MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma putrefaciens Mput9231

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021083	TATAA	2	10	5034	5043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021083	TTTAA	2	10	15627	15636	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021083	TTTAT	2	10	16634	16643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021083	TAAAA	2	10	16834	16843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021083	TAATA	2	10	16844	16853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021083	TGAAT	2	10	19059	19068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021083	TTAGA	2	10	19336	19345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021083	ATTAC	2	10	19862	19871	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021083	TTATT	2	10	21474	21483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021083	AGTAA	2	10	24576	24585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021083	ATTTT	2	10	45869	45878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021083	TTAGG	2	10	53827	53836	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021083	ATAAA	2	10	60991	61000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021083	TTTAA	2	10	66293	66302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021083	TTAAG	2	10	67593	67602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021083	ATTTT	2	10	70724	70733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021083	TAATT	2	10	71640	71649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021083	ATTAA	2	10	74721	74730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021083	TTTAT	2	10	76142	76151	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021083	AAAAT	2	10	76163	76172	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021083	TATAA	2	10	80016	80025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021083	AAAGC	2	10	101980	101989	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021083	TAAAA	2	10	102039	102048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021083	TTTTA	2	10	110901	110910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021083	TCTTA	2	10	124708	124717	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021083	TAGAA	2	10	143861	143870	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021083	TTCTT	2	10	143899	143908	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021083	TAAAA	2	10	147037	147046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021083	TTAAT	2	10	148490	148499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021083	AATTT	2	10	148707	148716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021083	ATCTT	2	10	149606	149615	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021083	AAGGT	2	10	149912	149921	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021083	ATTTA	2	10	150070	150079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021083	TTATT	2	10	150578	150587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021083	ATTTA	2	10	157581	157590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021083	TTTTC	2	10	159572	159581	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021083	TTTTG	2	10	160467	160476	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021083	ATTTA	2	10	160772	160781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021083	TTGTT	2	10	162134	162143	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021083	AAAAT	2	10	162241	162250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021083	CAAAA	2	10	165183	165192	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021083	AAAAT	2	10	167751	167760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021083	TAAAA	2	10	171892	171901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021083	TATAA	2	10	174892	174901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021083	TTTTA	2	10	182817	182826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021083	GATTA	2	10	188629	188638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021083	AAGCT	2	10	192922	192931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_021083	AATTA	2	10	193989	193998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021083	AGTCT	2	10	202928	202937	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021083	AATTT	2	10	212554	212563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021083	AAATC	2	10	215529	215538	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021083	AAAAC	2	10	217031	217040	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021083	TAAAA	2	10	220037	220046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021083	TTTGA	2	10	221720	221729	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021083	AATTT	2	10	221925	221934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021083	GAAAA	2	10	223008	223017	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021083	GTTAT	2	10	228846	228855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021083	CTAGC	2	10	228978	228987	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_021083	TAAAT	2	10	231625	231634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021083	AGTTA	2	10	231976	231985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021083	TATAA	2	10	232121	232130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021083	TAAAT	2	10	232636	232645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021083	TAATT	2	10	240661	240670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021083	TTAAT	2	10	257308	257317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021083	TAATA	2	10	259450	259459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021083	TCTAT	2	10	259599	259608	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021083	TTTAG	2	10	264893	264902	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021083	AACAA	2	10	270671	270680	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021083	CAATT	2	10	270843	270852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021083	TAATT	2	10	282534	282543	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021083	GTAAC	2	10	286143	286152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021083	TAAAT	2	10	286248	286257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021083	AATTA	2	10	286421	286430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021083	AAATT	2	10	286439	286448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021083	TCTTG	2	10	286636	286645	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021083	ATTTA	2	10	286752	286761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021083	ATTTC	2	10	286940	286949	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021083	AATAG	2	10	287071	287080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021083	ATTGT	2	10	287661	287670	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021083	ATTGT	2	10	287727	287736	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021083	ATAAA	2	10	287986	287995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021083	TAAAA	2	10	289453	289462	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021083	AATTA	2	10	292670	292679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021083	AAGTT	2	10	296244	296253	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021083	TAGTT	2	10	296715	296724	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021083	CTAAG	2	10	307062	307071	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021083	CTTTA	2	10	324932	324941	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021083	TCAAT	2	10	325122	325131	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021083	ATTTT	2	10	327850	327859	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021083	TTAAT	2	10	333414	333423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021083	ACTAA	2	10	361231	361240	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021083	TTTAA	2	10	362703	362712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021083	TAAAA	2	10	362913	362922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021083	AACAT	2	10	365430	365439	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021083	TTAAA	2	10	365876	365885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021083	ACTAT	2	10	370332	370341	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021083	TTTCT	2	10	370671	370680	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021083	ATCAA	2	10	371236	371245	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021083	TTATT	2	10	375451	375460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021083	TAATA	2	10	381010	381019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021083	ATTTT	2	10	390692	390701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021083	ATATT	2	10	399159	399168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021083	TAATA	2	10	406846	406855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021083	CCGAA	2	10	408690	408699	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_021083	AAAAC	2	10	409603	409612	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021083	TAAAA	2	10	411483	411492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021083	ATAAA	2	10	417678	417687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021083	CTTTT	2	10	417805	417814	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021083	TTGTT	2	10	423545	423554	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021083	TTTTA	2	10	426288	426297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021083	AAATA	2	10	426730	426739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021083	TTTTA	2	10	427021	427030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021083	AAAGA	2	10	427074	427083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021083	TATAA	2	10	427574	427583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021083	TATAA	2	10	432982	432991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021083	GATCA	2	10	446410	446419	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021083	CTTAA	2	10	452245	452254	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021083	TTTGA	2	10	456027	456036	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021083	ATTTA	2	10	456906	456915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021083	ACTTA	2	10	457086	457095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021083	ATTTC	2	10	457873	457882	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021083	CCTTT	2	10	482218	482227	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_021083	AAGTT	2	10	496884	496893	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021083	CTTAG	2	10	506208	506217	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021083	AACTT	2	10	506252	506261	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021083	CTTTC	2	10	516073	516082	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_021083	CAAAA	2	10	518919	518928	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021083	TTTTA	2	10	531662	531671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021083	TTTAA	2	10	537532	537541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021083	CCTTA	2	10	543423	543432	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_021083	TAATT	2	10	552821	552830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021083	TTCAA	2	10	554124	554133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021083	ACCCC	2	10	555729	555738	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
134	NC_021083	ATATT	2	10	565272	565281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021083	TGTTT	2	10	575755	575764	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021083	TTTTA	2	10	594894	594903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021083	TGAAA	2	10	595105	595114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021083	ATTTT	2	10	603468	603477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021083	GTATG	2	10	605041	605050	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021083	TAATT	2	10	605411	605420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021083	TCTTA	2	10	606261	606270	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021083	ATGGT	2	10	606426	606435	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021083	TTAAT	2	10	611283	611292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021083	ATTTG	2	10	611413	611422	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021083	AATTC	2	10	612781	612790	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021083	AGTTA	2	10	613508	613517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021083	TAAAA	2	10	613590	613599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021083	AAAAT	2	10	614082	614091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_021083	TTTTA	2	10	795306	795315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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207	NC_021083	GTTAT	2	10	824742	824751	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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218	NC_021083	CTATA	2	10	834698	834707	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
219	NC_021083	CATTA	2	10	835440	835449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
220	NC_021083	ATTAT	2	10	837374	837383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_021083	TATAA	2	10	837385	837394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.