MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120epsilon

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003270	TA	3	6	278	283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003270	CA	3	6	800	805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_003270	AT	3	6	855	860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003270	GT	3	6	1791	1796	0 %	50 %	50 %	0 %	17227466
5	NC_003270	CT	3	6	5057	5062	0 %	50 %	0 %	50 %	17227468
6	NC_003270	CT	3	6	5081	5086	0 %	50 %	0 %	50 %	17227468
7	NC_003270	AC	3	6	5906	5911	50 %	0 %	0 %	50 %	17227468
8	NC_003270	GT	3	6	6957	6962	0 %	50 %	50 %	0 %	17227468
9	NC_003270	AT	3	6	7913	7918	50 %	50 %	0 %	0 %	17227468
10	NC_003270	GC	3	6	8735	8740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_003270	AG	3	6	9586	9591	50 %	0 %	50 %	0 %	17227470
12	NC_003270	GA	3	6	12793	12798	50 %	0 %	50 %	0 %	17227477
13	NC_003270	GA	3	6	13772	13777	50 %	0 %	50 %	0 %	17227477
14	NC_003270	AG	3	6	14444	14449	50 %	0 %	50 %	0 %	17227478
15	NC_003270	AT	3	6	14520	14525	50 %	50 %	0 %	0 %	17227478
16	NC_003270	AG	4	8	16449	16456	50 %	0 %	50 %	0 %	17227479
17	NC_003270	GT	3	6	16622	16627	0 %	50 %	50 %	0 %	17227479
18	NC_003270	AT	3	6	17035	17040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003270	CT	3	6	17438	17443	0 %	50 %	0 %	50 %	17227480
20	NC_003270	CA	3	6	19109	19114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_003270	TA	3	6	20198	20203	50 %	50 %	0 %	0 %	17227482
22	NC_003270	TG	3	6	20447	20452	0 %	50 %	50 %	0 %	17227482
23	NC_003270	TA	3	6	22247	22252	50 %	50 %	0 %	0 %	17227483
24	NC_003270	AT	3	6	22291	22296	50 %	50 %	0 %	0 %	17227483
25	NC_003270	TA	4	8	22870	22877	50 %	50 %	0 %	0 %	17227483
26	NC_003270	TA	4	8	23511	23518	50 %	50 %	0 %	0 %	17227483
27	NC_003270	TA	4	8	23627	23634	50 %	50 %	0 %	0 %	17227483
28	NC_003270	AT	3	6	24190	24195	50 %	50 %	0 %	0 %	17227483
29	NC_003270	AT	3	6	24693	24698	50 %	50 %	0 %	0 %	17227483
30	NC_003270	AT	3	6	26527	26532	50 %	50 %	0 %	0 %	17227485
31	NC_003270	AT	3	6	26686	26691	50 %	50 %	0 %	0 %	17227485
32	NC_003270	AT	3	6	26831	26836	50 %	50 %	0 %	0 %	17227485
33	NC_003270	AT	3	6	27440	27445	50 %	50 %	0 %	0 %	17227485
34	NC_003270	TA	3	6	29388	29393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003270	TG	3	6	30149	30154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003270	TA	4	8	30187	30194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003270	CT	3	6	30281	30286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003270	TC	3	6	30551	30556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003270	TA	3	6	32277	32282	50 %	50 %	0 %	0 %	17227488
40	NC_003270	AT	3	6	32408	32413	50 %	50 %	0 %	0 %	17227488
41	NC_003270	AG	3	6	32903	32908	50 %	0 %	50 %	0 %	17227488
42	NC_003270	CG	3	6	33086	33091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_003270	TC	3	6	33324	33329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_003270	GA	3	6	33343	33348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003270	AT	3	6	33857	33862	50 %	50 %	0 %	0 %	17227489
46	NC_003270	CG	3	6	34757	34762	0 %	0 %	50 %	50 %	17227489
47	NC_003270	TC	3	6	34877	34882	0 %	50 %	0 %	50 %	17227489
48	NC_003270	GC	3	6	35059	35064	0 %	0 %	50 %	50 %	17227489
49	NC_003270	AT	3	6	35822	35827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003270	GA	3	6	36989	36994	50 %	0 %	50 %	0 %	17227492
51	NC_003270	AT	3	6	38918	38923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003270	CT	3	6	38948	38953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_003270	TC	3	6	39825	39830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.