MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 47754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002946	TGG	2	6	221428	221433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800670
5002	NC_002946	AGG	2	6	221451	221456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800670
5003	NC_002946	GAATA	2	10	221496	221505	60 %	20 %	20 %	0 %	59800670
5004	NC_002946	CGG	2	6	221509	221514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800670
5005	NC_002946	CTT	3	9	221527	221535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800670
5006	NC_002946	CTT	2	6	221629	221634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800670
5007	NC_002946	GGC	2	6	221678	221683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800670
5008	NC_002946	ATGA	2	8	221745	221752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_002946	GTGTA	2	10	221782	221791	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_002946	CTT	2	6	221795	221800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_002946	T	6	6	221799	221804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_002946	ATT	2	6	221818	221823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_002946	T	6	6	221822	221827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_002946	TTA	2	6	221835	221840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_002946	TTGT	2	8	221854	221861	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_002946	T	6	6	221873	221878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_002946	GCG	2	6	221905	221910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_002946	GGC	2	6	221938	221943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_002946	TGT	2	6	222093	222098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_002946	TA	3	6	222120	222125	50 %	50 %	0 %	0 %	59800671
5021	NC_002946	GCC	2	6	222192	222197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800671
5022	NC_002946	T	7	7	222232	222238	0 %	100 %	0 %	0 %	59800671
5023	NC_002946	CGG	3	9	222259	222267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800671
5024	NC_002946	GCC	2	6	222299	222304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800671
5025	NC_002946	CCGC	2	8	222322	222329	0 %	0 %	25 %	75 %	59800671
5026	NC_002946	CGTC	2	8	222354	222361	0 %	25 %	25 %	50 %	59800671
5027	NC_002946	CAT	2	6	222416	222421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800671
5028	NC_002946	ATA	2	6	222459	222464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800671
5029	NC_002946	TTC	2	6	222496	222501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_002946	GCC	2	6	222575	222580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800672
5031	NC_002946	GC	3	6	222590	222595	0 %	0 %	50 %	50 %	59800672
5032	NC_002946	CGT	2	6	222631	222636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800672
5033	NC_002946	T	6	6	222761	222766	0 %	100 %	0 %	0 %	59800672
5034	NC_002946	CGGTGG	2	12	222787	222798	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	59800672
5035	NC_002946	CGG	2	6	222814	222819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800672
5036	NC_002946	CGC	2	6	222847	222852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800672
5037	NC_002946	CAT	2	6	222854	222859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800672
5038	NC_002946	CGG	2	6	222895	222900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800672
5039	NC_002946	TGT	2	6	222937	222942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800672
5040	NC_002946	TCA	2	6	222961	222966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800672
5041	NC_002946	ATG	2	6	223053	223058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800672
5042	NC_002946	TTC	2	6	223127	223132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800672
5043	NC_002946	GGC	2	6	223138	223143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800672
5044	NC_002946	GGC	3	9	223166	223174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800672
5045	NC_002946	CGAG	2	8	223213	223220	25 %	0 %	50 %	25 %	59800672
5046	NC_002946	CAA	2	6	223244	223249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800672
5047	NC_002946	CGG	2	6	223252	223257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800672
5048	NC_002946	GGC	2	6	223295	223300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800672
5049	NC_002946	AAT	2	6	223473	223478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800672
5050	NC_002946	TGCGGC	2	12	223564	223575	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	59800672
5051	NC_002946	GGC	2	6	223618	223623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800672
5052	NC_002946	TTC	2	6	223685	223690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800672
5053	NC_002946	GCGA	2	8	223773	223780	25 %	0 %	50 %	25 %	59800672
5054	NC_002946	GGC	2	6	223939	223944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800673
5055	NC_002946	TGC	2	6	224011	224016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800673
5056	NC_002946	AGC	2	6	224070	224075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800673
5057	NC_002946	CGCGC	2	10	224111	224120	0 %	0 %	40 %	60 %	59800673
5058	NC_002946	CGA	2	6	224260	224265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800673
5059	NC_002946	TTTG	2	8	224347	224354	0 %	75 %	25 %	0 %	59800673
5060	NC_002946	GC	3	6	224356	224361	0 %	0 %	50 %	50 %	59800673
5061	NC_002946	GTC	2	6	224381	224386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800673
5062	NC_002946	TCG	2	6	224409	224414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800673
5063	NC_002946	GGC	2	6	224420	224425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800673
5064	NC_002946	CGG	2	6	224495	224500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800673
5065	NC_002946	CAA	2	6	224522	224527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800673
5066	NC_002946	TGC	2	6	224593	224598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800673
5067	NC_002946	TTG	2	6	224601	224606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	59800673
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5069	NC_002946	CTT	2	6	224650	224655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800673
5070	NC_002946	CGA	2	6	224683	224688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800673
5071	NC_002946	GCA	2	6	224692	224697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800673
5072	NC_002946	TTTC	2	8	224698	224705	0 %	75 %	0 %	25 %	59800673
5073	NC_002946	TGG	2	6	224716	224721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800673
5074	NC_002946	T	7	7	224765	224771	0 %	100 %	0 %	0 %	59800673
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5082	NC_002946	TGC	2	6	225124	225129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800674
5083	NC_002946	GC	3	6	225157	225162	0 %	0 %	50 %	50 %	59800674
5084	NC_002946	GCG	2	6	225171	225176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800674
5085	NC_002946	GTC	2	6	225191	225196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800674
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5090	NC_002946	GC	3	6	225494	225499	0 %	0 %	50 %	50 %	59800675
5091	NC_002946	AGGA	2	8	225511	225518	50 %	0 %	50 %	0 %	59800675
5092	NC_002946	TGC	2	6	225536	225541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800675
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5094	NC_002946	CAG	2	6	225549	225554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800675
5095	NC_002946	GCA	2	6	225575	225580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800675
5096	NC_002946	ACA	2	6	225608	225613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	59800675
5097	NC_002946	CGG	2	6	225625	225630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800675
5098	NC_002946	TCGG	2	8	225641	225648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_002946	GCG	2	6	225717	225722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_002946	TGTT	2	8	225750	225757	0 %	75 %	25 %	0 %	59800676
5101	NC_002946	TGA	2	6	225778	225783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800676
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5104	NC_002946	T	6	6	225836	225841	0 %	100 %	0 %	0 %	59800676
5105	NC_002946	TTTG	2	8	225874	225881	0 %	75 %	25 %	0 %	59800676
5106	NC_002946	GTC	2	6	225935	225940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800676
5107	NC_002946	GTC	2	6	225962	225967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800676
5108	NC_002946	CGT	2	6	225976	225981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800676
5109	NC_002946	CGA	2	6	225982	225987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800676
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5111	NC_002946	CG	3	6	226006	226011	0 %	0 %	50 %	50 %	59800676
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5113	NC_002946	GCG	2	6	226158	226163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800676
5114	NC_002946	TGC	2	6	226192	226197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800676
5115	NC_002946	CGG	2	6	226198	226203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800676
5116	NC_002946	GAC	2	6	226214	226219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800676
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5120	NC_002946	CCG	2	6	226446	226451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800677
5121	NC_002946	CTT	2	6	226452	226457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800677
5122	NC_002946	GAC	2	6	226501	226506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800677
5123	NC_002946	CG	3	6	226515	226520	0 %	0 %	50 %	50 %	59800677
5124	NC_002946	GCC	2	6	226578	226583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800677
5125	NC_002946	GTG	2	6	226585	226590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800677
5126	NC_002946	TCC	2	6	226637	226642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	59800677
5127	NC_002946	TTC	2	6	226657	226662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800677
5128	NC_002946	TGCG	2	8	226745	226752	0 %	25 %	50 %	25 %	59800677
5129	NC_002946	GCC	2	6	226768	226773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800677
5130	NC_002946	GAC	2	6	226789	226794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800677
5131	NC_002946	CGG	2	6	226841	226846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_002946	CGC	2	6	226879	226884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_002946	T	6	6	226915	226920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_002946	T	6	6	227154	227159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_002946	CCGT	2	8	227161	227168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5136	NC_002946	ATG	2	6	227175	227180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5138	NC_002946	CGA	2	6	227277	227282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5140	NC_002946	ATGC	2	8	227443	227450	25 %	25 %	25 %	25 %	59800678
5141	NC_002946	ACC	2	6	227528	227533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	59800678
5142	NC_002946	GCA	2	6	227540	227545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800678
5143	NC_002946	G	6	6	227546	227551	0 %	0 %	100 %	0 %	59800678
5144	NC_002946	TGA	2	6	227615	227620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800678
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5188	NC_002946	AG	3	6	229806	229811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5189	NC_002946	TAG	2	6	229826	229831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5190	NC_002946	AT	3	6	229849	229854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5191	NC_002946	AC	3	6	229872	229877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5192	NC_002946	TTA	2	6	229914	229919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5193	NC_002946	A	7	7	229972	229978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5194	NC_002946	GAA	2	6	230000	230005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5195	NC_002946	TA	5	10	230056	230065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5196	NC_002946	AT	3	6	230074	230079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5197	NC_002946	A	7	7	230092	230098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5198	NC_002946	TC	3	6	230100	230105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5199	NC_002946	GAT	2	6	230108	230113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5200	NC_002946	TTA	2	6	230116	230121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5201	NC_002946	T	6	6	230146	230151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5202	NC_002946	TTATGT	2	12	230170	230181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5203	NC_002946	GAG	2	6	230261	230266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	59800680
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5205	NC_002946	CAT	3	9	230347	230355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800680
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5208	NC_002946	TA	3	6	230501	230506	50 %	50 %	0 %	0 %	59800681
5209	NC_002946	CAAT	2	8	230515	230522	50 %	25 %	0 %	25 %	59800681
5210	NC_002946	A	6	6	230548	230553	100 %	0 %	0 %	0 %	59800681
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5213	NC_002946	TGAT	2	8	230629	230636	25 %	50 %	25 %	0 %	59800681
5214	NC_002946	A	6	6	230669	230674	100 %	0 %	0 %	0 %	59800681
5215	NC_002946	T	6	6	230702	230707	0 %	100 %	0 %	0 %	59800681
5216	NC_002946	TCC	2	6	230729	230734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	59800681
5217	NC_002946	TTTC	2	8	230801	230808	0 %	75 %	0 %	25 %	59800681
5218	NC_002946	CAT	3	9	230954	230962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5219	NC_002946	AGGA	2	8	230971	230978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5220	NC_002946	CAT	2	6	231002	231007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5221	NC_002946	TGA	2	6	231081	231086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800682
5222	NC_002946	TC	3	6	231113	231118	0 %	50 %	0 %	50 %	59800682
5223	NC_002946	A	8	8	231286	231293	100 %	0 %	0 %	0 %	59800682
5224	NC_002946	CTT	2	6	231312	231317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800682
5225	NC_002946	A	7	7	231375	231381	100 %	0 %	0 %	0 %	59800682
5226	NC_002946	CTT	2	6	231436	231441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800682
5227	NC_002946	TTC	2	6	231488	231493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800683
5228	NC_002946	CGG	2	6	231603	231608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800683
5229	NC_002946	CGG	2	6	231657	231662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800683
5230	NC_002946	GGT	2	6	231670	231675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	59800683
5231	NC_002946	CAG	2	6	231697	231702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800683
5232	NC_002946	GAC	2	6	231715	231720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800683
5233	NC_002946	AGATGA	2	12	231732	231743	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	59800683
5234	NC_002946	GCA	3	9	231819	231827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800683
5235	NC_002946	CAT	2	6	231829	231834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800683
5236	NC_002946	GCC	3	9	231883	231891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800683
5237	NC_002946	TGC	2	6	232089	232094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	59800683
5238	NC_002946	AGC	4	12	232100	232111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800683
5239	NC_002946	TTC	2	6	232123	232128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800683
5240	NC_002946	GCG	2	6	232166	232171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800683
5241	NC_002946	TGGC	2	8	232175	232182	0 %	25 %	50 %	25 %	59800683
5242	NC_002946	GCC	2	6	232192	232197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800683
5243	NC_002946	GAT	2	6	232213	232218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	59800683
5244	NC_002946	G	6	6	232233	232238	0 %	0 %	100 %	0 %	59800683
5245	NC_002946	TAA	2	6	232244	232249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	59800683
5246	NC_002946	GTGG	2	8	232264	232271	0 %	25 %	75 %	0 %	59800683
5247	NC_002946	AACC	2	8	232319	232326	50 %	0 %	0 %	50 %	59800683
5248	NC_002946	GCAG	2	8	232341	232348	25 %	0 %	50 %	25 %	59800683
5249	NC_002946	T	6	6	232390	232395	0 %	100 %	0 %	0 %	59800683
5250	NC_002946	GCG	2	6	232413	232418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	59800683
5251	NC_002946	CTTT	2	8	232427	232434	0 %	75 %	0 %	25 %	59800683
5252	NC_002946	GCC	2	6	232471	232476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800683
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5380	NC_002946	CCG	2	6	237482	237487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	59800688
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5384	NC_002946	CTT	2	6	237692	237697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	59800688
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5488	NC_002946	CCGC	2	8	243045	243052	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5489	NC_002946	ATG	2	6	243176	243181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5492	NC_002946	TGGCGT	2	12	243343	243354	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	59800693
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5495	NC_002946	GC	3	6	243487	243492	0 %	0 %	50 %	50 %	59800693
5496	NC_002946	A	6	6	243534	243539	100 %	0 %	0 %	0 %	59800693
5497	NC_002946	CGA	2	6	243572	243577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	59800693
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5499	NC_002946	CAT	2	6	243602	243607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	59800693
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