MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 54249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004757	AGC	2	6	230038	230043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_004757	ATTG	2	8	230050	230057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_004757	GCT	2	6	230073	230078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_004757	TTGA	2	8	230095	230102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_004757	GAT	2	6	230129	230134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_004757	GA	4	8	230155	230162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_004757	GCA	2	6	230198	230203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248216
4508	NC_004757	CAG	2	6	230223	230228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248216
4509	NC_004757	CCAG	2	8	230230	230237	25 %	0 %	25 %	50 %	30248216
4510	NC_004757	GAA	2	6	230305	230310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248216
4511	NC_004757	GCA	2	6	230319	230324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248216
4512	NC_004757	TTA	2	6	230330	230335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30248216
4513	NC_004757	GAA	2	6	230365	230370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248216
4514	NC_004757	AAC	2	6	230387	230392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248216
4515	NC_004757	CAG	2	6	230398	230403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248216
4516	NC_004757	TAA	2	6	230468	230473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_004757	GATC	2	8	230527	230534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_004757	TTG	2	6	230641	230646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248217
4519	NC_004757	AG	4	8	230667	230674	50 %	0 %	50 %	0 %	30248217
4520	NC_004757	CGG	2	6	230727	230732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248217
4521	NC_004757	GTG	2	6	230899	230904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248217
4522	NC_004757	GCG	2	6	230976	230981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248217
4523	NC_004757	AGG	2	6	230989	230994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248217
4524	NC_004757	TTG	2	6	231018	231023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248217
4525	NC_004757	ATG	2	6	231082	231087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248217
4526	NC_004757	GCAG	2	8	231096	231103	25 %	0 %	50 %	25 %	30248217
4527	NC_004757	GCA	2	6	231165	231170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248217
4528	NC_004757	GGT	2	6	231171	231176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248217
4529	NC_004757	TGA	2	6	231187	231192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248217
4530	NC_004757	GCC	2	6	231197	231202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248217
4531	NC_004757	GCC	2	6	231248	231253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248217
4532	NC_004757	AGG	2	6	231265	231270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248217
4533	NC_004757	TGAC	2	8	231319	231326	25 %	25 %	25 %	25 %	30248217
4534	NC_004757	CAT	2	6	231354	231359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248217
4535	NC_004757	AATG	2	8	231425	231432	50 %	25 %	25 %	0 %	30248217
4536	NC_004757	TGC	2	6	231484	231489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248217
4537	NC_004757	GC	3	6	231536	231541	0 %	0 %	50 %	50 %	30248217
4538	NC_004757	CCCCTG	2	12	231581	231592	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	30248217
4539	NC_004757	GC	3	6	231645	231650	0 %	0 %	50 %	50 %	30248217
4540	NC_004757	GCT	2	6	231674	231679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248217
4541	NC_004757	GAAG	2	8	231719	231726	50 %	0 %	50 %	0 %	30248217
4542	NC_004757	TTG	2	6	231729	231734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248217
4543	NC_004757	GAC	2	6	231776	231781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248217
4544	NC_004757	ATGC	2	8	231881	231888	25 %	25 %	25 %	25 %	30248217
4545	NC_004757	CCG	2	6	232022	232027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248217
4546	NC_004757	CAG	2	6	232083	232088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248218
4547	NC_004757	GCT	2	6	232161	232166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248218
4548	NC_004757	ATG	2	6	232172	232177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248218
4549	NC_004757	ATAA	2	8	232228	232235	75 %	25 %	0 %	0 %	30248218
4550	NC_004757	TTG	2	6	232301	232306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248218
4551	NC_004757	GTT	2	6	232311	232316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248218
4552	NC_004757	GCA	2	6	232409	232414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248218
4553	NC_004757	ATG	2	6	232466	232471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248218
4554	NC_004757	CGGGCG	2	12	232505	232516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248218
4555	NC_004757	AG	3	6	232526	232531	50 %	0 %	50 %	0 %	30248218
4556	NC_004757	CAT	2	6	232566	232571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248218
4557	NC_004757	TCA	3	9	232607	232615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248218
4558	NC_004757	CAA	2	6	232797	232802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248218
4559	NC_004757	TGC	2	6	232887	232892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248218
4560	NC_004757	CTA	2	6	232917	232922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248218
4561	NC_004757	CAG	2	6	232930	232935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248218
4562	NC_004757	CAG	2	6	233014	233019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248218
4563	NC_004757	CTG	2	6	233025	233030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248218
4564	NC_004757	TG	3	6	233066	233071	0 %	50 %	50 %	0 %	30248218
4565	NC_004757	CCT	2	6	233183	233188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248218
4566	NC_004757	GA	3	6	233215	233220	50 %	0 %	50 %	0 %	30248218
4567	NC_004757	TGA	2	6	233291	233296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248218
4568	NC_004757	GAT	3	9	233320	233328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248218
4569	NC_004757	GCCC	2	8	233367	233374	0 %	0 %	25 %	75 %	30248218
4570	NC_004757	GCT	2	6	233449	233454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248218
4571	NC_004757	A	7	7	233526	233532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_004757	CTTT	2	8	233548	233555	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4573	NC_004757	GCT	2	6	233824	233829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248219
4574	NC_004757	GCT	2	6	233842	233847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248219
4575	NC_004757	CG	3	6	233877	233882	0 %	0 %	50 %	50 %	30248219
4576	NC_004757	T	6	6	234008	234013	0 %	100 %	0 %	0 %	30248219
4577	NC_004757	CAA	2	6	234015	234020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248219
4578	NC_004757	TGT	2	6	234032	234037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248219
4579	NC_004757	GC	3	6	234091	234096	0 %	0 %	50 %	50 %	30248220
4580	NC_004757	ATA	2	6	234123	234128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248220
4581	NC_004757	CTGG	2	8	234148	234155	0 %	25 %	50 %	25 %	30248220
4582	NC_004757	CAG	2	6	234230	234235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248220
4583	NC_004757	TATTT	2	10	234357	234366	20 %	80 %	0 %	0 %	30248221
4584	NC_004757	GAT	2	6	234369	234374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248221
4585	NC_004757	T	8	8	234418	234425	0 %	100 %	0 %	0 %	30248221
4586	NC_004757	AAT	2	6	234471	234476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248221
4587	NC_004757	T	6	6	234476	234481	0 %	100 %	0 %	0 %	30248221
4588	NC_004757	TTCAAA	2	12	234507	234518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	30248221
4589	NC_004757	CTG	2	6	234546	234551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248221
4590	NC_004757	GAT	2	6	234664	234669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248221
4591	NC_004757	GTT	2	6	234701	234706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248222
4592	NC_004757	GGT	2	6	234785	234790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248222
4593	NC_004757	TCCT	2	8	234799	234806	0 %	50 %	0 %	50 %	30248222
4594	NC_004757	CAT	2	6	234808	234813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248222
4595	NC_004757	CGT	2	6	234870	234875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248222
4596	NC_004757	TTCA	2	8	234898	234905	25 %	50 %	0 %	25 %	30248222
4597	NC_004757	TCA	2	6	234930	234935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248222
4598	NC_004757	CTGC	2	8	234979	234986	0 %	25 %	25 %	50 %	30248222
4599	NC_004757	AATA	2	8	235090	235097	75 %	25 %	0 %	0 %	30248222
4600	NC_004757	ATG	2	6	235188	235193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_004757	TCT	2	6	235211	235216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_004757	T	6	6	235216	235221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_004757	CGG	2	6	235261	235266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_004757	A	6	6	235276	235281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_004757	GAG	2	6	235298	235303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_004757	ATTG	2	8	235423	235430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_004757	CGC	2	6	235457	235462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_004757	TTG	2	6	235468	235473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_004757	TCT	2	6	235481	235486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_004757	TG	3	6	235583	235588	0 %	50 %	50 %	0 %	30248223
4611	NC_004757	TGC	2	6	235608	235613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248223
4612	NC_004757	ATC	2	6	235636	235641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248223
4613	NC_004757	TCATAA	2	12	235748	235759	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	30248223
4614	NC_004757	TAAA	3	12	235874	235885	75 %	25 %	0 %	0 %	30248223
4615	NC_004757	GT	3	6	235901	235906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_004757	TAAA	2	8	235912	235919	75 %	25 %	0 %	0 %	30248224
4617	NC_004757	ACA	2	6	235946	235951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248224
4618	NC_004757	TA	3	6	235952	235957	50 %	50 %	0 %	0 %	30248224
4619	NC_004757	CA	3	6	235976	235981	50 %	0 %	0 %	50 %	30248224
4620	NC_004757	TGC	2	6	236040	236045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248224
4621	NC_004757	GGT	2	6	236050	236055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248224
4622	NC_004757	TGA	2	6	236149	236154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248224
4623	NC_004757	GAC	2	6	236164	236169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248224
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4625	NC_004757	CAT	2	6	236266	236271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248224
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4750	NC_004757	GGA	2	6	242289	242294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248231
4751	NC_004757	AGCTG	2	10	242340	242349	20 %	20 %	40 %	20 %	30248231
4752	NC_004757	TGG	2	6	242427	242432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4753	NC_004757	T	7	7	242465	242471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4754	NC_004757	ATGT	2	8	242538	242545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4860	NC_004757	TGC	2	6	248779	248784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248237
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4873	NC_004757	GT	4	8	249349	249356	0 %	50 %	50 %	0 %	30248238
4874	NC_004757	A	6	6	249404	249409	100 %	0 %	0 %	0 %	30248238
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4877	NC_004757	TGC	2	6	249502	249507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248239
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4949	NC_004757	CTGA	2	8	252549	252556	25 %	25 %	25 %	25 %	30248242
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4980	NC_004757	AAAT	2	8	254131	254138	75 %	25 %	0 %	0 %	30248244
4981	NC_004757	CTT	2	6	254181	254186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4982	NC_004757	TGG	2	6	254370	254375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248245
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4986	NC_004757	TC	3	6	254516	254521	0 %	50 %	0 %	50 %	30248245
4987	NC_004757	TGTGT	2	10	254667	254676	0 %	60 %	40 %	0 %	30248245
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4994	NC_004757	ATC	2	6	255065	255070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248246
4995	NC_004757	GCTGGC	3	18	255198	255215	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	30248246
4996	NC_004757	A	6	6	255317	255322	100 %	0 %	0 %	0 %	30248246
4997	NC_004757	AG	3	6	255349	255354	50 %	0 %	50 %	0 %	30248246
4998	NC_004757	TTGA	2	8	255382	255389	25 %	50 %	25 %	0 %	30248246
4999	NC_004757	ATC	2	6	255406	255411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248246
5000	NC_004757	ATGC	2	8	255500	255507	25 %	25 %	25 %	25 %	30248246

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