MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL23

Total Repeats: 402

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007428	CGA	2	6	147	152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007428	AAC	2	6	279	284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007428	TCG	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007428	TGG	2	6	456	461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007428	CGA	2	6	515	520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007428	GAA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007428	GCG	2	6	593	598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007428	GCT	2	6	648	653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007428	TGC	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007428	ACA	3	9	720	728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007428	GGT	2	6	772	777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007428	TCG	2	6	839	844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007428	CTG	2	6	846	851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007428	ACG	2	6	958	963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007428	CGA	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803318
16	NC_007428	GAG	2	6	1096	1101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803318
17	NC_007428	CGC	2	6	1114	1119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803318
18	NC_007428	CTG	2	6	1195	1200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803318
19	NC_007428	TGC	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803318
20	NC_007428	AGC	2	6	1242	1247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803318
21	NC_007428	ACC	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007428	TAG	2	6	1771	1776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007428	GTC	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803319
24	NC_007428	TGC	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803319
25	NC_007428	CCA	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803319
26	NC_007428	ACT	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803320
27	NC_007428	CGT	2	6	2465	2470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803320
28	NC_007428	CTC	2	6	2586	2591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_007428	CCG	2	6	2775	2780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007428	CCT	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803321
31	NC_007428	CGT	2	6	3000	3005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
32	NC_007428	GTC	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
33	NC_007428	GTA	2	6	3091	3096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803321
34	NC_007428	TGG	2	6	3108	3113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803321
35	NC_007428	CTT	2	6	3124	3129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803321
36	NC_007428	AGT	2	6	3168	3173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803321
37	NC_007428	TCC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803321
38	NC_007428	CGG	2	6	3299	3304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803321
39	NC_007428	TCC	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803321
40	NC_007428	TCG	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
41	NC_007428	GTC	2	6	3392	3397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
42	NC_007428	CAG	2	6	3452	3457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803321
43	NC_007428	GAA	2	6	3547	3552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803321
44	NC_007428	GCT	2	6	3584	3589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803321
45	NC_007428	CGG	2	6	3627	3632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803321
46	NC_007428	CAT	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803322
47	NC_007428	ATC	2	6	3783	3788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803322
48	NC_007428	GCG	2	6	3791	3796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803322
49	NC_007428	CTT	2	6	3828	3833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803322
50	NC_007428	TCG	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
51	NC_007428	CGT	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
52	NC_007428	TCG	2	6	4021	4026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
53	NC_007428	CGT	2	6	4043	4048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
54	NC_007428	GGC	3	9	4062	4070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803322
55	NC_007428	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803322
56	NC_007428	TCG	3	9	4195	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803322
57	NC_007428	GTC	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803323
58	NC_007428	GCC	2	6	4261	4266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803323
59	NC_007428	GCT	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803323
60	NC_007428	CGG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803323
61	NC_007428	CGG	2	6	4684	4689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803324
62	NC_007428	GAT	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803324
63	NC_007428	AGG	2	6	4761	4766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803324
64	NC_007428	GTC	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
65	NC_007428	TGC	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
66	NC_007428	GCT	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
67	NC_007428	CTG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803324
68	NC_007428	CTT	2	6	4870	4875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803324
69	NC_007428	CGT	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803325
70	NC_007428	CGG	2	6	4999	5004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803325
71	NC_007428	GAT	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803325
72	NC_007428	GGT	2	6	5105	5110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803325
73	NC_007428	GCA	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803325
74	NC_007428	GCT	2	6	5152	5157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803325
75	NC_007428	TCG	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803325
76	NC_007428	CTT	2	6	5200	5205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803325
77	NC_007428	ACT	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007428	CGT	3	9	5298	5306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803326
79	NC_007428	TGC	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803326
80	NC_007428	CAT	2	6	5388	5393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803326
81	NC_007428	TCG	2	6	5429	5434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803326
82	NC_007428	GGC	2	6	5442	5447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803326
83	NC_007428	GCT	2	6	5528	5533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803327
84	NC_007428	GCG	2	6	5538	5543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803327
85	NC_007428	TCG	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803327
86	NC_007428	GTG	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803327
87	NC_007428	CGT	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803327
88	NC_007428	CGC	2	6	5663	5668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803327
89	NC_007428	CCG	2	6	5757	5762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803327
90	NC_007428	CGA	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803327
91	NC_007428	AGC	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803328
92	NC_007428	CAG	2	6	5863	5868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803328
93	NC_007428	GCT	2	6	5881	5886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803328
94	NC_007428	CAA	2	6	6069	6074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803328
95	NC_007428	GCT	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803328
96	NC_007428	GGC	2	6	6122	6127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803328
97	NC_007428	TCC	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803328
98	NC_007428	GAG	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803328
99	NC_007428	GCC	2	6	6275	6280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803328
100	NC_007428	CGC	2	6	6300	6305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803328
101	NC_007428	GAA	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803328
102	NC_007428	CCG	2	6	6436	6441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803329
103	NC_007428	GGT	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803329
104	NC_007428	TGC	2	6	6652	6657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803329
105	NC_007428	CTG	2	6	6724	6729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803329
106	NC_007428	GAC	3	9	6748	6756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803329
107	NC_007428	CGA	2	6	6765	6770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
108	NC_007428	CGA	3	9	6777	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
109	NC_007428	CGG	2	6	6888	6893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803330
110	NC_007428	AAG	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803330
111	NC_007428	CGG	2	6	6999	7004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803330
112	NC_007428	TCG	2	6	7019	7024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803330
113	NC_007428	AGG	2	6	7028	7033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803330
114	NC_007428	GAG	2	6	7075	7080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803330
115	NC_007428	CGA	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
116	NC_007428	CGA	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
117	NC_007428	ACT	2	6	7262	7267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803330
118	NC_007428	GGT	2	6	7348	7353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803330
119	NC_007428	ACA	2	6	7409	7414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803330
120	NC_007428	ACG	2	6	7442	7447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
121	NC_007428	CAA	2	6	7464	7469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803330
122	NC_007428	GAC	3	9	7491	7499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
123	NC_007428	GGA	2	6	7521	7526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76803330
124	NC_007428	CGA	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803330
125	NC_007428	TGC	3	9	7583	7591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803330
126	NC_007428	GCC	2	6	7597	7602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803330
127	NC_007428	ATC	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803330
128	NC_007428	CGG	2	6	7650	7655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803330
129	NC_007428	CGG	2	6	7662	7667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803330
130	NC_007428	GTC	2	6	7668	7673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803330
131	NC_007428	GCT	2	6	7683	7688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803330
132	NC_007428	CGC	2	6	7777	7782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803331
133	NC_007428	CGG	2	6	7857	7862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803331
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258	NC_007428	GCT	2	6	14693	14698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803340
259	NC_007428	CGA	2	6	14716	14721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803340
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382	NC_007428	GTA	2	6	22012	22017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803349
383	NC_007428	CCT	2	6	22068	22073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803349
384	NC_007428	AGC	2	6	22100	22105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803349
385	NC_007428	TCG	2	6	22169	22174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803349
386	NC_007428	ACC	2	6	22189	22194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803350
387	NC_007428	GTC	2	6	22199	22204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803350
388	NC_007428	GGT	2	6	22268	22273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803350
389	NC_007428	GAC	2	6	22398	22403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803350
390	NC_007428	GTC	2	6	22411	22416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803350
391	NC_007428	CGA	2	6	22585	22590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803351
392	NC_007428	CGC	2	6	22654	22659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803352
393	NC_007428	CTT	2	6	22770	22775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803352
394	NC_007428	CCT	2	6	22827	22832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803352
395	NC_007428	TCT	2	6	22839	22844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803352
396	NC_007428	GTC	2	6	22923	22928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803353
397	NC_007428	CTG	2	6	22982	22987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803353
398	NC_007428	CAC	2	6	23001	23006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
399	NC_007428	GCG	2	6	23086	23091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_007428	AGC	2	6	23216	23221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_007428	GCT	3	9	23230	23238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_007428	GAC	2	6	23345	23350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.