MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7422

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021831	TAAA	2	8	106	113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021831	TAAA	2	8	1697	1704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021831	AATT	2	8	5152	5159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021831	TTTA	2	8	9177	9184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021831	TTTA	2	8	17031	17038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021831	ATTT	2	8	17043	17050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021831	ATAA	8	32	17080	17111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021831	ATTA	2	8	18733	18740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021831	ACCA	2	8	18753	18760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021831	GGTT	2	8	20695	20702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021831	AGTT	2	8	20850	20857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021831	GTTT	2	8	23515	23522	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021831	GGTT	2	8	28799	28806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021831	TCAA	2	8	29016	29023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021831	CCTT	2	8	29073	29080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021831	TCAA	2	8	31454	31461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021831	CCTT	2	8	31511	31518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021831	AGTT	2	8	31612	31619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021831	AATT	2	8	31638	31645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021831	TTTG	2	8	32505	32512	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021831	ATTA	2	8	32762	32769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021831	AAAT	2	8	32848	32855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021831	TTAT	2	8	33413	33420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021831	TAAG	2	8	36457	36464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021831	ATTT	2	8	36530	36537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021831	AGTA	2	8	46228	46235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021831	AATA	2	8	66243	66250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021831	CATA	2	8	77819	77826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021831	AAAT	2	8	87210	87217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021831	CTTT	2	8	87660	87667	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021831	ATCA	2	8	89671	89678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021831	CAAA	2	8	91988	91995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021831	AAAT	2	8	92279	92286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021831	TATT	2	8	96326	96333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021831	AATT	2	8	96565	96572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021831	AATT	2	8	101329	101336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021831	ATTT	2	8	102959	102966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021831	ATAA	2	8	110318	110325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021831	ATTT	2	8	110441	110448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021831	CTAC	2	8	110597	110604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021831	TTTA	2	8	113594	113601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021831	ATTT	2	8	114812	114819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021831	TTTA	2	8	114827	114834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021831	TAAA	2	8	120200	120207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021831	AAAG	2	8	120322	120329	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021831	AAAT	2	8	123327	123334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021831	TTAA	2	8	123337	123344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021831	GTTT	2	8	124007	124014	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021831	ATTA	2	8	124061	124068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021831	CATC	2	8	124221	124228	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021831	TTAA	2	8	124334	124341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021831	CTAA	2	8	135526	135533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021831	TTAA	2	8	135925	135932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021831	TTTA	2	8	136531	136538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021831	AAAC	2	8	136654	136661	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021831	TGAT	2	8	136711	136718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021831	AATT	2	8	141459	141466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021831	ACTT	2	8	160756	160763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021831	TAAT	2	8	160766	160773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021831	ATTA	2	8	160774	160781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021831	TTTA	2	8	162580	162587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021831	TAAA	2	8	163552	163559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021831	ACAA	2	8	169788	169795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021831	ATTA	2	8	171847	171854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021831	ATTT	2	8	173547	173554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021831	TATG	2	8	173567	173574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021831	TAAT	2	8	174982	174989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021831	TTAA	2	8	177143	177150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021831	ATAA	2	8	177202	177209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021831	TTAT	2	8	179661	179668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021831	ATGT	2	8	179989	179996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021831	TTAA	2	8	180043	180050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021831	AACA	2	8	180121	180128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021831	TAAT	2	8	180170	180177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021831	GTTT	2	8	180446	180453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021831	AGTA	2	8	182064	182071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021831	GTTT	2	8	182813	182820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021831	ATTA	2	8	183209	183216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021831	TAAA	2	8	184258	184265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021831	CTTT	2	8	184972	184979	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021831	TTTG	2	8	185956	185963	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021831	ATTA	2	8	187575	187582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021831	CTTT	2	8	189865	189872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021831	TTAG	2	8	191376	191383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021831	TAAT	2	8	191423	191430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021831	TAAT	2	8	192490	192497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021831	TTAA	2	8	195411	195418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021831	ATTA	2	8	204788	204795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021831	ATTA	2	8	210303	210310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021831	ATTA	2	8	212625	212632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021831	AAAT	2	8	212790	212797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021831	TAAT	2	8	213747	213754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021831	TTTA	2	8	213968	213975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021831	TAAA	2	8	214045	214052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021831	TTAA	2	8	214099	214106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021831	TAAT	2	8	216217	216224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021831	TGAA	2	8	219660	219667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021831	ATTA	2	8	220340	220347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021831	AAAT	2	8	222901	222908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021831	ATTT	2	8	223015	223022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021831	ATTT	2	8	226610	226617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021831	ATTT	2	8	236078	236085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021831	ATTT	2	8	239804	239811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021831	AAAT	2	8	240637	240644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021831	TAAA	2	8	240780	240787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021831	ATTT	2	8	240874	240881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021831	ATTT	2	8	260627	260634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021831	AAGA	2	8	260662	260669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021831	TTAA	2	8	260698	260705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021831	GCAA	2	8	261966	261973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021831	ATTT	2	8	270925	270932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021831	AACT	2	8	276667	276674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021831	TAAA	2	8	276768	276775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021831	AAAT	2	8	276845	276852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021831	ATTT	2	8	276859	276866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021831	ATAA	2	8	276983	276990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021831	AATT	2	8	277077	277084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021831	TAAA	2	8	277109	277116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021831	TTAA	2	8	277312	277319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021831	AAAT	3	12	277438	277449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021831	TTTA	2	8	277596	277603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021831	ATAA	2	8	281551	281558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021831	TAAT	2	8	281572	281579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021831	GGAA	2	8	300387	300394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021831	CTAA	2	8	300445	300452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021831	TGAA	2	8	317290	317297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021831	ATAA	2	8	319969	319976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021831	ATTT	8	32	320006	320037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021831	TTTA	2	8	322758	322765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021831	AATT	2	8	322817	322824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021831	TTAT	2	8	322825	322832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021831	ATTT	2	8	322839	322846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021831	ATTT	2	8	325043	325050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021831	GATA	2	8	337892	337899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021831	AATA	2	8	337934	337941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021831	TTAA	2	8	344629	344636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021831	TTAT	2	8	347984	347991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021831	AATT	3	12	348206	348217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021831	AAAT	2	8	352328	352335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021831	TATT	2	8	352518	352525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021831	ATTA	2	8	352565	352572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021831	AATT	2	8	359854	359861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021831	AGGC	2	8	359901	359908	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021831	AAAG	2	8	360661	360668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021831	TTTA	2	8	360807	360814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021831	CAAA	2	8	361828	361835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021831	ATTT	2	8	361848	361855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021831	ACAA	2	8	365793	365800	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021831	TAAA	2	8	365992	365999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021831	TATT	2	8	366180	366187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021831	ATTT	2	8	366227	366234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021831	TAAT	2	8	370328	370335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021831	ATTA	2	8	371483	371490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.