MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 plasmid A

Total Repeats: 515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007483	TGC	2	6	95	100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007483	GTT	3	9	159	167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007483	ATG	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007483	GTG	2	6	371	376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163518
5	NC_007483	GCC	2	6	477	482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163518
6	NC_007483	TCC	2	6	629	634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163518
7	NC_007483	GCC	2	6	684	689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163518
8	NC_007483	CAT	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163518
9	NC_007483	CCA	2	6	825	830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163518
10	NC_007483	GTA	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163518
11	NC_007483	CTC	2	6	910	915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163518
12	NC_007483	GCC	2	6	1180	1185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163519
13	NC_007483	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163519
14	NC_007483	TCA	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163519
15	NC_007483	CCT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163519
16	NC_007483	GCC	2	6	1468	1473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163519
17	NC_007483	CCT	3	9	1574	1582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163519
18	NC_007483	TTG	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163519
19	NC_007483	GTT	2	6	1592	1597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163519
20	NC_007483	TAG	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007483	TCA	2	6	1772	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007483	CTC	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007483	CAA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007483	CCA	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163520
25	NC_007483	CCT	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163522
26	NC_007483	CGG	2	6	2925	2930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
27	NC_007483	AAC	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163522
28	NC_007483	ACC	2	6	3040	3045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
29	NC_007483	ACT	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163522
30	NC_007483	GAA	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163522
31	NC_007483	ACC	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
32	NC_007483	ACC	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
33	NC_007483	CGG	2	6	3234	3239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
34	NC_007483	GGC	2	6	3255	3260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
35	NC_007483	GCA	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
36	NC_007483	GCA	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
37	NC_007483	GCA	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
38	NC_007483	ACC	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
39	NC_007483	AGC	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
40	NC_007483	GGC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
41	NC_007483	ACC	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
42	NC_007483	GAA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163522
43	NC_007483	AAC	2	6	3816	3821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163522
44	NC_007483	AGG	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163522
45	NC_007483	CGG	2	6	3913	3918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
46	NC_007483	CGG	2	6	3927	3932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
47	NC_007483	GCC	2	6	3999	4004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163522
48	NC_007483	GCC	2	6	4028	4033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_007483	CAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007483	GCC	2	6	4068	4073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007483	CGC	2	6	4102	4107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007483	CCG	2	6	4136	4141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007483	ACG	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007483	AGA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007483	ATG	2	6	4508	4513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007483	ACT	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163523
57	NC_007483	GAA	2	6	4679	4684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163523
58	NC_007483	CGC	2	6	4736	4741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163523
59	NC_007483	ATA	2	6	4913	4918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163524
60	NC_007483	TGC	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163524
61	NC_007483	CCT	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163524
62	NC_007483	AGC	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163524
63	NC_007483	CTG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163524
64	NC_007483	TGA	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163524
65	NC_007483	GAG	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163524
66	NC_007483	TTC	2	6	5435	5440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007483	CCG	2	6	5490	5495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
68	NC_007483	ATT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163525
69	NC_007483	AAT	2	6	5768	5773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
70	NC_007483	CAC	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163525
71	NC_007483	ACC	2	6	6123	6128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163525
72	NC_007483	TCA	2	6	6171	6176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163525
73	NC_007483	GCT	2	6	6178	6183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163525
74	NC_007483	TGC	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163525
75	NC_007483	GCC	2	6	6332	6337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
76	NC_007483	CTT	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163525
77	NC_007483	CCT	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163525
78	NC_007483	CCG	2	6	6532	6537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
79	NC_007483	TAA	2	6	6647	6652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
80	NC_007483	ATA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
81	NC_007483	CTC	2	6	6673	6678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007483	AAG	2	6	6820	6825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007483	AAC	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163526
84	NC_007483	CAG	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163526
85	NC_007483	CAG	2	6	6949	6954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163526
86	NC_007483	GCT	2	6	6985	6990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163526
87	NC_007483	GTC	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163526
88	NC_007483	CTC	2	6	7157	7162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163526
89	NC_007483	CCT	3	9	7178	7186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163526
90	NC_007483	CGC	2	6	7197	7202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163526
91	NC_007483	TGA	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163526
92	NC_007483	TGG	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163527
93	NC_007483	TGA	2	6	7435	7440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163527
94	NC_007483	CGG	2	6	7640	7645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163527
95	NC_007483	GAA	2	6	7661	7666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163527
96	NC_007483	AGG	2	6	7669	7674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163527
97	NC_007483	ACG	2	6	7708	7713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163527
98	NC_007483	GTG	2	6	7796	7801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163527
99	NC_007483	GCT	2	6	7909	7914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163527
100	NC_007483	GGA	2	6	8049	8054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163527
101	NC_007483	TTA	2	6	8205	8210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163528
102	NC_007483	CTG	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163528
103	NC_007483	CTT	2	6	8333	8338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163528
104	NC_007483	AGC	2	6	8384	8389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163528
105	NC_007483	CCA	2	6	8427	8432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163528
106	NC_007483	AGT	2	6	8525	8530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163528
107	NC_007483	CGG	2	6	8544	8549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163528
108	NC_007483	AGC	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163528
109	NC_007483	TTG	2	6	8618	8623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163528
110	NC_007483	GAA	2	6	8677	8682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163528
111	NC_007483	GGA	2	6	8857	8862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163528
112	NC_007483	ATT	2	6	8898	8903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163528
113	NC_007483	GAT	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163529
114	NC_007483	AAG	2	6	8961	8966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163529
115	NC_007483	GCT	2	6	8991	8996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163529
116	NC_007483	CTT	2	6	9023	9028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163529
117	NC_007483	CTT	2	6	9062	9067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163529
118	NC_007483	ATA	2	6	9268	9273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163529
119	NC_007483	CGA	2	6	9524	9529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163529
120	NC_007483	TCA	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007483	ATC	2	6	9699	9704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007483	ATC	2	6	9731	9736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007483	TTC	2	6	9752	9757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007483	GGT	2	6	9918	9923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163530
125	NC_007483	CAG	2	6	9946	9951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163530
126	NC_007483	AGC	2	6	10031	10036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163530
127	NC_007483	GGT	2	6	10072	10077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163530
128	NC_007483	GCT	2	6	10254	10259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163530
129	NC_007483	TAC	2	6	10275	10280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163530
130	NC_007483	GAC	2	6	10367	10372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163530
131	NC_007483	ATC	2	6	10393	10398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163530
132	NC_007483	GCA	2	6	10508	10513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163530
133	NC_007483	CTC	2	6	10558	10563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163530
134	NC_007483	GCG	2	6	10576	10581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163530
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262	NC_007483	GAA	2	6	19938	19943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163540
263	NC_007483	CAT	2	6	19964	19969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163540
264	NC_007483	CTT	2	6	20282	20287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163540
265	NC_007483	AGA	3	9	20528	20536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163540
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268	NC_007483	ATC	2	6	20823	20828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_007483	TCA	2	6	20832	20837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_007483	TCC	2	6	20877	20882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_007483	TTA	2	6	20982	20987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_007483	ATA	2	6	21007	21012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_007483	CGT	2	6	23556	23561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_007483	CAC	2	6	23769	23774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
298	NC_007483	GAT	2	6	23814	23819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_007483	CCG	2	6	23954	23959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
302	NC_007483	TGC	2	6	24046	24051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163545
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