MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanomassiliicoccus sp. Mx1-Issoire

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021353	ATTTTT	2	12	218	229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021353	GTTTAC	2	12	19695	19706	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021353	ATTTTT	2	12	31259	31270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021353	TATTAC	2	12	41677	41688	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021353	TAAAAA	2	12	50432	50443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021353	TAGTAT	2	12	51704	51715	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021353	CCTCTG	2	12	63236	63247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021353	GTTTTG	2	12	64442	64453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021353	CAAAAA	2	12	71098	71109	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021353	CAAAAC	2	12	71123	71134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021353	ATCAAA	2	12	71588	71599	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021353	AAATCA	2	12	71627	71638	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021353	ATCAAA	2	12	71647	71658	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021353	TTCAAA	2	12	71660	71671	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021353	TCAAAA	2	12	71754	71765	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021353	TATGCG	2	12	85090	85101	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021353	CATTTT	2	12	88592	88603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021353	AATCAA	2	12	89500	89511	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021353	AATGTG	2	12	89838	89849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021353	AGTTTG	2	12	90633	90644	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021353	GTTTTG	2	12	91193	91204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021353	CAAAAA	2	12	96884	96895	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021353	CAAAAC	2	12	96908	96919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021353	AGAGAA	2	12	97049	97060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021353	AAACAA	2	12	97188	97199	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021353	TTTTGT	2	12	107143	107154	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021353	GTTTTG	2	12	107463	107474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021353	CAAAAA	2	12	114117	114128	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021353	CAAAAC	2	12	114141	114152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021353	AGAGAA	2	12	114318	114329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021353	TCAAAA	2	12	114856	114867	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021353	TGATTT	2	12	128684	128695	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021353	TTTGAT	2	12	128739	128750	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021353	TTTGAT	2	12	128866	128877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021353	TCTTAT	2	12	129129	129140	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021353	TTTTCT	2	12	129192	129203	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021353	GTTTTG	2	12	129348	129359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021353	ACTTTT	2	12	132219	132230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021353	TTGATT	2	12	133865	133876	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021353	TTTGAA	2	12	133894	133905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021353	TTCTCT	2	12	134289	134300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021353	GTTTTG	2	12	134430	134441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021353	CAAAAA	2	12	140096	140107	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021353	CAAAAC	2	12	140120	140131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021353	AGAGAA	2	12	140261	140272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021353	ATCAAA	2	12	140676	140687	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021353	CTCAAA	2	12	140697	140708	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021353	TTTTGA	2	12	149272	149283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021353	TTCTCT	2	12	149707	149718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021353	GTTTTG	2	12	149848	149859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021353	CAAAAA	2	12	155363	155374	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021353	CAAAAC	2	12	155387	155398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021353	AATTCA	2	12	155725	155736	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021353	TTCAAA	2	12	155860	155871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021353	TTTTGA	2	12	162326	162337	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021353	TTTTCT	2	12	162738	162749	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021353	TCTTAT	2	12	162819	162830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021353	GTTTTG	2	12	162848	162859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021353	CAAAAA	2	12	168130	168141	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021353	CAAAAC	2	12	168154	168165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021353	ATCAAA	2	12	168314	168325	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021353	AAATCA	2	12	168374	168385	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021353	TTCAAA	2	12	168466	168477	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021353	TGCAGG	2	12	176307	176318	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021353	GATTTT	2	12	196834	196845	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021353	AATCAT	2	12	275578	275589	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021353	TGCCTA	2	12	294204	294215	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021353	TATGAT	2	12	297789	297800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021353	ATAAAA	2	12	330258	330269	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021353	TTTTTA	2	12	371282	371293	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021353	ACATCA	2	12	394579	394590	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021353	TTGTTT	2	12	394705	394716	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021353	TCTTTT	2	12	403184	403195	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021353	TATGCG	2	12	404837	404848	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021353	TATTTT	2	12	457112	457123	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021353	GATAAT	2	12	623642	623653	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021353	ATTTTT	2	12	695650	695661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021353	CGTTAT	2	12	755265	755276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021353	TTTGAT	2	12	789401	789412	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021353	TTAAAA	2	12	803760	803771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021353	TTTCAA	2	12	837320	837331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021353	TCTTAA	2	12	840555	840566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021353	TGAACT	2	12	841344	841355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021353	TTATCA	2	12	858613	858624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021353	AATATT	2	12	875992	876003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021353	TAAAAA	2	12	914509	914520	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021353	TGTACT	2	12	916424	916435	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021353	AATGTA	2	12	931179	931190	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021353	TGCCCA	2	12	933346	933357	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021353	ATTGTG	2	12	957444	957455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021353	AAAAAT	2	12	989248	989259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021353	TCTTGT	2	12	997744	997755	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021353	TAGCTT	2	12	997937	997948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021353	ACAATA	2	12	998224	998235	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021353	TGTGAT	2	12	999200	999211	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021353	GTAAAA	2	12	1024302	1024313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021353	CTTTTT	2	12	1106214	1106225	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021353	AAAAAT	2	12	1150830	1150841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021353	TGTTTT	2	12	1153636	1153647	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021353	TTTTAT	2	12	1172129	1172140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021353	AGTATG	2	12	1172566	1172577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021353	GTCTCC	2	12	1173487	1173498	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021353	TGCGGC	2	12	1190393	1190404	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021353	TTAAGT	2	12	1210567	1210578	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021353	CATTCA	2	12	1263672	1263683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021353	ATCCAG	2	12	1313415	1313426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021353	ACAAAA	2	12	1365238	1365249	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021353	TTAGCT	2	12	1365548	1365559	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021353	TCTAAA	2	12	1365561	1365572	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021353	TAATTA	2	12	1395632	1395643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021353	TTAATT	2	12	1434080	1434091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021353	TTAGAG	2	12	1457511	1457522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021353	TACCCC	2	12	1479180	1479191	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_021353	TTAAAA	2	12	1532357	1532368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021353	GTGTAT	2	12	1535649	1535660	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021353	ATGATC	2	12	1679272	1679283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_021353	TATTTT	2	12	1690594	1690605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021353	CAAAAA	2	12	1693974	1693985	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021353	TATAAC	2	12	1724748	1724759	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021353	CAAGCT	2	12	1727961	1727972	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021353	GCTTTT	2	12	1790934	1790945	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021353	TAAAAC	2	12	1803961	1803972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021353	TCCACC	2	12	1805973	1805984	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_021353	ATCAAA	2	12	1822369	1822380	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021353	ATGATC	2	12	1822449	1822460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021353	CAAAAT	2	12	1822483	1822494	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021353	CTAATA	2	12	1847288	1847299	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.