MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 47754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002946	ATATT	2	10	106	115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002946	CCG	2	6	191	196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800474
3	NC_002946	GAG	2	6	258	263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800474
4	NC_002946	GTG	2	6	276	281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800474
5	NC_002946	GCCG	2	8	363	370	0 %	0 %	50 %	50 %	59800474
6	NC_002946	GCGT	2	8	400	407	0 %	25 %	50 %	25 %	59800474
7	NC_002946	GGC	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
8	NC_002946	GGA	2	6	470	475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800474
9	NC_002946	AGG	2	6	487	492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800474
10	NC_002946	CGG	3	9	547	555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
11	NC_002946	CGG	2	6	631	636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
12	NC_002946	CGGA	2	8	651	658	25 %	0 %	50 %	25 %	59800474
13	NC_002946	GAA	2	6	675	680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800474
14	NC_002946	AACC	2	8	695	702	50 %	0 %	0 %	50 %	59800474
15	NC_002946	GCG	2	6	756	761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
16	NC_002946	GCG	2	6	765	770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
17	NC_002946	TTC	2	6	810	815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800474
18	NC_002946	GCA	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
19	NC_002946	GAC	2	6	918	923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
20	NC_002946	CAA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800474
21	NC_002946	ACG	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
22	NC_002946	AGC	2	6	976	981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
23	NC_002946	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800474
24	NC_002946	CGA	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
25	NC_002946	TCA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800474
26	NC_002946	GAA	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800474
27	NC_002946	A	6	6	1089	1094	100 %	0 %	0 %	0 %	59800474
28	NC_002946	GAC	2	6	1143	1148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800474
29	NC_002946	GCC	2	6	1193	1198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800474
30	NC_002946	GCG	2	6	1242	1247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800474
31	NC_002946	GAGC	2	8	1339	1346	25 %	0 %	50 %	25 %	59800474
32	NC_002946	CCGTC	2	10	1361	1370	0 %	20 %	20 %	60 %	59800474
33	NC_002946	ATT	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800474
34	NC_002946	TCA	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800474
35	NC_002946	CCG	2	6	1435	1440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800474
36	NC_002946	CAT	3	9	1442	1450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800474
37	NC_002946	A	6	6	1500	1505	100 %	0 %	0 %	0 %	59800474
38	NC_002946	TTCG	2	8	1592	1599	0 %	50 %	25 %	25 %	59800474
39	NC_002946	CTG	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800474
40	NC_002946	TCG	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800475
41	NC_002946	AC	3	6	1869	1874	50 %	0 %	0 %	50 %	59800475
42	NC_002946	GAGG	2	8	1972	1979	25 %	0 %	75 %	0 %	59800475
43	NC_002946	GC	4	8	2031	2038	0 %	0 %	50 %	50 %	59800475
44	NC_002946	TGCC	2	8	2039	2046	0 %	25 %	25 %	50 %	59800475
45	NC_002946	GAC	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800475
46	NC_002946	CTGC	2	8	2125	2132	0 %	25 %	25 %	50 %	59800475
47	NC_002946	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800475
48	NC_002946	TAT	2	6	2254	2259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800475
49	NC_002946	CTG	2	6	2269	2274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800475
50	NC_002946	CGAC	2	8	2309	2316	25 %	0 %	25 %	50 %	59800475
51	NC_002946	CG	3	6	2363	2368	0 %	0 %	50 %	50 %	59800475
52	NC_002946	AAC	2	6	2419	2424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800475
53	NC_002946	CGA	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800475
54	NC_002946	GCT	2	6	2448	2453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800475
55	NC_002946	GC	3	6	2591	2596	0 %	0 %	50 %	50 %	59800475
56	NC_002946	GT	3	6	2603	2608	0 %	50 %	50 %	0 %	59800475
57	NC_002946	GC	4	8	2636	2643	0 %	0 %	50 %	50 %	59800475
58	NC_002946	CGT	2	6	2670	2675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800475
59	NC_002946	GCA	2	6	2678	2683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800475
60	NC_002946	GAA	2	6	2695	2700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800475
61	NC_002946	GC	3	6	2701	2706	0 %	0 %	50 %	50 %	59800475
62	NC_002946	GAA	2	6	2707	2712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800475
63	NC_002946	GCG	2	6	2732	2737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800475
64	NC_002946	CGA	2	6	2796	2801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800475
65	NC_002946	AT	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	59800475
66	NC_002946	GCG	2	6	3001	3006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_002946	CGG	2	6	3103	3108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
68	NC_002946	GCGCG	2	10	3109	3118	0 %	0 %	60 %	40 %	59800476
69	NC_002946	GCC	2	6	3125	3130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800476
70	NC_002946	T	6	6	3200	3205	0 %	100 %	0 %	0 %	59800476
71	NC_002946	GCG	2	6	3242	3247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
72	NC_002946	GAA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800476
73	NC_002946	GTC	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800476
74	NC_002946	GTT	2	6	3302	3307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800476
75	NC_002946	CG	4	8	3322	3329	0 %	0 %	50 %	50 %	59800476
76	NC_002946	CTGC	2	8	3338	3345	0 %	25 %	25 %	50 %	59800476
77	NC_002946	CGA	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
78	NC_002946	GCC	2	6	3607	3612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800476
79	NC_002946	ATAA	2	8	3639	3646	75 %	25 %	0 %	0 %	59800476
80	NC_002946	CGG	2	6	3658	3663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
81	NC_002946	TCG	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800476
82	NC_002946	TGG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800476
83	NC_002946	CGG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
84	NC_002946	ACG	2	6	3828	3833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
85	NC_002946	GCT	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800476
86	NC_002946	GTT	2	6	3872	3877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800476
87	NC_002946	CGA	3	9	3904	3912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
88	NC_002946	TTGT	2	8	3920	3927	0 %	75 %	25 %	0 %	59800476
89	NC_002946	GCC	2	6	3936	3941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800476
90	NC_002946	TCA	2	6	3943	3948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800476
91	NC_002946	CGG	2	6	4009	4014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
92	NC_002946	CGG	3	9	4018	4026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
93	NC_002946	GTG	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800476
94	NC_002946	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
95	NC_002946	GCG	2	6	4153	4158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
96	NC_002946	CGCCGT	2	12	4321	4332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	59800476
97	NC_002946	GGC	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
98	NC_002946	TCT	2	6	4383	4388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800476
99	NC_002946	CG	3	6	4411	4416	0 %	0 %	50 %	50 %	59800476
100	NC_002946	TGG	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800476
101	NC_002946	GGA	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800476
102	NC_002946	GAC	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
103	NC_002946	CCG	2	6	4512	4517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800476
104	NC_002946	CA	3	6	4519	4524	50 %	0 %	0 %	50 %	59800476
105	NC_002946	AAC	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800476
106	NC_002946	GCA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
107	NC_002946	T	6	6	4733	4738	0 %	100 %	0 %	0 %	59800476
108	NC_002946	GCG	3	9	4757	4765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
109	NC_002946	GTT	2	6	4808	4813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800476
110	NC_002946	GC	3	6	4844	4849	0 %	0 %	50 %	50 %	59800476
111	NC_002946	A	6	6	4955	4960	100 %	0 %	0 %	0 %	59800476
112	NC_002946	GAC	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
113	NC_002946	CGG	2	6	5046	5051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800476
114	NC_002946	CAG	2	6	5060	5065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800476
115	NC_002946	GTT	3	9	5123	5131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002946	GCGG	2	8	5140	5147	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_002946	GGC	2	6	5168	5173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_002946	GGC	2	6	5190	5195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002946	TGACG	2	10	5197	5206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_002946	AAT	2	6	5293	5298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800477
121	NC_002946	ACGG	2	8	5364	5371	25 %	0 %	50 %	25 %	59800477
122	NC_002946	CGTT	2	8	5382	5389	0 %	50 %	25 %	25 %	59800477
123	NC_002946	GAAAA	2	10	5432	5441	80 %	0 %	20 %	0 %	59800477
124	NC_002946	CCT	2	6	5446	5451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	59800477
125	NC_002946	CGC	2	6	5470	5475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800477
126	NC_002946	GTC	2	6	5564	5569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800477
127	NC_002946	CGA	2	6	5599	5604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800477
128	NC_002946	T	6	6	5609	5614	0 %	100 %	0 %	0 %	59800477
129	NC_002946	GTC	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800477
130	NC_002946	GCAG	2	8	5677	5684	25 %	0 %	50 %	25 %	59800477
131	NC_002946	GGCGG	2	10	5704	5713	0 %	0 %	80 %	20 %	59800477
132	NC_002946	GAT	2	6	5765	5770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002946	CGGCT	2	10	5777	5786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_002946	GCGG	2	8	5793	5800	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_002946	GTA	2	6	5889	5894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002946	GTGGAA	2	12	5945	5956	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002946	TCG	2	6	5991	5996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_002946	GCGG	2	8	6001	6008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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267	NC_002946	TTAT	2	8	11355	11362	25 %	75 %	0 %	0 %	59800481
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270	NC_002946	CAA	2	6	11403	11408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800481
271	NC_002946	AGTT	2	8	11470	11477	25 %	50 %	25 %	0 %	59800481
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273	NC_002946	GGT	2	6	11609	11614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_002946	AATA	2	8	11642	11649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_002946	GTC	2	6	11676	11681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_002946	GAC	2	6	11696	11701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_002946	GCA	2	6	11796	11801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_002946	ATT	2	6	11812	11817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_002946	AAGGG	2	10	12034	12043	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_002946	CAG	2	6	12367	12372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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408	NC_002946	TG	3	6	18095	18100	0 %	50 %	50 %	0 %	59800490
409	NC_002946	TGT	2	6	18105	18110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800490
410	NC_002946	CTGC	2	8	18113	18120	0 %	25 %	25 %	50 %	59800490
411	NC_002946	GCC	2	6	18139	18144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800490
412	NC_002946	CGG	2	6	18165	18170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800490
413	NC_002946	GCC	2	6	18193	18198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800490
414	NC_002946	GCC	2	6	18204	18209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800490
415	NC_002946	GAT	2	6	18242	18247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800490
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439	NC_002946	TG	3	6	19512	19517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
440	NC_002946	GCCCC	2	10	19570	19579	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
441	NC_002946	CTGC	2	8	19645	19652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
442	NC_002946	CGC	2	6	19657	19662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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444	NC_002946	CTTC	2	8	19742	19749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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451	NC_002946	TGA	2	6	20014	20019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800491
452	NC_002946	GGC	2	6	20045	20050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800491
453	NC_002946	GTTT	2	8	20102	20109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_002946	ACT	2	6	20118	20123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800492
455	NC_002946	CGC	2	6	20152	20157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800492
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457	NC_002946	CG	3	6	20189	20194	0 %	0 %	50 %	50 %	59800492
458	NC_002946	CCGC	2	8	20195	20202	0 %	0 %	25 %	75 %	59800492
459	NC_002946	GGCA	2	8	20218	20225	25 %	0 %	50 %	25 %	59800492
460	NC_002946	GAT	2	6	20230	20235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800492
461	NC_002946	TTGC	2	8	20236	20243	0 %	50 %	25 %	25 %	59800492
462	NC_002946	GGC	2	6	20317	20322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800492
463	NC_002946	GAT	2	6	20332	20337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800492
464	NC_002946	GGC	2	6	20423	20428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800492
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468	NC_002946	CGC	2	6	20637	20642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800492
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473	NC_002946	CGC	2	6	20893	20898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800492
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478	NC_002946	CGG	2	6	21021	21026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800492
479	NC_002946	GGC	2	6	21043	21048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800492
480	NC_002946	TAT	2	6	21126	21131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800493
481	NC_002946	AAC	2	6	21138	21143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800493
482	NC_002946	CGC	2	6	21156	21161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800493
483	NC_002946	GTC	2	6	21211	21216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800493
484	NC_002946	GAC	2	6	21232	21237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800493
485	NC_002946	CCAA	2	8	21248	21255	50 %	0 %	0 %	50 %	59800493
486	NC_002946	ATT	2	6	21268	21273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_002946	TAA	2	6	21276	21281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_002946	CCG	2	6	21333	21338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800494
489	NC_002946	GCG	3	9	21501	21509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800494
490	NC_002946	GGC	2	6	21599	21604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800494
491	NC_002946	CTGG	2	8	21634	21641	0 %	25 %	50 %	25 %	59800494
492	NC_002946	CTG	2	6	21674	21679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800494
493	NC_002946	GCG	2	6	21687	21692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800494
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497	NC_002946	CGG	3	9	21837	21845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800494
498	NC_002946	CTG	2	6	21854	21859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800494
499	NC_002946	CGA	2	6	21898	21903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800494
500	NC_002946	ATT	2	6	21931	21936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	59800494

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