MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF2

Total Repeats: 2334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006363	GCA	2	6	19286	19291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027830
502	NC_006363	CGG	4	12	19292	19303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027830
503	NC_006363	CGT	2	6	19348	19353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_006363	AGCGA	2	10	19356	19365	40 %	0 %	40 %	20 %	54027831
505	NC_006363	CGA	2	6	19419	19424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
506	NC_006363	GGTC	2	8	19488	19495	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
507	NC_006363	TCC	2	6	19562	19567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027831
508	NC_006363	TGG	2	6	19605	19610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027831
509	NC_006363	CTT	3	9	19645	19653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027831
510	NC_006363	CGG	2	6	19701	19706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
511	NC_006363	GGC	2	6	19773	19778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
512	NC_006363	GCA	2	6	19833	19838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
513	NC_006363	TCT	2	6	19839	19844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027831
514	NC_006363	GCG	2	6	19853	19858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
515	NC_006363	GTA	2	6	19900	19905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
516	NC_006363	TCG	2	6	19928	19933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
517	NC_006363	TGT	2	6	19974	19979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027831
518	NC_006363	GCT	2	6	20011	20016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
519	NC_006363	GAC	2	6	20053	20058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
520	NC_006363	GAA	2	6	20080	20085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027831
521	NC_006363	ACC	2	6	20089	20094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027831
522	NC_006363	TGAGCA	2	12	20133	20144	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54027831
523	NC_006363	TGCG	2	8	20327	20334	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
524	NC_006363	GGTG	2	8	20343	20350	0 %	25 %	75 %	0 %	54027831
525	NC_006363	GTTGG	2	10	20393	20402	0 %	40 %	60 %	0 %	54027831
526	NC_006363	CGG	2	6	20421	20426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
527	NC_006363	TTCG	2	8	20428	20435	0 %	50 %	25 %	25 %	54027831
528	NC_006363	AGT	2	6	20460	20465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
529	NC_006363	AGT	2	6	20538	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
530	NC_006363	GTC	2	6	20564	20569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
531	NC_006363	TGGC	2	8	20634	20641	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
532	NC_006363	TCG	2	6	20654	20659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
533	NC_006363	GTTG	2	8	20664	20671	0 %	50 %	50 %	0 %	54027831
534	NC_006363	GAT	2	6	20737	20742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
535	NC_006363	GTA	2	6	20785	20790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
536	NC_006363	GCC	2	6	20875	20880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
537	NC_006363	GTTG	2	8	20910	20917	0 %	50 %	50 %	0 %	54027831
538	NC_006363	TCG	2	6	20951	20956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
539	NC_006363	CGG	2	6	20979	20984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
540	NC_006363	GCC	2	6	21001	21006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
541	NC_006363	CGA	2	6	21021	21026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
542	NC_006363	TTG	2	6	21032	21037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027831
543	NC_006363	CGGT	2	8	21044	21051	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
544	NC_006363	GTTC	2	8	21097	21104	0 %	50 %	25 %	25 %	54027831
545	NC_006363	GCG	2	6	21116	21121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
546	NC_006363	CCGA	2	8	21194	21201	25 %	0 %	25 %	50 %	54027831
547	NC_006363	GAC	2	6	21220	21225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
548	NC_006363	CGTT	2	8	21257	21264	0 %	50 %	25 %	25 %	54027831
549	NC_006363	ATC	2	6	21278	21283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027831
550	NC_006363	CGG	2	6	21357	21362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
551	NC_006363	CTT	2	6	21366	21371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027831
552	NC_006363	GGT	2	6	21391	21396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027831
553	NC_006363	GAG	2	6	21427	21432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027831
554	NC_006363	TGA	2	6	21489	21494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
555	NC_006363	GGTGCC	2	12	21523	21534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027831
556	NC_006363	CGG	2	6	21606	21611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
557	NC_006363	GGA	2	6	21615	21620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027831
558	NC_006363	CGA	2	6	21627	21632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
559	NC_006363	GAA	2	6	21691	21696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027831
560	NC_006363	CGG	2	6	21735	21740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
561	NC_006363	CGG	2	6	21750	21755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
562	NC_006363	TGA	2	6	22056	22061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
563	NC_006363	CGG	2	6	22086	22091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
564	NC_006363	CGA	2	6	22128	22133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
565	NC_006363	GC	3	6	22135	22140	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
566	NC_006363	AAC	2	6	22172	22177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54027831
567	NC_006363	CTG	2	6	22183	22188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
568	NC_006363	TGGT	2	8	22244	22251	0 %	50 %	50 %	0 %	54027831
569	NC_006363	GTC	2	6	22276	22281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
570	NC_006363	GCCC	2	8	22299	22306	0 %	0 %	25 %	75 %	54027831
571	NC_006363	GCT	2	6	22345	22350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
572	NC_006363	GTC	2	6	22390	22395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
573	NC_006363	GC	3	6	22400	22405	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
574	NC_006363	ACC	2	6	22427	22432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027831
575	NC_006363	CGG	2	6	22476	22481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
576	NC_006363	GAT	2	6	22498	22503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
577	NC_006363	CCCG	2	8	22539	22546	0 %	0 %	25 %	75 %	54027831
578	NC_006363	ACG	2	6	22556	22561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
579	NC_006363	CGA	2	6	22563	22568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
580	NC_006363	GTG	2	6	22735	22740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027831
581	NC_006363	TCG	2	6	22764	22769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
582	NC_006363	CGT	2	6	22785	22790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
583	NC_006363	AGC	2	6	22805	22810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
584	NC_006363	CCA	2	6	22824	22829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027831
585	NC_006363	GGC	2	6	22861	22866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
586	NC_006363	CGC	2	6	22892	22897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
587	NC_006363	CGG	2	6	22900	22905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
588	NC_006363	CGG	2	6	22912	22917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
589	NC_006363	ACCCC	2	10	22920	22929	20 %	0 %	0 %	80 %	54027831
590	NC_006363	CAG	2	6	22967	22972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
591	NC_006363	CAT	2	6	22989	22994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027831
592	NC_006363	CTG	3	9	23026	23034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
593	NC_006363	GCG	2	6	23042	23047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
594	NC_006363	TCG	2	6	23057	23062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
595	NC_006363	TCG	2	6	23156	23161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
596	NC_006363	CGA	2	6	23167	23172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
597	NC_006363	CGG	2	6	23178	23183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
598	NC_006363	CGG	2	6	23190	23195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
599	NC_006363	TCG	2	6	23213	23218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
600	NC_006363	GCC	2	6	23247	23252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
601	NC_006363	CGT	2	6	23274	23279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
602	NC_006363	GGT	2	6	23326	23331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027831
603	NC_006363	GC	3	6	23388	23393	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
604	NC_006363	CGG	2	6	23400	23405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
605	NC_006363	GGT	2	6	23419	23424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027831
606	NC_006363	ACC	2	6	23429	23434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027831
607	NC_006363	CGC	2	6	23443	23448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
608	NC_006363	GGC	3	9	23451	23459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
609	NC_006363	CAGC	2	8	23472	23479	25 %	0 %	25 %	50 %	54027831
610	NC_006363	CCG	2	6	23481	23486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
611	NC_006363	CGT	2	6	23511	23516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
612	NC_006363	CAG	2	6	23623	23628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027831
613	NC_006363	CG	3	6	23657	23662	0 %	0 %	50 %	50 %	54027831
614	NC_006363	GCC	2	6	23665	23670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027831
615	NC_006363	CGG	2	6	23679	23684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
616	NC_006363	CGG	2	6	23760	23765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027831
617	NC_006363	GGCCTG	2	12	23791	23802	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	54027831
618	NC_006363	CGGT	2	8	23969	23976	0 %	25 %	50 %	25 %	54027831
619	NC_006363	GAT	2	6	23983	23988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027831
620	NC_006363	CTT	2	6	24007	24012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027831
621	NC_006363	GAA	2	6	24025	24030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027831
622	NC_006363	GATC	2	8	24126	24133	25 %	25 %	25 %	25 %	54027831
623	NC_006363	CTG	2	6	24193	24198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027831
624	NC_006363	CAA	2	6	24340	24345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_006363	GTG	2	6	24451	24456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027832
626	NC_006363	CAG	2	6	24469	24474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027832
627	NC_006363	TCC	2	6	24476	24481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027832
628	NC_006363	CGC	2	6	24539	24544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_006363	CCGGT	2	10	24548	24557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
630	NC_006363	GTCGAA	2	12	24640	24651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54027833
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632	NC_006363	CG	3	6	24795	24800	0 %	0 %	50 %	50 %	54027833
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662	NC_006363	TCGCCA	2	12	25943	25954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	54027834
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757	NC_006363	CGG	2	6	29313	29318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027840
758	NC_006363	TGC	2	6	29391	29396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027840
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760	NC_006363	GCG	2	6	29404	29409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027840
761	NC_006363	GTT	2	6	29542	29547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027840
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792	NC_006363	CGG	2	6	30472	30477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027840
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827	NC_006363	GGT	2	6	32007	32012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027841
828	NC_006363	GTG	2	6	32050	32055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027841
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830	NC_006363	GAG	2	6	32064	32069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027841
831	NC_006363	GTG	2	6	32086	32091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027841
832	NC_006363	AGC	2	6	32116	32121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027841
833	NC_006363	CGC	2	6	32133	32138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027841
834	NC_006363	GTG	2	6	32149	32154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027841
835	NC_006363	GC	4	8	32179	32186	0 %	0 %	50 %	50 %	54027841
836	NC_006363	CCG	2	6	32233	32238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027841
837	NC_006363	CAG	2	6	32244	32249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027841
838	NC_006363	TCG	2	6	32308	32313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027841
839	NC_006363	GGTC	2	8	32327	32334	0 %	25 %	50 %	25 %	54027841
840	NC_006363	TCC	2	6	32347	32352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
841	NC_006363	CGTGC	2	10	32357	32366	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
842	NC_006363	GGAC	2	8	32477	32484	25 %	0 %	50 %	25 %	54027842
843	NC_006363	GTG	2	6	32517	32522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027842
844	NC_006363	TGG	2	6	32555	32560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027842
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846	NC_006363	TCG	2	6	32642	32647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027842
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850	NC_006363	GTG	2	6	32719	32724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027842
851	NC_006363	TGG	2	6	32726	32731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027842
852	NC_006363	TGG	2	6	32738	32743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027842
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855	NC_006363	CG	4	8	32804	32811	0 %	0 %	50 %	50 %	54027842
856	NC_006363	GCG	2	6	32827	32832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027842
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863	NC_006363	CCG	2	6	33176	33181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027842
864	NC_006363	CGG	2	6	33203	33208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027842
865	NC_006363	GTC	2	6	33220	33225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027842
866	NC_006363	GCG	2	6	33238	33243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027842
867	NC_006363	GCT	2	6	33246	33251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027842
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870	NC_006363	CTG	3	9	33337	33345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027842
871	NC_006363	TGG	2	6	33410	33415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027842
872	NC_006363	TGA	2	6	33476	33481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027842
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874	NC_006363	GCTGGT	2	12	33513	33524	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54027842
875	NC_006363	CGC	2	6	33540	33545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027842
876	NC_006363	CTG	2	6	33559	33564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027842
877	NC_006363	GCT	2	6	33570	33575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027842
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880	NC_006363	ACG	2	6	33674	33679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027842
881	NC_006363	CCGC	2	8	33680	33687	0 %	0 %	25 %	75 %	54027842
882	NC_006363	CGC	2	6	33732	33737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027842
883	NC_006363	GCCC	2	8	33783	33790	0 %	0 %	25 %	75 %	54027842
884	NC_006363	GCC	3	9	33814	33822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027842
885	NC_006363	GCCGC	2	10	33853	33862	0 %	0 %	40 %	60 %	54027842
886	NC_006363	GCC	2	6	33922	33927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027842
887	NC_006363	CAC	2	6	33930	33935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027842
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889	NC_006363	ATG	2	6	34044	34049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027842
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892	NC_006363	GCT	2	6	34133	34138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027843
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894	NC_006363	CCACC	2	10	34153	34162	20 %	0 %	0 %	80 %	54027843
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897	NC_006363	AC	3	6	34243	34248	50 %	0 %	0 %	50 %	54027844
898	NC_006363	AC	3	6	34258	34263	50 %	0 %	0 %	50 %	54027844
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1000	NC_006363	GGT	2	6	37674	37679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027848

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