MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nocardia farcinica IFM 10152 chromosome

Total Repeats: 175867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_006361	CGAAG	2	10	604986	604995	40 %	0 %	40 %	20 %	54022551
17502	NC_006361	CCG	2	6	605033	605038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022551
17503	NC_006361	GAG	2	6	605140	605145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022551
17504	NC_006361	ATC	2	6	605146	605151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022551
17505	NC_006361	TCG	2	6	605156	605161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022551
17506	NC_006361	GTG	2	6	605214	605219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_006361	GCG	2	6	605257	605262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17508	NC_006361	GT	3	6	605299	605304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17509	NC_006361	CG	3	6	605308	605313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17510	NC_006361	GC	3	6	605324	605329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17511	NC_006361	CCG	2	6	605347	605352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17512	NC_006361	TAC	2	6	605363	605368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17513	NC_006361	CGT	2	6	605373	605378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17514	NC_006361	CAC	2	6	605437	605442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022552
17515	NC_006361	TCG	2	6	605490	605495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17516	NC_006361	AACG	2	8	605528	605535	50 %	0 %	25 %	25 %	54022552
17517	NC_006361	TTC	2	6	605555	605560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022552
17518	NC_006361	TCG	2	6	605655	605660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17519	NC_006361	TTC	2	6	605705	605710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54022552
17520	NC_006361	CTGG	2	8	605785	605792	0 %	25 %	50 %	25 %	54022552
17521	NC_006361	TCG	2	6	605826	605831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17522	NC_006361	GCA	2	6	605848	605853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17523	NC_006361	CAA	2	6	605923	605928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022552
17524	NC_006361	GGC	2	6	605938	605943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022552
17525	NC_006361	TTCC	2	8	605965	605972	0 %	50 %	0 %	50 %	54022552
17526	NC_006361	TGG	2	6	606008	606013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022552
17527	NC_006361	CG	3	6	606025	606030	0 %	0 %	50 %	50 %	54022552
17528	NC_006361	GCG	2	6	606046	606051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022552
17529	NC_006361	GC	3	6	606059	606064	0 %	0 %	50 %	50 %	54022552
17530	NC_006361	GGC	2	6	606072	606077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022552
17531	NC_006361	CCG	2	6	606078	606083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022552
17532	NC_006361	CG	3	6	606086	606091	0 %	0 %	50 %	50 %	54022552
17533	NC_006361	GTG	2	6	606125	606130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022552
17534	NC_006361	AGC	3	9	606165	606173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17535	NC_006361	CGG	2	6	606189	606194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022552
17536	NC_006361	GACC	2	8	606214	606221	25 %	0 %	25 %	50 %	54022552
17537	NC_006361	GCAC	2	8	606246	606253	25 %	0 %	25 %	50 %	54022552
17538	NC_006361	AAC	2	6	606254	606259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54022552
17539	NC_006361	CACC	2	8	606271	606278	25 %	0 %	0 %	75 %	54022552
17540	NC_006361	TGC	2	6	606297	606302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17541	NC_006361	GCA	2	6	606358	606363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17542	NC_006361	CG	3	6	606431	606436	0 %	0 %	50 %	50 %	54022552
17543	NC_006361	TGC	2	6	606462	606467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17544	NC_006361	GCGG	2	8	606498	606505	0 %	0 %	75 %	25 %	54022552
17545	NC_006361	CTG	2	6	606539	606544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17546	NC_006361	GCAG	2	8	606600	606607	25 %	0 %	50 %	25 %	54022552
17547	NC_006361	GTG	3	9	606614	606622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022552
17548	NC_006361	CAG	2	6	606662	606667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17549	NC_006361	TGG	2	6	606708	606713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022552
17550	NC_006361	GC	3	6	606732	606737	0 %	0 %	50 %	50 %	54022552
17551	NC_006361	GGT	2	6	606742	606747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022552
17552	NC_006361	GCCGC	2	10	606794	606803	0 %	0 %	40 %	60 %	54022552
17553	NC_006361	CGA	2	6	606820	606825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022552
17554	NC_006361	TTCG	2	8	606883	606890	0 %	50 %	25 %	25 %	54022552
17555	NC_006361	GAG	2	6	606897	606902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022552
17556	NC_006361	CGA	2	6	606905	606910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17557	NC_006361	CG	3	6	607029	607034	0 %	0 %	50 %	50 %	54022553
17558	NC_006361	GCG	2	6	607103	607108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022553
17559	NC_006361	CGC	2	6	607116	607121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022553
17560	NC_006361	CTG	3	9	607168	607176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17561	NC_006361	CGA	2	6	607230	607235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17562	NC_006361	ATCGGC	2	12	607267	607278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17563	NC_006361	AGC	2	6	607352	607357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17564	NC_006361	GCT	2	6	607395	607400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17565	NC_006361	GC	3	6	607403	607408	0 %	0 %	50 %	50 %	54022553
17566	NC_006361	CTG	2	6	607420	607425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17567	NC_006361	GCT	3	9	607503	607511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17568	NC_006361	TCG	3	9	607526	607534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17569	NC_006361	TGG	2	6	607613	607618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022553
17570	NC_006361	GCCGCG	2	12	607621	607632	0 %	0 %	50 %	50 %	54022553
17571	NC_006361	CGC	3	9	607683	607691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022553
17572	NC_006361	TGC	2	6	607697	607702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17573	NC_006361	CCA	2	6	607736	607741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022553
17574	NC_006361	CCT	2	6	607775	607780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022553
17575	NC_006361	TGA	2	6	607802	607807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54022553
17576	NC_006361	GTG	3	9	607819	607827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022553
17577	NC_006361	CGT	2	6	607833	607838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022553
17578	NC_006361	GCCC	3	12	607949	607960	0 %	0 %	25 %	75 %	54022554
17579	NC_006361	GGC	2	6	607977	607982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022554
17580	NC_006361	CGCT	2	8	607984	607991	0 %	25 %	25 %	50 %	54022554
17581	NC_006361	GC	3	6	607994	607999	0 %	0 %	50 %	50 %	54022554
17582	NC_006361	ACC	2	6	608036	608041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022554
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17584	NC_006361	CGGG	2	8	608071	608078	0 %	0 %	75 %	25 %	54022554
17585	NC_006361	TCA	2	6	608091	608096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022554
17586	NC_006361	CGG	3	9	608108	608116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022554
17587	NC_006361	CCTCGC	2	12	608146	608157	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	54022554
17588	NC_006361	GGCC	2	8	608161	608168	0 %	0 %	50 %	50 %	54022554
17589	NC_006361	TGG	2	6	608183	608188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022554
17590	NC_006361	GC	3	6	608192	608197	0 %	0 %	50 %	50 %	54022554
17591	NC_006361	CCGGG	2	10	608206	608215	0 %	0 %	60 %	40 %	54022554
17592	NC_006361	GGC	2	6	608251	608256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022554
17593	NC_006361	GCC	2	6	608269	608274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022554
17594	NC_006361	CCGAA	2	10	608293	608302	40 %	0 %	20 %	40 %	54022554
17595	NC_006361	GTC	3	9	608309	608317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022554
17596	NC_006361	GC	3	6	608338	608343	0 %	0 %	50 %	50 %	54022554
17597	NC_006361	CCTG	2	8	608359	608366	0 %	25 %	25 %	50 %	54022554
17598	NC_006361	CTG	2	6	608369	608374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022554
17599	NC_006361	GGT	2	6	608395	608400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022554
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17601	NC_006361	GCT	2	6	608491	608496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022554
17602	NC_006361	GCCGC	2	10	608505	608514	0 %	0 %	40 %	60 %	54022554
17603	NC_006361	GGC	2	6	608524	608529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022554
17604	NC_006361	ACC	2	6	608531	608536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022554
17605	NC_006361	GC	3	6	608584	608589	0 %	0 %	50 %	50 %	54022554
17606	NC_006361	CGG	2	6	608611	608616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022554
17607	NC_006361	CGG	2	6	608619	608624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022554
17608	NC_006361	GC	3	6	608647	608652	0 %	0 %	50 %	50 %	54022554
17609	NC_006361	CGG	2	6	608785	608790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022554
17610	NC_006361	ACG	2	6	608802	608807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022554
17611	NC_006361	TCG	2	6	608811	608816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022554
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17616	NC_006361	CG	3	6	608964	608969	0 %	0 %	50 %	50 %	54022554
17617	NC_006361	GGC	2	6	609005	609010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022554
17618	NC_006361	GGTG	2	8	609016	609023	0 %	25 %	75 %	0 %	54022554
17619	NC_006361	CGG	2	6	609084	609089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022554
17620	NC_006361	TGG	2	6	609258	609263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022554
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17622	NC_006361	GTG	2	6	609325	609330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022554
17623	NC_006361	GCC	2	6	609333	609338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022554
17624	NC_006361	CTG	2	6	609398	609403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022554
17625	NC_006361	CGA	2	6	609463	609468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022554
17626	NC_006361	CGT	2	6	609490	609495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022554
17627	NC_006361	CAGCGG	2	12	609527	609538	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	54022554
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17629	NC_006361	CCGG	2	8	609568	609575	0 %	0 %	50 %	50 %	54022554
17630	NC_006361	CTG	2	6	609578	609583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022554
17631	NC_006361	CGA	2	6	609586	609591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022554
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17637	NC_006361	CGG	2	6	609766	609771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022554
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17641	NC_006361	CTG	2	6	609841	609846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022555
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17650	NC_006361	CG	3	6	610083	610088	0 %	0 %	50 %	50 %	54022555
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17657	NC_006361	CGC	2	6	610326	610331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022555
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17700	NC_006361	ACC	2	6	611345	611350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54022555
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17702	NC_006361	C	6	6	611429	611434	0 %	0 %	0 %	100 %	54022555
17703	NC_006361	CCT	2	6	611453	611458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022555
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17705	NC_006361	GGT	2	6	611495	611500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17706	NC_006361	GAA	2	6	611503	611508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17707	NC_006361	GGT	2	6	611560	611565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54022556
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17710	NC_006361	GCGG	2	8	611767	611774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17711	NC_006361	AC	3	6	611817	611822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17712	NC_006361	GGTCT	2	10	611839	611848	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17713	NC_006361	CGA	2	6	611972	611977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022557
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17715	NC_006361	GTCTAC	2	12	611988	611999	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54022557
17716	NC_006361	GTC	2	6	612103	612108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022557
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17718	NC_006361	GGT	2	6	612129	612134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17719	NC_006361	GGCG	2	8	612155	612162	0 %	0 %	75 %	25 %	54022558
17720	NC_006361	CGA	2	6	612191	612196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022558
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17725	NC_006361	ACG	3	9	612262	612270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022558
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17727	NC_006361	GAC	2	6	612313	612318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022558
17728	NC_006361	AGA	2	6	612338	612343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54022558
17729	NC_006361	CGA	2	6	612347	612352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022558
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17731	NC_006361	TCG	3	9	612388	612396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022558
17732	NC_006361	GCC	2	6	612441	612446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022558
17733	NC_006361	CGC	2	6	612500	612505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022558
17734	NC_006361	CGT	2	6	612506	612511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022558
17735	NC_006361	GAT	2	6	612519	612524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54022558
17736	NC_006361	CTG	2	6	612525	612530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022558
17737	NC_006361	CGGG	2	8	612550	612557	0 %	0 %	75 %	25 %	54022558
17738	NC_006361	GCCCTC	2	12	612564	612575	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	54022558
17739	NC_006361	GCA	2	6	612599	612604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022558
17740	NC_006361	GCA	2	6	612677	612682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022558
17741	NC_006361	GC	3	6	612712	612717	0 %	0 %	50 %	50 %	54022558
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17743	NC_006361	CGC	2	6	612743	612748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	54022558
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17984	NC_006361	GCA	2	6	621020	621025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022569
17985	NC_006361	GAG	2	6	621028	621033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54022569
17986	NC_006361	CGA	2	6	621051	621056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54022569
17987	NC_006361	CCT	2	6	621068	621073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	54022569
17988	NC_006361	TCG	2	6	621113	621118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022569
17989	NC_006361	CTG	2	6	621154	621159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022569
17990	NC_006361	GGTGCT	2	12	621192	621203	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	54022569
17991	NC_006361	CGCTGC	2	12	621257	621268	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	54022569
17992	NC_006361	GCG	2	6	621325	621330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022569
17993	NC_006361	CTG	2	6	621355	621360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022569
17994	NC_006361	CGG	2	6	621365	621370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54022569
17995	NC_006361	GTC	2	6	621376	621381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022569
17996	NC_006361	GCT	2	6	621387	621392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022569
17997	NC_006361	CTA	2	6	621462	621467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54022570
17998	NC_006361	TGC	2	6	621506	621511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022570
17999	NC_006361	TGC	2	6	621563	621568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022570
18000	NC_006361	CGT	2	6	621618	621623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54022570

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