	0 %	100 %	0 %	82701162
573	NC_007614	AAC	2	6	28357	28362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82701162
574	NC_007614	GC	4	8	28391	28398	0 %	0 %	50 %	50 %	82701162
575	NC_007614	CCG	2	6	28418	28423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701162
576	NC_007614	TTC	2	6	28425	28430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701162
577	NC_007614	TGG	2	6	28472	28477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82701162
578	NC_007614	GGC	2	6	28525	28530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701162
579	NC_007614	AGCA	2	8	28551	28558	50 %	0 %	25 %	25 %	82701162
580	NC_007614	GCAA	2	8	28597	28604	50 %	0 %	25 %	25 %	82701162
581	NC_007614	AG	3	6	28618	28623	50 %	0 %	50 %	0 %	82701162
582	NC_007614	GGT	2	6	28944	28949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_007614	GAG	2	6	28985	28990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_007614	TCC	2	6	29007	29012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_007614	CCG	2	6	29040	29045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_007614	TCCC	2	8	29092	29099	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
587	NC_007614	ATC	2	6	29180	29185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_007614	TGG	2	6	29188	29193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_007614	TGC	2	6	29200	29205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_007614	AAC	2	6	29228	29233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_007614	TTTC	2	8	29245	29252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_007614	CT	3	6	29281	29286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_007614	GTCAG	2	10	29441	29450	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
594	NC_007614	TGA	2	6	29522	29527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_007614	CCTCGG	2	12	29575	29586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
596	NC_007614	GCA	2	6	29609	29614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_007614	TCG	2	6	29616	29621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_007614	CTT	2	6	29655	29660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_007614	CGGCG	2	10	29668	29677	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
600	NC_007614	CG	3	6	29684	29689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_007614	A	6	6	29721	29726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_007614	GCTT	2	8	29823	29830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_007614	T	6	6	29867	29872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_007614	TCC	2	6	29897	29902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701163
605	NC_007614	TGC	2	6	29955	29960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701163
606	NC_007614	TCA	2	6	29963	29968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82701163
607	NC_007614	CGC	2	6	29997	30002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701163
608	NC_007614	GCG	2	6	30067	30072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701163
609	NC_007614	TCC	2	6	30094	30099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82701163
610	NC_007614	ATA	2	6	30115	30120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701163
611	NC_007614	GCCA	2	8	30133	30140	25 %	0 %	25 %	50 %	82701163
612	NC_007614	CCCA	2	8	30169	30176	25 %	0 %	0 %	75 %	82701163
613	NC_007614	GCC	2	6	30193	30198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701163
614	NC_007614	GCC	2	6	30229	30234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82701163
615	NC_007614	AGC	2	6	30290	30295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701163
616	NC_007614	TTA	2	6	30441	30446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82701164
617	NC_007614	AGA	2	6	30454	30459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82701164
618	NC_007614	GC	3	6	30470	30475	0 %	0 %	50 %	50 %	82701164
619	NC_007614	CTGTT	2	10	30476	30485	0 %	60 %	20 %	20 %	82701164
620	NC_007614	ATT	3	9	30511	30519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82701164
621	NC_007614	ATA	2	6	30557	30562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82701164
622	NC_007614	CTG	2	6	30575	30580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82701164
623	NC_007614	TTC	2	6	30585	30590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82701164
624	NC_007614	CGG	2	6	30640	30645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701164
625	NC_007614	TC	4	8	30797	30804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_007614	GGA	2	6	30818	30823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_007614	CCA	2	6	31041	31046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701165
628	NC_007614	TCCG	2	8	31204	31211	0 %	25 %	25 %	50 %	82701165
629	NC_007614	CAG	2	6	31237	31242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701165
630	NC_007614	GGC	2	6	31255	31260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82701165
631	NC_007614	GCA	2	6	31316	31321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82701165
632	NC_007614	CG	4	8	31353	31360	0 %	0 %	50 %	50 %	82701165
633	NC_007614	CCA	2	6	31368	31373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82701165
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635	NC_007614	CATC	2	8	31413	31420	25 %	25 %	0 %	50 %	82701165
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