MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 plasmid pNF1

Total Repeats: 3525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006362	GTT	2	6	16	21	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027649
2	NC_006362	GGC	2	6	69	74	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027649
3	NC_006362	CAC	2	6	75	80	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027649
4	NC_006362	GCG	2	6	127	132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027649
5	NC_006362	CAG	2	6	155	160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027649
6	NC_006362	TGG	2	6	163	168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027649
7	NC_006362	CAG	3	9	246	254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027649
8	NC_006362	AGC	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027649
9	NC_006362	TCA	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027649
10	NC_006362	AAT	2	6	487	492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54027649
11	NC_006362	GTG	2	6	622	627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027649
12	NC_006362	GAA	2	6	767	772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027650
13	NC_006362	TCG	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027650
14	NC_006362	ATC	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027650
15	NC_006362	CGT	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027650
16	NC_006362	CGG	2	6	1287	1292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027650
17	NC_006362	CCG	2	6	1381	1386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027650
18	NC_006362	GAA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027650
19	NC_006362	CTC	2	6	1463	1468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027650
20	NC_006362	GTG	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027650
21	NC_006362	AGC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027650
22	NC_006362	AGT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027650
23	NC_006362	GGA	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006362	ACC	2	6	1900	1905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_006362	GCA	2	6	1934	1939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006362	CGG	2	6	2213	2218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
27	NC_006362	CGG	2	6	2262	2267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
28	NC_006362	GCG	2	6	2295	2300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
29	NC_006362	TGC	2	6	2355	2360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027651
30	NC_006362	AGG	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027651
31	NC_006362	GAC	2	6	2434	2439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027651
32	NC_006362	GCG	2	6	2468	2473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
33	NC_006362	GTC	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027651
34	NC_006362	GCA	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027651
35	NC_006362	GAA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027651
36	NC_006362	CGG	2	6	2633	2638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
37	NC_006362	CAG	2	6	2737	2742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027651
38	NC_006362	GTG	2	6	2754	2759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027651
39	NC_006362	GGC	2	6	2814	2819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
40	NC_006362	GCC	2	6	2837	2842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027651
41	NC_006362	CGG	2	6	2880	2885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027651
42	NC_006362	GGC	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
43	NC_006362	GCG	3	9	3177	3185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
44	NC_006362	TGC	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027652
45	NC_006362	CGT	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027652
46	NC_006362	ACC	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027652
47	NC_006362	CAG	3	9	3585	3593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027652
48	NC_006362	GCG	2	6	3595	3600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
49	NC_006362	GCG	2	6	3610	3615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
50	NC_006362	GGC	2	6	3641	3646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
51	NC_006362	CGT	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027652
52	NC_006362	CGA	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027652
53	NC_006362	GCG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
54	NC_006362	CGA	2	6	3758	3763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027652
55	NC_006362	GCC	2	6	3793	3798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027652
56	NC_006362	GGT	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027652
57	NC_006362	CGG	2	6	3840	3845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
58	NC_006362	GCG	2	6	3852	3857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
59	NC_006362	GCG	2	6	3946	3951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
60	NC_006362	CCG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027652
61	NC_006362	GCG	2	6	4076	4081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027652
62	NC_006362	GCC	3	9	4177	4185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027652
63	NC_006362	GGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006362	AGC	2	6	4426	4431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027653
65	NC_006362	GTC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027653
66	NC_006362	GCC	2	6	4628	4633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027653
67	NC_006362	GCA	2	6	4634	4639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027653
68	NC_006362	CGG	2	6	4673	4678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027653
69	NC_006362	GCT	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027653
70	NC_006362	AGG	2	6	4777	4782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027653
71	NC_006362	CTC	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027653
72	NC_006362	ACC	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027653
73	NC_006362	CCG	3	9	4810	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027653
74	NC_006362	CGG	2	6	4913	4918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006362	GGC	2	6	4948	4953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006362	TTC	2	6	5090	5095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54027654
77	NC_006362	GGC	2	6	5104	5109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
78	NC_006362	GCA	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027654
79	NC_006362	GGT	2	6	5152	5157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027654
80	NC_006362	CGC	2	6	5169	5174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027654
81	NC_006362	GTC	2	6	5254	5259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
82	NC_006362	GTC	2	6	5279	5284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
83	NC_006362	GCT	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
84	NC_006362	TCG	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
85	NC_006362	GGC	2	6	5325	5330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
86	NC_006362	GTC	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027654
87	NC_006362	GGC	2	6	5374	5379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
88	NC_006362	CGG	2	6	5526	5531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
89	NC_006362	TGG	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027654
90	NC_006362	GCG	2	6	5663	5668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027654
91	NC_006362	GCG	2	6	5842	5847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006362	GTC	2	6	5962	5967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006362	GGA	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027655
94	NC_006362	CGC	2	6	6041	6046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027655
95	NC_006362	CGA	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027655
96	NC_006362	TCG	2	6	6119	6124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
97	NC_006362	TCG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
98	NC_006362	TCG	2	6	6209	6214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
99	NC_006362	GGC	2	6	6241	6246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027655
100	NC_006362	TCG	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
101	NC_006362	GTT	2	6	6327	6332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027655
102	NC_006362	GTC	2	6	6346	6351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027655
103	NC_006362	GTT	2	6	6364	6369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027655
104	NC_006362	GGC	2	6	6451	6456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027655
105	NC_006362	GTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027655
106	NC_006362	ATC	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027655
107	NC_006362	GCT	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006362	TCT	2	6	6506	6511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006362	CTT	2	6	6580	6585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006362	GGC	2	6	6606	6611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006362	TAG	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027656
112	NC_006362	GCG	2	6	6704	6709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027656
113	NC_006362	TCC	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027656
114	NC_006362	GTC	2	6	6766	6771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027656
115	NC_006362	GCG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027656
116	NC_006362	GAT	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027656
117	NC_006362	GGT	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027656
118	NC_006362	GGT	2	6	7003	7008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027656
119	NC_006362	TTG	2	6	7112	7117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027656
120	NC_006362	GTC	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027656
121	NC_006362	CGC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027656
122	NC_006362	GGC	2	6	7233	7238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027656
123	NC_006362	GCC	2	6	7246	7251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027656
124	NC_006362	CGC	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027656
125	NC_006362	TCG	2	6	7331	7336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027656
126	NC_006362	AGT	2	6	7381	7386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006362	TCG	2	6	7516	7521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
128	NC_006362	CGG	2	6	7583	7588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027657
129	NC_006362	TCG	2	6	7639	7644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
130	NC_006362	ACG	2	6	7666	7671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027657
131	NC_006362	GCT	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
132	NC_006362	GGC	2	6	7698	7703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027657
133	NC_006362	CGG	2	6	7742	7747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027657
134	NC_006362	CGA	2	6	7757	7762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027657
135	NC_006362	CGG	2	6	7772	7777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027657
136	NC_006362	GCC	2	6	7786	7791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027657
137	NC_006362	CGG	2	6	7793	7798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027657
138	NC_006362	CTC	2	6	7872	7877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027657
139	NC_006362	GGT	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027657
140	NC_006362	CCG	2	6	7982	7987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027657
141	NC_006362	GCC	2	6	7988	7993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027657
142	NC_006362	GTC	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
143	NC_006362	TCG	2	6	8080	8085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
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146	NC_006362	CTG	2	6	8121	8126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
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148	NC_006362	CGT	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
149	NC_006362	AGC	2	6	8222	8227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027657
150	NC_006362	CGA	2	6	8288	8293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027657
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152	NC_006362	GTC	2	6	8388	8393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027657
153	NC_006362	GGA	2	6	8397	8402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027657
154	NC_006362	CCA	2	6	8533	8538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54027658
155	NC_006362	CGG	3	9	8557	8565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027658
156	NC_006362	CTG	2	6	8597	8602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027658
157	NC_006362	TTG	2	6	8607	8612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54027658
158	NC_006362	GTA	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54027658
159	NC_006362	GCA	3	9	8797	8805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027658
160	NC_006362	GTG	2	6	8864	8869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027658
161	NC_006362	GAG	2	6	8922	8927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027658
162	NC_006362	CCG	2	6	8928	8933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027658
163	NC_006362	CGA	2	6	8944	8949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027658
164	NC_006362	CCG	2	6	8965	8970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027658
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166	NC_006362	CCT	2	6	9019	9024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54027658
167	NC_006362	ATC	2	6	9048	9053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54027658
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169	NC_006362	AGC	2	6	9150	9155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027658
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179	NC_006362	GGC	2	6	9405	9410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54027658
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186	NC_006362	AGA	2	6	9955	9960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54027658
187	NC_006362	TGG	2	6	10045	10050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027658
188	NC_006362	CGC	2	6	10082	10087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027658
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190	NC_006362	ATT	2	6	10294	10299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_006362	CAA	2	6	10317	10322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_006362	GCC	2	6	10454	10459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027659
193	NC_006362	ACG	2	6	10461	10466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027659
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245	NC_006362	CGT	2	6	12954	12959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027664
246	NC_006362	GTG	2	6	12970	12975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54027664
247	NC_006362	CGC	2	6	12987	12992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027664
248	NC_006362	CGC	2	6	13029	13034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027664
249	NC_006362	CCG	2	6	13082	13087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027664
250	NC_006362	GCC	2	6	13111	13116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54027664
251	NC_006362	GAC	2	6	13220	13225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_006362	ATC	2	6	13234	13239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_006362	TCA	2	6	13266	13271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_006362	CAC	2	6	13289	13294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_006362	CCG	2	6	13356	13361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_006362	GGT	2	6	13406	13411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_006362	CCG	2	6	13416	13421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_006362	ATC	2	6	13531	13536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_006362	TCG	2	6	13617	13622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027665
260	NC_006362	GGA	2	6	13649	13654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54027665
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263	NC_006362	CTG	2	6	13827	13832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027665
264	NC_006362	TCG	2	6	13842	13847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54027665
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389	NC_006362	CGA	2	6	19637	19642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54027669
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