MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 chromosome

Total Repeats: 129203

< Previous12...3031323334353637383940...258259Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_003272	AGTG	2	8	847526	847533	25 %	25 %	50 %	0 %	17228224
17002	NC_003272	CCAT	2	8	847543	847550	25 %	25 %	0 %	50 %	17228224
17003	NC_003272	CTT	2	6	847613	847618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
17004	NC_003272	GGC	2	6	847626	847631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17228224
17005	NC_003272	CAC	2	6	847638	847643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17228224
17006	NC_003272	TAA	2	6	847671	847676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17228224
17007	NC_003272	CAT	2	6	847694	847699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228224
17008	NC_003272	CTA	2	6	847700	847705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228224
17009	NC_003272	GTT	2	6	847724	847729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17228224
17010	NC_003272	GTG	2	6	847730	847735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17228224
17011	NC_003272	CCCCAC	2	12	847824	847835	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	17228224
17012	NC_003272	ACT	2	6	847839	847844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228224
17013	NC_003272	C	6	6	847858	847863	0 %	0 %	0 %	100 %	17228224
17014	NC_003272	TTG	2	6	847911	847916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17228224
17015	NC_003272	TCA	3	9	847969	847977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228224
17016	NC_003272	GATGCC	2	12	847980	847991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17228224
17017	NC_003272	GA	3	6	848056	848061	50 %	0 %	50 %	0 %	17228224
17018	NC_003272	GAT	2	6	848124	848129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17228224
17019	NC_003272	CAT	2	6	848277	848282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228224
17020	NC_003272	GGT	2	6	848334	848339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17228224
17021	NC_003272	CGT	2	6	848372	848377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17228224
17022	NC_003272	TAA	2	6	848411	848416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17228224
17023	NC_003272	GTTG	2	8	848429	848436	0 %	50 %	50 %	0 %	17228224
17024	NC_003272	TG	3	6	848470	848475	0 %	50 %	50 %	0 %	17228224
17025	NC_003272	GTG	2	6	848495	848500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17228224
17026	NC_003272	TGC	2	6	848550	848555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17228224
17027	NC_003272	GCG	2	6	848560	848565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17228224
17028	NC_003272	GCT	2	6	848572	848577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17228224
17029	NC_003272	CAG	2	6	848610	848615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17228224
17030	NC_003272	TGCT	2	8	848619	848626	0 %	50 %	25 %	25 %	17228224
17031	NC_003272	TAA	2	6	848718	848723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17228224
17032	NC_003272	ATA	2	6	848758	848763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17228224
17033	NC_003272	TTGC	2	8	848771	848778	0 %	50 %	25 %	25 %	17228224
17034	NC_003272	AAC	2	6	848881	848886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17228224
17035	NC_003272	T	7	7	848938	848944	0 %	100 %	0 %	0 %	17228224
17036	NC_003272	CAC	2	6	848996	849001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17228224
17037	NC_003272	TTC	2	6	849060	849065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
17038	NC_003272	GGT	2	6	849066	849071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17228224
17039	NC_003272	GCA	2	6	849073	849078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17228224
17040	NC_003272	CTTT	2	8	849151	849158	0 %	75 %	0 %	25 %	17228224
17041	NC_003272	CTT	2	6	849164	849169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
17042	NC_003272	TCG	2	6	849193	849198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17228224
17043	NC_003272	CTA	2	6	849215	849220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228224
17044	NC_003272	CGG	2	6	849686	849691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17228224
17045	NC_003272	CAA	2	6	849786	849791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17228224
17046	NC_003272	TCA	2	6	849808	849813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228224
17047	NC_003272	TCT	2	6	849814	849819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
17048	NC_003272	TG	3	6	849829	849834	0 %	50 %	50 %	0 %	17228224
17049	NC_003272	TTC	2	6	849939	849944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
17050	NC_003272	TCAA	2	8	849979	849986	50 %	25 %	0 %	25 %	17228224
17051	NC_003272	CTT	2	6	850082	850087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
17052	NC_003272	AAT	2	6	850095	850100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17228224
17053	NC_003272	GCT	2	6	850135	850140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17228224
17054	NC_003272	CTTG	2	8	850163	850170	0 %	50 %	25 %	25 %	17228224
17055	NC_003272	GTTTG	2	10	850202	850211	0 %	60 %	40 %	0 %	17228224
17056	NC_003272	TGA	2	6	850264	850269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17228224
17057	NC_003272	TTC	2	6	850275	850280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
17058	NC_003272	CAAAC	2	10	850303	850312	60 %	0 %	0 %	40 %	17228224
17059	NC_003272	GTT	2	6	850444	850449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17228224
17060	NC_003272	TAA	2	6	850455	850460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17228224
17061	NC_003272	GCTT	2	8	850477	850484	0 %	50 %	25 %	25 %	17228224
17062	NC_003272	CGT	2	6	850560	850565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17228224
17063	NC_003272	TGGCTT	2	12	850613	850624	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	17228224
17064	NC_003272	TGC	2	6	850842	850847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17228224
17065	NC_003272	CTAAGG	2	12	850874	850885	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17228224
17066	NC_003272	TGA	2	6	850936	850941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17228224
17067	NC_003272	CAT	2	6	851078	851083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228224
17068	NC_003272	TGCT	2	8	851234	851241	0 %	50 %	25 %	25 %	17228224
17069	NC_003272	AGC	2	6	851262	851267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17228224
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17071	NC_003272	T	6	6	851398	851403	0 %	100 %	0 %	0 %	17228224
17072	NC_003272	TTA	2	6	851419	851424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17228224
17073	NC_003272	TACT	2	8	851426	851433	25 %	50 %	0 %	25 %	17228224
17074	NC_003272	TGAT	2	8	851451	851458	25 %	50 %	25 %	0 %	17228224
17075	NC_003272	TTC	2	6	851466	851471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
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17077	NC_003272	T	6	6	851505	851510	0 %	100 %	0 %	0 %	17228224
17078	NC_003272	TTC	2	6	851586	851591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
17079	NC_003272	TTC	2	6	851649	851654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
17080	NC_003272	TAA	2	6	851672	851677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17228224
17081	NC_003272	ACT	2	6	851703	851708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228224
17082	NC_003272	AT	3	6	851750	851755	50 %	50 %	0 %	0 %	17228224
17083	NC_003272	TTC	2	6	851766	851771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228224
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17085	NC_003272	CTAT	2	8	851821	851828	25 %	50 %	0 %	25 %	17228224
17086	NC_003272	ACT	2	6	851859	851864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228224
17087	NC_003272	TAA	2	6	851895	851900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17228224
17088	NC_003272	TAA	2	6	851961	851966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17228224
17089	NC_003272	AGC	2	6	852009	852014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17090	NC_003272	A	6	6	852040	852045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_003272	ATC	2	6	852062	852067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17092	NC_003272	AAC	2	6	852090	852095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17093	NC_003272	TAA	2	6	852101	852106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_003272	ATT	2	6	852121	852126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_003272	AGAA	2	8	852187	852194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_003272	GTT	2	6	852339	852344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17228225
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17099	NC_003272	CAGTGG	2	12	852562	852573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	17228225
17100	NC_003272	AGT	2	6	852643	852648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17228225
17101	NC_003272	CAG	2	6	852702	852707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17228225
17102	NC_003272	ATCA	2	8	852758	852765	50 %	25 %	0 %	25 %	17228225
17103	NC_003272	CAT	2	6	852793	852798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228225
17104	NC_003272	A	6	6	852900	852905	100 %	0 %	0 %	0 %	17228225
17105	NC_003272	AAT	2	6	852989	852994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17228225
17106	NC_003272	CAA	2	6	853161	853166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17107	NC_003272	AAC	2	6	853191	853196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17108	NC_003272	CAAC	2	8	853232	853239	50 %	0 %	0 %	50 %	17228226
17109	NC_003272	CCA	2	6	853240	853245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17228226
17110	NC_003272	ATCA	2	8	853402	853409	50 %	25 %	0 %	25 %	17228226
17111	NC_003272	TTG	2	6	853430	853435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17228226
17112	NC_003272	TGG	2	6	853479	853484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17228226
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17114	NC_003272	GCT	2	6	853537	853542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17228226
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17117	NC_003272	AAC	2	6	853628	853633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17228226
17118	NC_003272	TTC	2	6	853698	853703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228226
17119	NC_003272	GGTT	2	8	853822	853829	0 %	50 %	50 %	0 %	17228226
17120	NC_003272	TTGAC	2	10	853834	853843	20 %	40 %	20 %	20 %	17228226
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17122	NC_003272	TTG	2	6	853867	853872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17495	NC_003272	ATC	2	6	871226	871231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17228243
17496	NC_003272	TCT	2	6	871262	871267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228243
17497	NC_003272	GCT	2	6	871281	871286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17228243
17498	NC_003272	CTT	2	6	871305	871310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228243
17499	NC_003272	T	9	9	871358	871366	0 %	100 %	0 %	0 %	17228243
17500	NC_003272	TTC	2	6	871396	871401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17228243

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