MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 5860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002946	GCCG	2	8	363	370	0 %	0 %	50 %	50 %	59800474
2	NC_002946	GCGT	2	8	400	407	0 %	25 %	50 %	25 %	59800474
3	NC_002946	CGGA	2	8	651	658	25 %	0 %	50 %	25 %	59800474
4	NC_002946	AACC	2	8	695	702	50 %	0 %	0 %	50 %	59800474
5	NC_002946	GAGC	2	8	1339	1346	25 %	0 %	50 %	25 %	59800474
6	NC_002946	TTCG	2	8	1592	1599	0 %	50 %	25 %	25 %	59800474
7	NC_002946	GAGG	2	8	1972	1979	25 %	0 %	75 %	0 %	59800475
8	NC_002946	TGCC	2	8	2039	2046	0 %	25 %	25 %	50 %	59800475
9	NC_002946	CTGC	2	8	2125	2132	0 %	25 %	25 %	50 %	59800475
10	NC_002946	CGAC	2	8	2309	2316	25 %	0 %	25 %	50 %	59800475
11	NC_002946	CTGC	2	8	3338	3345	0 %	25 %	25 %	50 %	59800476
12	NC_002946	ATAA	2	8	3639	3646	75 %	25 %	0 %	0 %	59800476
13	NC_002946	TTGT	2	8	3920	3927	0 %	75 %	25 %	0 %	59800476
14	NC_002946	GCGG	2	8	5140	5147	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002946	ACGG	2	8	5364	5371	25 %	0 %	50 %	25 %	59800477
16	NC_002946	CGTT	2	8	5382	5389	0 %	50 %	25 %	25 %	59800477
17	NC_002946	GCAG	2	8	5677	5684	25 %	0 %	50 %	25 %	59800477
18	NC_002946	GCGG	2	8	5793	5800	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_002946	GCGG	2	8	6001	6008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_002946	GTCG	2	8	6134	6141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_002946	GCAG	2	8	6174	6181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_002946	TGCC	2	8	6188	6195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002946	TTTG	2	8	6224	6231	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002946	GACG	2	8	7022	7029	25 %	0 %	50 %	25 %	59800478
25	NC_002946	AGCA	2	8	7223	7230	50 %	0 %	25 %	25 %	59800478
26	NC_002946	CCTG	2	8	7900	7907	0 %	25 %	25 %	50 %	59800478
27	NC_002946	CCGC	2	8	8472	8479	0 %	0 %	25 %	75 %	59800478
28	NC_002946	AGAC	2	8	9232	9239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_002946	ATTT	2	8	9369	9376	25 %	75 %	0 %	0 %	59800479
30	NC_002946	AAGC	2	8	9478	9485	50 %	0 %	25 %	25 %	59800479
31	NC_002946	TCTT	2	8	9657	9664	0 %	75 %	0 %	25 %	59800479
32	NC_002946	ACCG	2	8	9765	9772	25 %	0 %	25 %	50 %	59800479
33	NC_002946	ATCC	2	8	10009	10016	25 %	25 %	0 %	50 %	59800479
34	NC_002946	TGAT	2	8	10288	10295	25 %	50 %	25 %	0 %	59800479
35	NC_002946	CTTT	2	8	10459	10466	0 %	75 %	0 %	25 %	59800480
36	NC_002946	TTAT	2	8	11355	11362	25 %	75 %	0 %	0 %	59800481
37	NC_002946	TTAT	2	8	11379	11386	25 %	75 %	0 %	0 %	59800481
38	NC_002946	AGTT	2	8	11470	11477	25 %	50 %	25 %	0 %	59800481
39	NC_002946	AATA	2	8	11642	11649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002946	CCCG	2	8	12123	12130	0 %	0 %	25 %	75 %	59800482
41	NC_002946	GGCA	2	8	12355	12362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_002946	CAGG	2	8	12618	12625	25 %	0 %	50 %	25 %	59800483
43	NC_002946	AATC	2	8	13224	13231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002946	AACC	2	8	13294	13301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_002946	TTAT	2	8	13592	13599	25 %	75 %	0 %	0 %	59800484
46	NC_002946	ATTG	2	8	13903	13910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002946	TGCT	2	8	14138	14145	0 %	50 %	25 %	25 %	59800485
48	NC_002946	GCCG	2	8	15145	15152	0 %	0 %	50 %	50 %	59800486
49	NC_002946	TCTG	2	8	15236	15243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_002946	GCGG	2	8	15304	15311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002946	TGGG	2	8	15544	15551	0 %	25 %	75 %	0 %	59800487
52	NC_002946	CGGG	2	8	15909	15916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_002946	TGCC	2	8	15960	15967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_002946	CTGG	2	8	16291	16298	0 %	25 %	50 %	25 %	59800488
55	NC_002946	TGGA	2	8	16776	16783	25 %	25 %	50 %	0 %	59800489
56	NC_002946	GCCT	2	8	17722	17729	0 %	25 %	25 %	50 %	59800490
57	NC_002946	TTGG	2	8	17791	17798	0 %	50 %	50 %	0 %	59800490
58	NC_002946	CTGC	2	8	18113	18120	0 %	25 %	25 %	50 %	59800490
59	NC_002946	TTTC	2	8	18714	18721	0 %	75 %	0 %	25 %	59800490
60	NC_002946	GTGC	2	8	19324	19331	0 %	25 %	50 %	25 %	59800490
61	NC_002946	CTGC	2	8	19645	19652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002946	CTTC	2	8	19742	19749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002946	ATCA	2	8	19790	19797	50 %	25 %	0 %	25 %	59800491
64	NC_002946	CGTG	2	8	19951	19958	0 %	25 %	50 %	25 %	59800491
65	NC_002946	GTTT	2	8	20102	20109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002946	CCGC	2	8	20195	20202	0 %	0 %	25 %	75 %	59800492
67	NC_002946	GGCA	2	8	20218	20225	25 %	0 %	50 %	25 %	59800492
68	NC_002946	TTGC	2	8	20236	20243	0 %	50 %	25 %	25 %	59800492
69	NC_002946	CCAA	2	8	21248	21255	50 %	0 %	0 %	50 %	59800493
70	NC_002946	CTGG	2	8	21634	21641	0 %	25 %	50 %	25 %	59800494
71	NC_002946	CGCC	2	8	22018	22025	0 %	0 %	25 %	75 %	59800494
72	NC_002946	CGCC	2	8	22045	22052	0 %	0 %	25 %	75 %	59800494
73	NC_002946	GCGG	2	8	22594	22601	0 %	0 %	75 %	25 %	59800495
74	NC_002946	CGTC	2	8	22691	22698	0 %	25 %	25 %	50 %	59800495
75	NC_002946	CACG	2	8	22877	22884	25 %	0 %	25 %	50 %	59800495
76	NC_002946	AAAC	2	8	23180	23187	75 %	0 %	0 %	25 %	59800495
77	NC_002946	GGTC	2	8	23306	23313	0 %	25 %	50 %	25 %	59800495
78	NC_002946	CAAA	2	8	23477	23484	75 %	0 %	0 %	25 %	59800495
79	NC_002946	TCAA	2	8	23704	23711	50 %	25 %	0 %	25 %	59800495
80	NC_002946	TGCC	2	8	23924	23931	0 %	25 %	25 %	50 %	59800495
81	NC_002946	AGGC	2	8	24747	24754	25 %	0 %	50 %	25 %	59800496
82	NC_002946	GCGG	2	8	24898	24905	0 %	0 %	75 %	25 %	59800496
83	NC_002946	CGAG	2	8	25540	25547	25 %	0 %	50 %	25 %	59800496
84	NC_002946	CGGG	2	8	25898	25905	0 %	0 %	75 %	25 %	59800497
85	NC_002946	GCGG	2	8	25952	25959	0 %	0 %	75 %	25 %	59800497
86	NC_002946	GCGT	2	8	26033	26040	0 %	25 %	50 %	25 %	59800497
87	NC_002946	TGAT	2	8	26542	26549	25 %	50 %	25 %	0 %	59800498
88	NC_002946	CGGG	2	8	27100	27107	0 %	0 %	75 %	25 %	59800499
89	NC_002946	CGGG	2	8	27491	27498	0 %	0 %	75 %	25 %	59800499
90	NC_002946	GCGA	2	8	28793	28800	25 %	0 %	50 %	25 %	59800501
91	NC_002946	TGCC	2	8	28905	28912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002946	GTTG	2	8	29331	29338	0 %	50 %	50 %	0 %	59800502
93	NC_002946	AAGG	2	8	29371	29378	50 %	0 %	50 %	0 %	59800502
94	NC_002946	GTCC	2	8	29502	29509	0 %	25 %	25 %	50 %	59800502
95	NC_002946	AAAG	2	8	29804	29811	75 %	0 %	25 %	0 %	59800502
96	NC_002946	TGCC	2	8	30066	30073	0 %	25 %	25 %	50 %	59800503
97	NC_002946	TGCC	2	8	30564	30571	0 %	25 %	25 %	50 %	59800503
98	NC_002946	TGGA	2	8	30770	30777	25 %	25 %	50 %	0 %	59800503
99	NC_002946	CTGG	2	8	31519	31526	0 %	25 %	50 %	25 %	59800504
100	NC_002946	GGCA	2	8	31967	31974	25 %	0 %	50 %	25 %	59800504
101	NC_002946	CGCC	2	8	32116	32123	0 %	0 %	25 %	75 %	59800504
102	NC_002946	CAGG	2	8	32505	32512	25 %	0 %	50 %	25 %	59800505
103	NC_002946	GGAC	2	8	33031	33038	25 %	0 %	50 %	25 %	59800505
104	NC_002946	TTTG	2	8	33526	33533	0 %	75 %	25 %	0 %	59800505
105	NC_002946	GTTT	2	8	34211	34218	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002946	GCGG	2	8	34616	34623	0 %	0 %	75 %	25 %	59800506
107	NC_002946	TAAA	2	8	34728	34735	75 %	25 %	0 %	0 %	59800506
108	NC_002946	TTTC	2	8	35155	35162	0 %	75 %	0 %	25 %	59800506
109	NC_002946	GCGG	2	8	35209	35216	0 %	0 %	75 %	25 %	59800506
110	NC_002946	CGGG	2	8	35313	35320	0 %	0 %	75 %	25 %	59800506
111	NC_002946	GGAA	2	8	35350	35357	50 %	0 %	50 %	0 %	59800506
112	NC_002946	CGGA	2	8	35537	35544	25 %	0 %	50 %	25 %	59800506
113	NC_002946	GGAC	2	8	35668	35675	25 %	0 %	50 %	25 %	59800506
114	NC_002946	TCGG	2	8	35897	35904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002946	GGGA	2	8	36333	36340	25 %	0 %	75 %	0 %	59800507
116	NC_002946	GCAG	2	8	36980	36987	25 %	0 %	50 %	25 %	59800508
117	NC_002946	TGCC	2	8	37026	37033	0 %	25 %	25 %	50 %	59800508
118	NC_002946	CCGA	2	8	37166	37173	25 %	0 %	25 %	50 %	59800508
119	NC_002946	CAGG	2	8	37403	37410	25 %	0 %	50 %	25 %	59800508
120	NC_002946	TTTG	2	8	37835	37842	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002946	CCGG	2	8	38500	38507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002946	TGTT	2	8	38741	38748	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002946	TTGT	2	8	39099	39106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002946	CGGT	2	8	39606	39613	0 %	25 %	50 %	25 %	59800509
125	NC_002946	CCAG	2	8	40711	40718	25 %	0 %	25 %	50 %	59800511
126	NC_002946	CGCC	2	8	41544	41551	0 %	0 %	25 %	75 %	59800511
127	NC_002946	GGCA	2	8	41980	41987	25 %	0 %	50 %	25 %	59800511
128	NC_002946	CGGC	2	8	42402	42409	0 %	0 %	50 %	50 %	59800512
129	NC_002946	CGGC	2	8	42456	42463	0 %	0 %	50 %	50 %	59800512
130	NC_002946	ATCA	2	8	42586	42593	50 %	25 %	0 %	25 %	59800512
131	NC_002946	AGGC	2	8	43122	43129	25 %	0 %	50 %	25 %	59800514
132	NC_002946	CTGC	2	8	43345	43352	0 %	25 %	25 %	50 %	59800514
133	NC_002946	GGGC	2	8	44002	44009	0 %	0 %	75 %	25 %	59800514
134	NC_002946	AAAG	2	8	44130	44137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002946	GCGG	2	8	44451	44458	0 %	0 %	75 %	25 %	59800515
136	NC_002946	TGCC	2	8	44835	44842	0 %	25 %	25 %	50 %	59800515
137	NC_002946	CTTC	2	8	46029	46036	0 %	50 %	0 %	50 %	59800515
138	NC_002946	GACG	2	8	46919	46926	25 %	0 %	50 %	25 %	59800515
139	NC_002946	GGTC	2	8	47259	47266	0 %	25 %	50 %	25 %	59800515
140	NC_002946	GGAT	2	8	47400	47407	25 %	25 %	50 %	0 %	59800515
141	NC_002946	TGGG	2	8	47430	47437	0 %	25 %	75 %	0 %	59800515
142	NC_002946	TGAT	2	8	47516	47523	25 %	50 %	25 %	0 %	59800516
143	NC_002946	ATTT	3	12	47656	47667	25 %	75 %	0 %	0 %	59800516
144	NC_002946	GAAA	2	8	47717	47724	75 %	0 %	25 %	0 %	59800516
145	NC_002946	TAAT	2	8	47820	47827	50 %	50 %	0 %	0 %	59800516
146	NC_002946	GCTC	2	8	48008	48015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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