MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 1963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004757	GTGCT	2	10	3801	3810	0 %	40 %	40 %	20 %	30248034
2	NC_004757	TGTCA	2	10	5409	5418	20 %	40 %	20 %	20 %	30248035
3	NC_004757	TTTTA	2	10	6479	6488	20 %	80 %	0 %	0 %	30248036
4	NC_004757	TTTTG	2	10	7751	7760	0 %	80 %	20 %	0 %	30248038
5	NC_004757	TGATT	2	10	8577	8586	20 %	60 %	20 %	0 %	30248039
6	NC_004757	ACTGG	2	10	10029	10038	20 %	20 %	40 %	20 %	30248039
7	NC_004757	CTGCG	2	10	10960	10969	0 %	20 %	40 %	40 %	30248039
8	NC_004757	TCGAT	2	10	10991	11000	20 %	40 %	20 %	20 %	30248039
9	NC_004757	CGATA	2	10	11018	11027	40 %	20 %	20 %	20 %	30248039
10	NC_004757	AAATC	2	10	11300	11309	60 %	20 %	0 %	20 %	30248039
11	NC_004757	GGTGA	2	10	11312	11321	20 %	20 %	60 %	0 %	30248039
12	NC_004757	GCCCA	2	10	11780	11789	20 %	0 %	20 %	60 %	30248040
13	NC_004757	CATGG	2	10	13305	13314	20 %	20 %	40 %	20 %	30248041
14	NC_004757	GTTCA	2	10	13650	13659	20 %	40 %	20 %	20 %	30248041
15	NC_004757	GCAGC	2	10	15441	15450	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_004757	TCTGG	2	10	16981	16990	0 %	40 %	40 %	20 %	30248044
17	NC_004757	ACAAG	2	10	20171	20180	60 %	0 %	20 %	20 %	30248048
18	NC_004757	ATGGC	2	10	20350	20359	20 %	20 %	40 %	20 %	30248048
19	NC_004757	CGTTG	2	10	22858	22867	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_004757	GTACG	2	10	22957	22966	20 %	20 %	40 %	20 %	30248050
21	NC_004757	GCAAC	2	10	23101	23110	40 %	0 %	20 %	40 %	30248050
22	NC_004757	TGAAT	2	10	26721	26730	40 %	40 %	20 %	0 %	30248050
23	NC_004757	GGCCG	2	10	27024	27033	0 %	0 %	60 %	40 %	30248051
24	NC_004757	GCGGG	2	10	27673	27682	0 %	0 %	80 %	20 %	30248051
25	NC_004757	CCCGA	2	10	30306	30315	20 %	0 %	20 %	60 %	30248053
26	NC_004757	CAGTC	2	10	31722	31731	20 %	20 %	20 %	40 %	30248056
27	NC_004757	GGCCA	2	10	35886	35895	20 %	0 %	40 %	40 %	30248059
28	NC_004757	GCAGG	2	10	36762	36771	20 %	0 %	60 %	20 %	30248060
29	NC_004757	ATGAC	2	10	41188	41197	40 %	20 %	20 %	20 %	30248064
30	NC_004757	TCAGG	2	10	41552	41561	20 %	20 %	40 %	20 %	30248064
31	NC_004757	AGCTG	2	10	41810	41819	20 %	20 %	40 %	20 %	30248064
32	NC_004757	TTGTC	2	10	42260	42269	0 %	60 %	20 %	20 %	30248064
33	NC_004757	ATGTT	2	10	42598	42607	20 %	60 %	20 %	0 %	30248064
34	NC_004757	TTTTG	2	10	43823	43832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004757	GCATT	2	10	45787	45796	20 %	40 %	20 %	20 %	30248066
36	NC_004757	ATCTT	2	10	46134	46143	20 %	60 %	0 %	20 %	30248066
37	NC_004757	GTCCG	2	10	47313	47322	0 %	20 %	40 %	40 %	30248066
38	NC_004757	CATTG	2	10	52549	52558	20 %	40 %	20 %	20 %	30248070
39	NC_004757	AAAGA	2	10	54641	54650	80 %	0 %	20 %	0 %	30248073
40	NC_004757	CACCT	2	10	58383	58392	20 %	20 %	0 %	60 %	30248077
41	NC_004757	TTGCC	2	10	58703	58712	0 %	40 %	20 %	40 %	30248077
42	NC_004757	GTCTG	2	10	59435	59444	0 %	40 %	40 %	20 %	30248078
43	NC_004757	TGTGA	2	10	65389	65398	20 %	40 %	40 %	0 %	30248081
44	NC_004757	AGGAG	2	10	65753	65762	40 %	0 %	60 %	0 %	30248082
45	NC_004757	TTGCT	2	10	66556	66565	0 %	60 %	20 %	20 %	30248083
46	NC_004757	CGGCA	2	10	68588	68597	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_004757	CAAAG	2	10	68992	69001	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_004757	TCGTG	2	10	70204	70213	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_004757	GGGAG	2	10	71567	71576	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004757	ACCGT	2	10	72673	72682	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_004757	AGATT	2	10	73841	73850	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004757	ATTTG	2	10	74381	74390	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004757	TTCAT	2	10	76355	76364	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_004757	GCGAT	2	10	78250	78259	20 %	20 %	40 %	20 %	30248088
55	NC_004757	TTTCC	2	10	78282	78291	0 %	60 %	0 %	40 %	30248088
56	NC_004757	GATCC	2	10	78339	78348	20 %	20 %	20 %	40 %	30248088
57	NC_004757	ATGAC	2	10	82272	82281	40 %	20 %	20 %	20 %	30248093
58	NC_004757	TTGAG	2	10	82320	82329	20 %	40 %	40 %	0 %	30248093
59	NC_004757	GCCAT	2	10	84446	84455	20 %	20 %	20 %	40 %	30248095
60	NC_004757	ATCAG	2	10	86453	86462	40 %	20 %	20 %	20 %	30248097
61	NC_004757	GCAGC	2	10	87524	87533	20 %	0 %	40 %	40 %	30248099
62	NC_004757	GGTTC	2	10	87564	87573	0 %	40 %	40 %	20 %	30248099
63	NC_004757	GATGA	2	10	91394	91403	40 %	20 %	40 %	0 %	30248103
64	NC_004757	ACCAT	2	10	92901	92910	40 %	20 %	0 %	40 %	30248105
65	NC_004757	TCCAT	2	10	95859	95868	20 %	40 %	0 %	40 %	30248106
66	NC_004757	GGATT	2	10	96064	96073	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004757	GTGTC	2	10	97710	97719	0 %	40 %	40 %	20 %	30248108
68	NC_004757	GGGAT	2	10	103061	103070	20 %	20 %	60 %	0 %	30248114
69	NC_004757	CGTTA	2	10	103749	103758	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_004757	AAAAG	2	10	103784	103793	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004757	TTGCC	2	10	108279	108288	0 %	40 %	20 %	40 %	30248120
72	NC_004757	TTTTA	2	10	108680	108689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004757	GCCTG	2	10	113915	113924	0 %	20 %	40 %	40 %	30248122
74	NC_004757	TACAG	2	10	114120	114129	40 %	20 %	20 %	20 %	30248122
75	NC_004757	TGCCA	2	10	114186	114195	20 %	20 %	20 %	40 %	30248122
76	NC_004757	TTGCC	2	10	116103	116112	0 %	40 %	20 %	40 %	30248124
77	NC_004757	GCCCG	2	10	117701	117710	0 %	0 %	40 %	60 %	30248124
78	NC_004757	CGTGG	2	10	120205	120214	0 %	20 %	60 %	20 %	30248124
79	NC_004757	TTGGG	2	10	121041	121050	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004757	CTGCA	2	10	122727	122736	20 %	20 %	20 %	40 %	30248125
81	NC_004757	TTGCC	2	10	122763	122772	0 %	40 %	20 %	40 %	30248125
82	NC_004757	GAGCT	2	10	123049	123058	20 %	20 %	40 %	20 %	30248125
83	NC_004757	TTGGC	2	10	124851	124860	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_004757	GCAGC	2	10	128468	128477	20 %	0 %	40 %	40 %	30248131
85	NC_004757	GCCAA	2	10	135555	135564	40 %	0 %	20 %	40 %	30248136
86	NC_004757	CTCAC	2	10	135934	135943	20 %	20 %	0 %	60 %	30248137
87	NC_004757	TTGCC	2	10	136652	136661	0 %	40 %	20 %	40 %	30248137
88	NC_004757	ACCTT	2	10	138697	138706	20 %	40 %	0 %	40 %	30248139
89	NC_004757	CGCAA	2	10	138851	138860	40 %	0 %	20 %	40 %	30248139
90	NC_004757	ATGCA	2	10	141078	141087	40 %	20 %	20 %	20 %	30248142
91	NC_004757	TGCGG	2	10	143199	143208	0 %	20 %	60 %	20 %	30248144
92	NC_004757	CACGA	2	10	143658	143667	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_004757	CGCGC	2	10	146023	146032	0 %	0 %	40 %	60 %	30248148
94	NC_004757	ATGTG	2	10	146132	146141	20 %	40 %	40 %	0 %	30248148
95	NC_004757	GTGAG	2	10	146260	146269	20 %	20 %	60 %	0 %	30248149
96	NC_004757	TCAGG	2	10	150265	150274	20 %	20 %	40 %	20 %	30248153
97	NC_004757	CAGCG	2	10	152805	152814	20 %	0 %	40 %	40 %	30248154
98	NC_004757	TGCCA	2	10	155056	155065	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_004757	ATTCA	2	10	157051	157060	40 %	40 %	0 %	20 %	30248156
100	NC_004757	TGCCG	2	10	158560	158569	0 %	20 %	40 %	40 %	30248158
101	NC_004757	AAAGT	2	10	159400	159409	60 %	20 %	20 %	0 %	30248160
102	NC_004757	GCGGA	2	10	161857	161866	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_004757	TCGGT	2	10	167164	167173	0 %	40 %	40 %	20 %	30248168
104	NC_004757	GGCAG	2	10	170912	170921	20 %	0 %	60 %	20 %	30248171
105	NC_004757	GGCCG	2	10	176918	176927	0 %	0 %	60 %	40 %	30248178
106	NC_004757	GCTGC	2	10	179490	179499	0 %	20 %	40 %	40 %	30248181
107	NC_004757	ATGCG	2	10	182399	182408	20 %	20 %	40 %	20 %	30248183
108	NC_004757	CTGAT	2	10	184331	184340	20 %	40 %	20 %	20 %	30248183
109	NC_004757	CAAGG	2	10	184726	184735	40 %	0 %	40 %	20 %	30248183
110	NC_004757	TACGC	2	10	184856	184865	20 %	20 %	20 %	40 %	30248183
111	NC_004757	ATCCA	2	10	187100	187109	40 %	20 %	0 %	40 %	30248185
112	NC_004757	ACAGC	2	10	187141	187150	40 %	0 %	20 %	40 %	30248185
113	NC_004757	TCAGC	2	10	189095	189104	20 %	20 %	20 %	40 %	30248186
114	NC_004757	AGTGG	2	10	189914	189923	20 %	20 %	60 %	0 %	30248187
115	NC_004757	CGGTG	2	10	192718	192727	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
116	NC_004757	CGGTG	2	10	193687	193696	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
117	NC_004757	CGGTG	2	10	194026	194035	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
118	NC_004757	CGGTG	2	10	194365	194374	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
119	NC_004757	CGGTG	2	10	194704	194713	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
120	NC_004757	CGGTG	2	10	195673	195682	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
121	NC_004757	CGGTG	2	10	196642	196651	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
122	NC_004757	CGGTG	2	10	196981	196990	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
123	NC_004757	CGGTG	2	10	197320	197329	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
124	NC_004757	CGGTG	2	10	197659	197668	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
125	NC_004757	CGGTG	2	10	197998	198007	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
126	NC_004757	TGGCC	2	10	198468	198477	0 %	20 %	40 %	40 %	30248187
127	NC_004757	GATCT	2	10	199492	199501	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_004757	GGGCT	2	10	201954	201963	0 %	20 %	60 %	20 %	30248189
129	NC_004757	ATAAA	2	10	202448	202457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004757	AATTG	2	10	204374	204383	40 %	40 %	20 %	0 %	30248192
131	NC_004757	ATGGA	2	10	204618	204627	40 %	20 %	40 %	0 %	30248192
132	NC_004757	GCTGT	2	10	205494	205503	0 %	40 %	40 %	20 %	30248192
133	NC_004757	CAACG	2	10	205984	205993	40 %	0 %	20 %	40 %	30248192
134	NC_004757	TGACC	2	10	210282	210291	20 %	20 %	20 %	40 %	30248195
135	NC_004757	GAGCA	2	10	211393	211402	40 %	0 %	40 %	20 %	30248196
136	NC_004757	TTGAG	2	10	212441	212450	20 %	40 %	40 %	0 %	30248196
137	NC_004757	CAAAT	2	10	213503	213512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_004757	TTCTT	2	10	214888	214897	0 %	80 %	0 %	20 %	30248198
139	NC_004757	GCAGG	2	10	215047	215056	20 %	0 %	60 %	20 %	30248199
140	NC_004757	CGAAA	2	10	215308	215317	60 %	0 %	20 %	20 %	30248199
141	NC_004757	TCAGG	2	10	215475	215484	20 %	20 %	40 %	20 %	30248199
142	NC_004757	TGATC	2	10	217243	217252	20 %	40 %	20 %	20 %	30248201
143	NC_004757	GTTGT	2	10	218335	218344	0 %	60 %	40 %	0 %	30248203
144	NC_004757	GCGCC	2	10	219068	219077	0 %	0 %	40 %	60 %	30248204
145	NC_004757	CCGGA	2	10	219528	219537	20 %	0 %	40 %	40 %	30248204
146	NC_004757	AGGTA	2	10	219603	219612	40 %	20 %	40 %	0 %	30248204
147	NC_004757	TGATT	2	10	220921	220930	20 %	60 %	20 %	0 %	30248205
148	NC_004757	GGGAT	2	10	220961	220970	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004757	ATCCA	2	10	223800	223809	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
150	NC_004757	TGCCT	2	10	224784	224793	0 %	40 %	20 %	40 %	30248210
151	NC_004757	ACCTG	2	10	224822	224831	20 %	20 %	20 %	40 %	30248210
152	NC_004757	ACATG	21	105	225141	225245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_004757	GATTT	2	10	225387	225396	20 %	60 %	20 %	0 %	30248211
154	NC_004757	TTAAT	2	10	225442	225451	40 %	60 %	0 %	0 %	30248211
155	NC_004757	TAAAC	2	10	226379	226388	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_004757	TCAGA	2	10	227591	227600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_004757	TCGGC	2	10	228411	228420	0 %	20 %	40 %	40 %	30248214
158	NC_004757	TGCAG	2	10	228801	228810	20 %	20 %	40 %	20 %	30248214
159	NC_004757	GTGTC	2	10	229553	229562	0 %	40 %	40 %	20 %	30248215
160	NC_004757	TATTT	2	10	234357	234366	20 %	80 %	0 %	0 %	30248221
161	NC_004757	GCAAG	2	10	236932	236941	40 %	0 %	40 %	20 %	30248225
162	NC_004757	TTGGC	2	10	238291	238300	0 %	40 %	40 %	20 %	30248228
163	NC_004757	GTCGT	2	10	238426	238435	0 %	40 %	40 %	20 %	30248228
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165	NC_004757	TGACT	2	10	241475	241484	20 %	40 %	20 %	20 %	30248230
166	NC_004757	TCAAT	2	10	241944	241953	40 %	40 %	0 %	20 %	30248230
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172	NC_004757	GTTTT	2	10	254743	254752	0 %	80 %	20 %	0 %	30248245
173	NC_004757	ATTCA	2	10	255874	255883	40 %	40 %	0 %	20 %	30248247
174	NC_004757	TTTCC	2	10	255898	255907	0 %	60 %	0 %	40 %	30248247
175	NC_004757	CGGAT	2	10	257304	257313	20 %	20 %	40 %	20 %	30248249
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177	NC_004757	GTCAG	2	10	262088	262097	20 %	20 %	40 %	20 %	30248253
178	NC_004757	CTCGG	2	10	263774	263783	0 %	20 %	40 %	40 %	30248254
179	NC_004757	AGTTA	2	10	268023	268032	40 %	40 %	20 %	0 %	30248257
180	NC_004757	ACCAA	2	10	268106	268115	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
181	NC_004757	GCCTG	2	10	269987	269996	0 %	20 %	40 %	40 %	30248259
182	NC_004757	GGCAG	2	10	270147	270156	20 %	0 %	60 %	20 %	30248259
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184	NC_004757	GATTG	2	10	271945	271954	20 %	40 %	40 %	0 %	30248261
185	NC_004757	TCAGA	2	10	274347	274356	40 %	20 %	20 %	20 %	30248264
186	NC_004757	TAACT	2	10	274730	274739	40 %	40 %	0 %	20 %	30248264
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196	NC_004757	ATACA	2	10	281492	281501	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_004757	CAATC	2	10	284779	284788	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_004757	GATCT	2	10	289251	289260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
199	NC_004757	CCCAG	2	10	290930	290939	20 %	0 %	20 %	60 %	30248275
200	NC_004757	AACTC	2	10	291355	291364	40 %	20 %	0 %	40 %	30248276
201	NC_004757	TTTAT	2	10	291534	291543	20 %	80 %	0 %	0 %	30248276
202	NC_004757	ACTTT	2	10	292689	292698	20 %	60 %	0 %	20 %	30248276
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206	NC_004757	GATCT	2	10	299594	299603	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
207	NC_004757	GCTGC	2	10	301110	301119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
208	NC_004757	GGAAT	2	10	304070	304079	40 %	20 %	40 %	0 %	30248292
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218	NC_004757	TGAGC	2	10	318516	318525	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
219	NC_004757	TTGTA	2	10	320611	320620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
220	NC_004757	CGGTG	2	10	322173	322182	0 %	20 %	60 %	20 %	30248311
221	NC_004757	ATTCC	2	10	326219	326228	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
222	NC_004757	GCGCT	2	10	326454	326463	0 %	20 %	40 %	40 %	30248315
223	NC_004757	AGCGG	2	10	328206	328215	20 %	0 %	60 %	20 %	30248315
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240	NC_004757	ATCCG	2	10	351228	351237	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
241	NC_004757	AGGCA	2	10	352141	352150	40 %	0 %	40 %	20 %	30248335
242	NC_004757	CGATA	2	10	355397	355406	40 %	20 %	20 %	20 %	30248338
243	NC_004757	ATGGC	2	10	357339	357348	20 %	20 %	40 %	20 %	30248340
244	NC_004757	ATTGC	2	10	357866	357875	20 %	40 %	20 %	20 %	30248340
245	NC_004757	TGATC	2	10	358042	358051	20 %	40 %	20 %	20 %	30248340
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247	NC_004757	CCTGA	2	10	359903	359912	20 %	20 %	20 %	40 %	30248341
248	NC_004757	CTTCC	2	10	362128	362137	0 %	40 %	0 %	60 %	30248343
249	NC_004757	TACCG	2	10	362335	362344	20 %	20 %	20 %	40 %	30248343
250	NC_004757	TTCAG	2	10	363902	363911	20 %	40 %	20 %	20 %	30248344
251	NC_004757	GAGCA	2	10	366403	366412	40 %	0 %	40 %	20 %	30248345
252	NC_004757	GGGAG	2	10	367331	367340	20 %	0 %	80 %	0 %	30248346
253	NC_004757	ATGCC	2	10	373718	373727	20 %	20 %	20 %	40 %	30248350
254	NC_004757	GATCA	2	10	374669	374678	40 %	20 %	20 %	20 %	30248351
255	NC_004757	CGGTG	2	10	375885	375894	0 %	20 %	60 %	20 %	30248352
256	NC_004757	GCCGT	2	10	378493	378502	0 %	20 %	40 %	40 %	30248355
257	NC_004757	TGCGC	2	10	378538	378547	0 %	20 %	40 %	40 %	30248355
258	NC_004757	GATCG	2	10	379472	379481	20 %	20 %	40 %	20 %	30248356
259	NC_004757	ATACA	2	10	380918	380927	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
260	NC_004757	GTCTG	2	10	382331	382340	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
261	NC_004757	GGCAG	2	10	382659	382668	20 %	0 %	60 %	20 %	30248360
262	NC_004757	CGATA	2	10	383782	383791	40 %	20 %	20 %	20 %	30248361
263	NC_004757	ACGGC	2	10	385167	385176	20 %	0 %	40 %	40 %	30248362
264	NC_004757	GCTTG	2	10	386686	386695	0 %	40 %	40 %	20 %	30248362
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266	NC_004757	ACGTC	2	10	388336	388345	20 %	20 %	20 %	40 %	30248363
267	NC_004757	GTATG	2	10	393428	393437	20 %	40 %	40 %	0 %	30248367
268	NC_004757	CTGCG	2	10	395949	395958	0 %	20 %	40 %	40 %	30248370
269	NC_004757	GGACA	2	10	396945	396954	40 %	0 %	40 %	20 %	30248371
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