MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. Gladysdale MU clone SC5

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021025	TAGAAA	3	18	1429	1446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021025	TAGTAA	2	12	1447	1458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021025	ATTTTT	2	12	2662	2673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021025	TTAAAT	2	12	16829	16840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021025	AAATTT	2	12	43543	43554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021025	TTTAAT	2	12	68984	68995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021025	GATATT	2	12	74664	74675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021025	ATATCC	2	12	81893	81904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021025	ATATCT	2	12	88472	88483	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021025	ATATCT	2	12	90486	90497	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021025	ATAAAA	2	12	127140	127151	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021025	ATAAAA	2	12	133619	133630	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021025	ATAAAA	2	12	138210	138221	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021025	ATGGTG	2	12	145078	145089	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021025	TAAAGT	2	12	145850	145861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021025	ACAAAA	2	12	147376	147387	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021025	CAGATC	2	12	158381	158392	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021025	TATTAA	2	12	170873	170884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021025	AAAATG	2	12	170962	170973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021025	AGATAA	2	12	177040	177051	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021025	ATATTT	2	12	180706	180717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021025	ATTTTA	2	12	189700	189711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021025	TTTAAT	2	12	202950	202961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021025	AAAATT	2	12	209981	209992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021025	TTTTAA	2	12	221482	221493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021025	ATAAAT	2	12	240767	240778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021025	TGACTT	2	12	241387	241398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021025	TAAATC	2	12	242955	242966	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021025	ATCTAA	2	12	244458	244469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021025	TAAAAC	2	12	251866	251877	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021025	TTCATC	2	12	274285	274296	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021025	CTAATA	2	12	277689	277700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021025	CAAAAT	2	12	278800	278811	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021025	AGAACA	2	12	278818	278829	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021025	ATATTA	2	12	292800	292811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021025	TTAATT	2	12	293295	293306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021025	ATTTTC	2	12	299288	299299	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021025	AAGCTT	2	12	327909	327920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021025	ATTTTT	2	12	333886	333897	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021025	AAAGAA	2	12	337102	337113	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021025	AATTAA	2	12	347713	347724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021025	CTTTTT	2	12	362681	362692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021025	ATTTTT	2	12	370117	370128	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021025	AAATTA	2	12	370214	370225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021025	TTTTAT	2	12	377048	377059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021025	ATTATC	2	12	377290	377301	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021025	ATTTTG	2	12	401574	401585	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021025	TGGTAA	2	12	428361	428372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021025	GATAAA	2	12	428548	428559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021025	TCTTTA	2	12	430131	430142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021025	AAATTT	2	12	430913	430924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021025	CAAATA	2	12	440598	440609	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021025	ATTAAT	2	12	441358	441369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021025	TAAAGA	2	12	445804	445815	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021025	ATATAA	2	12	446559	446570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021025	TTTTAA	2	12	454221	454232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021025	AAGTTA	2	12	455155	455166	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021025	TATAAA	2	12	455234	455245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021025	AAATTT	2	12	456467	456478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021025	TAAAAA	2	12	461808	461819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021025	AATTCA	2	12	468408	468419	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021025	CTAAAA	2	12	479455	479466	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021025	ACTTAA	2	12	498180	498191	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021025	TCTTTT	2	12	498936	498947	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021025	ATTTTA	2	12	533750	533761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021025	TTTAAT	2	12	589859	589870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021025	AATCCA	2	12	597342	597353	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021025	ACTCCA	2	12	597363	597374	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021025	ATTTTT	2	12	598418	598429	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021025	ATTTAA	2	12	606625	606636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021025	TTATTT	2	12	649073	649084	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021025	TTTTAG	2	12	650808	650819	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021025	TTTCTT	2	12	658711	658722	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021025	TATTTT	2	12	670929	670940	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021025	TAAAAA	2	12	685910	685921	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021025	AAAAAC	2	12	703627	703638	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021025	TCAAAT	2	12	736418	736429	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021025	ATAAAA	2	12	746417	746428	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021025	AATTAG	2	12	755716	755727	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021025	CTTTTT	2	12	756013	756024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021025	TTTTTC	2	12	759521	759532	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021025	ATTAAT	2	12	766636	766647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021025	CTAAAT	2	12	776111	776122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021025	AGAAAT	2	12	803486	803497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021025	TTTGAA	2	12	806792	806803	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021025	AATCAA	2	12	807039	807050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021025	TTGTTT	2	12	807334	807345	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021025	AATACA	2	12	810411	810422	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021025	TAAGTG	2	12	812713	812724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021025	TTTTAA	2	12	860525	860536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021025	TTTTTA	2	12	861491	861502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021025	TTGCTA	2	12	888969	888980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021025	CTAAAA	2	12	901753	901764	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021025	TAATCA	2	12	902051	902062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021025	TCTCCA	2	12	905175	905186	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021025	ATCAAT	2	12	905822	905833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021025	ACTTAA	2	12	954645	954656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021025	CTAATT	2	12	958122	958133	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021025	TAATAG	2	12	958372	958383	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021025	TTTATA	2	12	959022	959033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021025	TAAAAA	2	12	973396	973407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021025	ATTTTT	2	12	978784	978795	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021025	CTAAAA	2	12	986802	986813	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021025	TTTAAA	2	12	993030	993041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021025	CTAAAA	2	12	1001955	1001966	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021025	TTTAAA	2	12	1008179	1008190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021025	CATTTT	2	12	1029123	1029134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021025	TTAATA	2	12	1029212	1029223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021025	TTAAAA	2	12	1038084	1038095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021025	ATTTAT	2	12	1061212	1061223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021025	AATGAA	2	12	1087006	1087017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021025	AAGTTT	2	12	1115350	1115361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021025	TAAAAA	2	12	1115641	1115652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021025	AAGTTT	2	12	1123133	1123144	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021025	AAACAT	2	12	1130028	1130039	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021025	AAGTTT	2	12	1130857	1130868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021025	ATAAAA	2	12	1137556	1137567	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021025	ATAAAA	2	12	1144381	1144392	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021025	TAATGA	2	12	1147967	1147978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021025	ACATTC	2	12	1148319	1148330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021025	GGATCT	2	12	1148470	1148481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021025	AACCAA	2	12	1162654	1162665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021025	TAAACT	2	12	1164641	1164652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021025	CTAATA	2	12	1164757	1164768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021025	ATATTA	2	12	1170917	1170928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021025	TTTTCT	2	12	1174571	1174582	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021025	TCTTTA	2	12	1184815	1184826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_021025	TTTTAG	2	12	1185278	1185289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.