MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 31590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002946	CCG	2	6	191	196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800474
2	NC_002946	GAG	2	6	258	263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800474
3	NC_002946	GTG	2	6	276	281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800474
4	NC_002946	GGC	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
5	NC_002946	GGA	2	6	470	475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800474
6	NC_002946	AGG	2	6	487	492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800474
7	NC_002946	CGG	3	9	547	555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
8	NC_002946	CGG	2	6	631	636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
9	NC_002946	GAA	2	6	675	680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800474
10	NC_002946	GCG	2	6	756	761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
11	NC_002946	GCG	2	6	765	770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
12	NC_002946	TTC	2	6	810	815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800474
13	NC_002946	GCA	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
14	NC_002946	GAC	2	6	918	923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
15	NC_002946	CAA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800474
16	NC_002946	ACG	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
17	NC_002946	AGC	2	6	976	981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
18	NC_002946	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800474
19	NC_002946	CGA	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
20	NC_002946	TCA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800474
21	NC_002946	GAA	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800474
22	NC_002946	GAC	2	6	1143	1148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
23	NC_002946	GCC	2	6	1193	1198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800474
24	NC_002946	GCG	2	6	1242	1247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
25	NC_002946	ATT	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800474
26	NC_002946	TCA	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800474
27	NC_002946	CCG	2	6	1435	1440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800474
28	NC_002946	CAT	3	9	1442	1450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800474
29	NC_002946	CTG	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800474
30	NC_002946	TCG	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800475
31	NC_002946	GAC	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800475
32	NC_002946	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800475
33	NC_002946	TAT	2	6	2254	2259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800475
34	NC_002946	CTG	2	6	2269	2274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800475
35	NC_002946	AAC	2	6	2419	2424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800475
36	NC_002946	CGA	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800475
37	NC_002946	GCT	2	6	2448	2453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800475
38	NC_002946	CGT	2	6	2670	2675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800475
39	NC_002946	GCA	2	6	2678	2683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800475
40	NC_002946	GAA	2	6	2695	2700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800475
41	NC_002946	GAA	2	6	2707	2712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800475
42	NC_002946	GCG	2	6	2732	2737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800475
43	NC_002946	CGA	2	6	2796	2801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800475
44	NC_002946	GCG	2	6	3001	3006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002946	CGG	2	6	3103	3108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
46	NC_002946	GCC	2	6	3125	3130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800476
47	NC_002946	GCG	2	6	3242	3247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
48	NC_002946	GAA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800476
49	NC_002946	GTC	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800476
50	NC_002946	GTT	2	6	3302	3307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800476
51	NC_002946	CGA	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
52	NC_002946	GCC	2	6	3607	3612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800476
53	NC_002946	CGG	2	6	3658	3663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
54	NC_002946	TCG	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800476
55	NC_002946	TGG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800476
56	NC_002946	CGG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
57	NC_002946	ACG	2	6	3828	3833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
58	NC_002946	GCT	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800476
59	NC_002946	GTT	2	6	3872	3877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800476
60	NC_002946	CGA	3	9	3904	3912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
61	NC_002946	GCC	2	6	3936	3941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800476
62	NC_002946	TCA	2	6	3943	3948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800476
63	NC_002946	CGG	2	6	4009	4014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
64	NC_002946	CGG	3	9	4018	4026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
65	NC_002946	GTG	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800476
66	NC_002946	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
67	NC_002946	GCG	2	6	4153	4158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
68	NC_002946	GGC	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
69	NC_002946	TCT	2	6	4383	4388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800476
70	NC_002946	TGG	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800476
71	NC_002946	GGA	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800476
72	NC_002946	GAC	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
73	NC_002946	CCG	2	6	4512	4517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800476
74	NC_002946	AAC	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800476
75	NC_002946	GCA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
76	NC_002946	GCG	3	9	4757	4765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
77	NC_002946	GTT	2	6	4808	4813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800476
78	NC_002946	GAC	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
79	NC_002946	CGG	2	6	5046	5051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
80	NC_002946	CAG	2	6	5060	5065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
81	NC_002946	GTT	3	9	5123	5131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002946	GGC	2	6	5168	5173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002946	GGC	2	6	5190	5195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002946	AAT	2	6	5293	5298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800477
85	NC_002946	CCT	2	6	5446	5451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	59800477
86	NC_002946	CGC	2	6	5470	5475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800477
87	NC_002946	GTC	2	6	5564	5569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800477
88	NC_002946	CGA	2	6	5599	5604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800477
89	NC_002946	GTC	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800477
90	NC_002946	GAT	2	6	5765	5770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002946	GTA	2	6	5889	5894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002946	TCG	2	6	5991	5996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_002946	GTC	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_002946	TTG	2	6	6090	6095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002946	ATG	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002946	TCC	2	6	6460	6465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_002946	CGC	2	6	6526	6531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800478
98	NC_002946	GCG	2	6	6542	6547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800478
99	NC_002946	GAC	2	6	6560	6565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800478
100	NC_002946	ATT	2	6	6609	6614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800478
101	NC_002946	CGG	2	6	6759	6764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800478
102	NC_002946	GCG	2	6	6770	6775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800478
103	NC_002946	AAC	2	6	6782	6787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800478
104	NC_002946	CGC	2	6	6796	6801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800478
105	NC_002946	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800478
106	NC_002946	TAC	2	6	6899	6904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800478
107	NC_002946	GCT	2	6	7108	7113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800478
108	NC_002946	GAC	2	6	7217	7222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800478
109	NC_002946	ACC	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800478
110	NC_002946	GCC	2	6	7316	7321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800478
111	NC_002946	CGA	2	6	7419	7424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800478
112	NC_002946	CGT	2	6	7456	7461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800478
113	NC_002946	ACG	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800478
114	NC_002946	GCC	2	6	7577	7582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800478
115	NC_002946	GCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800478
116	NC_002946	GCC	2	6	7739	7744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800478
117	NC_002946	CGT	2	6	7894	7899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800478
118	NC_002946	CGT	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800478
119	NC_002946	CGC	2	6	7935	7940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800478
120	NC_002946	TGC	2	6	7979	7984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800478
121	NC_002946	GGC	2	6	7985	7990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800478
122	NC_002946	GCG	2	6	7991	7996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800478
123	NC_002946	CTT	2	6	8044	8049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800478
124	NC_002946	CGG	2	6	8131	8136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800478
125	NC_002946	CCT	2	6	8158	8163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	59800478
126	NC_002946	CTT	2	6	8173	8178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800478
127	NC_002946	CGA	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800478
128	NC_002946	GTC	2	6	8252	8257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800478
129	NC_002946	CTA	2	6	8266	8271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800478
130	NC_002946	GGC	2	6	8288	8293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800478
131	NC_002946	CCG	2	6	8310	8315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800478
132	NC_002946	GCC	2	6	8343	8348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800478
133	NC_002946	CCG	2	6	8355	8360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800478
134	NC_002946	CGT	2	6	8383	8388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800478
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155	NC_002946	CTA	2	6	9335	9340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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261	NC_002946	CGC	2	6	17344	17349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800490
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