MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 1000

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021883	TAAA	2	8	30	37	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021883	AAAT	2	8	41	48	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021883	GGTT	2	8	2337	2344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021883	CTGC	2	8	3326	3333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021883	ATTT	2	8	3408	3415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021883	TACT	2	8	5075	5082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021883	TCTT	2	8	5237	5244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021883	TGGT	2	8	5262	5269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021883	ACTA	2	8	5313	5320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021883	TGGT	2	8	5855	5862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021883	ATTG	2	8	6106	6113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021883	TAAC	2	8	6237	6244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021883	TCAC	2	8	6253	6260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021883	GAAA	2	8	6427	6434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021883	ATTC	2	8	6450	6457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021883	GCTG	2	8	6565	6572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021883	TCCT	2	8	10407	10414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021883	AGAA	2	8	12090	12097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021883	AAGC	2	8	13838	13845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021883	TTAA	2	8	15004	15011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021883	ATTT	2	8	17714	17721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021883	GAGG	2	8	19951	19958	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021883	GGAG	2	8	19978	19985	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021883	GGAG	2	8	22739	22746	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021883	TTTC	2	8	32786	32793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021883	TAAA	2	8	32980	32987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021883	ATTT	2	8	44408	44415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021883	AAAC	2	8	44478	44485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021883	ATAA	2	8	51194	51201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021883	ACCC	2	8	55824	55831	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_021883	TTTA	2	8	55917	55924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021883	GGCA	2	8	64486	64493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021883	TTTG	2	8	67741	67748	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021883	AATT	2	8	68578	68585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021883	ATTA	2	8	68596	68603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021883	ATAA	2	8	68621	68628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021883	TTTG	2	8	68660	68667	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021883	CAAA	2	8	70250	70257	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021883	TTAT	2	8	75581	75588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021883	TGAA	2	8	76779	76786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021883	AGCA	2	8	81204	81211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021883	ATAA	2	8	81420	81427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021883	ATTT	2	8	84258	84265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021883	ATTT	2	8	88578	88585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021883	TTAG	2	8	88620	88627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021883	GTTC	2	8	89230	89237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021883	CAAA	2	8	89734	89741	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021883	AGCT	2	8	91321	91328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021883	ATCC	2	8	91570	91577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021883	TGTC	2	8	92295	92302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021883	TAAT	2	8	92403	92410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021883	TTTA	2	8	96451	96458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021883	CCTT	2	8	99578	99585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021883	ATTT	2	8	99643	99650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021883	GAAA	2	8	99735	99742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021883	GCTC	2	8	103907	103914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021883	AGAT	2	8	106430	106437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021883	GCCC	2	8	108468	108475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_021883	GGGC	2	8	108494	108501	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021883	CTTT	2	8	110269	110276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021883	TTTG	2	8	112386	112393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021883	TAAA	2	8	113301	113308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021883	TTAG	2	8	116905	116912	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021883	AACC	2	8	122291	122298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021883	TTAA	2	8	123185	123192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021883	TATT	2	8	123231	123238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021883	TCGC	2	8	124648	124655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021883	TTAG	2	8	131477	131484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021883	GATT	2	8	138613	138620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021883	AAAC	2	8	138943	138950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021883	ATTA	2	8	142108	142115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021883	CGCT	2	8	142273	142280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021883	ATTT	2	8	144981	144988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021883	ATTT	2	8	150928	150935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021883	TCAT	2	8	158113	158120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021883	CGTC	2	8	162432	162439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021883	ATCT	2	8	170321	170328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021883	GTAC	2	8	170342	170349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021883	TGAA	2	8	174969	174976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021883	ATCA	2	8	180689	180696	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021883	TAAA	2	8	180745	180752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021883	GTAG	2	8	182038	182045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021883	TAAA	2	8	183743	183750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021883	TCAA	2	8	188316	188323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021883	TAAA	2	8	188383	188390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021883	ATTA	2	8	188436	188443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021883	CTTT	2	8	188763	188770	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021883	GTTA	2	8	191459	191466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021883	CTTA	2	8	191542	191549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021883	GAAA	2	8	198112	198119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021883	CTAT	2	8	205763	205770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021883	TTGT	2	8	205833	205840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021883	ATTT	2	8	212383	212390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021883	ACCG	2	8	218177	218184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021883	CGGT	2	8	222205	222212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021883	ATTT	2	8	222239	222246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021883	CATA	2	8	224539	224546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021883	CTTT	2	8	230929	230936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021883	TAAA	2	8	235345	235352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021883	TTTC	2	8	236851	236858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021883	GAGG	2	8	237306	237313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021883	TTTA	2	8	239766	239773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021883	ATTG	2	8	240632	240639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021883	TTAG	2	8	241867	241874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021883	AAAT	2	8	243300	243307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021883	AAAT	2	8	243320	243327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021883	CTAT	2	8	252775	252782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021883	CTTA	2	8	253472	253479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021883	AATC	2	8	257766	257773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021883	GACA	2	8	258838	258845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021883	TGTT	2	8	259132	259139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021883	CAGT	2	8	260452	260459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021883	TGAT	2	8	268607	268614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021883	TCTA	2	8	268714	268721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021883	TGTT	2	8	279393	279400	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021883	ACCG	2	8	283064	283071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021883	ATAG	2	8	286034	286041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021883	TAAC	2	8	286144	286151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021883	AATA	2	8	287623	287630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021883	CCTA	2	8	293731	293738	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021883	AATC	2	8	298536	298543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021883	AAAC	2	8	298611	298618	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021883	TTAC	2	8	305325	305332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021883	TTAG	2	8	307319	307326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021883	GGCA	2	8	307386	307393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021883	ATTT	2	8	312028	312035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021883	GCTT	2	8	312895	312902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021883	TTGA	2	8	317729	317736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021883	ATTT	2	8	321174	321181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021883	TTAA	2	8	321658	321665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021883	CTTT	2	8	322335	322342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021883	AGTA	2	8	328153	328160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021883	TGAT	2	8	329889	329896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021883	TTAT	2	8	334422	334429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021883	GACA	2	8	338868	338875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021883	AGTT	2	8	341175	341182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021883	GAGC	2	8	345578	345585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021883	TTGT	2	8	347175	347182	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021883	TAAG	2	8	349746	349753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021883	GTAG	2	8	361433	361440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021883	TGCC	2	8	361453	361460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021883	CTAT	2	8	363793	363800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021883	TAAT	2	8	363893	363900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021883	CAAA	2	8	367359	367366	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021883	ACTA	2	8	368950	368957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021883	ATAA	2	8	376786	376793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021883	AGCA	2	8	390769	390776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021883	AAAG	2	8	393533	393540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021883	ATAA	2	8	393977	393984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021883	GCCA	2	8	394423	394430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021883	TGCG	2	8	397515	397522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_021883	AATG	2	8	412442	412449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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