MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7422

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021831	TAATTT	2	12	7974	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021831	AAGAAA	2	12	32636	32647	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021831	AAAATT	2	12	60282	60293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021831	TTTTAA	2	12	112962	112973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021831	TAAATT	2	12	114624	114635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021831	TCATAA	2	12	120262	120273	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021831	ATTTTT	2	12	120773	120784	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021831	TAATTT	2	12	123299	123310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021831	TATAAT	2	12	136346	136357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021831	AGAACT	2	12	141547	141558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021831	AGTAAA	2	12	149289	149300	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021831	GTTTTT	2	12	151171	151182	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021831	TAAAAA	2	12	162082	162093	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021831	GCAATT	2	12	163302	163313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021831	AGGCAA	2	12	163454	163465	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021831	TTTAAA	2	12	171910	171921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021831	TTTAAA	2	12	172153	172164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021831	TTTAAT	2	12	173555	173566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021831	TAAAAA	2	12	180198	180209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021831	TATAAT	2	12	180239	180250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021831	AGATCA	2	12	180524	180535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021831	AAAAAC	2	12	182455	182466	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021831	AGATCA	2	12	182891	182902	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021831	TAATTT	3	18	185918	185935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021831	ATTTTT	2	12	196608	196619	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021831	ATTATA	2	12	208260	208271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021831	TTATTT	2	12	208273	208284	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021831	ATTTAA	2	12	213690	213701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021831	TATTTG	2	12	213863	213874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021831	TTAATT	2	12	240760	240771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021831	AAATTA	2	12	246983	246994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021831	TTTAAT	2	12	250732	250743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021831	TAAAAA	2	12	261878	261889	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021831	ATTTTT	2	12	261908	261919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021831	ATTTTT	2	12	262032	262043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021831	TAAATA	2	12	262196	262207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021831	AAATAA	2	12	281978	281989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021831	TTTATA	2	12	281991	282002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021831	TTTAAT	2	12	296695	296706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021831	TTTTAA	2	12	300146	300157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021831	TTAAGT	2	12	317150	317161	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021831	TTATAA	2	12	322795	322806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021831	TTATAA	2	12	337194	337205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021831	AACTTC	2	12	337906	337917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021831	TATTTT	2	12	341471	341482	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021831	TTTATT	2	12	344904	344915	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021831	ATGAAA	2	12	347972	347983	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021831	AATTTT	2	12	359037	359048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021831	AATTTA	2	12	360536	360547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021831	AGAATT	2	12	360918	360929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021831	ATTTAA	2	12	365930	365941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021831	TTGATT	2	12	366088	366099	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021831	ATTTTT	2	12	373994	374005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021831	ATAAAA	2	12	381523	381534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021831	TTTTGT	2	12	408534	408545	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021831	TTTCAT	2	12	418671	418682	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021831	TTATAA	2	12	425845	425856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021831	TCAAGA	2	12	429725	429736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021831	TATAAA	2	12	435210	435221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021831	AATAAG	2	12	435669	435680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021831	TTAATT	2	12	441252	441263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021831	AAATTT	2	12	443041	443052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021831	CAAAAC	2	12	443229	443240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021831	TATAAT	2	12	447018	447029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021831	TTAATC	2	12	462231	462242	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021831	GGTTTT	2	12	463198	463209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021831	TTTTTG	2	12	474691	474702	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021831	TAATAT	3	18	482949	482966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021831	ATAAAA	2	12	486106	486117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021831	AAATTT	2	12	496598	496609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021831	TATTTT	2	12	500917	500928	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021831	AAGATT	2	12	503353	503364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021831	AATTTA	2	12	515077	515088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021831	AAAAAT	2	12	515279	515290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021831	ATTTTT	2	12	515478	515489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021831	TAAAAA	2	12	515524	515535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021831	ATTTAA	2	12	523912	523923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021831	TTTTAA	2	12	526084	526095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021831	TTATAT	2	12	536743	536754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021831	TCAAAT	2	12	539566	539577	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021831	GTCTTG	2	12	555963	555974	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021831	GATTTT	2	12	558445	558456	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021831	CAAAAA	2	12	560431	560442	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021831	ATTTTT	2	12	602875	602886	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021831	AAATAA	2	12	637814	637825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021831	TGAATT	2	12	643190	643201	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021831	TATTTT	2	12	656599	656610	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021831	TAAAAA	2	12	665828	665839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021831	ATTTTT	2	12	666200	666211	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021831	ATTTTT	2	12	698195	698206	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021831	ATATTT	2	12	699044	699055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021831	TATTTT	2	12	732698	732709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021831	TTTTGG	2	12	735148	735159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021831	TTTTTA	2	12	742787	742798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021831	TTAAAA	2	12	747886	747897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021831	TTGAAT	2	12	755050	755061	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021831	AAATAA	2	12	760355	760366	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021831	TTTAGG	2	12	790581	790592	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021831	GAAAAA	2	12	791788	791799	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021831	TATAAT	2	12	816034	816045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021831	ATTTAT	2	12	816187	816198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021831	ATTACA	2	12	822928	822939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021831	ATTTTT	2	12	836649	836660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021831	TTATAA	2	12	836672	836683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021831	TTATAA	2	12	838160	838171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021831	TTAAAA	2	12	848786	848797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021831	TTATAA	2	12	858744	858755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021831	TATTAG	2	12	878801	878812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021831	AGAATA	2	12	882061	882072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.