MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 2334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006363	GC	3	6	37709	37714	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
1002	NC_006363	TCG	2	6	37725	37730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1003	NC_006363	TGG	2	6	37791	37796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027848
1004	NC_006363	CGGGTG	2	12	37799	37810	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	54027848
1005	NC_006363	GCC	2	6	37817	37822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1006	NC_006363	CCG	2	6	37917	37922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1007	NC_006363	CCA	2	6	37938	37943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027848
1008	NC_006363	CGG	2	6	37950	37955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027848
1009	NC_006363	CGCCCG	2	12	37989	38000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1010	NC_006363	CCG	2	6	38007	38012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1011	NC_006363	CGC	2	6	38062	38067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1012	NC_006363	GAC	2	6	38071	38076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1013	NC_006363	CGA	2	6	38086	38091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1014	NC_006363	CAGT	2	8	38107	38114	25 %	25 %	25 %	25 %	54027848
1015	NC_006363	GCA	2	6	38140	38145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1016	NC_006363	TGC	2	6	38148	38153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1017	NC_006363	CCA	2	6	38173	38178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027848
1018	NC_006363	GC	3	6	38179	38184	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
1019	NC_006363	GCC	4	12	38186	38197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1020	NC_006363	GGC	2	6	38200	38205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027848
1021	NC_006363	GCC	2	6	38222	38227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1022	NC_006363	CGC	3	9	38245	38253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1023	NC_006363	CGC	2	6	38347	38352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1024	NC_006363	CTCGAC	2	12	38435	38446	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027848
1025	NC_006363	CGC	2	6	38512	38517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1026	NC_006363	GCC	2	6	38519	38524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1027	NC_006363	CG	3	6	38563	38568	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
1028	NC_006363	CGA	2	6	38581	38586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1029	NC_006363	CGC	2	6	38608	38613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1030	NC_006363	GC	3	6	38626	38631	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
1031	NC_006363	CAG	2	6	38693	38698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1032	NC_006363	TCG	2	6	38718	38723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1033	NC_006363	CGC	2	6	38743	38748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1034	NC_006363	TGA	2	6	38755	38760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027848
1035	NC_006363	CGG	2	6	38787	38792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027848
1036	NC_006363	GAG	2	6	38795	38800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027848
1037	NC_006363	GTC	2	6	38805	38810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1038	NC_006363	TGG	2	6	38823	38828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027848
1039	NC_006363	GAG	2	6	38837	38842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027848
1040	NC_006363	AGC	2	6	38883	38888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1041	NC_006363	CG	3	6	38929	38934	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
1042	NC_006363	GGA	2	6	38956	38961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027848
1043	NC_006363	GCC	2	6	38969	38974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1044	NC_006363	CCG	2	6	39006	39011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1045	NC_006363	CGA	2	6	39049	39054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1046	NC_006363	CGA	2	6	39058	39063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1047	NC_006363	CTC	2	6	39083	39088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027848
1048	NC_006363	GCC	2	6	39107	39112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1049	NC_006363	CGA	2	6	39130	39135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1050	NC_006363	GCC	2	6	39164	39169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1051	NC_006363	GATCA	2	10	39233	39242	40 %	20 %	20 %	20 %	54027848
1052	NC_006363	TGC	2	6	39249	39254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1053	NC_006363	AGGC	2	8	39264	39271	25 %	0 %	50 %	25 %	54027848
1054	NC_006363	GTT	2	6	39292	39297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027848
1055	NC_006363	CGA	2	6	39301	39306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1056	NC_006363	TCG	2	6	39321	39326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1057	NC_006363	ACA	2	6	39354	39359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027848
1058	NC_006363	CAG	2	6	39428	39433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1059	NC_006363	ACA	2	6	39450	39455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027848
1060	NC_006363	CGC	2	6	39496	39501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1061	NC_006363	ACG	2	6	39514	39519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
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1063	NC_006363	GGC	2	6	39569	39574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027848
1064	NC_006363	AGC	2	6	39609	39614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1065	NC_006363	GC	3	6	39616	39621	0 %	0 %	50 %	50 %	54027848
1066	NC_006363	CGG	2	6	39622	39627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027848
1067	NC_006363	CGA	3	9	39631	39639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027848
1068	NC_006363	GCC	2	6	39659	39664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1069	NC_006363	TCC	2	6	39668	39673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027848
1070	NC_006363	GCC	2	6	39703	39708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027848
1071	NC_006363	CAC	2	6	39724	39729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027848
1072	NC_006363	ACC	2	6	39759	39764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027848
1073	NC_006363	CAA	2	6	39766	39771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027848
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1075	NC_006363	CAG	2	6	39842	39847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
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1079	NC_006363	GCC	3	9	39969	39977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1080	NC_006363	TGG	2	6	39978	39983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027849
1081	NC_006363	TCGCCC	2	12	39999	40010	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	54027849
1082	NC_006363	GGC	2	6	40042	40047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027849
1083	NC_006363	CACC	2	8	40066	40073	25 %	0 %	0 %	75 %	54027849
1084	NC_006363	CGC	2	6	40081	40086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1085	NC_006363	CGC	2	6	40091	40096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
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1088	NC_006363	CCA	2	6	40197	40202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027849
1089	NC_006363	ACCA	2	8	40265	40272	50 %	0 %	0 %	50 %	54027849
1090	NC_006363	CCG	2	6	40282	40287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1091	NC_006363	GCC	2	6	40316	40321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1092	NC_006363	GGT	2	6	40328	40333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027849
1093	NC_006363	CGG	2	6	40398	40403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027849
1094	NC_006363	ACACCG	2	12	40425	40436	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	54027849
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1096	NC_006363	CCG	2	6	40479	40484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1097	NC_006363	GCC	2	6	40517	40522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1098	NC_006363	ACC	2	6	40598	40603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027849
1099	NC_006363	TCG	2	6	40641	40646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1100	NC_006363	CGT	2	6	40648	40653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1101	NC_006363	CGG	2	6	40728	40733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027849
1102	NC_006363	GCA	2	6	40734	40739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1103	NC_006363	CGG	2	6	40754	40759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027849
1104	NC_006363	AGC	2	6	40761	40766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1105	NC_006363	GCTG	2	8	40777	40784	0 %	25 %	50 %	25 %	54027849
1106	NC_006363	GTGCG	2	10	40787	40796	0 %	20 %	60 %	20 %	54027849
1107	NC_006363	ACCG	2	8	40802	40809	25 %	0 %	25 %	50 %	54027849
1108	NC_006363	GACC	2	8	40840	40847	25 %	0 %	25 %	50 %	54027849
1109	NC_006363	CCG	2	6	40851	40856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1110	NC_006363	TCG	2	6	40884	40889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1111	NC_006363	CTG	2	6	40925	40930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1112	NC_006363	TGA	2	6	40986	40991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027849
1113	NC_006363	CAG	2	6	41003	41008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1114	NC_006363	AGC	2	6	41103	41108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1115	NC_006363	CGA	3	9	41179	41187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1116	NC_006363	CGA	2	6	41209	41214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1117	NC_006363	CCG	2	6	41241	41246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1118	NC_006363	CCA	3	9	41271	41279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027849
1119	NC_006363	CCA	2	6	41305	41310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027849
1120	NC_006363	CCG	2	6	41316	41321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1121	NC_006363	CGA	2	6	41386	41391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1122	NC_006363	GCA	2	6	41394	41399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1123	NC_006363	CGC	2	6	41438	41443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1124	NC_006363	GCA	2	6	41550	41555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1125	NC_006363	GCT	2	6	41584	41589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1126	NC_006363	ACA	2	6	41641	41646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027849
1127	NC_006363	ACC	2	6	41681	41686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027849
1128	NC_006363	GTC	2	6	41696	41701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1129	NC_006363	CGC	2	6	41750	41755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1130	NC_006363	CGC	3	9	41785	41793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1131	NC_006363	CGA	2	6	41797	41802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027849
1132	NC_006363	GCC	2	6	41822	41827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1133	NC_006363	CCG	2	6	41829	41834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027849
1134	NC_006363	CCA	2	6	41841	41846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027849
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1137	NC_006363	CTT	2	6	42034	42039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027850
1138	NC_006363	GCC	2	6	42040	42045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027850
1139	NC_006363	CGA	3	9	42094	42102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027850
1140	NC_006363	TTC	2	6	42110	42115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027850
1141	NC_006363	GCC	2	6	42119	42124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027850
1142	NC_006363	GCC	2	6	42140	42145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027850
1143	NC_006363	GCC	2	6	42160	42165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027850
1144	NC_006363	TCCT	2	8	42194	42201	0 %	50 %	0 %	50 %	54027850
1145	NC_006363	CGG	2	6	42324	42329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1146	NC_006363	CAT	2	6	42349	42354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1147	NC_006363	GTG	2	6	42393	42398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027851
1148	NC_006363	GTT	3	9	42414	42422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027851
1149	NC_006363	GCGCTC	2	12	42427	42438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	54027851
1150	NC_006363	GAG	2	6	42451	42456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027851
1151	NC_006363	CGC	2	6	42459	42464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027851
1152	NC_006363	CGG	2	6	42483	42488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027851
1153	NC_006363	CTG	3	9	42505	42513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027851
1154	NC_006363	CCA	2	6	42524	42529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027851
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1156	NC_006363	TGC	2	6	42551	42556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027851
1157	NC_006363	GGC	2	6	42557	42562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027851
1158	NC_006363	GCC	2	6	42643	42648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027851
1159	NC_006363	GCC	2	6	42673	42678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027851
1160	NC_006363	CAG	2	6	42697	42702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027851
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1162	NC_006363	ATC	2	6	42751	42756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027851
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1164	NC_006363	GTC	2	6	42877	42882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027851
1165	NC_006363	ACC	2	6	42889	42894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027851
1166	NC_006363	ACC	2	6	42925	42930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027851
1167	NC_006363	CCA	3	9	42938	42946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027851
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1176	NC_006363	CGG	2	6	43224	43229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1192	NC_006363	CG	3	6	43862	43867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1193	NC_006363	GTC	2	6	43918	43923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027853
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1200	NC_006363	CAG	2	6	44029	44034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027853
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1209	NC_006363	TCG	2	6	44439	44444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1212	NC_006363	GCG	2	6	44495	44500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1220	NC_006363	ACC	3	9	44882	44890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1221	NC_006363	CAGC	2	8	44923	44930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1222	NC_006363	CGG	3	9	44941	44949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1223	NC_006363	CGG	2	6	44963	44968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1224	NC_006363	CAC	2	6	44972	44977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1236	NC_006363	CGAG	2	8	45489	45496	25 %	0 %	50 %	25 %	54027854
1237	NC_006363	TGGC	2	8	45505	45512	0 %	25 %	50 %	25 %	54027854
1238	NC_006363	GCC	2	6	45617	45622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027854
1239	NC_006363	ACT	2	6	45693	45698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027854
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1243	NC_006363	CAC	2	6	45948	45953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027854
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1246	NC_006363	CCTGG	2	10	45987	45996	0 %	20 %	40 %	40 %	54027854
1247	NC_006363	ACCC	2	8	46043	46050	25 %	0 %	0 %	75 %	54027854
1248	NC_006363	ACA	2	6	46085	46090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027854
1249	NC_006363	ACC	2	6	46108	46113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027854
1250	NC_006363	CTTG	2	8	46227	46234	0 %	50 %	25 %	25 %	54027854
1251	NC_006363	ATC	2	6	46247	46252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027854
1252	NC_006363	CG	3	6	46361	46366	0 %	0 %	50 %	50 %	54027854
1253	NC_006363	CA	3	6	46396	46401	50 %	0 %	0 %	50 %	54027854
1254	NC_006363	GC	3	6	46403	46408	0 %	0 %	50 %	50 %	54027854
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1262	NC_006363	CGCCTA	2	12	46872	46883	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027854
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1373	NC_006363	ACCA	2	8	52014	52021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1374	NC_006363	GCTC	2	8	52058	52065	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1375	NC_006363	CG	3	6	52129	52134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1378	NC_006363	CCCG	2	8	52235	52242	0 %	0 %	25 %	75 %	54027861
1379	NC_006363	AGG	2	6	52255	52260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027861
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1381	NC_006363	CGGG	2	8	52314	52321	0 %	0 %	75 %	25 %	54027861
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1383	NC_006363	CCG	2	6	52354	52359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027861
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1482	NC_006363	GCCT	2	8	56227	56234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1486	NC_006363	CTC	2	6	56427	56432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1495	NC_006363	CCTG	2	8	56920	56927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1496	NC_006363	GCC	2	6	56935	56940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1497	NC_006363	GGTGT	2	10	56954	56963	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1498	NC_006363	TTC	2	6	57035	57040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1499	NC_006363	CAGG	2	8	57142	57149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1500	NC_006363	GCA	2	6	57154	57159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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