MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020834	TAAC	2	8	376	383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020834	TTAC	2	8	1036	1043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020834	ATTA	2	8	9589	9596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020834	GTAA	2	8	14135	14142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020834	TAAA	2	8	14712	14719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020834	AAAT	2	8	14723	14730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020834	ATTT	2	8	15091	15098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020834	GGTT	2	8	17020	17027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020834	CTGC	2	8	18009	18016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020834	ATTT	2	8	18091	18098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020834	TCTA	2	8	18678	18685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020834	TCCT	2	8	24336	24343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020834	AGAA	2	8	26019	26026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020834	AAGC	2	8	27767	27774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020834	TTAA	2	8	28933	28940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020834	ATTT	2	8	31643	31650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020834	GAGG	2	8	33880	33887	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020834	GGAG	2	8	33907	33914	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020834	GGAG	2	8	36668	36675	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020834	TTTC	2	8	46756	46763	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020834	TAAA	2	8	46950	46957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020834	ATTT	2	8	58378	58385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020834	AAAC	2	8	58448	58455	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020834	TGGC	2	8	58838	58845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020834	ATAA	2	8	65176	65183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020834	ACCC	2	8	69812	69819	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_020834	TTTA	2	8	69905	69912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020834	GGCA	2	8	78474	78481	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020834	TTTG	2	8	81729	81736	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020834	TTTG	2	8	82648	82655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020834	CAAA	2	8	84238	84245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020834	TTAT	2	8	89569	89576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020834	TGAA	2	8	90767	90774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020834	AGCA	2	8	95195	95202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020834	ATAA	2	8	95411	95418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020834	ATTT	2	8	98249	98256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020834	GTTC	2	8	103221	103228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020834	CAAA	2	8	103725	103732	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020834	AGCT	2	8	105312	105319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020834	ATCC	2	8	105561	105568	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020834	TGTC	2	8	106286	106293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020834	TAAT	2	8	106394	106401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020834	GCAA	2	8	109892	109899	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020834	TTTA	2	8	110442	110449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020834	TTTA	2	8	112951	112958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020834	CCTT	2	8	113569	113576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020834	ATTT	2	8	113634	113641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020834	GAAA	2	8	113726	113733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020834	AATA	2	8	117234	117241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020834	GCTC	2	8	117898	117905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020834	AGAT	2	8	120421	120428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020834	GCCC	2	8	122459	122466	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_020834	GGGC	2	8	122485	122492	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020834	CTTT	2	8	124260	124267	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020834	TTTG	2	8	126377	126384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020834	TAAA	2	8	127292	127299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020834	TTAG	2	8	130896	130903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020834	AACC	2	8	136282	136289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020834	TTAA	2	8	137176	137183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020834	TATT	2	8	137222	137229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020834	TCGC	2	8	138639	138646	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020834	TTAG	2	8	145468	145475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020834	GGAG	2	8	152551	152558	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020834	GATT	2	8	152604	152611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020834	AAAC	2	8	152944	152951	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020834	ATTA	2	8	156109	156116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020834	CGCT	2	8	156274	156281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020834	ATTT	2	8	158982	158989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020834	ATTT	2	8	165018	165025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020834	TCAT	2	8	172203	172210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020834	CGTC	2	8	176522	176529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020834	ATCT	2	8	184411	184418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020834	GTAC	2	8	184432	184439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020834	TGAA	2	8	189086	189093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020834	ATCA	2	8	194806	194813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020834	TAAA	2	8	194862	194869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020834	GTAG	2	8	196155	196162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020834	TAAA	2	8	197860	197867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020834	TCAA	2	8	202433	202440	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020834	TAAA	2	8	202500	202507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020834	ATTA	2	8	202553	202560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020834	CTTT	2	8	202880	202887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020834	GTTA	2	8	205576	205583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020834	CTTA	2	8	205659	205666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020834	GAAA	2	8	212229	212236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020834	CTAT	2	8	219880	219887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020834	TTGT	2	8	219950	219957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020834	ATTT	2	8	226500	226507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020834	ACCG	2	8	232294	232301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020834	CATA	2	8	238656	238663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020834	TCTT	2	8	242803	242810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020834	CTTT	2	8	245046	245053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020834	TAAA	2	8	249462	249469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020834	TTTC	2	8	250968	250975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020834	GAGG	2	8	251423	251430	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020834	TTTA	2	8	253883	253890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020834	ATTG	2	8	254749	254756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020834	TTAG	2	8	255984	255991	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020834	AAAT	2	8	257417	257424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020834	AAAT	2	8	257437	257444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020834	CTAT	2	8	266892	266899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020834	CTTA	2	8	267589	267596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020834	GACA	2	8	272955	272962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020834	TGTT	2	8	273249	273256	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020834	TGAT	2	8	282724	282731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020834	TGTT	2	8	291679	291686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020834	ACCG	2	8	295350	295357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020834	ATAG	2	8	298320	298327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020834	TAAC	2	8	298430	298437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020834	AATA	2	8	299909	299916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020834	CCTA	2	8	306017	306024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020834	TTAC	2	8	317887	317894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020834	TTAG	2	8	319881	319888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020834	GGCA	2	8	319948	319955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020834	ATTT	2	8	324590	324597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020834	GCTT	2	8	325457	325464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020834	GTTG	2	8	325615	325622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020834	ATTT	2	8	333736	333743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020834	TTAA	2	8	334220	334227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020834	CTTT	2	8	334897	334904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020834	AGTA	2	8	340715	340722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020834	TTAT	2	8	346984	346991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020834	GACA	2	8	351466	351473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020834	AGTT	2	8	353773	353780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020834	GAGC	2	8	358176	358183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020834	TTGT	2	8	359773	359780	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020834	TAAG	2	8	362344	362351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020834	GACA	2	8	370991	370998	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020834	GTAG	2	8	375290	375297	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020834	TGCC	2	8	375310	375317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020834	CTAT	2	8	377650	377657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020834	TAAT	2	8	377750	377757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020834	CAAA	2	8	381216	381223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020834	ACTA	2	8	382807	382814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020834	ATAA	2	8	390643	390650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020834	AGCA	2	8	404626	404633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020834	TGCG	2	8	411372	411379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020834	AAAT	2	8	411382	411389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020834	AATG	2	8	426299	426306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020834	TATC	2	8	435702	435709	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020834	TTAG	2	8	436747	436754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020834	TCTA	2	8	438735	438742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020834	TTAT	2	8	438752	438759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020834	AATA	2	8	445419	445426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020834	AGAT	2	8	445649	445656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020834	GGAG	2	8	446377	446384	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020834	GTAC	10	40	446443	446482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020834	GGAG	2	8	446499	446506	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020834	AATA	2	8	446683	446690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020834	GATA	2	8	459281	459288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020834	TAAG	2	8	463135	463142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020834	GGGC	2	8	464649	464656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_020834	CGTA	11	44	471970	472013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_020834	TTTA	2	8	496903	496910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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