MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 8045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021200	CGC	2	6	1535	1540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021200	GTA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021200	GCC	2	6	1746	1751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021200	GCG	2	6	1789	1794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021200	TTA	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021200	TTC	2	6	1855	1860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021200	CGT	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021200	GTT	2	6	1972	1977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021200	GTC	3	9	1995	2003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021200	GAC	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021200	GAA	2	6	5110	5115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021200	TTG	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021200	GGC	2	6	10803	10808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021200	TCG	2	6	10822	10827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021200	TCC	2	6	10907	10912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021200	CAC	2	6	10919	10924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_021200	ACG	2	6	10937	10942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021200	GGC	2	6	10985	10990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021200	GTG	2	6	12488	12493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021200	GGC	2	6	12502	12507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021200	CGC	2	6	13951	13956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021200	GCC	2	6	13978	13983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021200	GGC	2	6	14003	14008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021200	TTG	2	6	14030	14035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021200	ATC	2	6	16936	16941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021200	GAC	2	6	16972	16977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021200	GAG	2	6	16981	16986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021200	CAA	2	6	16996	17001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021200	CCA	2	6	17024	17029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021200	CGA	2	6	17241	17246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021200	TTG	2	6	17257	17262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021200	GCG	2	6	17282	17287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021200	CGG	2	6	17349	17354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021200	TGG	2	6	17355	17360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021200	TTG	2	6	17453	17458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021200	GCA	2	6	17463	17468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021200	TGC	2	6	17534	17539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021200	TCG	2	6	17575	17580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021200	CGA	2	6	17666	17671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021200	CGT	2	6	17700	17705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021200	CTT	2	6	17750	17755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021200	GCG	2	6	17810	17815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021200	GAT	2	6	17818	17823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021200	ATC	2	6	17867	17872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021200	GCG	2	6	21495	21500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021200	GGC	2	6	21560	21565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021200	CGA	2	6	24996	25001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021200	TCC	2	6	25942	25947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_021200	GTT	2	6	25975	25980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021200	TGC	2	6	25987	25992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021200	GCC	2	6	26058	26063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021200	GCT	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021200	CTT	2	6	27392	27397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021200	ACA	2	6	27455	27460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021200	AGG	2	6	27513	27518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021200	AGG	2	6	28803	28808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021200	GCT	2	6	28905	28910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021200	CCT	2	6	28962	28967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021200	CGC	2	6	29118	29123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021200	CCG	2	6	29868	29873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021200	CTC	2	6	31681	31686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021200	GCC	2	6	31688	31693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021200	TCC	2	6	32918	32923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021200	CGC	2	6	32949	32954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_021200	GGA	2	6	32961	32966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021200	CCG	2	6	32991	32996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021200	CGG	2	6	33057	33062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021200	GCT	2	6	33108	33113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021200	GCG	2	6	33122	33127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021200	AGT	2	6	33297	33302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021200	GTC	3	9	33310	33318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021200	CGA	2	6	33366	33371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021200	GTG	2	6	33497	33502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021200	CGG	2	6	33511	33516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021200	CAG	2	6	33579	33584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021200	GCT	2	6	33606	33611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021200	CGT	2	6	33636	33641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021200	GTC	2	6	33814	33819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021200	CGG	2	6	33831	33836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021200	TCG	2	6	33839	33844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021200	CAG	2	6	33880	33885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021200	CCG	2	6	34016	34021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021200	CCG	2	6	34030	34035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_021200	TGG	2	6	34095	34100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021200	TGC	2	6	34232	34237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021200	CCT	2	6	34380	34385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_021200	ATC	2	6	34400	34405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021200	TGG	2	6	34416	34421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021200	GCC	2	6	34447	34452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021200	CGG	2	6	34546	34551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021200	GGC	2	6	34627	34632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021200	GTG	2	6	34678	34683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021200	GCC	2	6	34717	34722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021200	CTG	2	6	34820	34825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021200	GGC	2	6	34843	34848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021200	CAG	2	6	34951	34956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021200	TCG	2	6	34958	34963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021200	TGC	2	6	34997	35002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021200	GCA	2	6	35109	35114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021200	CGG	2	6	35274	35279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021200	CGG	2	6	35298	35303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021200	TCG	4	12	35348	35359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021200	CGA	3	9	35370	35378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021200	GCC	2	6	35381	35386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_021200	CGA	2	6	35412	35417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021200	CGT	2	6	35541	35546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021200	GAC	2	6	35602	35607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021200	CCG	2	6	35663	35668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021200	CGC	2	6	35706	35711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_021200	CGA	2	6	35803	35808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021200	CGC	2	6	35812	35817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021200	GGT	2	6	36006	36011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021200	CGG	2	6	36081	36086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021200	TGT	2	6	36102	36107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021200	TGC	2	6	36128	36133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021200	CAC	2	6	36199	36204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_021200	CAT	2	6	36217	36222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021200	GTC	2	6	36274	36279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021200	CAC	2	6	36310	36315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_021200	CGC	2	6	36316	36321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021200	AGC	2	6	36350	36355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021200	GGC	2	6	36457	36462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021200	GTG	2	6	36605	36610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021200	CGG	2	6	36831	36836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021200	CAG	2	6	36904	36909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021200	GAG	2	6	36915	36920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021200	CAA	2	6	36952	36957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021200	ACG	2	6	37010	37015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021200	GTC	3	9	37033	37041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021200	CGC	2	6	37071	37076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_021200	GGT	2	6	37078	37083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021200	GTC	2	6	37096	37101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021200	GCA	2	6	37125	37130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021200	CGG	2	6	37209	37214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021200	GTC	2	6	37238	37243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021200	CAG	2	6	37249	37254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021200	GTC	2	6	37432	37437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021200	GCA	2	6	37440	37445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021200	GTG	2	6	37458	37463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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