MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 54249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004757	CAGC	2	8	25558	25565	25 %	0 %	25 %	50 %	30248050
502	NC_004757	ATG	2	6	25566	25571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248050
503	NC_004757	GCC	2	6	25670	25675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248050
504	NC_004757	ATG	2	6	25692	25697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248050
505	NC_004757	C	6	6	25851	25856	0 %	0 %	0 %	100 %	30248050
506	NC_004757	GGT	2	6	25897	25902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248050
507	NC_004757	GCCA	2	8	25920	25927	25 %	0 %	25 %	50 %	30248050
508	NC_004757	GT	3	6	25928	25933	0 %	50 %	50 %	0 %	30248050
509	NC_004757	T	6	6	25962	25967	0 %	100 %	0 %	0 %	30248050
510	NC_004757	GAT	2	6	25985	25990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248050
511	NC_004757	GTT	2	6	26089	26094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248050
512	NC_004757	CAT	2	6	26165	26170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248050
513	NC_004757	CAG	2	6	26216	26221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248050
514	NC_004757	AGA	2	6	26237	26242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248050
515	NC_004757	TTCA	2	8	26309	26316	25 %	50 %	0 %	25 %	30248050
516	NC_004757	AGTG	2	8	26361	26368	25 %	25 %	50 %	0 %	30248050
517	NC_004757	TAC	2	6	26372	26377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248050
518	NC_004757	ATGC	2	8	26397	26404	25 %	25 %	25 %	25 %	30248050
519	NC_004757	GCA	2	6	26428	26433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248050
520	NC_004757	GCA	2	6	26498	26503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248050
521	NC_004757	ACC	2	6	26559	26564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248050
522	NC_004757	TTC	2	6	26639	26644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248050
523	NC_004757	TGAAT	2	10	26721	26730	40 %	40 %	20 %	0 %	30248050
524	NC_004757	GCA	2	6	26782	26787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248050
525	NC_004757	A	6	6	26812	26817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004757	ATT	2	6	26849	26854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004757	CGC	2	6	26933	26938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248051
528	NC_004757	GGC	2	6	26961	26966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248051
529	NC_004757	GGCCG	2	10	27024	27033	0 %	0 %	60 %	40 %	30248051
530	NC_004757	TGG	2	6	27056	27061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248051
531	NC_004757	GGT	2	6	27202	27207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248051
532	NC_004757	GCG	2	6	27217	27222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248051
533	NC_004757	CTG	2	6	27262	27267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
534	NC_004757	CCGG	2	8	27359	27366	0 %	0 %	50 %	50 %	30248051
535	NC_004757	AGC	2	6	27387	27392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248051
536	NC_004757	ACC	2	6	27400	27405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248051
537	NC_004757	CTG	2	6	27427	27432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
538	NC_004757	GCG	2	6	27455	27460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248051
539	NC_004757	GTG	2	6	27466	27471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248051
540	NC_004757	TG	3	6	27470	27475	0 %	50 %	50 %	0 %	30248051
541	NC_004757	TGC	2	6	27492	27497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
542	NC_004757	GCT	2	6	27519	27524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
543	NC_004757	GTG	2	6	27611	27616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248051
544	NC_004757	CTG	2	6	27640	27645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
545	NC_004757	CGGG	2	8	27648	27655	0 %	0 %	75 %	25 %	30248051
546	NC_004757	GCGGG	2	10	27673	27682	0 %	0 %	80 %	20 %	30248051
547	NC_004757	GCT	2	6	27693	27698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
548	NC_004757	GAT	2	6	27706	27711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248051
549	NC_004757	GGT	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248051
550	NC_004757	TGC	2	6	27746	27751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
551	NC_004757	T	7	7	27765	27771	0 %	100 %	0 %	0 %	30248051
552	NC_004757	CGC	2	6	27825	27830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248051
553	NC_004757	CCTG	2	8	27860	27867	0 %	25 %	25 %	50 %	30248051
554	NC_004757	GCA	2	6	27906	27911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248051
555	NC_004757	AGC	2	6	27922	27927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248051
556	NC_004757	GC	3	6	27937	27942	0 %	0 %	50 %	50 %	30248051
557	NC_004757	AGC	2	6	27978	27983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248051
558	NC_004757	CTG	2	6	27988	27993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
559	NC_004757	GTC	2	6	28069	28074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
560	NC_004757	TC	3	6	28173	28178	0 %	50 %	0 %	50 %	30248051
561	NC_004757	GCT	2	6	28194	28199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
562	NC_004757	GCT	2	6	28209	28214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
563	NC_004757	CTG	3	9	28228	28236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
564	NC_004757	GCA	3	9	28255	28263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248051
565	NC_004757	CAG	2	6	28279	28284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248051
566	NC_004757	TGG	2	6	28301	28306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248051
567	NC_004757	ATC	2	6	28315	28320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248051
568	NC_004757	CTG	2	6	28322	28327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248051
569	NC_004757	GAG	2	6	28354	28359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248051
570	NC_004757	CTA	2	6	28397	28402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_004757	TCA	2	6	28617	28622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_004757	AGG	2	6	28640	28645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004757	AG	3	6	28671	28676	50 %	0 %	50 %	0 %	30248052
574	NC_004757	GATT	2	8	28684	28691	25 %	50 %	25 %	0 %	30248052
575	NC_004757	GGC	2	6	28729	28734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248052
576	NC_004757	GTG	2	6	28826	28831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248052
577	NC_004757	TGA	2	6	28840	28845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248052
578	NC_004757	CGG	2	6	28891	28896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248052
579	NC_004757	GCC	2	6	28950	28955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248052
580	NC_004757	A	6	6	28987	28992	100 %	0 %	0 %	0 %	30248052
581	NC_004757	TGA	2	6	29008	29013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248052
582	NC_004757	ACT	2	6	29035	29040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248052
583	NC_004757	GGT	2	6	29056	29061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248052
584	NC_004757	ATG	2	6	29070	29075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248052
585	NC_004757	ATCT	2	8	29093	29100	25 %	50 %	0 %	25 %	30248052
586	NC_004757	CAC	2	6	29130	29135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248052
587	NC_004757	CAA	2	6	29181	29186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_004757	GCA	2	6	29202	29207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_004757	TCA	2	6	29342	29347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248053
590	NC_004757	TG	4	8	29510	29517	0 %	50 %	50 %	0 %	30248053
591	NC_004757	CCCT	2	8	29541	29548	0 %	25 %	0 %	75 %	30248053
592	NC_004757	CCAG	2	8	29612	29619	25 %	0 %	25 %	50 %	30248053
593	NC_004757	CCG	2	6	29629	29634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248053
594	NC_004757	TGAT	2	8	29758	29765	25 %	50 %	25 %	0 %	30248053
595	NC_004757	CGG	2	6	29795	29800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248053
596	NC_004757	ACT	2	6	29824	29829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248053
597	NC_004757	CAC	2	6	29873	29878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248053
598	NC_004757	CAG	2	6	29910	29915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248053
599	NC_004757	AGC	2	6	29971	29976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248053
600	NC_004757	CAG	2	6	30087	30092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248053
601	NC_004757	ACC	2	6	30145	30150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248053
602	NC_004757	CTG	2	6	30155	30160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248053
603	NC_004757	GCA	2	6	30199	30204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248053
604	NC_004757	CCCGA	2	10	30306	30315	20 %	0 %	20 %	60 %	30248053
605	NC_004757	CCA	2	6	30431	30436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248054
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607	NC_004757	CAT	2	6	30570	30575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248054
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609	NC_004757	T	6	6	30599	30604	0 %	100 %	0 %	0 %	30248054
610	NC_004757	CAA	2	6	30756	30761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248054
611	NC_004757	TGC	3	9	30787	30795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248054
612	NC_004757	TGC	2	6	30906	30911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248054
613	NC_004757	ATC	2	6	30930	30935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248054
614	NC_004757	CATC	2	8	31049	31056	25 %	25 %	0 %	50 %	30248054
615	NC_004757	AT	3	6	31097	31102	50 %	50 %	0 %	0 %	30248054
616	NC_004757	TGT	2	6	31135	31140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248054
617	NC_004757	TGAG	2	8	31151	31158	25 %	25 %	50 %	0 %	30248054
618	NC_004757	ATG	2	6	31278	31283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_004757	TGA	2	6	31292	31297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248055
620	NC_004757	ATG	2	6	31324	31329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248055
621	NC_004757	GA	4	8	31343	31350	50 %	0 %	50 %	0 %	30248055
622	NC_004757	TTG	2	6	31372	31377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248055
623	NC_004757	AC	3	6	31427	31432	50 %	0 %	0 %	50 %	30248055
624	NC_004757	GCG	2	6	31448	31453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248055
625	NC_004757	T	6	6	31460	31465	0 %	100 %	0 %	0 %	30248055
626	NC_004757	TGA	2	6	31511	31516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248055
627	NC_004757	CAT	2	6	31548	31553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248055
628	NC_004757	TAA	2	6	31563	31568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248055
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