MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Beijing/NITR203

Total Repeats: 1404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021054	CCGA	2	8	1724	1731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021054	GCCC	2	8	12452	12459	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_021054	ATTC	2	8	13690	13697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021054	TCAA	2	8	25513	25520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021054	GAGC	2	8	25541	25548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021054	GGCC	2	8	25555	25562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021054	ACCA	2	8	31122	31129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021054	GCTA	2	8	33853	33860	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021054	CTAC	2	8	47217	47224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021054	CTGG	2	8	52716	52723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021054	CGGC	2	8	59990	59997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021054	GCGG	2	8	60002	60009	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021054	CGGA	2	8	65032	65039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021054	CGGT	2	8	79171	79178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021054	CGGT	2	8	79356	79363	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021054	CTGG	2	8	87201	87208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021054	CGCA	2	8	89501	89508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021054	GACG	2	8	94248	94255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021054	CGCT	2	8	97631	97638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021054	CCTG	2	8	97678	97685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021054	GCGA	2	8	97722	97729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021054	ACCG	2	8	99436	99443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021054	ATCC	2	8	125571	125578	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021054	GCGA	2	8	130656	130663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021054	CGGG	2	8	130699	130706	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021054	GCTC	2	8	131211	131218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021054	CGGG	2	8	133923	133930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021054	TTCT	2	8	139839	139846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021054	ACGC	2	8	139911	139918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021054	AGCA	2	8	141083	141090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021054	GCCG	2	8	143889	143896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021054	GCGT	2	8	148433	148440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021054	GCGG	2	8	149499	149506	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021054	GCCG	2	8	152227	152234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021054	CCGG	2	8	155593	155600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021054	GCGT	3	12	155621	155632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021054	GGCT	2	8	157767	157774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021054	CGCA	2	8	157793	157800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021054	TCGT	2	8	161484	161491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021054	CCGG	2	8	161492	161499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021054	CCCG	2	8	161704	161711	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_021054	ACTT	2	8	171177	171184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021054	TTGA	2	8	186709	186716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021054	CTGG	2	8	196691	196698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021054	CTGT	2	8	212246	212253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021054	GGCC	2	8	218334	218341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021054	CGGT	2	8	218670	218677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021054	GATG	2	8	219417	219424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021054	AACT	2	8	230613	230620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021054	GGAA	2	8	230788	230795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021054	ACGT	2	8	231540	231547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021054	ACAT	2	8	231607	231614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021054	GTGC	2	8	241320	241327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021054	GAAC	2	8	249006	249013	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021054	CGCA	2	8	253615	253622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021054	GACG	2	8	256024	256031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021054	GCGG	2	8	272905	272912	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021054	CGGC	2	8	274271	274278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021054	TAGA	2	8	288378	288385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021054	ACTT	2	8	292083	292090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021054	TCGT	2	8	293711	293718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021054	AACT	2	8	295761	295768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021054	AACC	2	8	295769	295776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021054	ATGC	2	8	296759	296766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021054	GACG	2	8	302077	302084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021054	TTGC	2	8	309717	309724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021054	GGTC	2	8	309889	309896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021054	TCGG	2	8	310114	310121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021054	GCGG	2	8	318288	318295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021054	CCGT	2	8	318591	318598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021054	GGTG	2	8	318779	318786	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021054	GCGG	2	8	319587	319594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021054	ACGG	2	8	320011	320018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021054	GTGG	2	8	320022	320029	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021054	GTCG	2	8	320274	320281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021054	CAGA	2	8	320369	320376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021054	TCCG	2	8	320673	320680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021054	CCGT	2	8	321054	321061	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021054	CCGG	2	8	321062	321069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021054	GGTA	2	8	336413	336420	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021054	GCCG	2	8	336491	336498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021054	TGGC	2	8	336503	336510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021054	GGTG	2	8	345185	345192	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021054	GAGG	2	8	345606	345613	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021054	CTGT	2	8	364501	364508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021054	AATC	2	8	375741	375748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021054	GGCC	2	8	386101	386108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021054	AAGG	2	8	387117	387124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021054	CCCG	2	8	392131	392138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_021054	TGAC	2	8	396086	396093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021054	GTCA	2	8	396097	396104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021054	ATCG	2	8	417066	417073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021054	GCCA	2	8	417157	417164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021054	GTCC	2	8	417183	417190	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021054	ACGG	2	8	417269	417276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021054	GAGC	2	8	424051	424058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021054	GAGC	2	8	424102	424109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021054	TCGG	2	8	425619	425626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021054	GACC	2	8	426094	426101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021054	GATG	2	8	427935	427942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021054	GCCG	2	8	429625	429632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021054	GATC	2	8	431919	431926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021054	CGCC	2	8	432231	432238	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_021054	CACG	2	8	454372	454379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021054	TGCG	2	8	455485	455492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021054	GCTC	2	8	455865	455872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021054	GTCG	2	8	467389	467396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021054	GGAT	2	8	468156	468163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021054	CGAG	2	8	468299	468306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021054	GCAC	2	8	476379	476386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021054	CAAC	2	8	480245	480252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021054	GTCC	2	8	486485	486492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021054	GGGT	2	8	486621	486628	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021054	ATGC	2	8	486863	486870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021054	AGAA	2	8	490751	490758	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021054	ACCG	2	8	505004	505011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021054	CGGG	2	8	505041	505048	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021054	GAGG	2	8	506997	507004	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021054	GCGT	2	8	507082	507089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021054	ACGG	2	8	510332	510339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021054	GATG	2	8	515306	515313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021054	CTGA	2	8	515930	515937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021054	GCAA	2	8	518566	518573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021054	GCTG	2	8	521439	521446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021054	CCGT	2	8	528484	528491	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021054	CGGC	2	8	533796	533803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021054	CGGC	2	8	538539	538546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021054	GACG	2	8	538549	538556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021054	CCGA	2	8	544801	544808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021054	AATC	2	8	545232	545239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021054	GTCT	2	8	545854	545861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021054	CGGC	2	8	559855	559862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021054	CCGG	2	8	560790	560797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021054	AGCA	2	8	564934	564941	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021054	CGAC	2	8	565604	565611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021054	GTTT	2	8	586311	586318	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021054	GCCG	2	8	591323	591330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021054	GCTA	2	8	596625	596632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021054	GCGT	2	8	604511	604518	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021054	CCGA	2	8	604536	604543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021054	CCGA	2	8	608539	608546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021054	GTCC	2	8	611094	611101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021054	GCCC	2	8	625504	625511	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_021054	AGCC	2	8	629985	629992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021054	CGGC	2	8	631765	631772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021054	CCGG	2	8	635507	635514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021054	TGCC	2	8	639936	639943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021054	CCGG	2	8	646381	646388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021054	GCCG	2	8	651475	651482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021054	TGGC	2	8	654765	654772	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021054	CCAG	2	8	657475	657482	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_021054	TTGC	2	8	665520	665527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_021054	GTCG	2	8	665591	665598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
158	NC_021054	CGGC	2	8	668420	668427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_021054	GTGG	2	8	668437	668444	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_021054	CGGC	2	8	677054	677061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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173	NC_021054	CGGC	2	8	728278	728285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
174	NC_021054	CATG	2	8	728292	728299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
175	NC_021054	CACC	2	8	728524	728531	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
176	NC_021054	GCTG	2	8	730189	730196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
177	NC_021054	GACT	2	8	731856	731863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_021054	CGGG	2	8	744295	744302	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
186	NC_021054	GCCG	2	8	744713	744720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
187	NC_021054	GCCG	2	8	745238	745245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
188	NC_021054	CCGG	2	8	745406	745413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
189	NC_021054	GGGC	2	8	745631	745638	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
190	NC_021054	GGCC	2	8	745777	745784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
191	NC_021054	GCCG	2	8	746012	746019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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242	NC_021054	GCGG	2	8	890626	890633	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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269	NC_021054	ATCT	2	8	946654	946661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
270	NC_021054	GATT	2	8	947123	947130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
271	NC_021054	CGGT	2	8	947202	947209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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274	NC_021054	CAGC	2	8	955505	955512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
275	NC_021054	GTCA	2	8	960074	960081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
276	NC_021054	TGGA	2	8	965652	965659	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
277	NC_021054	GAGG	2	8	965678	965685	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_021054	GGTC	2	8	966321	966328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
280	NC_021054	ACAG	2	8	966342	966349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
281	NC_021054	CCAG	2	8	966463	966470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
282	NC_021054	GCCC	2	8	966851	966858	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
283	NC_021054	CGGT	2	8	967113	967120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
284	NC_021054	GCCG	2	8	975931	975938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
285	NC_021054	GGCA	2	8	978370	978377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
286	NC_021054	GTGG	2	8	978712	978719	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_021054	CAGG	2	8	980457	980464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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294	NC_021054	AACG	2	8	987619	987626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
295	NC_021054	CGAC	2	8	987793	987800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
296	NC_021054	CCAG	2	8	987988	987995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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464	NC_021054	TCGA	2	8	1616718	1616725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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469	NC_021054	CGCC	2	8	1631516	1631523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
470	NC_021054	CCGC	2	8	1631615	1631622	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
471	NC_021054	GGCC	2	8	1631811	1631818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
472	NC_021054	CGCC	2	8	1632459	1632466	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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477	NC_021054	CGAT	2	8	1634424	1634431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_021054	GCGA	2	8	1653529	1653536	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
482	NC_021054	CGAC	2	8	1656620	1656627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
483	NC_021054	AGGC	2	8	1659234	1659241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_021054	CGCC	2	8	1665941	1665948	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
485	NC_021054	AGGA	2	8	1666064	1666071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_021054	GCTC	2	8	1676332	1676339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
488	NC_021054	CAGC	2	8	1676470	1676477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
489	NC_021054	CGGC	2	8	1677008	1677015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_021054	GCGA	2	8	1679101	1679108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_021054	AAGC	2	8	1681979	1681986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_021054	GGAT	2	8	1690702	1690709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
497	NC_021054	TCAC	2	8	1693801	1693808	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
498	NC_021054	CGGC	2	8	1694013	1694020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_021054	GAAG	2	8	1694349	1694356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
500	NC_021054	GCCC	2	8	1694504	1694511	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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