MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis MC58 chromosome

Total Repeats: 1628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003112	AAAAT	2	10	823	832	80 %	20 %	0 %	0 %	15675950
2	NC_003112	CGCAA	2	10	1306	1315	40 %	0 %	20 %	40 %	15675951
3	NC_003112	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	15675951
4	NC_003112	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	15675951
5	NC_003112	TTTTC	2	10	4154	4163	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_003112	AAGGC	2	10	6081	6090	40 %	0 %	40 %	20 %	15675957
7	NC_003112	GCTTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	15675958
8	NC_003112	TACCG	2	10	8590	8599	20 %	20 %	20 %	40 %	15675959
9	NC_003112	TCAAT	2	10	9657	9666	40 %	40 %	0 %	20 %	15675960
10	NC_003112	CGCGC	2	10	10670	10679	0 %	0 %	40 %	60 %	15675961
11	NC_003112	CCCGT	2	10	10691	10700	0 %	20 %	20 %	60 %	15675961
12	NC_003112	CGCGC	2	10	13214	13223	0 %	0 %	40 %	60 %	15675963
13	NC_003112	TGTCG	2	10	13296	13305	0 %	40 %	40 %	20 %	15675963
14	NC_003112	ATTTA	2	10	13643	13652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003112	CTTGC	2	10	17125	17134	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_003112	GGAAA	2	10	17758	17767	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003112	TTTTA	2	10	17910	17919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003112	AATTT	2	10	18135	18144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003112	AGGGC	2	10	27700	27709	20 %	0 %	60 %	20 %	15675970
20	NC_003112	AAACC	2	10	28403	28412	60 %	0 %	0 %	40 %	15675971
21	NC_003112	TCCGC	2	10	31703	31712	0 %	20 %	20 %	60 %	15675973
22	NC_003112	GCCTT	2	10	34535	34544	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_003112	CATTC	2	10	36286	36295	20 %	40 %	0 %	40 %	15675977
24	NC_003112	AGGTG	2	10	36732	36741	20 %	20 %	60 %	0 %	15675978
25	NC_003112	GGGCT	2	10	39396	39405	0 %	20 %	60 %	20 %	15675981
26	NC_003112	GGCGG	2	10	42894	42903	0 %	0 %	80 %	20 %	15675984
27	NC_003112	GCGGT	2	10	43370	43379	0 %	20 %	60 %	20 %	15675985
28	NC_003112	GCGCG	2	10	43767	43776	0 %	0 %	60 %	40 %	15675985
29	NC_003112	ACGGC	2	10	44312	44321	20 %	0 %	40 %	40 %	15675985
30	NC_003112	CCCGT	2	10	48089	48098	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_003112	CGGCG	2	10	48439	48448	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_003112	GAAAA	2	10	49318	49327	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003112	GAACG	2	10	49973	49982	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_003112	TTTGA	2	10	50414	50423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003112	GAAAA	2	10	51080	51089	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003112	CAATT	2	10	51423	51432	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_003112	GTTGG	2	10	53909	53918	0 %	40 %	60 %	0 %	15675988
38	NC_003112	AAACC	2	10	56299	56308	60 %	0 %	0 %	40 %	15675989
39	NC_003112	CCCGC	2	10	56796	56805	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
40	NC_003112	GTGCG	2	10	58650	58659	0 %	20 %	60 %	20 %	15675991
41	NC_003112	GTAGC	2	10	61824	61833	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_003112	TCGTG	2	10	62041	62050	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_003112	AGAAA	2	10	63002	63011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003112	GGGAG	2	10	63666	63675	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003112	AGGTT	2	10	64608	64617	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003112	TTTGC	2	10	66335	66344	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_003112	ATTTT	2	10	66954	66963	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003112	TGCCG	2	10	69006	69015	0 %	20 %	40 %	40 %	15675998
49	NC_003112	TGGCT	2	10	69335	69344	0 %	40 %	40 %	20 %	15675998
50	NC_003112	TGCCC	2	10	69942	69951	0 %	20 %	20 %	60 %	15675998
51	NC_003112	TCTTT	2	10	71835	71844	0 %	80 %	0 %	20 %	15675999
52	NC_003112	GCGTA	2	10	72061	72070	20 %	20 %	40 %	20 %	15676000
53	NC_003112	GGGTA	2	10	73425	73434	20 %	20 %	60 %	0 %	15676001
54	NC_003112	TCGGC	2	10	73818	73827	0 %	20 %	40 %	40 %	15676001
55	NC_003112	TGCTA	2	10	75227	75236	20 %	40 %	20 %	20 %	15676002
56	NC_003112	AAGCA	2	10	77884	77893	60 %	0 %	20 %	20 %	15676004
57	NC_003112	TTTAA	2	10	78134	78143	40 %	60 %	0 %	0 %	15676004
58	NC_003112	GATTT	2	10	80047	80056	20 %	60 %	20 %	0 %	15676006
59	NC_003112	TGTAT	2	10	81449	81458	20 %	60 %	20 %	0 %	15676007
60	NC_003112	AAAAG	2	10	81633	81642	80 %	0 %	20 %	0 %	15676008
61	NC_003112	TTTGA	2	10	82256	82265	20 %	60 %	20 %	0 %	15676008
62	NC_003112	TGGCT	2	10	83189	83198	0 %	40 %	40 %	20 %	15676009
63	NC_003112	GCAAG	2	10	84470	84479	40 %	0 %	40 %	20 %	15676011
64	NC_003112	GCGCG	2	10	85529	85538	0 %	0 %	60 %	40 %	15676011
65	NC_003112	CAACG	2	10	86451	86460	40 %	0 %	20 %	40 %	15676011
66	NC_003112	TTGAT	2	10	86764	86773	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003112	TTTCC	2	10	87085	87094	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_003112	ATTTT	2	10	87434	87443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003112	CTACC	2	10	88231	88240	20 %	20 %	0 %	60 %	15677985
70	NC_003112	TACGC	2	10	89596	89605	20 %	20 %	20 %	40 %	15676012
71	NC_003112	CCCGT	2	10	92682	92691	0 %	20 %	20 %	60 %	15676015
72	NC_003112	CCGTA	2	10	92919	92928	20 %	20 %	20 %	40 %	15676015
73	NC_003112	ACATC	2	10	93820	93829	40 %	20 %	0 %	40 %	15676016
74	NC_003112	GGCAA	2	10	95075	95084	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_003112	CGCAA	2	10	95529	95538	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_003112	ACCGC	2	10	101823	101832	20 %	0 %	20 %	60 %	15676021
77	NC_003112	AAACC	2	10	102265	102274	60 %	0 %	0 %	40 %	15676021
78	NC_003112	ACCAA	2	10	103940	103949	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_003112	ATTTA	2	10	104302	104311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003112	AAATA	2	10	104312	104321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003112	ATTAA	2	10	104336	104345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003112	CAGGT	2	10	105919	105928	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_003112	TTTGA	2	10	106629	106638	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003112	AATGA	2	10	107521	107530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003112	GAACA	2	10	109405	109414	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_003112	CGTGC	2	10	110711	110720	0 %	20 %	40 %	40 %	15676030
87	NC_003112	GCCGC	2	10	111881	111890	0 %	0 %	40 %	60 %	15676031
88	NC_003112	AATTG	2	10	112665	112674	40 %	40 %	20 %	0 %	15676032
89	NC_003112	AAAAT	2	10	112926	112935	80 %	20 %	0 %	0 %	15676032
90	NC_003112	CGGCG	2	10	114769	114778	0 %	0 %	60 %	40 %	15676034
91	NC_003112	CAGGT	2	10	116235	116244	20 %	20 %	40 %	20 %	15676036
92	NC_003112	CGCCT	2	10	116921	116930	0 %	20 %	20 %	60 %	15676037
93	NC_003112	GGTAT	2	10	117161	117170	20 %	40 %	40 %	0 %	15676037
94	NC_003112	GGCGC	2	10	117412	117421	0 %	0 %	60 %	40 %	15676037
95	NC_003112	TGCCG	2	10	118535	118544	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_003112	TGGCG	2	10	118957	118966	0 %	20 %	60 %	20 %	15676039
97	NC_003112	CAAAG	2	10	119167	119176	60 %	0 %	20 %	20 %	15676039
98	NC_003112	GCGCC	2	10	120374	120383	0 %	0 %	40 %	60 %	15676040
99	NC_003112	GGCGC	2	10	120603	120612	0 %	0 %	60 %	40 %	15676040
100	NC_003112	TGAGT	2	10	122217	122226	20 %	40 %	40 %	0 %	15676042
101	NC_003112	CGGCG	2	10	122721	122730	0 %	0 %	60 %	40 %	15676042
102	NC_003112	GGCAA	2	10	122794	122803	40 %	0 %	40 %	20 %	15676042
103	NC_003112	GTTTT	2	10	125234	125243	0 %	80 %	20 %	0 %	15676044
104	NC_003112	CGTGT	2	10	127004	127013	0 %	40 %	40 %	20 %	15676046
105	NC_003112	GAAAA	2	10	127418	127427	80 %	0 %	20 %	0 %	15676046
106	NC_003112	CAAAT	2	10	128453	128462	60 %	20 %	0 %	20 %	15676046
107	NC_003112	TAATA	2	10	130272	130281	60 %	40 %	0 %	0 %	15676048
108	NC_003112	GAAGG	2	10	133910	133919	40 %	0 %	60 %	0 %	15676053
109	NC_003112	TTGGG	2	10	140511	140520	0 %	40 %	60 %	0 %	15676060
110	NC_003112	CATAC	2	10	142987	142996	40 %	20 %	0 %	40 %	15676061
111	NC_003112	GTGAT	2	10	143866	143875	20 %	40 %	40 %	0 %	15676061
112	NC_003112	CCTGC	2	10	149217	149226	0 %	20 %	20 %	60 %	15676066
113	NC_003112	CTTTA	2	10	151760	151769	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_003112	GAAAA	2	10	153467	153476	80 %	0 %	20 %	0 %	15676072
115	NC_003112	TGATT	2	10	154554	154563	20 %	60 %	20 %	0 %	15676074
116	NC_003112	AATGC	2	10	155248	155257	40 %	20 %	20 %	20 %	15676075
117	NC_003112	GTAAA	2	10	156199	156208	60 %	20 %	20 %	0 %	15676078
118	NC_003112	AATTT	2	10	156423	156432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003112	TCAAA	2	10	157271	157280	60 %	20 %	0 %	20 %	15676080
120	NC_003112	TTTGG	2	10	158082	158091	0 %	60 %	40 %	0 %	15676082
121	NC_003112	GAAAT	2	10	161928	161937	60 %	20 %	20 %	0 %	15676089
122	NC_003112	AAAAT	2	10	162190	162199	80 %	20 %	0 %	0 %	15676091
123	NC_003112	GGGTT	2	10	163677	163686	0 %	40 %	60 %	0 %	15676094
124	NC_003112	GTCAT	2	10	164199	164208	20 %	40 %	20 %	20 %	15676095
125	NC_003112	GCAAA	2	10	166571	166580	60 %	0 %	20 %	20 %	15676098
126	NC_003112	CGGTT	2	10	166601	166610	0 %	40 %	40 %	20 %	15676098
127	NC_003112	TGGTT	2	10	171088	171097	0 %	60 %	40 %	0 %	15676101
128	NC_003112	CGGCG	2	10	171641	171650	0 %	0 %	60 %	40 %	15676102
129	NC_003112	CCAAA	2	10	172030	172039	60 %	0 %	0 %	40 %	15676102
130	NC_003112	TTTAT	2	10	172237	172246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003112	TGAAA	2	10	172942	172951	60 %	20 %	20 %	0 %	15676103
132	NC_003112	TGCCG	2	10	173639	173648	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_003112	GCCGC	2	10	174033	174042	0 %	0 %	40 %	60 %	15676104
134	NC_003112	CGGCG	2	10	175497	175506	0 %	0 %	60 %	40 %	15676105
135	NC_003112	TCTGC	2	10	175584	175593	0 %	40 %	20 %	40 %	15676105
136	NC_003112	TTTCC	2	10	176209	176218	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_003112	AACCC	2	10	179515	179524	40 %	0 %	0 %	60 %	15676109
138	NC_003112	CTCGG	2	10	180698	180707	0 %	20 %	40 %	40 %	15676109
139	NC_003112	GCCGT	2	10	183200	183209	0 %	20 %	40 %	40 %	15676111
140	NC_003112	ACCAA	2	10	184042	184051	60 %	0 %	0 %	40 %	15676112
141	NC_003112	TGCCG	2	10	186616	186625	0 %	20 %	40 %	40 %	15676115
142	NC_003112	GTTGC	2	10	186931	186940	0 %	40 %	40 %	20 %	15676115
143	NC_003112	TGGCG	2	10	187512	187521	0 %	20 %	60 %	20 %	15676116
144	NC_003112	GTTTG	2	10	187536	187545	0 %	60 %	40 %	0 %	15676116
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162	NC_003112	ATAAA	2	10	225183	225192	80 %	20 %	0 %	0 %	15676144
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179	NC_003112	CATTT	2	10	244019	244028	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
180	NC_003112	GGTCC	2	10	245121	245130	0 %	20 %	40 %	40 %	15676164
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261	NC_003112	TTTGG	2	10	340550	340559	0 %	60 %	40 %	0 %	15676247
262	NC_003112	CAAAA	2	10	340872	340881	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_003112	ACCGG	2	10	342604	342613	20 %	0 %	40 %	40 %	15676249
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273	NC_003112	GCGGG	2	10	364269	364278	0 %	0 %	80 %	20 %	15676272
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407	NC_003112	ATCAT	2	10	543863	543872	40 %	40 %	0 %	20 %	15676430
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