MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 1028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021082	TGAT	2	8	2592	2599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021082	AAAG	2	8	6754	6761	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021082	ATTT	2	8	8393	8400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021082	AAAT	2	8	18653	18660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021082	TAAT	2	8	19474	19481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021082	TCGC	2	8	19508	19515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021082	TGAT	2	8	21253	21260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021082	TTAA	2	8	21407	21414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021082	TAAA	2	8	25959	25966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021082	ATTT	2	8	26034	26041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021082	TCAC	2	8	29998	30005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021082	TTAA	2	8	34598	34605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021082	GTTA	2	8	34617	34624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021082	TGAT	2	8	34641	34648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021082	CTTA	2	8	44733	44740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021082	CGCT	2	8	45734	45741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021082	AATA	2	8	51393	51400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021082	TAAA	2	8	54358	54365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021082	AATT	2	8	54480	54487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021082	ATCA	2	8	57591	57598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021082	TAAA	2	8	65586	65593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021082	CTTT	2	8	71026	71033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021082	TAAT	2	8	71077	71084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021082	CAAG	2	8	86174	86181	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021082	TTGA	2	8	86185	86192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021082	AAAT	2	8	88338	88345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021082	TTTA	2	8	90137	90144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021082	AATA	2	8	90504	90511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021082	AAAC	2	8	92729	92736	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021082	TAAA	2	8	95365	95372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021082	TAAC	2	8	99108	99115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021082	GCTT	2	8	99155	99162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021082	AAGA	2	8	103076	103083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021082	TCGA	2	8	112342	112349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021082	CGGG	2	8	114067	114074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021082	GACT	2	8	115293	115300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021082	ATTT	2	8	123076	123083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021082	ATCT	2	8	125150	125157	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021082	AAAC	2	8	125336	125343	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021082	CAAA	2	8	125855	125862	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021082	AATA	2	8	127386	127393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021082	TGCG	2	8	128143	128150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021082	TTAT	2	8	130952	130959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021082	TCTA	2	8	133713	133720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021082	TTTA	2	8	136376	136383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021082	TATT	2	8	139761	139768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021082	AAAC	2	8	141922	141929	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021082	TAAA	2	8	143561	143568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021082	ATTT	2	8	145003	145010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021082	ATTT	2	8	145141	145148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021082	TAAA	2	8	145705	145712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021082	GGAA	2	8	146677	146684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021082	CAAC	2	8	154036	154043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021082	ATTT	2	8	158683	158690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021082	TAAT	2	8	158868	158875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021082	TAAA	2	8	158917	158924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021082	AAAT	2	8	161663	161670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021082	ATAA	2	8	173076	173083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021082	TCAA	2	8	175870	175877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021082	ACGA	2	8	175964	175971	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021082	TTTC	2	8	181592	181599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021082	AATA	2	8	182414	182421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021082	ATTT	2	8	195705	195712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021082	AAAT	2	8	198633	198640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021082	ATTG	2	8	198657	198664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021082	AGGC	2	8	198665	198672	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021082	GGTT	2	8	199322	199329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021082	TAAA	2	8	199518	199525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021082	AAGC	2	8	200351	200358	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021082	AAAG	2	8	204172	204179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021082	CTTT	2	8	204469	204476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021082	AAAG	2	8	204485	204492	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021082	AGAT	2	8	214488	214495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021082	TATT	2	8	217593	217600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021082	CAAA	2	8	223928	223935	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021082	AAAT	2	8	223961	223968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021082	TAAC	2	8	224235	224242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021082	ATTA	2	8	229833	229840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021082	ATTA	2	8	229891	229898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021082	GCCC	2	8	235027	235034	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_021082	ACCG	2	8	238999	239006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021082	AGAA	2	8	241186	241193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021082	AAGG	2	8	242184	242191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021082	CAAC	2	8	243262	243269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021082	AAAT	2	8	245317	245324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021082	TCAG	2	8	249107	249114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021082	CTTT	2	8	251491	251498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021082	TCTT	2	8	251638	251645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021082	TGGC	2	8	251708	251715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021082	CAAC	2	8	253526	253533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021082	ACTA	2	8	253569	253576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021082	CAAA	2	8	259644	259651	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021082	ATAA	2	8	259670	259677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021082	TATC	2	8	263512	263519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021082	TCTT	2	8	267112	267119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021082	GATT	2	8	267424	267431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021082	TGTC	2	8	268034	268041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021082	GCTT	2	8	268052	268059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021082	GGCA	2	8	268557	268564	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021082	CAGC	2	8	268624	268631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021082	CTTT	2	8	269301	269308	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021082	CACC	2	8	269436	269443	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_021082	TCGC	2	8	270138	270145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021082	TCAT	2	8	270824	270831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021082	CCCT	2	8	271748	271755	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_021082	AAAG	2	8	272491	272498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021082	TCAA	2	8	272552	272559	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021082	TCAA	2	8	272561	272568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021082	CTCA	2	8	274279	274286	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021082	TATT	2	8	275975	275982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021082	TAAT	2	8	276988	276995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021082	AAAG	2	8	277277	277284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021082	TGTT	2	8	277791	277798	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021082	AAAT	2	8	284802	284809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021082	AAAT	2	8	284832	284839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021082	AAAT	2	8	287484	287491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021082	AAAT	2	8	290279	290286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021082	CGCT	2	8	294539	294546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021082	GATT	2	8	297480	297487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021082	GATT	2	8	302604	302611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021082	TCTT	2	8	302874	302881	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021082	GATT	2	8	303186	303193	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021082	TGTC	2	8	303796	303803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021082	GCTT	2	8	303814	303821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021082	GGCA	2	8	304319	304326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021082	CAGC	2	8	304386	304393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021082	CTTT	2	8	305063	305070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021082	CACC	2	8	305198	305205	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_021082	TCGC	2	8	305900	305907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021082	AGGC	2	8	306514	306521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021082	CCCT	2	8	307626	307633	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_021082	AAAG	2	8	308369	308376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021082	TCAA	2	8	308430	308437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021082	TCAA	2	8	308439	308446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021082	ACAA	2	8	312010	312017	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021082	AAAG	2	8	318709	318716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021082	TCAA	2	8	321714	321721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021082	ACTT	2	8	339012	339019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021082	AAAT	2	8	343811	343818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021082	TCTG	2	8	344870	344877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021082	CGGG	2	8	348537	348544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021082	AATT	2	8	354385	354392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021082	AGAA	2	8	356565	356572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021082	ATTC	2	8	356713	356720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021082	AAAT	2	8	365360	365367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021082	GCCT	2	8	368894	368901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021082	AGAA	2	8	369005	369012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021082	CTTT	2	8	369711	369718	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021082	ATTT	2	8	372078	372085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021082	CTAC	2	8	375418	375425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021082	ATTT	2	8	383713	383720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021082	ATTT	2	8	383742	383749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_021082	TATT	2	8	402897	402904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_021082	AAAG	2	8	1201607	1201614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_021082	TTGA	2	8	1241880	1241887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
472	NC_021082	TTTA	2	8	1243655	1243662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_021082	AGGA	2	8	1244562	1244569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_021082	TTTA	2	8	1286434	1286441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_021082	TTGT	2	8	1298902	1298909	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_021082	GACA	2	8	1310290	1310297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_021082	ATTA	2	8	1341908	1341915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_021082	AGTA	2	8	1343346	1343353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
499	NC_021082	ACCG	2	8	1345325	1345332	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_021082	ATTT	2	8	1351672	1351679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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