MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594 plasmid 2

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021279	GCCA	2	8	1264	1271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021279	GCTT	2	8	1558	1565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021279	CACC	2	8	1691	1698	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_021279	TTCC	2	8	1732	1739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021279	TCAG	2	8	5592	5599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021279	TCGG	2	8	5673	5680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021279	CGAA	2	8	5990	5997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021279	TCGG	2	8	6558	6565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021279	ACGC	2	8	14769	14776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021279	ACCT	2	8	17178	17185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021279	CCGC	2	8	17272	17279	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_021279	GAAA	2	8	17637	17644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021279	GGGC	2	8	18861	18868	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021279	AGCG	2	8	20512	20519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021279	GGAG	2	8	21280	21287	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021279	ACTC	2	8	21489	21496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021279	CAAA	2	8	22058	22065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021279	CCGT	2	8	22394	22401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021279	AGTG	2	8	22518	22525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021279	CACG	2	8	23894	23901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021279	GGTT	2	8	24496	24503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021279	TGAG	2	8	24709	24716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021279	TTGT	2	8	26152	26159	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021279	CAGC	2	8	26212	26219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021279	TGGT	2	8	26352	26359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021279	AACA	2	8	27063	27070	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021279	CCGA	2	8	27148	27155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021279	GAGC	2	8	27418	27425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021279	ATGA	2	8	28501	28508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021279	CGCT	2	8	28646	28653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021279	CAGT	2	8	28794	28801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021279	AGCA	2	8	29587	29594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021279	GTTC	3	12	29596	29607	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021279	AGGG	2	8	29617	29624	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021279	GCCA	2	8	31538	31545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021279	TTCC	2	8	33041	33048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021279	GGAA	2	8	33263	33270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021279	AAGA	2	8	33444	33451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021279	ACGA	2	8	35963	35970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021279	CGAT	2	8	35982	35989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021279	ACGC	2	8	37913	37920	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021279	CGCC	2	8	38162	38169	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_021279	CCAG	2	8	38642	38649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021279	AGGA	2	8	38728	38735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021279	GCCC	2	8	39795	39802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_021279	GATT	2	8	41374	41381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021279	TCGT	2	8	42417	42424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021279	GCCA	2	8	42548	42555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021279	CGAC	2	8	42586	42593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021279	GCAA	2	8	43605	43612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021279	CGAA	2	8	43930	43937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021279	GCGA	2	8	44119	44126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021279	GTCG	2	8	44748	44755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021279	CATT	2	8	44868	44875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021279	GCAC	2	8	45395	45402	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021279	GTGG	2	8	48869	48876	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021279	GCCG	2	8	51425	51432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021279	CGTG	2	8	52126	52133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021279	TAGG	2	8	52160	52167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021279	TGCT	2	8	59582	59589	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021279	CAGC	2	8	59638	59645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021279	AGCC	2	8	59770	59777	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021279	TCCC	2	8	60968	60975	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_021279	TCCC	2	8	62043	62050	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_021279	TCCA	2	8	62076	62083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021279	CCAC	2	8	62119	62126	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_021279	CCCG	2	8	64735	64742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_021279	AGGT	2	8	75319	75326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021279	ATCT	2	8	75436	75443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021279	GCTC	2	8	78041	78048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021279	ACAA	2	8	78077	78084	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021279	TGGA	2	8	78509	78516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021279	CCCG	2	8	87822	87829	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_021279	ACGA	2	8	88667	88674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021279	CGCC	2	8	89004	89011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_021279	TCCC	2	8	89127	89134	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_021279	CATC	2	8	89135	89142	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021279	CTGC	2	8	89355	89362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021279	CTCC	2	8	90490	90497	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_021279	CCTG	2	8	91565	91572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021279	TCCT	2	8	94438	94445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021279	CATC	2	8	96328	96335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021279	TAGG	2	8	96339	96346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.