MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 11781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021200	CCGC	2	8	1420250	1420257	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3502	NC_021200	GCGCCG	2	12	1420271	1420282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_021200	CCG	2	6	1423142	1423147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_021200	CGC	2	6	1423171	1423176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_021200	ACC	2	6	1424092	1424097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_021200	CGT	2	6	1424592	1424597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_021200	GCCGG	2	10	1425514	1425523	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3508	NC_021200	CGG	2	6	1425526	1425531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_021200	TGG	2	6	1425541	1425546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021200	TGCCG	2	10	1426429	1426438	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3511	NC_021200	TGA	2	6	1428203	1428208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021200	GGC	2	6	1428277	1428282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021200	ATG	2	6	1429579	1429584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021200	CTT	2	6	1429593	1429598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_021200	GC	3	6	1429645	1429650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_021200	GCG	2	6	1429691	1429696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021200	GGT	2	6	1429718	1429723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021200	CAG	2	6	1430462	1430467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_021200	CGC	2	6	1430473	1430478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_021200	GCC	3	9	1431102	1431110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_021200	ACA	2	6	1431145	1431150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021200	CGA	2	6	1431736	1431741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_021200	CGG	2	6	1431760	1431765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021200	GAAGT	2	10	1431775	1431784	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021200	GAC	2	6	1431871	1431876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_021200	GCC	2	6	1431919	1431924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_021200	AAG	2	6	1431928	1431933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021200	CGA	2	6	1431984	1431989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_021200	CGA	2	6	1432098	1432103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_021200	CGA	2	6	1432176	1432181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_021200	GGC	2	6	1433618	1433623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_021200	GATC	2	8	1433629	1433636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_021200	GTG	2	6	1433671	1433676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021200	GTT	3	9	1433756	1433764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_021200	GC	3	6	1439346	1439351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_021200	CG	3	6	1442447	1442452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_021200	CGG	2	6	1442458	1442463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_021200	CG	3	6	1442522	1442527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_021200	GC	3	6	1442814	1442819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_021200	GCAGG	2	10	1442867	1442876	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3541	NC_021200	GCT	2	6	1446850	1446855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_021200	CGG	2	6	1446928	1446933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021200	GTCG	2	8	1446945	1446952	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_021200	G	6	6	1446952	1446957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021200	CCA	2	6	1446966	1446971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_021200	TGC	2	6	1446986	1446991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021200	ACC	2	6	1448228	1448233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_021200	CACG	2	8	1448250	1448257	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_021200	AGG	2	6	1448293	1448298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021200	GCA	2	6	1450453	1450458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_021200	AC	3	6	1450478	1450483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_021200	GCA	2	6	1453104	1453109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_021200	AGA	2	6	1453125	1453130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021200	GCG	2	6	1456061	1456066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_021200	CGGG	2	8	1456069	1456076	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_021200	CTGA	2	8	1456089	1456096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_021200	GCT	2	6	1457478	1457483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_021200	CTC	2	6	1457522	1457527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_021200	GTT	2	6	1457580	1457585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021200	GT	3	6	1457599	1457604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021200	TGT	2	6	1457619	1457624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021200	GT	3	6	1457649	1457654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021200	ATG	2	6	1457669	1457674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021200	GAG	2	6	1457729	1457734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021200	TTTG	2	8	1457737	1457744	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021200	GGC	2	6	1457776	1457781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_021200	TCT	2	6	1457930	1457935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_021200	TTG	2	6	1457981	1457986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021200	CGA	2	6	1458009	1458014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_021200	GCA	2	6	1458083	1458088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_021200	CGC	2	6	1458130	1458135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_021200	CGA	2	6	1458178	1458183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_021200	GAA	2	6	1458218	1458223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021200	CAG	2	6	1458243	1458248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_021200	GGT	2	6	1458308	1458313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021200	GTT	2	6	1458321	1458326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021200	AGG	2	6	1458433	1458438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021200	GAG	2	6	1458482	1458487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021200	TCCT	2	8	1458563	1458570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_021200	GCG	2	6	1458665	1458670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_021200	GAA	2	6	1458699	1458704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021200	TG	3	6	1458763	1458768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021200	GGT	2	6	1458771	1458776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021200	GTC	2	6	1458785	1458790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_021200	TCGTG	2	10	1458794	1458803	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3586	NC_021200	GA	3	6	1458877	1458882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021200	GGA	2	6	1458899	1458904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021200	TCA	2	6	1458924	1458929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_021200	CA	3	6	1458951	1458956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_021200	AC	3	6	1459121	1459126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_021200	CGTCA	2	10	1459131	1459140	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3592	NC_021200	GGGA	2	8	1459182	1459189	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_021200	CCT	2	6	1459264	1459269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_021200	CAC	2	6	1459280	1459285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_021200	TGG	2	6	1459301	1459306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021200	AC	3	6	1459377	1459382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_021200	ACA	2	6	1459397	1459402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_021200	GTCC	2	8	1459407	1459414	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_021200	TGG	3	9	1459434	1459442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021200	GGTGT	2	10	1459443	1459452	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021200	T	6	6	1459533	1459538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021200	TG	3	6	1459545	1459550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021200	TAAG	2	8	1459551	1459558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021200	TGG	2	6	1459573	1459578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021200	AT	3	6	1459714	1459719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021200	GAA	2	6	1459770	1459775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021200	AGT	2	6	1459794	1459799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021200	GCGA	2	8	1459801	1459808	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3609	NC_021200	GCAT	2	8	1459828	1459835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_021200	TG	4	8	1459854	1459861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021200	CCG	2	6	1459950	1459955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_021200	AGC	2	6	1460015	1460020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_021200	CTG	2	6	1460034	1460039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_021200	ACC	2	6	1460053	1460058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_021200	GGGAG	2	10	1460129	1460138	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021200	CCT	2	6	1460180	1460185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_021200	GAA	2	6	1460209	1460214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021200	CAC	2	6	1460504	1460509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_021200	CTA	2	6	1460541	1460546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_021200	GTG	2	6	1460578	1460583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021200	CGG	2	6	1460602	1460607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_021200	AGG	2	6	1460709	1460714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021200	AGC	2	6	1460725	1460730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_021200	CCG	2	6	1460805	1460810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_021200	GGT	2	6	1460887	1460892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021200	CCG	2	6	1460952	1460957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_021200	GCCAG	2	10	1460977	1460986	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3628	NC_021200	TGA	2	6	1461080	1461085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021200	ACC	2	6	1461099	1461104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_021200	GTA	2	6	1461170	1461175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_021200	CAGT	2	8	1461212	1461219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3632	NC_021200	CTG	2	6	1461322	1461327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_021200	GGT	2	6	1461381	1461386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_021200	G	6	6	1461464	1461469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_021200	CGG	2	6	1461667	1461672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3636	NC_021200	CG	3	6	1461808	1461813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3637	NC_021200	TG	3	6	1461915	1461920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3638	NC_021200	GTT	2	6	1461926	1461931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3640	NC_021200	TCG	2	6	1462275	1462280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3642	NC_021200	CCG	2	6	1462380	1462385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3643	NC_021200	CG	4	8	1462384	1462391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3644	NC_021200	GACG	2	8	1462434	1462441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3645	NC_021200	CCA	2	6	1462464	1462469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3649	NC_021200	C	6	6	1462726	1462731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3650	NC_021200	CGG	2	6	1462757	1462762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3652	NC_021200	CCG	2	6	1462859	1462864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3653	NC_021200	GTC	2	6	1462913	1462918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3655	NC_021200	CGG	2	6	1462990	1462995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3660	NC_021200	GTC	2	6	1464302	1464307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3662	NC_021200	TCG	3	9	1467104	1467112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3666	NC_021200	CGGG	2	8	1469385	1469392	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3667	NC_021200	CCG	2	6	1469408	1469413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3672	NC_021200	CCG	2	6	1469504	1469509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3700	NC_021200	TCG	2	6	1479833	1479838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3752	NC_021200	TGGG	2	8	1493863	1493870	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3753	NC_021200	ACC	2	6	1493877	1493882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3754	NC_021200	CA	5	10	1493886	1493895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3755	NC_021200	TG	3	6	1494516	1494521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3756	NC_021200	CTG	2	6	1494571	1494576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3757	NC_021200	AATT	2	8	1494577	1494584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3758	NC_021200	ACA	2	6	1496278	1496283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3759	NC_021200	CGC	2	6	1496284	1496289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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