MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 1243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021738	ATAA	2	8	649	656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021738	GCGG	2	8	1088	1095	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021738	AATG	2	8	1108	1115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021738	ATAA	2	8	1411	1418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021738	TTGC	2	8	1531	1538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021738	AATT	2	8	1895	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021738	TTGG	2	8	2067	2074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021738	AGCA	2	8	7358	7365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021738	AATC	2	8	7472	7479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021738	GACA	2	8	8544	8551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021738	TGCC	2	8	8795	8802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021738	CGGA	2	8	10709	10716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021738	ATTA	2	8	11032	11039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021738	CTAT	2	8	27560	27567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021738	CAAA	3	12	27781	27792	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021738	TTAT	2	8	27809	27816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021738	TGAT	2	8	32725	32732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021738	TTAT	2	8	35368	35375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021738	TGTT	2	8	38354	38361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021738	ATTA	2	8	39197	39204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021738	AATT	2	8	39277	39284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021738	CAAG	2	8	39931	39938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021738	TTTC	2	8	43656	43663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021738	GTTT	2	8	48984	48991	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021738	AAAT	2	8	51369	51376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021738	AAAT	2	8	51389	51396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021738	ATTA	2	8	54149	54156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021738	TTAA	2	8	57955	57962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021738	AAAT	2	8	67975	67982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021738	TGAT	2	8	69259	69266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021738	GTTG	2	8	70211	70218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021738	TATC	2	8	70447	70454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021738	CATA	2	8	75453	75460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021738	TCAC	2	8	75481	75488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021738	TGAG	2	8	75552	75559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021738	AAAG	2	8	76469	76476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021738	ATTA	2	8	76586	76593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021738	TTAA	2	8	77486	77493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021738	AATG	2	8	77841	77848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021738	TAAA	2	8	77864	77871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021738	CGAT	2	8	80003	80010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021738	CAAT	3	12	88180	88191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021738	GAAA	2	8	90203	90210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021738	GATA	2	8	93198	93205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021738	GGTC	2	8	93964	93971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021738	ATCT	2	8	98010	98017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021738	TTGC	2	8	98032	98039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021738	TTTA	2	8	99879	99886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021738	ATTT	2	8	100018	100025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021738	AATT	2	8	100555	100562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021738	ATAC	2	8	100650	100657	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021738	TCAG	2	8	101199	101206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021738	AAAC	2	8	101395	101402	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021738	ATGA	2	8	101671	101678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021738	CAAC	2	8	101902	101909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021738	GAAT	2	8	102543	102550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021738	AATA	2	8	102769	102776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021738	TTTG	2	8	106711	106718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021738	TGAA	2	8	106885	106892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021738	TGAA	2	8	109817	109824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021738	GGCA	2	8	112185	112192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021738	ATAA	2	8	117266	117273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021738	GCTT	2	8	120905	120912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021738	TATT	2	8	121289	121296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021738	GCTT	2	8	121402	121409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021738	CGAG	2	8	124037	124044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021738	TTGT	2	8	127989	127996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021738	GCTT	2	8	133123	133130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021738	GATT	2	8	139656	139663	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021738	AAAC	2	8	140073	140080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021738	TAAA	2	8	146562	146569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021738	TTGT	2	8	150554	150561	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021738	CCCG	2	8	150578	150585	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_021738	TTTC	2	8	152877	152884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021738	GCTT	2	8	155889	155896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021738	TTAT	2	8	156196	156203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021738	GGGA	2	8	161941	161948	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021738	AAAG	2	8	164101	164108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021738	AAAT	2	8	165440	165447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021738	AAAG	2	8	165458	165465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021738	ATTT	2	8	170064	170071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021738	TAAA	2	8	171712	171719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021738	CATT	2	8	172231	172238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021738	ATTT	2	8	172450	172457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021738	TGAT	2	8	177307	177314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021738	CGTT	2	8	177326	177333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021738	TTAA	2	8	177382	177389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021738	TAAA	2	8	183513	183520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021738	AATG	2	8	190064	190071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021738	TAAA	2	8	190122	190129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021738	TAAA	2	8	190175	190182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021738	AAAT	2	8	190239	190246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021738	AATC	2	8	191916	191923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021738	GACA	2	8	192988	192995	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021738	AAAG	2	8	202168	202175	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021738	TTTA	2	8	202346	202353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021738	CTTT	2	8	202517	202524	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021738	CTTT	2	8	202530	202537	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021738	AAAG	2	8	202546	202553	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021738	ACAA	2	8	202600	202607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021738	AGTT	2	8	211078	211085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021738	GATT	2	8	212368	212375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021738	TTTC	2	8	225122	225129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021738	GCCT	2	8	242194	242201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021738	ATAA	2	8	243467	243474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021738	TATT	2	8	243669	243676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021738	CAAC	2	8	244059	244066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021738	ACTC	2	8	245745	245752	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021738	GATT	2	8	247055	247062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021738	CTTC	2	8	248709	248716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021738	TAAG	2	8	250256	250263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021738	AATT	2	8	250318	250325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021738	CTTA	2	8	250388	250395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021738	AAAT	2	8	252315	252322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021738	TAAC	2	8	257728	257735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021738	CGGT	2	8	260375	260382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021738	ATAG	2	8	268454	268461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021738	GTTT	2	8	275615	275622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021738	GTCT	2	8	275808	275815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021738	TTCT	2	8	279228	279235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021738	AATT	2	8	281057	281064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021738	CATC	2	8	282860	282867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021738	CTAA	2	8	285212	285219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021738	TTTA	2	8	290625	290632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021738	GAAA	2	8	290787	290794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021738	CATT	2	8	291338	291345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_021738	AATC	2	8	295587	295594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021738	GATT	2	8	296060	296067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021738	AATC	2	8	296075	296082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021738	AATA	2	8	300606	300613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021738	ACTC	2	8	303848	303855	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021738	GCTG	2	8	308189	308196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021738	AAAT	2	8	308407	308414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021738	ATAA	2	8	308586	308593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021738	TTTC	2	8	308610	308617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021738	TGCC	2	8	308689	308696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021738	ATTA	2	8	308846	308853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021738	ATTT	2	8	308870	308877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021738	AAAT	2	8	308890	308897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021738	TTTA	2	8	308997	309004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021738	GCGT	2	8	309557	309564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021738	GCTC	2	8	310330	310337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021738	GTGC	2	8	311019	311026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021738	CGGA	2	8	311267	311274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021738	TAAA	2	8	311286	311293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021738	GGCT	2	8	311497	311504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021738	TGGC	2	8	311617	311624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021738	CGAA	2	8	312927	312934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021738	GAAC	2	8	313128	313135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021738	ACGC	2	8	313176	313183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021738	ATCA	2	8	313542	313549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_021738	TATT	2	8	315869	315876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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