MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	AGCGGA	2	12	3490	3501	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	76803371
2	NC_007427	CCAGAA	2	12	7351	7362	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	76803378
3	NC_007427	GGCGAC	2	12	7540	7551	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	76803378
4	NC_007427	TGACCG	2	12	9549	9560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	76803380
5	NC_007427	TGGGTC	2	12	10024	10035	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	76803380
6	NC_007427	AGAGCG	2	12	10482	10493	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	76803380
7	NC_007427	CATCGA	2	12	28615	28626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	76803396
8	NC_007427	CCGTCT	2	12	30478	30489	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007427	AAGCCC	2	12	30785	30796	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007427	GGACTG	2	12	32878	32889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	76803401
11	NC_007427	CGCTCG	2	12	34996	35007	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	76803403
12	NC_007427	CCTCGA	2	12	35297	35308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	76803403
13	NC_007427	CGATGT	2	12	38743	38754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	76803407
14	NC_007427	GTCGGC	2	12	40188	40199	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	76803409
15	NC_007427	TCGAGA	2	12	40432	40443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	76803409
16	NC_007427	GTCATG	2	12	42511	42522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	76803412
17	NC_007427	TTCGAT	2	12	45472	45483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	76803414
18	NC_007427	GTCGAA	2	12	50259	50270	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	76803418
19	NC_007427	GGGCCG	2	12	51414	51425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803420
20	NC_007427	GACCCG	2	12	55059	55070	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	76803424
21	NC_007427	GCGAAG	2	12	58854	58865	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	76803428
22	NC_007427	CTTCGA	2	12	60253	60264	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	76803429
23	NC_007427	TTCCGC	2	12	60722	60733	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	76803429
24	NC_007427	CCTACA	2	12	61733	61744	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	76803432
25	NC_007427	AGGAGA	2	12	71081	71092	50 %	0 %	50 %	0 %	76803442
26	NC_007427	GATTGC	2	12	78796	78807	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007427	CGCCGA	2	12	81783	81794	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	76803451
28	NC_007427	TCGCAA	2	12	85876	85887	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	76803454
29	NC_007427	ATCTAC	2	12	86016	86027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803454
30	NC_007427	TGACCG	2	12	86826	86837	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	76803455
31	NC_007427	TCAGCG	2	12	87620	87631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	76803456
32	NC_007427	GAGCGA	2	12	89731	89742	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	76803458
33	NC_007427	TGGGAC	2	12	90166	90177	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	76803458
34	NC_007427	CTTCGA	2	12	92975	92986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	76803459
35	NC_007427	AACAGC	2	12	93129	93140	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	76803460
36	NC_007427	ACGGTG	2	12	98090	98101	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	76803462
37	NC_007427	GCCGGG	2	12	103968	103979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803466
38	NC_007427	TTCGAG	2	12	115637	115648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	76803480
39	NC_007427	GTTCCG	2	12	117833	117844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803483
40	NC_007427	TGGGCG	2	12	118004	118015	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	76803483
41	NC_007427	AGCGGC	2	12	125876	125887	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007427	GGCGAG	2	12	125959	125970	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.