MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. Gladysdale MU clone SC5

Total Repeats: 462

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021025	TA	3	6	89	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021025	TA	3	6	1459	1464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021025	TA	3	6	4023	4028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021025	AT	3	6	5252	5257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021025	AT	3	6	5261	5266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021025	AT	3	6	16823	16828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021025	AT	3	6	18572	18577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021025	TA	3	6	18581	18586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021025	AT	3	6	18603	18608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021025	TA	3	6	20379	20384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021025	GA	3	6	20398	20403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021025	TA	3	6	22012	22017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021025	GA	3	6	23519	23524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021025	AT	3	6	28347	28352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021025	AT	3	6	29822	29827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021025	TA	3	6	31287	31292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021025	TA	3	6	34447	34452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021025	TA	3	6	34482	34487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021025	AT	4	8	34519	34526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021025	TA	3	6	43562	43567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021025	TA	3	6	54568	54573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021025	CA	3	6	61738	61743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021025	TA	3	6	65015	65020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021025	AT	3	6	72178	72183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021025	AT	4	8	73214	73221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021025	TA	3	6	74679	74684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021025	TA	3	6	81910	81915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021025	TA	3	6	82219	82224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021025	TC	3	6	82538	82543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021025	AT	3	6	83470	83475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021025	AG	3	6	84781	84786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021025	GT	3	6	84932	84937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021025	AC	3	6	85528	85533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021025	CA	3	6	85708	85713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021025	AT	3	6	85729	85734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021025	GT	3	6	86963	86968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021025	GT	3	6	87134	87139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021025	AT	3	6	87642	87647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021025	CT	3	6	87685	87690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021025	TA	3	6	88502	88507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021025	TA	3	6	90516	90521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021025	TA	3	6	90810	90815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021025	TA	3	6	90867	90872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021025	AT	3	6	97993	97998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021025	AT	3	6	98078	98083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021025	AT	4	8	102906	102913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021025	TA	3	6	109475	109480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021025	AT	3	6	112203	112208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021025	TA	3	6	112964	112969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021025	AC	3	6	113645	113650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021025	AT	3	6	113829	113834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021025	TA	3	6	117042	117047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021025	TA	3	6	124733	124738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021025	TA	3	6	127153	127158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021025	AT	3	6	131405	131410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021025	AT	3	6	131669	131674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021025	TA	4	8	132665	132672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021025	TA	3	6	132753	132758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021025	TA	3	6	133585	133590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021025	TA	3	6	133632	133637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021025	AT	3	6	135997	136002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021025	AT	3	6	136261	136266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021025	TA	4	8	137257	137264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021025	TA	3	6	137345	137350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021025	TA	3	6	138176	138181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021025	TA	3	6	138223	138228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021025	AT	3	6	140588	140593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021025	AT	3	6	140852	140857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021025	TA	4	8	141849	141856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021025	TA	3	6	141937	141942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021025	GT	3	6	145709	145714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021025	AT	3	6	145729	145734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021025	TA	3	6	145768	145773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021025	TA	3	6	145871	145876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021025	AT	4	8	149878	149885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021025	TA	10	20	150005	150024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021025	TA	3	6	150036	150041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021025	TA	3	6	150049	150054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021025	TA	3	6	152660	152665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021025	TA	3	6	153992	153997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021025	TA	5	10	156441	156450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021025	AT	3	6	157924	157929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021025	TA	3	6	158089	158094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021025	AT	4	8	158119	158126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021025	AT	3	6	158134	158139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021025	TA	3	6	158275	158280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021025	AG	3	6	159033	159038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021025	TA	5	10	160021	160030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021025	TA	3	6	160056	160061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021025	AT	4	8	160220	160227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021025	TA	3	6	168030	168035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021025	TA	3	6	169729	169734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021025	TA	3	6	170855	170860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021025	AT	3	6	173373	173378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021025	TA	3	6	179622	179627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021025	TA	3	6	179693	179698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021025	TA	3	6	179922	179927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021025	AG	3	6	179930	179935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021025	TA	3	6	180723	180728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021025	AT	3	6	188656	188661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021025	TA	3	6	189724	189729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021025	TA	4	8	192134	192141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021025	AC	3	6	192162	192167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021025	GT	3	6	192630	192635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021025	AT	3	6	195295	195300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021025	AT	3	6	195343	195348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021025	AT	3	6	196687	196692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021025	TA	3	6	200903	200908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021025	TA	3	6	200964	200969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021025	GT	3	6	202454	202459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021025	AT	4	8	202742	202749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021025	TA	3	6	202965	202970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021025	TA	3	6	203140	203145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021025	TA	3	6	203444	203449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021025	AC	3	6	203506	203511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021025	TA	3	6	204092	204097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021025	AT	3	6	207352	207357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021025	TA	3	6	210199	210204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021025	TA	3	6	216681	216686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021025	TA	3	6	220931	220936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021025	AT	3	6	221657	221662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021025	AT	3	6	230786	230791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021025	TC	3	6	233650	233655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021025	AT	3	6	240712	240717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021025	TA	3	6	240761	240766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021025	AT	3	6	241381	241386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021025	CT	3	6	241649	241654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021025	TA	3	6	241781	241786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021025	AT	3	6	244451	244456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021025	TA	3	6	249073	249078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021025	TA	3	6	249568	249573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021025	TA	3	6	252121	252126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021025	AT	3	6	252501	252506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021025	TA	3	6	252512	252517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021025	TA	3	6	254430	254435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021025	AT	4	8	254441	254448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021025	AT	3	6	254453	254458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021025	AT	3	6	254463	254468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021025	TA	3	6	254850	254855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021025	AT	3	6	254861	254866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021025	TA	3	6	254870	254875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021025	AT	3	6	256870	256875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021025	AT	3	6	257791	257796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021025	AT	4	8	264888	264895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021025	TC	4	8	266188	266195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021025	GA	3	6	266198	266203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021025	TC	3	6	266469	266474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021025	AT	3	6	271857	271862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021025	GC	3	6	272319	272324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021025	TA	3	6	274557	274562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021025	AT	4	8	274722	274729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021025	TA	3	6	277585	277590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021025	GT	3	6	277740	277745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021025	AT	3	6	284553	284558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_021025	TA	3	6	1185265	1185270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_021025	AT	3	6	1188891	1188896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_021025	CT	3	6	1191835	1191840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
461	NC_021025	TA	3	6	1193567	1193572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_021025	AT	3	6	1193735	1193740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.