MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021739	CAAATA	2	12	16590	16601	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021739	TCGATT	2	12	55530	55541	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021739	TGTGAT	2	12	97348	97359	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021739	TGCCTA	2	12	98784	98795	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021739	TAAAAC	2	12	131147	131158	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021739	AACAAA	2	12	161418	161429	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021739	ATACCA	2	12	162655	162666	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021739	CTATCT	2	12	165569	165580	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021739	AGCACA	2	12	165875	165886	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021739	TGATAG	2	12	173598	173609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021739	GATTTT	2	12	196777	196788	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021739	GTATAT	2	12	203540	203551	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021739	TTGTAA	2	12	216763	216774	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021739	CCCCTT	2	12	223931	223942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021739	TAAAAA	2	12	241074	241085	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021739	AAAAAT	2	12	243671	243682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021739	ATTTTT	2	12	243714	243725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021739	TTAATA	2	12	266322	266333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021739	ACTTTT	2	12	372527	372538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021739	GACAGA	2	12	385345	385356	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021739	ATTTTT	2	12	403062	403073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021739	AGATTA	2	12	410553	410564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021739	ATTTTT	2	12	435959	435970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021739	TGTGCT	2	12	456349	456360	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021739	ATATTA	2	12	456899	456910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021739	ATCTTG	2	12	459745	459756	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021739	GTTTTA	2	12	490992	491003	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021739	CTTTAA	2	12	531881	531892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021739	AAAAGT	2	12	591276	591287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021739	TGTGCT	2	12	602426	602437	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021739	ATATTA	2	12	602972	602983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021739	ATCTTG	2	12	605815	605826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021739	TGCACT	2	12	624210	624221	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021739	AAATCA	2	12	630029	630040	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021739	ATTGTT	2	12	632641	632652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021739	AAAAAT	2	12	684413	684424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021739	TCTGTT	2	12	690567	690578	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021739	TAAAGA	2	12	707412	707423	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021739	TCTTTA	2	12	708536	708547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021739	AAAATA	2	12	711916	711927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021739	AAAACA	2	12	711987	711998	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021739	ATGGAA	2	12	718441	718452	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021739	AAATTT	2	12	765022	765033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021739	TGAGAG	2	12	772160	772171	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021739	TTTTGC	2	12	835142	835153	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021739	ATTTCA	2	12	836363	836374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021739	GCCTTC	2	12	839677	839688	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021739	AATTAA	2	12	840466	840477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021739	TCTATT	2	12	885583	885594	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021739	TTTTAT	2	12	889499	889510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021739	ATATTC	2	12	905238	905249	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021739	AAAATT	2	12	909127	909138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021739	TTTTCG	2	12	917176	917187	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021739	AGCCAT	3	18	939028	939045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021739	TTTTAT	2	12	961771	961782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021739	GATAAA	2	12	1037787	1037798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021739	AGTTTA	2	12	1084728	1084739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021739	AATGAA	2	12	1101306	1101317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021739	AGTGAC	2	12	1114590	1114601	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021739	CTGTAT	2	12	1158733	1158744	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021739	TAAACT	2	12	1174342	1174353	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021739	CACCCA	2	12	1199707	1199718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021739	CTTGAA	2	12	1205158	1205169	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021739	TGCTTT	2	12	1245674	1245685	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021739	AAGAGC	2	12	1245742	1245753	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021739	TATAGG	2	12	1250439	1250450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021739	TATAAA	2	12	1277359	1277370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021739	ATTTTA	2	12	1281099	1281110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021739	GTTTTT	2	12	1292718	1292729	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021739	TATTTT	2	12	1295587	1295598	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021739	TTGAAA	2	12	1295670	1295681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021739	TTTTGC	2	12	1310794	1310805	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021739	ATTTCA	2	12	1312015	1312026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021739	GCCTTC	2	12	1315448	1315459	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021739	AATTAA	2	12	1316237	1316248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021739	AAGCTC	2	12	1320248	1320259	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021739	GTGATG	2	12	1337992	1338003	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021739	TTTCGT	2	12	1340434	1340445	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021739	TTTTGC	2	12	1341556	1341567	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021739	ATTTCA	2	12	1342777	1342788	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021739	GCCTTC	2	12	1346207	1346218	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021739	AATTAA	2	12	1346996	1347007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021739	GCTTTC	2	12	1355363	1355374	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021739	TTCAAC	2	12	1378258	1378269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021739	GTTTTT	2	12	1385125	1385136	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021739	CCCCTT	2	12	1390303	1390314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_021739	ACTTTA	2	12	1404015	1404026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021739	CTATAA	2	12	1415071	1415082	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021739	CGTTGC	2	12	1424504	1424515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021739	ATTTCA	2	12	1450128	1450139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021739	GCCTTC	2	12	1453558	1453569	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021739	AATTAA	2	12	1454347	1454358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021739	AAAAAC	2	12	1454557	1454568	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021739	CTCTTT	2	12	1491212	1491223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021739	TTTTGC	2	12	1508039	1508050	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021739	ATTTCA	2	12	1509290	1509301	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021739	GCCTTC	2	12	1512720	1512731	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021739	AATTAA	2	12	1513509	1513520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021739	AAAAAG	2	12	1516729	1516740	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021739	TTTAAA	2	12	1516776	1516787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021739	CTATTC	2	12	1521510	1521521	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021739	CAAAAA	2	12	1551295	1551306	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_021739	CGAAAA	2	12	1556311	1556322	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021739	ATAATT	2	12	1602812	1602823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021739	ATTTAA	2	12	1636132	1636143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021739	TGATTT	2	12	1674793	1674804	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021739	GTTTTT	2	12	1748878	1748889	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021739	TTAAAC	2	12	1770453	1770464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021739	TTTTAT	2	12	1805434	1805445	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021739	GCTTTT	2	12	1811730	1811741	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021739	TAAGGC	2	12	1834435	1834446	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021739	AAAAAT	2	12	1840072	1840083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021739	TTAAAA	2	12	1852681	1852692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021739	TGAAAG	2	12	1896866	1896877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021739	TAAAAA	2	12	1900150	1900161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021739	CTATTG	2	12	1929302	1929313	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021739	AATATT	2	12	1946244	1946255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021739	TATTTA	2	12	1955770	1955781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021739	AATTTG	2	12	1976446	1976457	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021739	ATACAA	2	12	1978648	1978659	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021739	CAAATA	2	12	2015381	2015392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021739	AATTGA	2	12	2063296	2063307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021739	TAATGA	2	12	2063396	2063407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021739	TTAATT	2	12	2073279	2073290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021739	CGAAGG	2	12	2074067	2074078	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021739	AAGCGA	2	12	2075051	2075062	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021739	TGAAAT	2	12	2077498	2077509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021739	AAGCAA	2	12	2078717	2078728	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_021739	GGTAAA	2	12	2078807	2078818	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021739	TGAGAA	2	12	2115003	2115014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021739	CACCAA	2	12	2128340	2128351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021739	AGCATT	2	12	2194910	2194921	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_021739	TAAGGG	2	12	2196323	2196334	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021739	AAATGA	2	12	2198435	2198446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021739	TAGAAA	2	12	2242469	2242480	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021739	TTTTTA	2	12	2303666	2303677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021739	TCAAAG	2	12	2320515	2320526	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_021739	TCCCTC	2	12	2401755	2401766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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140	NC_021739	AAACAT	2	12	2435239	2435250	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_021739	GGCAAA	2	12	2463957	2463968	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_021739	ATTGAA	2	12	2472876	2472887	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021739	ACTGAA	2	12	2526847	2526858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_021739	GATATA	2	12	2529739	2529750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_021739	TTTGTG	2	12	2597345	2597356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021739	TTACGC	2	12	2609824	2609835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021739	GCGTTT	2	12	2653384	2653395	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.