MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 302

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021082	TAAAT	2	10	12501	12510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021082	ACTAG	2	10	26092	26101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021082	CTGCT	2	10	28744	28753	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_021082	AATTA	2	10	50258	50267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021082	TGTCT	2	10	57566	57575	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021082	GTTTT	2	10	65499	65508	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021082	CATGC	2	10	86082	86091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_021082	ATATA	2	10	90028	90037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021082	TTGTG	2	10	91150	91159	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021082	GCAAC	2	10	92687	92696	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_021082	AAAAC	2	10	96230	96239	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021082	AGGGG	2	10	103938	103947	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021082	ATGCA	2	10	107620	107629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021082	TAAGT	2	10	121504	121513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021082	ATTTT	2	10	122987	122996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021082	TAAAT	2	10	123052	123061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021082	TAAAT	2	10	125501	125510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021082	AGACT	2	10	125562	125571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021082	AAATG	2	10	136296	136305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021082	ATATG	2	10	136306	136315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021082	TTAAA	2	10	139783	139792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021082	AAAAT	2	10	140861	140870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021082	AAAGA	2	10	158799	158808	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021082	ATAAA	2	10	178743	178752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021082	ATTTT	2	10	181625	181634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021082	AATTT	2	10	181639	181648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021082	TAATT	2	10	193245	193254	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021082	TCTAT	2	10	201334	201343	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021082	AGCGA	2	10	204387	204396	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021082	AAAGA	2	10	214357	214366	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021082	CTCTT	2	10	251474	251483	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_021082	TAAAA	2	10	253427	253436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021082	TTTTA	2	10	260768	260777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021082	TTAAA	2	10	267207	267216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021082	CTAAC	2	10	268948	268957	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_021082	CGACT	2	10	269277	269286	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_021082	TCGGT	2	10	269652	269661	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021082	TTCAA	2	10	272410	272419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021082	CAAAA	2	10	272684	272693	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021082	TCAAA	2	10	284903	284912	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021082	TTAAA	2	10	302969	302978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021082	CTAAC	2	10	304710	304719	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_021082	CGACT	2	10	305039	305048	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_021082	TCGGT	2	10	305414	305423	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021082	TCGCT	2	10	306576	306585	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_021082	TTCAA	2	10	308288	308297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021082	TTTTA	2	10	308893	308902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021082	TCTAT	2	10	356672	356681	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021082	ATTCC	2	10	365670	365679	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_021082	GCAAC	2	10	368994	369003	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_021082	TTGAA	2	10	371393	371402	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021082	AAAAT	2	10	383830	383839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021082	CTAAC	2	10	412143	412152	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_021082	CGACT	2	10	412472	412481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_021082	TCGGT	2	10	412847	412856	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_021082	TTCAA	2	10	415605	415614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021082	AATTT	2	10	419601	419610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021082	CTTTC	2	10	428206	428215	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_021082	ACATT	2	10	434185	434194	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021082	CTAAC	2	10	471167	471176	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_021082	CGACT	2	10	471496	471505	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_021082	TCGGT	2	10	471871	471880	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021082	TCGCT	2	10	473033	473042	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021082	TTCAA	2	10	474745	474754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021082	TTCAA	2	10	507498	507507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021082	TATAT	2	10	508307	508316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021082	ATTTT	2	10	520165	520174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021082	TTTAA	2	10	523087	523096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021082	TAAAT	2	10	523117	523126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021082	CTAAA	2	10	547636	547645	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021082	GTTTT	2	10	549914	549923	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021082	CTTTT	2	10	552379	552388	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021082	AGATG	2	10	585745	585754	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021082	ATTTC	2	10	589287	589296	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021082	AATTT	2	10	599679	599688	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021082	TTTTG	2	10	607592	607601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021082	TAAAA	2	10	607668	607677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021082	ATTTT	2	10	607723	607732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021082	ATTTT	2	10	614320	614329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021082	AAATA	2	10	637481	637490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021082	AATGA	2	10	639402	639411	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021082	AAAAG	2	10	639432	639441	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021082	TAAAA	2	10	643160	643169	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021082	CTTTT	2	10	646828	646837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021082	TTTTC	2	10	656160	656169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021082	TCACT	2	10	656247	656256	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_021082	AAAAT	2	10	682007	682016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021082	CATAT	2	10	691815	691824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021082	CATTT	2	10	691825	691834	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021082	GCCCA	2	10	694888	694897	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_021082	CTTTT	2	10	696645	696654	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021082	GCTCA	2	10	705133	705142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_021082	ATTTT	2	10	708164	708173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021082	AAATT	2	10	709434	709443	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021082	TAAAA	2	10	711135	711144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021082	TAAAT	2	10	713753	713762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021082	GTTTT	2	10	732303	732312	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021082	TAAAA	2	10	787241	787250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021082	TTAAC	2	10	790974	790983	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021082	ATTTA	2	10	825718	825727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021082	TTTAA	2	10	843280	843289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021082	TGTTT	2	10	871640	871649	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021082	AATCA	2	10	875228	875237	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021082	GAATT	2	10	883309	883318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021082	CTTTT	2	10	908330	908339	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021082	TTTTA	2	10	918895	918904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021082	TTTAA	2	10	930532	930541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021082	ATAAA	2	10	939700	939709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021082	ATTTA	2	10	946930	946939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021082	AATTC	2	10	953143	953152	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021082	GGGAA	2	10	960420	960429	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021082	TAAAA	2	10	964004	964013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021082	TAAAT	2	10	965133	965142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021082	TCCTT	2	10	984342	984351	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_021082	AGAGA	2	10	989363	989372	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021082	ATTTT	2	10	999993	1000002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021082	TTGAA	2	10	1002287	1002296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021082	AGTCG	2	10	1005421	1005430	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_021082	AGGTT	2	10	1005748	1005757	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021082	TTTAA	2	10	1007491	1007500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021082	AAATA	2	10	1039290	1039299	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021082	AAGAC	2	10	1071027	1071036	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021082	TTCAG	2	10	1071045	1071054	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021082	AATAA	2	10	1076657	1076666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021082	GCCAT	2	10	1080555	1080564	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_021082	CAACC	2	10	1090347	1090356	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_021082	AGAGA	2	10	1122231	1122240	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021082	ATAAA	2	10	1125195	1125204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021082	TTTTC	2	10	1133600	1133609	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021082	TCTTT	2	10	1135797	1135806	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021082	TAATA	2	10	1181439	1181448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021082	TTTAA	2	10	1184496	1184505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021082	CTGTG	2	10	1184561	1184570	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021082	AAAAT	2	10	1194617	1194626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021082	TTCGC	2	10	1201315	1201324	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_021082	AAATG	2	10	1216648	1216657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021082	GTTTA	2	10	1225555	1225564	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021082	ATTTA	2	10	1227540	1227549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021082	ATAAA	2	10	1252671	1252680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021082	CTTTT	2	10	1258708	1258717	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021082	TTTAG	2	10	1258746	1258755	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021082	AAATG	2	10	1270892	1270901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021082	TTTTG	2	10	1294081	1294090	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021082	CAAAT	2	10	1308724	1308733	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_021082	GTTAA	2	10	1308743	1308752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021082	ATAGC	2	10	1308943	1308952	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_021082	GTTTT	2	10	1342230	1342239	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021082	CAGGG	2	10	1348029	1348038	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
149	NC_021082	CGAGC	2	10	1348067	1348076	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_021082	AATAA	2	10	1382693	1382702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_021082	ATTTT	2	10	1507075	1507084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021082	TATTT	2	10	1738303	1738312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_021082	CGACT	2	10	2525466	2525475	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_021082	TCGCT	2	10	2527003	2527012	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_021082	TTCAA	2	10	2528715	2528724	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_021082	ATTAA	2	10	2541010	2541019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021082	TTTTA	2	10	2545755	2545764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021082	AAATT	2	10	2548594	2548603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021082	TGCTA	2	10	2566528	2566537	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_021082	TATTT	2	10	2587764	2587773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021082	TAGAT	2	10	2592535	2592544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021082	ATGAA	2	10	2592817	2592826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
295	NC_021082	TTGAT	2	10	2600685	2600694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_021082	TAAAT	2	10	2601710	2601719	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_021082	AATTT	2	10	2619060	2619069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_021082	GATTT	2	10	2626031	2626040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
299	NC_021082	CATAC	2	10	2636489	2636498	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
300	NC_021082	TAAAA	2	10	2655351	2655360	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_021082	CTTTT	2	10	2662643	2662652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
302	NC_021082	AGCGA	2	10	2699664	2699673	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.