MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 47754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002946	CGA	2	6	176418	176423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_002946	GT	3	6	176531	176536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_002946	CTG	2	6	176568	176573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_002946	GTT	2	6	176622	176627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_002946	T	6	6	176626	176631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_002946	TGC	2	6	176652	176657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_002946	GCT	2	6	176686	176691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_002946	CGGTTT	2	12	176693	176704	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4009	NC_002946	TGC	2	6	176705	176710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_002946	GCG	2	6	176722	176727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_002946	TG	3	6	176736	176741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_002946	CGG	2	6	176753	176758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_002946	GCG	2	6	176785	176790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_002946	GCG	2	6	176806	176811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_002946	GGC	2	6	176829	176834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_002946	CGTGT	2	10	176859	176868	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4017	NC_002946	GCT	2	6	176895	176900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_002946	CCG	2	6	176908	176913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_002946	TTGAGG	2	12	176914	176925	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_002946	GT	3	6	176969	176974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_002946	TG	3	6	176995	177000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_002946	GGC	2	6	177029	177034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_002946	CGG	2	6	177051	177056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_002946	GAATTG	2	12	177123	177134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_002946	GTG	2	6	177148	177153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_002946	T	6	6	177214	177219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_002946	GCG	2	6	177258	177263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_002946	GCG	3	9	177293	177301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_002946	GCT	2	6	177373	177378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_002946	T	7	7	177432	177438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_002946	GGGC	2	8	177491	177498	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_002946	GGGTGT	2	12	177532	177543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_002946	TGG	2	6	177569	177574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_002946	T	6	6	177602	177607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_002946	GTGC	2	8	177609	177616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_002946	GTC	2	6	177709	177714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_002946	TGA	2	6	177726	177731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_002946	GCAGT	2	10	177754	177763	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4039	NC_002946	CGGT	2	8	177770	177777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_002946	GCG	2	6	177810	177815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_002946	CGG	2	6	177885	177890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_002946	CGG	2	6	177930	177935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_002946	TGT	2	6	178005	178010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_002946	GGC	2	6	178017	178022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_002946	CGG	2	6	178026	178031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_002946	GGT	2	6	178120	178125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_002946	GTG	2	6	178153	178158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_002946	CGG	2	6	178176	178181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_002946	GAT	2	6	178225	178230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_002946	GCT	2	6	178239	178244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_002946	GAG	2	6	178261	178266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_002946	CGGG	2	8	178281	178288	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_002946	TAA	2	6	178296	178301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_002946	TTG	2	6	178325	178330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_002946	TGGTG	2	10	178359	178368	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_002946	CAG	2	6	178411	178416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_002946	GTT	2	6	178449	178454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_002946	GAA	2	6	178489	178494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_002946	AT	3	6	178523	178528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_002946	TG	3	6	178573	178578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_002946	T	6	6	178650	178655	0 %	100 %	0 %	0 %	59800631
4062	NC_002946	T	7	7	178671	178677	0 %	100 %	0 %	0 %	59800631
4063	NC_002946	GAT	2	6	178729	178734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800631
4064	NC_002946	AAT	2	6	178753	178758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800631
4065	NC_002946	TTG	2	6	178796	178801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800631
4066	NC_002946	TGC	2	6	178929	178934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800631
4067	NC_002946	TCT	2	6	179087	179092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800631
4068	NC_002946	CTTT	2	8	179126	179133	0 %	75 %	0 %	25 %	59800631
4069	NC_002946	GTG	2	6	179317	179322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800631
4070	NC_002946	TCG	3	9	179402	179410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800631
4071	NC_002946	GTC	2	6	179413	179418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800631
4072	NC_002946	AT	3	6	179516	179521	50 %	50 %	0 %	0 %	59800631
4073	NC_002946	CAG	2	6	179527	179532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800631
4074	NC_002946	ATG	3	9	179540	179548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800631
4075	NC_002946	GAT	2	6	179557	179562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800631
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4077	NC_002946	GAA	2	6	179653	179658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800631
4078	NC_002946	TTC	2	6	179665	179670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800631
4079	NC_002946	GTT	2	6	179713	179718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800631
4080	NC_002946	GGC	2	6	179719	179724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800631
4081	NC_002946	T	6	6	179779	179784	0 %	100 %	0 %	0 %	59800631
4082	NC_002946	TCG	2	6	179786	179791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800631
4083	NC_002946	CGG	2	6	179808	179813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800631
4084	NC_002946	CG	4	8	179850	179857	0 %	0 %	50 %	50 %	59800631
4085	NC_002946	TGC	2	6	179892	179897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800631
4086	NC_002946	GCG	2	6	179920	179925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800631
4087	NC_002946	GCT	2	6	180052	180057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_002946	GAC	2	6	180322	180327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800632
4089	NC_002946	GTT	2	6	180355	180360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800632
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4091	NC_002946	TGT	2	6	180374	180379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800632
4092	NC_002946	CGG	2	6	180383	180388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800632
4093	NC_002946	GTG	2	6	180420	180425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800632
4094	NC_002946	GTC	2	6	180445	180450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800632
4095	NC_002946	GAT	2	6	180469	180474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800632
4096	NC_002946	GTC	2	6	180484	180489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800632
4097	NC_002946	ATG	3	9	180506	180514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800632
4098	NC_002946	CAT	2	6	180571	180576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800632
4099	NC_002946	CAG	2	6	180685	180690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800632
4100	NC_002946	CAG	2	6	180697	180702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800632
4101	NC_002946	GCGTG	2	10	180778	180787	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4102	NC_002946	T	6	6	180828	180833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_002946	T	6	6	180862	180867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_002946	ATCCGC	2	12	180904	180915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_002946	GCG	3	9	180959	180967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800633
4106	NC_002946	GCA	2	6	180996	181001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800633
4107	NC_002946	TCG	2	6	181031	181036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800633
4108	NC_002946	TTGCC	2	10	181106	181115	0 %	40 %	20 %	40 %	59800633
4109	NC_002946	CTT	2	6	181182	181187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800633
4110	NC_002946	GTC	2	6	181324	181329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800633
4111	NC_002946	GCG	2	6	181331	181336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800633
4112	NC_002946	GTCCA	2	10	181367	181376	20 %	20 %	20 %	40 %	59800633
4113	NC_002946	GCA	2	6	181380	181385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800633
4114	NC_002946	GGC	2	6	181399	181404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800633
4115	NC_002946	GGC	2	6	181429	181434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800633
4116	NC_002946	T	6	6	181435	181440	0 %	100 %	0 %	0 %	59800633
4117	NC_002946	GC	3	6	181560	181565	0 %	0 %	50 %	50 %	59800633
4118	NC_002946	CAG	2	6	181567	181572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800633
4119	NC_002946	CAG	2	6	181603	181608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800633
4120	NC_002946	CAG	2	6	181624	181629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800633
4121	NC_002946	GGA	2	6	181680	181685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800633
4122	NC_002946	TGT	2	6	181689	181694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800633
4123	NC_002946	TTG	2	6	181765	181770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800633
4124	NC_002946	GGC	2	6	181816	181821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800633
4125	NC_002946	CCG	2	6	181865	181870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800633
4126	NC_002946	CGTC	2	8	181987	181994	0 %	25 %	25 %	50 %	59800633
4127	NC_002946	GAAGG	2	10	182023	182032	40 %	0 %	60 %	0 %	59800633
4128	NC_002946	GGC	2	6	182044	182049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800633
4129	NC_002946	CGG	2	6	182091	182096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800633
4130	NC_002946	GTT	2	6	182197	182202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800633
4131	NC_002946	GAT	2	6	182245	182250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800633
4132	NC_002946	G	6	6	182262	182267	0 %	0 %	100 %	0 %	59800633
4133	NC_002946	GAC	2	6	182293	182298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800633
4134	NC_002946	AGC	2	6	182327	182332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800633
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4136	NC_002946	CCA	2	6	182482	182487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800633
4137	NC_002946	GCC	2	6	182492	182497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800633
4138	NC_002946	AGG	2	6	182507	182512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800633
4139	NC_002946	T	6	6	182546	182551	0 %	100 %	0 %	0 %	59800633
4140	NC_002946	AAC	2	6	182564	182569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800633
4141	NC_002946	GGCC	2	8	182580	182587	0 %	0 %	50 %	50 %	59800633
4142	NC_002946	GCG	3	9	182588	182596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800633
4143	NC_002946	GAT	2	6	182650	182655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800633
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4145	NC_002946	GGC	2	6	182698	182703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800633
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4147	NC_002946	TTGT	2	8	182739	182746	0 %	75 %	25 %	0 %	59800633
4148	NC_002946	ACGA	2	8	182763	182770	50 %	0 %	25 %	25 %	59800634
4149	NC_002946	CAGG	2	8	182771	182778	25 %	0 %	50 %	25 %	59800634
4150	NC_002946	GAA	2	6	182783	182788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	59800634
4151	NC_002946	GAT	2	6	182789	182794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800634
4152	NC_002946	GCG	2	6	182814	182819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800634
4153	NC_002946	T	6	6	182824	182829	0 %	100 %	0 %	0 %	59800634
4154	NC_002946	GGTA	2	8	182902	182909	25 %	25 %	50 %	0 %	59800634
4155	NC_002946	T	7	7	182914	182920	0 %	100 %	0 %	0 %	59800634
4156	NC_002946	GGCA	2	8	182940	182947	25 %	0 %	50 %	25 %	59800634
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4160	NC_002946	CGC	2	6	183258	183263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800635
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4164	NC_002946	AATG	2	8	183351	183358	50 %	25 %	25 %	0 %	59800635
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4172	NC_002946	TCG	2	6	183602	183607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800635
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4180	NC_002946	TGA	2	6	183880	183885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800636
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4185	NC_002946	ATGCC	2	10	184132	184141	20 %	20 %	20 %	40 %	59800636
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4198	NC_002946	GCGG	2	8	185123	185130	0 %	0 %	75 %	25 %	59800637
4199	NC_002946	T	6	6	185234	185239	0 %	100 %	0 %	0 %	59800638
4200	NC_002946	CTT	2	6	185266	185271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800638
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4202	NC_002946	T	6	6	185348	185353	0 %	100 %	0 %	0 %	59800638
4203	NC_002946	ACG	2	6	185370	185375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800638
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4223	NC_002946	TGTT	2	8	186198	186205	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4224	NC_002946	TGTT	2	8	186208	186215	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4225	NC_002946	GCT	2	6	186235	186240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4234	NC_002946	CTT	2	6	186692	186697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800641
4235	NC_002946	CAA	2	6	186698	186703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800641
4236	NC_002946	ATG	2	6	186787	186792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800641
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4239	NC_002946	CGC	2	6	186881	186886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800641
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4242	NC_002946	TCAA	2	8	186922	186929	50 %	25 %	0 %	25 %	59800641
4243	NC_002946	AGC	2	6	186930	186935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800641
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4247	NC_002946	GGT	2	6	187052	187057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800641
4248	NC_002946	TGC	2	6	187061	187066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800641
4249	NC_002946	CGGT	2	8	187073	187080	0 %	25 %	50 %	25 %	59800641
4250	NC_002946	CGT	2	6	187082	187087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800641
4251	NC_002946	GAT	2	6	187092	187097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800641
4252	NC_002946	ACG	2	6	187111	187116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800641
4253	NC_002946	GTC	2	6	187134	187139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800641
4254	NC_002946	CGGATG	2	12	187215	187226	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	59800641
4255	NC_002946	CGGT	2	8	187328	187335	0 %	25 %	50 %	25 %	59800641
4256	NC_002946	TGT	2	6	187367	187372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800641
4257	NC_002946	TGC	2	6	187380	187385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800641
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4260	NC_002946	TAC	2	6	187506	187511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4262	NC_002946	CCT	2	6	187592	187597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4272	NC_002946	T	6	6	187986	187991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4274	NC_002946	GAA	2	6	188098	188103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4374	NC_002946	TTA	2	6	193326	193331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_002946	TGC	2	6	193391	193396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800647
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