MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120epsilon

Total Repeats: 821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003270	TAA	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003270	T	6	6	126	131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003270	ATAC	2	8	178	185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003270	CTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_003270	TA	3	6	278	283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003270	ACA	2	6	317	322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_003270	CTA	2	6	326	331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_003270	CTG	2	6	485	490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_003270	TCT	2	6	577	582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003270	T	6	6	614	619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003270	ATT	2	6	650	655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003270	CAA	2	6	692	697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_003270	ACC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_003270	TCA	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_003270	ATC	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_003270	CA	3	6	800	805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_003270	CAC	2	6	814	819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_003270	T	7	7	839	845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003270	AT	3	6	855	860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003270	ATG	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003270	TAG	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003270	A	6	6	957	962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003270	TAA	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003270	ACC	2	6	986	991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_003270	TAA	2	6	1032	1037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003270	ATG	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003270	AGTG	2	8	1182	1189	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003270	GGGT	2	8	1243	1250	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003270	TCGCT	2	10	1341	1350	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_003270	TTCG	2	8	1365	1372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003270	A	8	8	1540	1547	100 %	0 %	0 %	0 %	17227466
32	NC_003270	GGA	2	6	1566	1571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227466
33	NC_003270	TCA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227466
34	NC_003270	AGA	2	6	1584	1589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227466
35	NC_003270	GAC	2	6	1696	1701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
36	NC_003270	CAA	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
37	NC_003270	GT	3	6	1791	1796	0 %	50 %	50 %	0 %	17227466
38	NC_003270	CGG	2	6	1896	1901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
39	NC_003270	GCA	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
40	NC_003270	G	6	6	1982	1987	0 %	0 %	100 %	0 %	17227466
41	NC_003270	CCAC	2	8	2003	2010	25 %	0 %	0 %	75 %	17227466
42	NC_003270	CACT	2	8	2051	2058	25 %	25 %	0 %	50 %	17227466
43	NC_003270	A	6	6	2074	2079	100 %	0 %	0 %	0 %	17227466
44	NC_003270	ATG	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227466
45	NC_003270	ACC	2	6	2156	2161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227466
46	NC_003270	AAG	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227466
47	NC_003270	CAA	2	6	2281	2286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
48	NC_003270	ATT	2	6	2301	2306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227466
49	NC_003270	GGTCAC	2	12	2356	2367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17227466
50	NC_003270	GCG	3	9	2423	2431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
51	NC_003270	GATT	2	8	2436	2443	25 %	50 %	25 %	0 %	17227466
52	NC_003270	GCG	2	6	2554	2559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
53	NC_003270	CACCC	2	10	2592	2601	20 %	0 %	0 %	80 %	17227466
54	NC_003270	TTACC	2	10	2637	2646	20 %	40 %	0 %	40 %	17227466
55	NC_003270	CAA	2	6	2647	2652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
56	NC_003270	ACT	2	6	2697	2702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227466
57	NC_003270	TGA	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227466
58	NC_003270	CAA	2	6	2716	2721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
59	NC_003270	AAC	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
60	NC_003270	GGT	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227466
61	NC_003270	CTG	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227466
62	NC_003270	TTC	2	6	2901	2906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227466
63	NC_003270	CAA	2	6	3068	3073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
64	NC_003270	CAA	2	6	3115	3120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
65	NC_003270	GCG	2	6	3133	3138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
66	NC_003270	CAG	2	6	3148	3153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
67	NC_003270	CTT	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227466
68	NC_003270	ATGG	2	8	3164	3171	25 %	25 %	50 %	0 %	17227466
69	NC_003270	CAG	2	6	3184	3189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
70	NC_003270	GAT	2	6	3202	3207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227466
71	NC_003270	TCT	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_003270	GTT	2	6	3385	3390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003270	ATG	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227467
74	NC_003270	GCAACA	2	12	3484	3495	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	17227467
75	NC_003270	ACC	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227467
76	NC_003270	CTG	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227467
77	NC_003270	CCA	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227467
78	NC_003270	CTC	2	6	3581	3586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227467
79	NC_003270	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227467
80	NC_003270	GTA	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227467
81	NC_003270	TCGT	2	8	3732	3739	0 %	50 %	25 %	25 %	17227467
82	NC_003270	TAA	2	6	3746	3751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227467
83	NC_003270	AACT	2	8	3819	3826	50 %	25 %	0 %	25 %	17227467
84	NC_003270	CTG	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_003270	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_003270	TCA	2	6	3937	3942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_003270	ATG	2	6	4032	4037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003270	CACC	2	8	4042	4049	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_003270	T	6	6	4094	4099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003270	AGT	2	6	4100	4105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003270	GTTG	2	8	4113	4120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003270	T	8	8	4121	4128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003270	A	6	6	4147	4152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003270	T	6	6	4163	4168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003270	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003270	TTA	2	6	4387	4392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003270	ATTT	2	8	4420	4427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003270	TTGT	2	8	4461	4468	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003270	CTG	2	6	4494	4499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_003270	ACA	2	6	4507	4512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_003270	CGT	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_003270	GAT	2	6	4607	4612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003270	TTCA	2	8	4619	4626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003270	CTC	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227468
105	NC_003270	ACTC	2	8	4800	4807	25 %	25 %	0 %	50 %	17227468
106	NC_003270	TTC	2	6	4813	4818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
107	NC_003270	GTT	2	6	4965	4970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
108	NC_003270	CT	3	6	5057	5062	0 %	50 %	0 %	50 %	17227468
109	NC_003270	TGT	2	6	5068	5073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
110	NC_003270	CT	3	6	5081	5086	0 %	50 %	0 %	50 %	17227468
111	NC_003270	TGCT	2	8	5145	5152	0 %	50 %	25 %	25 %	17227468
112	NC_003270	GACATT	2	12	5275	5286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17227468
113	NC_003270	GTT	2	6	5301	5306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
114	NC_003270	ATT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227468
115	NC_003270	T	7	7	5339	5345	0 %	100 %	0 %	0 %	17227468
116	NC_003270	TCA	2	6	5357	5362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
117	NC_003270	GTGG	2	8	5368	5375	0 %	25 %	75 %	0 %	17227468
118	NC_003270	TTG	2	6	5401	5406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
119	NC_003270	GATG	2	8	5528	5535	25 %	25 %	50 %	0 %	17227468
120	NC_003270	AAT	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227468
121	NC_003270	TTC	2	6	5812	5817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
122	NC_003270	TTG	2	6	5824	5829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
123	NC_003270	ATC	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
124	NC_003270	AC	3	6	5906	5911	50 %	0 %	0 %	50 %	17227468
125	NC_003270	GCG	2	6	6014	6019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227468
126	NC_003270	CTTTGC	2	12	6114	6125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	17227468
127	NC_003270	TCA	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
128	NC_003270	AGC	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227468
129	NC_003270	TGA	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227468
130	NC_003270	TAC	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
131	NC_003270	CAAG	2	8	6368	6375	50 %	0 %	25 %	25 %	17227468
132	NC_003270	TAA	2	6	6445	6450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227468
133	NC_003270	TGT	2	6	6458	6463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
134	NC_003270	A	6	6	6544	6549	100 %	0 %	0 %	0 %	17227468
135	NC_003270	TTC	2	6	6568	6573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
136	NC_003270	TTG	2	6	6707	6712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
137	NC_003270	AAT	2	6	6780	6785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227468
138	NC_003270	TGCCA	2	10	6834	6843	20 %	20 %	20 %	40 %	17227468
139	NC_003270	GTA	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227468
140	NC_003270	CTC	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227468
141	NC_003270	GT	3	6	6957	6962	0 %	50 %	50 %	0 %	17227468
142	NC_003270	TTG	3	9	6973	6981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
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267	NC_003270	GGC	2	6	13182	13187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227477
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270	NC_003270	CAA	2	6	13345	13350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227477
271	NC_003270	A	7	7	13662	13668	100 %	0 %	0 %	0 %	17227477
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407	NC_003270	CTT	2	6	19993	19998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227482
408	NC_003270	CAA	2	6	20076	20081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227482
409	NC_003270	ATG	2	6	20142	20147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227482
410	NC_003270	GAG	2	6	20165	20170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227482
411	NC_003270	TA	3	6	20198	20203	50 %	50 %	0 %	0 %	17227482
412	NC_003270	ACTC	2	8	20209	20216	25 %	25 %	0 %	50 %	17227482
413	NC_003270	TGG	2	6	20239	20244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227482
414	NC_003270	TG	3	6	20447	20452	0 %	50 %	50 %	0 %	17227482
415	NC_003270	T	6	6	20523	20528	0 %	100 %	0 %	0 %	17227482
416	NC_003270	TGT	2	6	20545	20550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227482
417	NC_003270	AGA	2	6	20618	20623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227482
418	NC_003270	GAA	2	6	20626	20631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227482
419	NC_003270	T	6	6	20756	20761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_003270	TAA	2	6	20797	20802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_003270	TTAT	2	8	20944	20951	25 %	75 %	0 %	0 %	17227483
422	NC_003270	A	6	6	21084	21089	100 %	0 %	0 %	0 %	17227483
423	NC_003270	AGA	2	6	21109	21114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227483
424	NC_003270	CAG	2	6	21151	21156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227483
425	NC_003270	T	6	6	21179	21184	0 %	100 %	0 %	0 %	17227483
426	NC_003270	TAG	2	6	21291	21296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227483
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428	NC_003270	A	7	7	21392	21398	100 %	0 %	0 %	0 %	17227483
429	NC_003270	CAAA	2	8	21470	21477	75 %	0 %	0 %	25 %	17227483
430	NC_003270	AAC	2	6	21491	21496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227483
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433	NC_003270	AAG	2	6	21519	21524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227483
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437	NC_003270	GTT	2	6	21707	21712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227483
438	NC_003270	GCC	2	6	21725	21730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17227483
439	NC_003270	ATGG	2	8	21760	21767	25 %	25 %	50 %	0 %	17227483
440	NC_003270	AGA	2	6	21793	21798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227483
441	NC_003270	TGT	2	6	21799	21804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227483
442	NC_003270	GGA	2	6	21821	21826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227483
443	NC_003270	ATT	2	6	21895	21900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227483
444	NC_003270	TTC	2	6	21901	21906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227483
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453	NC_003270	AT	3	6	22291	22296	50 %	50 %	0 %	0 %	17227483
454	NC_003270	ATG	2	6	22299	22304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227483
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499	NC_003270	TCC	2	6	24229	24234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227483
500	NC_003270	A	6	6	24240	24245	100 %	0 %	0 %	0 %	17227483

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