MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 42850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021192	GCC	2	6	381196	381201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_021192	CGG	3	9	381211	381219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_021192	GCC	2	6	381244	381249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_021192	GCC	2	6	381259	381264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_021192	ACG	2	6	381356	381361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_021192	CGG	2	6	381387	381392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_021192	CAC	2	6	381393	381398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_021192	TCG	2	6	381447	381452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_021192	ATG	4	12	381457	381468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021192	CGGC	2	8	381529	381536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_021192	CGC	2	6	381564	381569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_021192	ACG	2	6	381602	381607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021192	GCCG	2	8	381618	381625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_021192	ACC	2	6	381658	381663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_021192	T	6	6	381700	381705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_021192	TGC	2	6	381761	381766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021192	GC	3	6	381765	381770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_021192	G	6	6	381821	381826	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021192	ACC	2	6	381833	381838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_021192	TGG	2	6	381890	381895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021192	GCG	2	6	381921	381926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021192	ACC	2	6	381974	381979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_021192	GGT	2	6	382034	382039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021192	CTGG	2	8	382084	382091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_021192	TGG	2	6	382231	382236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021192	TCG	2	6	382275	382280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_021192	ACC	2	6	382370	382375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_021192	CG	3	6	382440	382445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_021192	CGC	2	6	382485	382490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_021192	CGC	2	6	382525	382530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_021192	CGA	2	6	382531	382536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_021192	AGC	2	6	382551	382556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_021192	GCC	2	6	382570	382575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_021192	CGA	2	6	382591	382596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021192	CGC	2	6	382602	382607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_021192	CGA	2	6	382683	382688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_021192	GGT	2	6	382720	382725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021192	CGA	2	6	382726	382731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_021192	GC	3	6	382739	382744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_021192	CGC	2	6	382751	382756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_021192	GC	3	6	382755	382760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_021192	CGGG	2	8	382771	382778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_021192	CGGAC	2	10	382810	382819	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3544	NC_021192	GCTG	2	8	382894	382901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_021192	CGC	2	6	382919	382924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_021192	GAT	2	6	382939	382944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021192	CGC	2	6	383003	383008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_021192	CG	3	6	383037	383042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_021192	TGA	2	6	383048	383053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021192	CGTCCA	2	12	383057	383068	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_021192	TCG	2	6	383098	383103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_021192	GCA	2	6	383131	383136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_021192	CAT	2	6	383214	383219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_021192	CG	3	6	383251	383256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_021192	CAG	2	6	383268	383273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_021192	CAG	2	6	383310	383315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_021192	GC	3	6	383323	383328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_021192	ACCCC	2	10	383555	383564	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3559	NC_021192	GCC	2	6	383651	383656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_021192	ACG	2	6	383694	383699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_021192	AC	3	6	384297	384302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_021192	CGC	2	6	384340	384345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_021192	GCC	2	6	384370	384375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_021192	TGA	3	9	384431	384439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021192	GGC	2	6	388322	388327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_021192	CAGC	2	8	388381	388388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_021192	GAC	2	6	388419	388424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_021192	CGG	2	6	388443	388448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_021192	TGG	2	6	388482	388487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021192	ATG	2	6	388501	388506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021192	GTGACC	2	12	388512	388523	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_021192	C	6	6	388527	388532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3573	NC_021192	AGG	2	6	388535	388540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021192	GCC	2	6	388618	388623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_021192	GGT	2	6	388649	388654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021192	GTC	2	6	388677	388682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_021192	CCA	2	6	388718	388723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_021192	GGT	2	6	390045	390050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021192	GC	3	6	390103	390108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_021192	CG	3	6	390117	390122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_021192	CA	3	6	390193	390198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_021192	CCA	2	6	390220	390225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_021192	GAC	2	6	390342	390347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3585	NC_021192	CCG	2	6	390383	390388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_021192	GC	3	6	390399	390404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_021192	GAG	2	6	390426	390431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021192	GGT	2	6	390540	390545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021192	CGG	3	9	390584	390592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_021192	CCG	3	9	390675	390683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_021192	ACC	2	6	390798	390803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_021192	ACC	2	6	390824	390829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_021192	GT	3	6	390876	390881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021192	TTCC	2	8	390889	390896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_021192	CGT	2	6	390919	390924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_021192	CCG	2	6	390927	390932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_021192	ACT	2	6	390945	390950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_021192	GCG	3	9	391002	391010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_021192	CAG	2	6	391028	391033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_021192	TGA	2	6	391039	391044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021192	TAG	2	6	391078	391083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021192	CGG	2	6	391149	391154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_021192	G	6	6	391153	391158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021192	GGTG	2	8	391163	391170	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021192	TTGGT	2	10	391177	391186	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021192	GAA	2	6	391191	391196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021192	GATG	2	8	391256	391263	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021192	GAT	2	6	391338	391343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021192	GCC	2	6	391394	391399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_021192	GCGCG	2	10	391454	391463	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3611	NC_021192	AGC	2	6	391480	391485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_021192	CG	3	6	391495	391500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_021192	TCG	2	6	391510	391515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_021192	TCA	2	6	391517	391522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_021192	AGG	2	6	392071	392076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021192	TCC	2	6	392084	392089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_021192	CGC	2	6	392092	392097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_021192	CCGG	2	8	392102	392109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_021192	TTCG	2	8	392143	392150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_021192	CCGCC	2	10	392158	392167	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3621	NC_021192	GT	3	6	392176	392181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021192	CGA	2	6	393241	393246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_021192	CCA	2	6	393256	393261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_021192	CCGG	2	8	393345	393352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_021192	CGG	2	6	393368	393373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_021192	GGCC	2	8	393394	393401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_021192	GGC	2	6	393430	393435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_021192	CG	3	6	393471	393476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3629	NC_021192	ACG	2	6	394905	394910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_021192	CAC	2	6	396175	396180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_021192	GTC	2	6	396190	396195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_021192	GCG	2	6	396212	396217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_021192	GC	3	6	396951	396956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3634	NC_021192	GCT	2	6	397067	397072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3636	NC_021192	GAA	2	6	397134	397139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3639	NC_021192	CTG	2	6	397224	397229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3653	NC_021192	GC	3	6	398668	398673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3766	NC_021192	GCT	2	6	409086	409091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3767	NC_021192	TGG	2	6	409112	409117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3768	NC_021192	CCAG	2	8	409127	409134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3769	NC_021192	CGG	2	6	409185	409190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3770	NC_021192	G	7	7	409189	409195	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3771	NC_021192	GACC	2	8	409205	409212	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3772	NC_021192	CAATGC	2	12	409237	409248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3773	NC_021192	ATC	2	6	409283	409288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3774	NC_021192	TCA	2	6	409295	409300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3775	NC_021192	CG	3	6	409400	409405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3776	NC_021192	GTGC	2	8	409415	409422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3777	NC_021192	GGT	2	6	409489	409494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3779	NC_021192	TGC	2	6	410097	410102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3780	NC_021192	AGGCCA	2	12	410115	410126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3782	NC_021192	TCG	2	6	410139	410144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3783	NC_021192	TCGT	2	8	410153	410160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3784	NC_021192	GAT	2	6	410191	410196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3785	NC_021192	CTG	2	6	410204	410209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3786	NC_021192	CGG	2	6	410280	410285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3787	NC_021192	CG	3	6	410439	410444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3788	NC_021192	GC	3	6	410529	410534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3789	NC_021192	TGGC	2	8	410560	410567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3790	NC_021192	CGA	2	6	410612	410617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3792	NC_021192	CGG	2	6	410704	410709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3793	NC_021192	GGGC	2	8	410740	410747	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3794	NC_021192	CGA	2	6	410783	410788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3795	NC_021192	CCA	2	6	410826	410831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3796	NC_021192	TTG	2	6	410832	410837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3797	NC_021192	CGT	3	9	410850	410858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3798	NC_021192	GCT	2	6	410890	410895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3799	NC_021192	CCG	2	6	410901	410906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3800	NC_021192	GGT	2	6	410929	410934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3801	NC_021192	GCT	2	6	410969	410974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3802	NC_021192	CGG	2	6	410996	411001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3803	NC_021192	CAT	2	6	411020	411025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3805	NC_021192	ATTG	2	8	415152	415159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3877	NC_021192	GAGC	2	8	421650	421657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3878	NC_021192	GC	3	6	421656	421661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3879	NC_021192	GAGC	2	8	421701	421708	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3880	NC_021192	GC	3	6	421707	421712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3892	NC_021192	GGT	2	6	422199	422204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3894	NC_021192	AGA	2	6	422444	422449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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